More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1250 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_2627  ABC transporter related  65.56 
 
 		 592 aa  786    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0494  ABC transporter related  92.28 
 
 		 611 aa  1145    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1250  ABC transporter related  100 
 
 		 610 aa  1221    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1201  ABC transporter related protein  51 
 
 		 594 aa  633  1e-180  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2371  ABC transporter, ATPase subunit  48.38 
 
 		 622 aa  577  1.0000000000000001e-163  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2505  ABC transporter related protein  48.77 
 
 		 607 aa  575  1.0000000000000001e-163  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.152219  normal  0.502097 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0801  ABC transporter-like protein  46.36 
 
 		 635 aa  564  1.0000000000000001e-159  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.678319 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2181  ABC transporter related  45.48 
 
 		 600 aa  557  1e-157  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0418  ABC transporter related protein  48.58 
 
 		 600 aa  549  1e-155  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0282  ABC transporter related protein  48.63 
 
 		 600 aa  541  9.999999999999999e-153  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0648  ABC transporter related  46.57 
 
 		 623 aa  528  1e-148  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.986523 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3126  ABC transporter related  51.44 
 
 		 592 aa  513  1e-144  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0443  ABC transporter related  43.27 
 
 		 588 aa  509  1e-143  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000201252  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0419  ABC transporter-related protein  41.38 
 
 		 608 aa  503  1e-141  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0718918 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0453  ATPase  41.52 
 
 		 614 aa  496  1e-139  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0033  ABC transporter related  43.7 
 
 		 602 aa  495  1e-139  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0387  ABC transporter related  40.64 
 
 		 611 aa  497  1e-139  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.000000031667  normal  0.0347309 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0034  ABC transporter related protein  43.32 
 
 		 603 aa  495  9.999999999999999e-139  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1761  ATPase  41.38 
 
 		 611 aa  490  1e-137  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.115592  normal  0.424794 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3416  ABC transporter-related protein  44.66 
 
 		 602 aa  488  1e-136  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0313  ABC transporter, ATP-binding/membrane-spanning protein  40.47 
 
 		 590 aa  487  1e-136  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0422  ABC transporter related  40.96 
 
 		 613 aa  486  1e-136  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.333547  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1469  ABC transporter related protein  38.37 
 
 		 586 aa  473  1e-132  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3627  ABC transporter related  44.19 
 
 		 617 aa  474  1e-132  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0318  ABC transporter related  39.87 
 
 		 603 aa  470  1.0000000000000001e-131  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0669  ABC transporter related  39.53 
 
 		 588 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.921203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4763  ABC transporter related  37.71 
 
 		 591 aa  471  1.0000000000000001e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.116722  normal  0.0159357 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2613  ABC transporter, transmembrane region  42.74 
 
 		 625 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.200186  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0160  ABC transporter related  42.74 
 
 		 616 aa  467  9.999999999999999e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0101  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  43.76 
 
 		 592 aa  464  1e-129  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0673  ABC transporter related  46.39 
 
 		 650 aa  464  1e-129  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2497  ABC transporter related  43.77 
 
 		 614 aa  460  9.999999999999999e-129  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0387  ABC transporter related  39.3 
 
 		 619 aa  461  9.999999999999999e-129  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.102241  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  40.3 
 
 		 597 aa  453  1.0000000000000001e-126  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2717  ABC transporter related  43.05 
 
 		 608 aa  451  1e-125  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1227  ABC transporter related  36.23 
 
 		 589 aa  448  1.0000000000000001e-124  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.175574 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0335  ABC transporter transmembrane region  39.26 
 
 		 588 aa  442  1e-123  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0047  ABC transporter-like protein  37.29 
 
 		 586 aa  433  1e-120  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.99996 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3384  ABC transporter, ATP-binding protein  37.99 
 
 		 587 aa  426  1e-118  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.603869  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2332  ABC transporter-related protein  38.01 
 
 		 587 aa  426  1e-118  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000229781  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13518  ATPase  36.68 
 
 		 587 aa  427  1e-118  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3695  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  37.82 
 
 		 587 aa  425  1e-117  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000106018 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0963  ABC transporter related  38.68 
 
 		 599 aa  424  1e-117  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.798601  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3466  ABC transporter ATP-binding/permease  37.82 
 
 		 587 aa  425  1e-117  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.197712  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3432  ABC transporter, ATP-binding protein  37.82 
 
 		 587 aa  425  1e-117  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000147455  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3786  ABC transporter  37.61 
 
 		 587 aa  425  1e-117  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.469191  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3740  ABC transporter permease/ATP-binding protein  37.82 
 
 		 587 aa  425  1e-117  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.037622  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1528  ABC transporter, transmembrane region  37.78 
 
 		 587 aa  422  1e-117  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00299054  normal  0.0159788 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1390  ABC transporter related  40.66 
 
 		 602 aa  422  1e-117  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.838756  normal  0.671981 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3714  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  37.65 
 
 		 587 aa  420  1e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.207401  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3067  ABC transporter related  39.31 
 
 		 621 aa  421  1e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.134342  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3719  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  37.65 
 
 		 587 aa  421  1e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2282  ABC transporter related  39.54 
 
 		 609 aa  419  9.999999999999999e-116  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0569  ABC transporter related  37.46 
 
 		 597 aa  416  9.999999999999999e-116  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1359  ABC transporter related  40.45 
 
 		 608 aa  415  1e-114  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4668  ABC transporter, transmembrane region  37.27 
 
 		 584 aa  415  1e-114  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1430  ABC transporter related  37.07 
 
 		 592 aa  410  1e-113  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3813  ABC transporter related protein  39.68 
 
 		 642 aa  409  1e-113  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.206928  normal  0.202717 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19280  ABC transporter related  37.04 
 
 		 609 aa  408  1.0000000000000001e-112  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2254  ABC transporter related  40.72 
 
 		 592 aa  407  1.0000000000000001e-112  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2669  ABC transporter related  37 
 
 		 637 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.871518  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2306  ABC transporter related  37.71 
 
 		 610 aa  408  1.0000000000000001e-112  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.306403 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0841  ABC transporter related  39.21 
 
 		 607 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3365  ABC transporter related  37.65 
 
 		 587 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000714306  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1776  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.76 
 
 		 589 aa  405  1e-111  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184019  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1942  ABC transporter, transmembrane region  38.72 
 
 		 594 aa  401  9.999999999999999e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3782  ABC transporter related  36.9 
 
 		 594 aa  401  9.999999999999999e-111  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.91836  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2921  ABC transporter related protein  40.62 
 
 		 636 aa  399  9.999999999999999e-111  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0048  ABC transporter related  36.35 
 
 		 598 aa  400  9.999999999999999e-111  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000163685  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3872  ABC transporter related  38.75 
 
 		 585 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2726  ABC transporter related  42.55 
 
 		 610 aa  396  1e-109  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0902  ABC transporter related  36.24 
 
 		 579 aa  398  1e-109  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00896089  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0880  ABC transporter related  36.24 
 
 		 579 aa  398  1e-109  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000184481  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3227  ABC transporter-related protein  40.31 
 
 		 675 aa  396  1e-109  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3376  ABC transporter related  42.55 
 
 		 610 aa  396  1e-109  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1540  multidrug ABC transporter ATPase/permease  35.97 
 
 		 602 aa  395  1e-108  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.652681  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1245  ABC transporter related  36.41 
 
 		 594 aa  392  1e-108  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00497584  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0118  ABC transporter related  37.95 
 
 		 645 aa  390  1e-107  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00403697  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0817  ABC transporter related  42.72 
 
 		 629 aa  390  1e-107  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.527463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5995  ABC transporter related  36.39 
 
 		 632 aa  391  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.210924  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  39.9 
 
 		 598 aa  388  1e-106  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0782  ATPase  43.55 
 
 		 598 aa  385  1e-106  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.461775 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1385  ABC transporter related  39.77 
 
 		 622 aa  385  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2848  ABC transporter related  37.6 
 
 		 606 aa  385  1e-105  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0334718  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7144  ABC transporter related  35.56 
 
 		 632 aa  383  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2270  ABC transporter related  37.3 
 
 		 619 aa  383  1e-105  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.903332  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  35.99 
 
 		 597 aa  385  1e-105  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1382  ABC transporter related  34.51 
 
 		 578 aa  383  1e-105  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.372914  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  35.99 
 
 		 597 aa  385  1e-105  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2471  ABC transporter related protein  37.8 
 
 		 600 aa  381  1e-104  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0039  putative ATP-binding component of a transport system  38.29 
 
 		 588 aa  379  1e-104  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0738965  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0881  ATPase  39.54 
 
 		 592 aa  380  1e-104  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3551  ABC transporter related  37.68 
 
 		 632 aa  381  1e-104  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.127969 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2350  ABC transporter related protein  40.11 
 
 		 620 aa  379  1e-104  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1249  ABC transporter, ATP-binding protein  34.16 
 
 		 598 aa  380  1e-104  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159778 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0461  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.71 
 
 		 579 aa  377  1e-103  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0684  ABC transporter related  38.37 
 
 		 598 aa  378  1e-103  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000210902  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1455  ABC transporter related  37.8 
 
 		 625 aa  377  1e-103  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0017  ABC transporter related  35.58 
 
 		 593 aa  376  1e-103  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0545  ABC transporter related  37.82 
 
 		 602 aa  379  1e-103  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>