More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0387 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_1761  ATPase  69.64 
 
 
611 aa  887    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.115592  normal  0.424794 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0453  ATPase  67.91 
 
 
614 aa  858    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0318  ABC transporter related  68.72 
 
 
603 aa  874    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0422  ABC transporter related  70.1 
 
 
613 aa  899    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.333547  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0419  ABC transporter-related protein  73.85 
 
 
608 aa  931    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0718918 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0387  ABC transporter related  70.12 
 
 
619 aa  880    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.102241  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0387  ABC transporter related  100 
 
 
611 aa  1248    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.000000031667  normal  0.0347309 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0418  ABC transporter related protein  49.83 
 
 
600 aa  618  1e-176  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1201  ABC transporter related protein  47.29 
 
 
594 aa  581  1e-164  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1469  ABC transporter related protein  46.48 
 
 
586 aa  567  1e-160  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0313  ABC transporter, ATP-binding/membrane-spanning protein  44.97 
 
 
590 aa  549  1e-155  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0669  ABC transporter related  46.67 
 
 
588 aa  545  1e-153  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.921203  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4763  ABC transporter related  44.77 
 
 
591 aa  541  9.999999999999999e-153  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.116722  normal  0.0159357 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2371  ABC transporter, ATPase subunit  44.44 
 
 
622 aa  530  1e-149  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1227  ABC transporter related  43.08 
 
 
589 aa  523  1e-147  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.175574 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2181  ABC transporter related  43.45 
 
 
600 aa  523  1e-147  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0160  ABC transporter related  42.55 
 
 
616 aa  521  1e-146  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3416  ABC transporter-related protein  45.38 
 
 
602 aa  513  1e-144  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0033  ABC transporter related  41.91 
 
 
602 aa  506  9.999999999999999e-143  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0034  ABC transporter related protein  41.33 
 
 
603 aa  501  1e-140  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0494  ABC transporter related  40 
 
 
611 aa  501  1e-140  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0101  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  44.6 
 
 
592 aa  498  1e-139  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2627  ABC transporter related  41.25 
 
 
592 aa  488  1e-137  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13518  ATPase  42.12 
 
 
587 aa  491  1e-137  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0047  ABC transporter-like protein  41.3 
 
 
586 aa  489  1e-137  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.99996 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1250  ABC transporter related  40.64 
 
 
610 aa  485  1e-136  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0443  ABC transporter related  39.09 
 
 
588 aa  487  1e-136  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000201252  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0801  ABC transporter-like protein  39.07 
 
 
635 aa  479  1e-134  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.678319 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2505  ABC transporter related protein  39.41 
 
 
607 aa  479  1e-134  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.152219  normal  0.502097 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2613  ABC transporter, transmembrane region  41.54 
 
 
625 aa  476  1e-133  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.200186  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0335  ABC transporter transmembrane region  39.9 
 
 
588 aa  470  1.0000000000000001e-131  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4668  ABC transporter, transmembrane region  39.93 
 
 
584 aa  468  9.999999999999999e-131  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0673  ABC transporter related  42.86 
 
 
650 aa  456  1e-127  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0648  ABC transporter related  38.86 
 
 
623 aa  444  1e-123  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.986523 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3786  ABC transporter  39.86 
 
 
587 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.469191  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1528  ABC transporter, transmembrane region  39.52 
 
 
587 aa  438  1e-121  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00299054  normal  0.0159788 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  38.56 
 
 
597 aa  434  1e-120  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  38.56 
 
 
597 aa  434  1e-120  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3466  ABC transporter ATP-binding/permease  39.41 
 
 
587 aa  431  1e-119  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.197712  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3432  ABC transporter, ATP-binding protein  39.41 
 
 
587 aa  431  1e-119  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000147455  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2332  ABC transporter-related protein  39.03 
 
 
587 aa  432  1e-119  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000229781  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3384  ABC transporter, ATP-binding protein  39.41 
 
 
587 aa  430  1e-119  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.603869  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3740  ABC transporter permease/ATP-binding protein  39.41 
 
 
587 aa  431  1e-119  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.037622  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0048  ABC transporter related  39.01 
 
 
598 aa  430  1e-119  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000163685  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  38.87 
 
 
597 aa  431  1e-119  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1390  ABC transporter related  38.83 
 
 
602 aa  430  1e-119  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.838756  normal  0.671981 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3695  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  39.41 
 
 
587 aa  431  1e-119  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000106018 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3714  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  39.24 
 
 
587 aa  427  1e-118  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.207401  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2618  ABC transporter related  38.98 
 
 
617 aa  429  1e-118  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000100526  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3719  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  39.41 
 
 
587 aa  428  1e-118  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3365  ABC transporter related  40.07 
 
 
587 aa  419  1e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000714306  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3067  ABC transporter related  37.27 
 
 
621 aa  420  1e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.134342  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3627  ABC transporter related  38.31 
 
 
617 aa  422  1e-116  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1359  ABC transporter related  38.25 
 
 
608 aa  415  1e-114  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1782  ABC transporter-related protein  37.2 
 
 
605 aa  414  1e-114  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.563719  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2306  ABC transporter related  37.82 
 
 
610 aa  412  1e-114  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.306403 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2497  ABC transporter related  37.82 
 
 
614 aa  409  1e-113  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2717  ABC transporter related  38.86 
 
 
608 aa  410  1e-113  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3813  ABC transporter related protein  39.33 
 
 
642 aa  406  1.0000000000000001e-112  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.206928  normal  0.202717 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0841  ABC transporter related  38.1 
 
 
607 aa  406  1.0000000000000001e-112  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19280  ABC transporter related  37.65 
 
 
609 aa  404  1e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0642  ABC transporter related  37.17 
 
 
620 aa  405  1e-111  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.014004  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2350  ABC transporter related protein  39.06 
 
 
620 aa  401  9.999999999999999e-111  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1245  ABC transporter related  37.22 
 
 
594 aa  402  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00497584  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0569  ABC transporter related  36.33 
 
 
597 aa  400  9.999999999999999e-111  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2475  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.12 
 
 
598 aa  397  1e-109  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00961334  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2932  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.68 
 
 
598 aa  398  1e-109  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00230756 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2282  ABC transporter related  37.12 
 
 
609 aa  398  1e-109  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2539  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.34 
 
 
598 aa  397  1e-109  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2921  ABC transporter related protein  37.61 
 
 
636 aa  398  1e-109  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2401  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.51 
 
 
598 aa  396  1e-109  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1776  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.99 
 
 
589 aa  393  1e-108  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184019  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2471  ABC transporter related protein  38.17 
 
 
600 aa  392  1e-108  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3782  ABC transporter related  37.37 
 
 
594 aa  389  1e-107  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.91836  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2250  ABC transporter related  35.81 
 
 
598 aa  392  1e-107  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0582239  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0545  ABC transporter related  34.69 
 
 
602 aa  389  1e-107  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0282  ABC transporter related protein  37.65 
 
 
600 aa  386  1e-106  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2276  ABC transporter ATP-binding/permease  35.29 
 
 
598 aa  387  1e-106  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.406907  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2236  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  35.29 
 
 
598 aa  387  1e-106  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0563945  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1385  ABC transporter related  39.6 
 
 
622 aa  385  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2193  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  35.12 
 
 
598 aa  386  1e-106  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0325354  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1942  ABC transporter, transmembrane region  37.41 
 
 
594 aa  388  1e-106  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2444  ABC transporter permease/ATP-binding protein  35.29 
 
 
598 aa  387  1e-106  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.290529  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3376  ABC transporter related  37.14 
 
 
610 aa  387  1e-106  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2726  ABC transporter related  40.72 
 
 
610 aa  386  1e-106  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2460  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.29 
 
 
598 aa  387  1e-106  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0017  ABC transporter related  36.46 
 
 
593 aa  388  1e-106  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2126  ABC transporter related protein  37.71 
 
 
592 aa  384  1e-105  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  35.68 
 
 
598 aa  383  1e-105  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1540  multidrug ABC transporter ATPase/permease  38.42 
 
 
602 aa  380  1e-104  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.652681  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1430  ABC transporter related  36.83 
 
 
592 aa  380  1e-104  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0817  ABC transporter related  40.61 
 
 
629 aa  382  1e-104  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.527463  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3781  ABC transporter related  35.3 
 
 
588 aa  377  1e-103  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000284212  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4444  ABC transporter related  36.96 
 
 
610 aa  377  1e-103  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.949596  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1455  ABC transporter related  35 
 
 
625 aa  377  1e-103  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4531  ABC transporter related  36.96 
 
 
610 aa  377  1e-103  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.319604  normal  0.425635 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4826  ABC transporter related  36.96 
 
 
610 aa  376  1e-103  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.596215 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02150  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  37.45 
 
 
608 aa  373  1e-102  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2254  ABC transporter related  33.27 
 
 
592 aa  374  1e-102  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0544  ABC transporter related  33.73 
 
 
587 aa  374  1e-102  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>