More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1429 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_1429  ABC transporter related  100 
 
 		 581 aa  1191    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3781  ABC transporter related  48.11 
 
 		 588 aa  627  1e-178  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000284212  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1250  ABC transporter, ATP-binding protein  45.16 
 
 		 604 aa  539  9.999999999999999e-153  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00143997 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1525  ABC transporter related  45.28 
 
 		 581 aa  532  1e-150  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.628149  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1539  multidrug ABC transporter ATPase/permease  42.46 
 
 		 636 aa  504  1e-141  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0047  ABC transporter related  41.54 
 
 		 580 aa  449  1e-125  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00438981  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2283  ABC transporter related  38.78 
 
 		 589 aa  451  1e-125  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0568  ABC transporter related  41.22 
 
 		 578 aa  432  1e-119  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1777  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  39.47 
 
 		 573 aa  420  1e-116  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00514902  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0018  ABC transporter related  40.38 
 
 		 581 aa  416  9.999999999999999e-116  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2719  ABC transporter related  37.63 
 
 		 606 aa  404  1e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  37.66 
 
 		 597 aa  393  1e-108  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2499  ABC transporter transmembrane region  37.69 
 
 		 601 aa  394  1e-108  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  37.66 
 
 		 597 aa  393  1e-108  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2618  ABC transporter related  36.2 
 
 		 617 aa  389  1e-107  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000100526  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  39.54 
 
 		 556 aa  392  1e-107  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2922  ABC transporter related protein  35.08 
 
 		 581 aa  386  1e-106  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.364865  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2180  ABC transporter related  38.85 
 
 		 582 aa  385  1e-105  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  34.14 
 
 		 598 aa  377  1e-103  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0544  ABC transporter related  33.99 
 
 		 587 aa  376  1e-103  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1166  ABC transporter related protein  38.75 
 
 		 588 aa  375  1e-103  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  35.24 
 
 		 575 aa  378  1e-103  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1761  ATPase  36.04 
 
 		 611 aa  370  1e-101  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.115592  normal  0.424794 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2539  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.39 
 
 		 598 aa  366  1e-100  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3626  ABC transporter related  36.7 
 
 		 588 aa  366  1e-100  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.058238  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2475  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.22 
 
 		 598 aa  365  1e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00961334  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0422  ABC transporter related  35.98 
 
 		 613 aa  364  2e-99  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.333547  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2333  ABC transporter-related protein  36.1 
 
 		 583 aa  363  3e-99  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000218217  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1941  ABC transporter, transmembrane region  37 
 
 		 592 aa  364  3e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.121107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2351  ABC transporter related protein  35.78 
 
 		 581 aa  363  4e-99  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.589414  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1192  ABC transporter related  33.91 
 
 		 625 aa  363  4e-99  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0387  ABC transporter related  36.44 
 
 		 619 aa  363  4e-99  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.102241  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12933  ATPase  35.24 
 
 		 585 aa  363  6e-99  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.756809  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2932  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.22 
 
 		 598 aa  362  1e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00230756 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1262  ABC transporter related  34.88 
 
 		 644 aa  361  2e-98  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1201  ABC transporter related protein  34.69 
 
 		 594 aa  360  4e-98  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1285  ABC transporter related protein  34.87 
 
 		 585 aa  360  5e-98  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.652863  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1514  ABC transporter, ATPase subunit  36.08 
 
 		 591 aa  359  7e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.143347  normal  0.756975 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2276  ABC transporter ATP-binding/permease  34.04 
 
 		 598 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.406907  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2236  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  34.04 
 
 		 598 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0563945  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2444  ABC transporter permease/ATP-binding protein  34.04 
 
 		 598 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.290529  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2350  ABC transporter related protein  33.39 
 
 		 620 aa  358  9.999999999999999e-98  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2460  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.04 
 
 		 598 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2401  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.86 
 
 		 598 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2200  ABC transporter related  34.71 
 
 		 592 aa  357  1.9999999999999998e-97  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.257555  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5496  ABC transporter related  40.42 
 
 		 598 aa  357  2.9999999999999997e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.311446  hitchhiker  0.0036652 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4923  ABC transporter related  34.52 
 
 		 593 aa  357  3.9999999999999996e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0406307 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0159  ABC transporter related  37.65 
 
 		 541 aa  356  5e-97  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2584  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  33.85 
 
 		 768 aa  356  5.999999999999999e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0444  ABC transporter related  32.82 
 
 		 586 aa  356  6.999999999999999e-97  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0637  ABC transporter related  35.31 
 
 		 770 aa  355  8.999999999999999e-97  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.57887  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2193  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  33.69 
 
 		 598 aa  355  1e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0325354  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0841  ABC transporter related  32.51 
 
 		 607 aa  355  1e-96  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0658  ABC transporter related  35.14 
 
 		 750 aa  355  1e-96  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0439  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  33.33 
 
 		 586 aa  354  2e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.214785  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0511  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.33 
 
 		 586 aa  354  2e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1782  ABC transporter-related protein  33.22 
 
 		 605 aa  355  2e-96  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.563719  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2616  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  32.69 
 
 		 577 aa  355  2e-96  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0639798  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0033  ABC transporter related protein  34.87 
 
 		 569 aa  354  2.9999999999999997e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3627  ABC transporter related  34.04 
 
 		 617 aa  353  4e-96  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0387  ABC transporter related  33.04 
 
 		 611 aa  353  4e-96  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.000000031667  normal  0.0347309 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0584  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.33 
 
 		 586 aa  353  4e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0435  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  33.51 
 
 		 586 aa  353  5e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.290198  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0532  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.99 
 
 		 586 aa  353  5.9999999999999994e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.117534  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0583  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.33 
 
 		 586 aa  353  7e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3967  ABC transporter related  34.49 
 
 		 768 aa  353  7e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4080  ABC transporter related  34.49 
 
 		 814 aa  353  7e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.256448  normal  0.875845 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4793  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.16 
 
 		 586 aa  353  7e-96  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.646278  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0496  ABC transporter ATP-binding/permease  33.16 
 
 		 586 aa  352  8e-96  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.384636  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0528  ABC transporter permease/ATP-binding protein  33.16 
 
 		 586 aa  352  8e-96  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.249641  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0418  ABC transporter related protein  32.86 
 
 		 600 aa  352  8e-96  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0948  ABC transporter related  37.69 
 
 		 642 aa  352  1e-95  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.336517  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5708  ABC transporter related  34.09 
 
 		 764 aa  352  1e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.920431  normal  0.127768 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1454  ABC transporter related  37.69 
 
 		 641 aa  352  1e-95  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2260  ABC transporter ATP-binding protein  33.91 
 
 		 571 aa  351  2e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1080  ABC transporter related  33.85 
 
 		 601 aa  351  2e-95  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169898 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1244  ABC transporter related  34.09 
 
 		 589 aa  351  2e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000217275  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0453  ATPase  34.63 
 
 		 614 aa  351  2e-95  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2619  ABC transporter related  35.71 
 
 		 578 aa  351  2e-95  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000800932  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0684  ABC transporter related  34.04 
 
 		 598 aa  351  3e-95  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000210902  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1469  ABC transporter related protein  33.04 
 
 		 586 aa  351  3e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0569  ABC transporter related  33.39 
 
 		 597 aa  350  4e-95  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2349  ABC transporter-related protein  35.26 
 
 		 571 aa  349  6e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0705  ABC transporter-related protein  35.24 
 
 		 784 aa  349  8e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0450  ABC transporter-related protein  32.99 
 
 		 586 aa  348  1e-94  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0495  ABC transporter related  35.54 
 
 		 603 aa  348  1e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3017  ABC transporter, transmembrane region  33.96 
 
 		 602 aa  348  1e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0138128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0419  ABC transporter-related protein  34.57 
 
 		 608 aa  348  1e-94  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0718918 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3231  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  35.31 
 
 		 572 aa  348  2e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.659501  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3262  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  33.57 
 
 		 764 aa  348  2e-94  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0642  ABC transporter related  36.24 
 
 		 620 aa  348  2e-94  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.014004  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3379  ABC transporter transmembrane region  33.92 
 
 		 646 aa  348  2e-94  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3366  ABC transporter related  34.89 
 
 		 583 aa  348  2e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000372221  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3549  ABC transporter related  34.08 
 
 		 614 aa  347  3e-94  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0722197 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2497  ABC transporter related  35.27 
 
 		 614 aa  347  4e-94  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3467  ABC transporter ATP-binding/permease  34.74 
 
 		 583 aa  346  5e-94  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000139825  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3433  ABC transporter, ATP-binding and permease protein  34.74 
 
 		 583 aa  346  5e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000702904  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3385  ABC transporter, ATP-binding and permease protein  34.74 
 
 		 583 aa  347  5e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000105585  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3741  ABC transporter permease/ATP-binding protein  34.74 
 
 		 583 aa  346  5e-94  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000316784  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2250  ABC transporter related  32.51 
 
 		 598 aa  347  5e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0582239  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>