More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0568 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011661  Dtur_0568  ABC transporter related  100 
 
 		 578 aa  1160    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0018  ABC transporter related  44.85 
 
 		 581 aa  488  1e-136  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1777  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  44.14 
 
 		 573 aa  476  1e-133  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00514902  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1429  ABC transporter related  41.22 
 
 		 581 aa  432  1e-119  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1525  ABC transporter related  41.26 
 
 		 581 aa  419  1e-116  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.628149  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1250  ABC transporter, ATP-binding protein  38.65 
 
 		 604 aa  403  1e-111  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00143997 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3781  ABC transporter related  38.2 
 
 		 588 aa  405  1e-111  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000284212  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1539  multidrug ABC transporter ATPase/permease  37.7 
 
 		 636 aa  392  1e-108  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2283  ABC transporter related  36.67 
 
 		 589 aa  390  1e-107  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0047  ABC transporter related  38.43 
 
 		 580 aa  385  1e-105  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00438981  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2499  ABC transporter transmembrane region  36.61 
 
 		 601 aa  361  2e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  37.97 
 
 		 597 aa  359  6e-98  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  37.57 
 
 		 597 aa  359  7e-98  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2719  ABC transporter related  35.14 
 
 		 606 aa  357  2.9999999999999997e-97  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2180  ABC transporter related  38.38 
 
 		 582 aa  355  1e-96  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1201  ABC transporter related protein  35.59 
 
 		 594 aa  352  1e-95  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  37.26 
 
 		 556 aa  350  4e-95  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1166  ABC transporter related protein  38 
 
 		 588 aa  348  2e-94  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1941  ABC transporter, transmembrane region  37.27 
 
 		 592 aa  345  8.999999999999999e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.121107  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2618  ABC transporter related  35.27 
 
 		 617 aa  345  1e-93  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000100526  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2922  ABC transporter related protein  36.44 
 
 		 581 aa  342  1e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.364865  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12933  ATPase  37.9 
 
 		 585 aa  341  2e-92  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.756809  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0418  ABC transporter related protein  34.78 
 
 		 600 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6331  ABC transporter related protein  38.9 
 
 		 593 aa  337  1.9999999999999998e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2448  ABC transporter, ATP-binding  39.39 
 
 		 594 aa  338  1.9999999999999998e-91  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.946245 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2282  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.43 
 
 		 566 aa  338  1.9999999999999998e-91  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2351  ABC transporter related protein  32.52 
 
 		 581 aa  337  3.9999999999999995e-91  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.589414  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2580  ABC transporter, ATP-binding protein/permease protein  36.08 
 
 		 566 aa  337  5e-91  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3231  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  35.42 
 
 		 572 aa  335  1e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.659501  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0337  ABC transporter related  34.72 
 
 		 582 aa  335  1e-90  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5496  ABC transporter related  34.48 
 
 		 598 aa  335  2e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.311446  hitchhiker  0.0036652 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3626  ABC transporter related  36.08 
 
 		 588 aa  334  2e-90  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.058238  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0642  ABC transporter related  36.16 
 
 		 620 aa  334  3e-90  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.014004  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1706  ABC transporter related  37.98 
 
 		 586 aa  333  5e-90  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000217452  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2628  ABC transporter related  38.09 
 
 		 583 aa  333  7.000000000000001e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2616  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  33.9 
 
 		 577 aa  333  7.000000000000001e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0639798  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0674  ABC transporter related  37.76 
 
 		 589 aa  331  2e-89  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0387  ABC transporter related  34.79 
 
 		 611 aa  331  2e-89  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.000000031667  normal  0.0347309 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1597  ABC transporter related  34.9 
 
 		 583 aa  332  2e-89  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0825  ABC transporter related  35.75 
 
 		 575 aa  331  3e-89  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  33.57 
 
 		 598 aa  330  6e-89  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0416  cyclic nucleotide-binding protein  34.17 
 
 		 600 aa  330  6e-89  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1890  ABC transporter related  36.2 
 
 		 586 aa  328  1.0000000000000001e-88  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0664725  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  34.33 
 
 		 597 aa  328  2.0000000000000001e-88  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2528  ABC transporter related  34.31 
 
 		 580 aa  328  2.0000000000000001e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000757065  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2181  ABC transporter related  36.08 
 
 		 600 aa  328  2.0000000000000001e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4923  ABC transporter related  36.73 
 
 		 593 aa  328  2.0000000000000001e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0406307 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0544  ABC transporter related  34.24 
 
 		 587 aa  327  3e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0505  hypothetical protein  36.81 
 
 		 606 aa  327  3e-88  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3627  ABC transporter related  32.06 
 
 		 617 aa  327  4.0000000000000003e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1502  ATPase  36.84 
 
 		 587 aa  327  4.0000000000000003e-88  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0313  ABC transporter, ATP-binding/membrane-spanning protein  34.9 
 
 		 590 aa  327  4.0000000000000003e-88  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1057  ABC transporter related  38.62 
 
 		 583 aa  327  4.0000000000000003e-88  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1327  ATPase  36.71 
 
 		 604 aa  325  2e-87  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.0000000155487  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  33.56 
 
 		 575 aa  324  2e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0684  ABC transporter related  32.46 
 
 		 598 aa  324  3e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000210902  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1080  ABC transporter related  32.59 
 
 		 601 aa  323  4e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169898 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3226  ABC transporter-related protein  33.97 
 
 		 579 aa  323  4e-87  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0475  ABC transporter related  35.62 
 
 		 584 aa  323  4e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00181463  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1454  ABC transporter related  37.01 
 
 		 641 aa  323  5e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2932  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.69 
 
 		 598 aa  323  5e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00230756 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0569  ABC transporter related  34.9 
 
 		 597 aa  323  8e-87  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0419  ABC transporter-related protein  35.43 
 
 		 608 aa  323  8e-87  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0718918 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0948  ABC transporter related  35.82 
 
 		 642 aa  322  9.000000000000001e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.336517  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2401  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.34 
 
 		 598 aa  322  9.000000000000001e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2733  ABC transporter related  33.5 
 
 		 631 aa  322  9.000000000000001e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.021846  normal  0.190322 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1390  ABC transporter related  32.58 
 
 		 602 aa  322  9.999999999999999e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.838756  normal  0.671981 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2836  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  33.97 
 
 		 585 aa  322  9.999999999999999e-87  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.333651  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0641  ABC transporter related  35.19 
 
 		 577 aa  320  5e-86  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.061779  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0839  ABC transporter-related protein  37.27 
 
 		 585 aa  319  7.999999999999999e-86  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.677417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2371  ABC transporter, ATPase subunit  34.17 
 
 		 622 aa  319  9e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0842  ABC transporter related  35.59 
 
 		 594 aa  319  1e-85  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1259  ATP-binding transport protein; multicopy suppressor of HtrB  32.18 
 
 		 579 aa  318  2e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0444  ABC transporter related  33.39 
 
 		 586 aa  318  2e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3351  ABC transporter related  34.76 
 
 		 579 aa  317  3e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.773989  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1540  multidrug ABC transporter ATPase/permease  32.99 
 
 		 602 aa  317  3e-85  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.652681  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2497  ABC transporter related  33.45 
 
 		 614 aa  317  3e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0673  ABC transporter related  36.02 
 
 		 650 aa  316  6e-85  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0082  ATPase  34.91 
 
 		 582 aa  316  6e-85  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2539  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.39 
 
 		 598 aa  316  7e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2475  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.39 
 
 		 598 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00961334  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2189  ABC transporter related protein  32.24 
 
 		 572 aa  315  9.999999999999999e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.480877  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0017  ABC transporter related  34.34 
 
 		 593 aa  315  9.999999999999999e-85  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2717  ABC transporter related  32.24 
 
 		 608 aa  313  3.9999999999999997e-84  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2333  ABC transporter-related protein  33.96 
 
 		 583 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000218217  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1896  ABC transporter related  31.71 
 
 		 572 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.332587  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0033  ABC transporter related protein  35.1 
 
 		 569 aa  313  3.9999999999999997e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0450  ABC transporter-related protein  35.69 
 
 		 586 aa  313  4.999999999999999e-84  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1469  ABC transporter related protein  32.81 
 
 		 586 aa  313  6.999999999999999e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0532  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.39 
 
 		 586 aa  313  6.999999999999999e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.117534  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0511  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.39 
 
 		 586 aa  313  7.999999999999999e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0439  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  33.39 
 
 		 586 aa  313  7.999999999999999e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.214785  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0435  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  33.39 
 
 		 586 aa  312  7.999999999999999e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.290198  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3501  ABC transporter related  34.65 
 
 		 575 aa  312  9e-84  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1514  ABC transporter, ATPase subunit  34.26 
 
 		 591 aa  312  9e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.143347  normal  0.756975 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0583  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.56 
 
 		 586 aa  312  1e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2350  ABC transporter related protein  35.35 
 
 		 620 aa  311  1e-83  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2627  ABC transporter related  34.15 
 
 		 592 aa  312  1e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0584  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.39 
 
 		 586 aa  312  1e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3466  ABC transporter ATP-binding/permease  34.5 
 
 		 587 aa  311  2e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.197712  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>