More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3781 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3781  ABC transporter related  100 
 
 		 588 aa  1219    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000284212  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1429  ABC transporter related  48.11 
 
 		 581 aa  627  1e-178  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1525  ABC transporter related  44.17 
 
 		 581 aa  520  1e-146  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.628149  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1539  multidrug ABC transporter ATPase/permease  41 
 
 		 636 aa  484  1e-135  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1250  ABC transporter, ATP-binding protein  40.27 
 
 		 604 aa  483  1e-135  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00143997 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0047  ABC transporter related  37.7 
 
 		 580 aa  428  1e-118  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00438981  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2283  ABC transporter related  37.37 
 
 		 589 aa  422  1e-117  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0018  ABC transporter related  40.18 
 
 		 581 aa  418  9.999999999999999e-116  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2719  ABC transporter related  37.07 
 
 		 606 aa  408  1.0000000000000001e-112  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0568  ABC transporter related  38.2 
 
 		 578 aa  405  1e-111  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2499  ABC transporter transmembrane region  36.22 
 
 		 601 aa  399  9.999999999999999e-111  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1777  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.7 
 
 		 573 aa  398  1e-109  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00514902  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3626  ABC transporter related  38.56 
 
 		 588 aa  389  1e-107  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.058238  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  34.8 
 
 		 597 aa  379  1e-104  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  35.37 
 
 		 575 aa  380  1e-104  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0418  ABC transporter related protein  34.09 
 
 		 600 aa  380  1e-104  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  34.8 
 
 		 597 aa  379  1e-104  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0387  ABC transporter related  35.3 
 
 		 611 aa  377  1e-103  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.000000031667  normal  0.0347309 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0544  ABC transporter related  34.85 
 
 		 587 aa  373  1e-102  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  37.43 
 
 		 556 aa  374  1e-102  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2922  ABC transporter related protein  34.21 
 
 		 581 aa  370  1e-101  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.364865  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2618  ABC transporter related  33.92 
 
 		 617 aa  370  1e-101  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000100526  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0552  ABC transporter related  37.45 
 
 		 589 aa  370  1e-101  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0419  ABC transporter-related protein  34.57 
 
 		 608 aa  368  1e-100  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0718918 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  34.32 
 
 		 598 aa  366  1e-100  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0453  ATPase  32.57 
 
 		 614 aa  365  2e-99  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2351  ABC transporter related protein  35.83 
 
 		 581 aa  363  3e-99  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.589414  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1469  ABC transporter related protein  34.49 
 
 		 586 aa  361  2e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0422  ABC transporter related  32.8 
 
 		 613 aa  359  8e-98  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.333547  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1941  ABC transporter, transmembrane region  34.46 
 
 		 592 aa  358  1.9999999999999998e-97  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.121107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1954  ABC transporter related  35.92 
 
 		 578 aa  358  1.9999999999999998e-97  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1920  ABC transporter related  35.92 
 
 		 578 aa  358  1.9999999999999998e-97  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0641  ABC transporter related  35.03 
 
 		 577 aa  357  2.9999999999999997e-97  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.061779  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3262  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  32.94 
 
 		 764 aa  357  3.9999999999999996e-97  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  32.99 
 
 		 597 aa  356  7.999999999999999e-97  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2733  ABC transporter related  32.87 
 
 		 631 aa  355  1e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.021846  normal  0.190322 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2180  ABC transporter related  35.39 
 
 		 582 aa  355  1e-96  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0674  ABC transporter related  37.14 
 
 		 589 aa  354  2e-96  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2584  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  32.7 
 
 		 768 aa  354  2.9999999999999997e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1417  ABC transporter related  32.93 
 
 		 782 aa  353  2.9999999999999997e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.111222 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2497  ABC transporter related  33.7 
 
 		 614 aa  353  4e-96  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0435  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  31.66 
 
 		 586 aa  352  8.999999999999999e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.290198  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4080  ABC transporter related  32.59 
 
 		 814 aa  352  1e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.256448  normal  0.875845 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3967  ABC transporter related  32.59 
 
 		 768 aa  352  1e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2717  ABC transporter related  32.87 
 
 		 608 aa  352  1e-95  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1316  ABC transporter related  33.57 
 
 		 784 aa  351  2e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.512065  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2350  ABC transporter related protein  34.63 
 
 		 620 aa  352  2e-95  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1227  ABC transporter related  33.51 
 
 		 589 aa  350  3e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.175574 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6290  ABC transporter related protein  33.69 
 
 		 598 aa  351  3e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0584  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.66 
 
 		 586 aa  350  3e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0439  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  31.66 
 
 		 586 aa  350  5e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.214785  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0511  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.66 
 
 		 586 aa  350  5e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0337  ABC transporter related  33.73 
 
 		 582 aa  349  6e-95  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1201  ABC transporter related protein  30.76 
 
 		 594 aa  350  6e-95  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4793  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.49 
 
 		 586 aa  349  9e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.646278  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0583  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.49 
 
 		 586 aa  349  1e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5708  ABC transporter related  34.04 
 
 		 764 aa  349  1e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.920431  normal  0.127768 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1060  ABC transporter related  33.61 
 
 		 760 aa  348  1e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.120719  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0496  ABC transporter ATP-binding/permease  31.49 
 
 		 586 aa  348  2e-94  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.384636  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1761  ATPase  32.97 
 
 		 611 aa  348  2e-94  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.115592  normal  0.424794 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0528  ABC transporter permease/ATP-binding protein  31.49 
 
 		 586 aa  348  2e-94  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.249641  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0841  ABC transporter related  32.04 
 
 		 607 aa  347  3e-94  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0838  ABC transporter related  31.93 
 
 		 640 aa  347  3e-94  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0450  ABC transporter-related protein  32.88 
 
 		 586 aa  347  4e-94  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0669  ABC transporter related  34.97 
 
 		 588 aa  347  5e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.921203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0684  ABC transporter related  32.87 
 
 		 598 aa  345  1e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000210902  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0532  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.31 
 
 		 586 aa  345  1e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.117534  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0475  ABC transporter related  35.14 
 
 		 584 aa  345  1e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00181463  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1166  ABC transporter related protein  38.3 
 
 		 588 aa  345  1e-93  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0033  ABC transporter related protein  33.66 
 
 		 569 aa  344  2e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0313  ABC transporter, ATP-binding/membrane-spanning protein  33.8 
 
 		 590 aa  345  2e-93  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3025  ABC transporter related  33.1 
 
 		 582 aa  345  2e-93  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2619  ABC transporter related  35.37 
 
 		 578 aa  345  2e-93  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000800932  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3351  ABC transporter related  32.93 
 
 		 579 aa  344  2.9999999999999997e-93  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.773989  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0444  ABC transporter related  31.14 
 
 		 586 aa  343  4e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3979  ABC transporter-related protein  33.86 
 
 		 773 aa  343  4e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1007  ABC transporter related  32.59 
 
 		 784 aa  343  4e-93  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.29536 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0417  ABC transporter related  33.52 
 
 		 660 aa  343  4e-93  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_002936  DET1180  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.28 
 
 		 637 aa  343  5.999999999999999e-93  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1455  ABC transporter related  32.49 
 
 		 625 aa  343  7e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0466  ABC transporter related  36.29 
 
 		 588 aa  342  8e-93  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4763  ABC transporter related  32.76 
 
 		 591 aa  342  9e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.116722  normal  0.0159357 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2475  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.98 
 
 		 598 aa  342  1e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00961334  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2528  ABC transporter related  34.14 
 
 		 580 aa  342  1e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000757065  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1454  ABC transporter related  36.09 
 
 		 641 aa  342  1e-92  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0387  ABC transporter related  32.28 
 
 		 619 aa  342  1e-92  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.102241  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0133  ABC transporter, transmembrane region  33.62 
 
 		 613 aa  342  1e-92  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.260657  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1244  ABC transporter related  34.44 
 
 		 589 aa  341  2e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000217275  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2254  ABC transporter related  32.14 
 
 		 782 aa  342  2e-92  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3627  ABC transporter related  31.93 
 
 		 617 aa  341  2e-92  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4991  ABC transporter related  32.34 
 
 		 808 aa  341  2e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2539  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.16 
 
 		 598 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3231  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  32.69 
 
 		 572 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.659501  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4038  ABC transporter-related protein  32.76 
 
 		 726 aa  340  4e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000838789 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1192  ABC transporter related  32.24 
 
 		 625 aa  339  7e-92  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2505  ABC transporter related protein  32.09 
 
 		 607 aa  339  8e-92  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.152219  normal  0.502097 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0842  ABC transporter related  33.16 
 
 		 594 aa  339  8e-92  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0705  ABC transporter-related protein  33.1 
 
 		 784 aa  339  9e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0948  ABC transporter related  36.8 
 
 		 642 aa  339  9.999999999999999e-92  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.336517  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1262  ABC transporter related  32.62 
 
 		 644 aa  338  9.999999999999999e-92  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>