More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0842 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_0842  ABC transporter related  100 
 
 
594 aa  1201    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2351  ABC transporter related protein  45.99 
 
 
581 aa  494  9.999999999999999e-139  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.589414  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0641  ABC transporter related  43.5 
 
 
577 aa  476  1e-133  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.061779  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2499  ABC transporter transmembrane region  43.03 
 
 
601 aa  451  1e-125  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2619  ABC transporter related  41.8 
 
 
578 aa  446  1.0000000000000001e-124  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000800932  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2719  ABC transporter related  43.22 
 
 
606 aa  444  1e-123  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0625  ABC transporter related  39.66 
 
 
577 aa  439  9.999999999999999e-123  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0650  ABC transporter related  39.66 
 
 
577 aa  439  1e-121  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.430432  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1454  ABC transporter related  45.69 
 
 
641 aa  429  1e-119  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0837  ABC transporter related  40.04 
 
 
575 aa  422  1e-117  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1501  ABC transporter, transmembrane region  39.44 
 
 
578 aa  422  1e-116  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.014393  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2474  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  39.41 
 
 
584 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.258083  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2538  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  39.97 
 
 
584 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.809201  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2275  ABC transporter ATP-binding/permease  39.69 
 
 
584 aa  418  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2235  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  39.69 
 
 
584 aa  418  9.999999999999999e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000997582  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2443  ABC transporter permease/ATP-binding protein  39.69 
 
 
584 aa  418  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.176104  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2470  ABC transporter related protein  39.86 
 
 
578 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2459  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  39.69 
 
 
584 aa  418  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2192  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  39.45 
 
 
584 aa  414  1e-114  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2734  ABC transporter related  39.41 
 
 
575 aa  412  1e-113  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0162284  normal  0.11621 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1343  ABC transporter related  39.62 
 
 
577 aa  406  1.0000000000000001e-112  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2933  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  39.69 
 
 
584 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000220217 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2400  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  39.58 
 
 
584 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1884  ABC transporter related protein  37.21 
 
 
578 aa  405  1e-111  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2249  ABC transporter related  38.89 
 
 
584 aa  402  1e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000569913  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0583  ABC transporter related  39.18 
 
 
583 aa  399  9.999999999999999e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2689  uncharacterized ABC transporter, ATPase component  39.61 
 
 
579 aa  400  9.999999999999999e-111  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00000000864453  normal  0.0786508 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0948  ABC transporter related  43.02 
 
 
642 aa  400  9.999999999999999e-111  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.336517  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1258  hypothetical protein  36.62 
 
 
578 aa  400  9.999999999999999e-111  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3626  ABC transporter related  39.16 
 
 
588 aa  398  1e-109  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.058238  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1941  ABC transporter, transmembrane region  40.94 
 
 
592 aa  394  1e-108  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.121107  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2278  ABC transporter related  38.78 
 
 
591 aa  390  1e-107  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0134  ABC transporter related  36.16 
 
 
574 aa  389  1e-107  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21680  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  36.67 
 
 
579 aa  388  1e-106  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3128  ABC transporter related protein  35.85 
 
 
576 aa  387  1e-106  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000595027  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0857  ABC transporter related  36.75 
 
 
577 aa  386  1e-106  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.641031  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2245  ABC transporter related  37.2 
 
 
582 aa  385  1e-106  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.767894  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1781  ABC transporter-related protein  37.84 
 
 
584 aa  385  1e-105  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0405926  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28710  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.06 
 
 
587 aa  382  1e-104  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0971  ABC transporter related  35.23 
 
 
577 aa  377  1e-103  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.474508 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1525  ABC transporter related  37.65 
 
 
581 aa  373  1e-102  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.628149  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1947  multidrug ABC transporter ATPase/permease  34.54 
 
 
652 aa  374  1e-102  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0369658  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1237  ABC transporter related  36.67 
 
 
583 aa  375  1e-102  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0631  ABC transporter related  37.88 
 
 
741 aa  373  1e-102  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00287092  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1191  ABC transporter related  37.24 
 
 
755 aa  374  1e-102  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0823  ABC transporter related  36.99 
 
 
589 aa  372  1e-101  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000224084  hitchhiker  0.000000643029 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0736  ABC transporter related  35.77 
 
 
578 aa  370  1e-101  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2014  ABC transporter related  36.06 
 
 
577 aa  372  1e-101  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000880254  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1385  ABC transporter related  36.95 
 
 
579 aa  365  1e-100  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000408144  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  36.73 
 
 
597 aa  367  1e-100  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0149  ABC transporter related  35.6 
 
 
584 aa  368  1e-100  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.29338  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0807  ABC transporter related  36.11 
 
 
577 aa  367  1e-100  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21640  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  36.68 
 
 
585 aa  366  1e-100  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0855  ABC transporter related  37.71 
 
 
755 aa  366  1e-100  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000335378  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2050  ABC transporter related protein  35.79 
 
 
581 aa  368  1e-100  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.382467  normal  0.714233 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0984  ABC transporter related  36.7 
 
 
741 aa  368  1e-100  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09400  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.5 
 
 
578 aa  365  1e-99  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.780202  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5936  ABC transporter related  36.19 
 
 
577 aa  364  3e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.960188  normal  0.0915983 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1338  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.73 
 
 
579 aa  363  5.0000000000000005e-99  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2251  ABC transporter related  35.61 
 
 
586 aa  363  5.0000000000000005e-99  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3639  ABC transporter related  35.64 
 
 
582 aa  362  7.0000000000000005e-99  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2432  ABC transporter related  37.22 
 
 
748 aa  363  7.0000000000000005e-99  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.143972  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3147  ABC transporter related protein  36.65 
 
 
581 aa  363  7.0000000000000005e-99  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000208385  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2312  ABC transporter transmembrane region  36.19 
 
 
577 aa  361  2e-98  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0984577  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2283  ABC transporter related  36.91 
 
 
589 aa  361  2e-98  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0578  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.94 
 
 
578 aa  360  3e-98  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3400  ABC transporter related  35.42 
 
 
573 aa  360  5e-98  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8741  carbohydrate ABC transporter  35.3 
 
 
577 aa  360  6e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0378  ABC transporter related  36.7 
 
 
577 aa  359  8e-98  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1179  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  37.65 
 
 
741 aa  358  9.999999999999999e-98  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.208335  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3356  ABC transporter related  34.94 
 
 
577 aa  358  9.999999999999999e-98  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0366  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.37 
 
 
577 aa  355  8.999999999999999e-97  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0363  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.54 
 
 
577 aa  356  8.999999999999999e-97  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.456127  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6413  ABC transporter related  36.38 
 
 
577 aa  354  2e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.637608  normal  0.411769 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0099  ABC transporter related  33.86 
 
 
575 aa  354  2.9999999999999997e-96  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000575789  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4440  ABC transporter-related protein  36.22 
 
 
594 aa  352  1e-95  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.153405  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  37.02 
 
 
598 aa  351  2e-95  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2168  ABC transporter related  36.8 
 
 
572 aa  350  5e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0385  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.33 
 
 
572 aa  349  7e-95  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0640638  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0569  ABC transporter related  34.55 
 
 
597 aa  348  1e-94  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1221  ABC transporter related protein  36.35 
 
 
576 aa  348  2e-94  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0421  ABC transporter related  36.04 
 
 
600 aa  347  3e-94  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0396  ABC transporter related protein  35.01 
 
 
574 aa  347  3e-94  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000464799  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3756  ABC transporter related  34.33 
 
 
581 aa  347  4e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0241948  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0202  ABC transporter related  35.39 
 
 
742 aa  345  8.999999999999999e-94  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000528171  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4564  ABC transporter related protein  35.07 
 
 
577 aa  345  1e-93  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1070  ABC transporter related protein  33.63 
 
 
582 aa  345  1e-93  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1691  ABC transporter related  35.31 
 
 
580 aa  345  1e-93  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0360  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.73 
 
 
580 aa  344  2e-93  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000217109  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1429  ABC transporter related  34.74 
 
 
581 aa  343  4e-93  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0525  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.51 
 
 
577 aa  342  1e-92  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0225728  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0494  uncharacterized ABC transporter, ATPase component  35.58 
 
 
765 aa  341  2e-92  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0506  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.58 
 
 
765 aa  341  2.9999999999999998e-92  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3781  ABC transporter related  33.16 
 
 
588 aa  339  8e-92  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000284212  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1711  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.9 
 
 
654 aa  338  1.9999999999999998e-91  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  35.74 
 
 
575 aa  338  1.9999999999999998e-91  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11299  drug ABC transporter ATP-binding protein  34.32 
 
 
582 aa  337  3.9999999999999995e-91  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27210  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.16 
 
 
578 aa  337  3.9999999999999995e-91  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1524  multidrug ABC transporter ATPase/permease  32.1 
 
 
623 aa  336  5.999999999999999e-91  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.833166  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3252  ABC transporter related  34.66 
 
 
577 aa  336  7e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.516071  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>