More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4763 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1227  ABC transporter related  51.2 
 
 		 589 aa  648    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.175574 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1469  ABC transporter related protein  78.97 
 
 		 586 aa  956    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0669  ABC transporter related  57.19 
 
 		 588 aa  687    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.921203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0313  ABC transporter, ATP-binding/membrane-spanning protein  58.16 
 
 		 590 aa  694    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4763  ABC transporter related  100 
 
 		 591 aa  1207    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.116722  normal  0.0159357 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0047  ABC transporter-like protein  49.74 
 
 		 586 aa  624  1e-177  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.99996 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13518  ATPase  48.88 
 
 		 587 aa  597  1e-169  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0335  ABC transporter transmembrane region  47.2 
 
 		 588 aa  568  1e-161  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1761  ATPase  46.23 
 
 		 611 aa  566  1e-160  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.115592  normal  0.424794 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0422  ABC transporter related  47.04 
 
 		 613 aa  565  1e-160  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.333547  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0418  ABC transporter related protein  46.58 
 
 		 600 aa  565  1.0000000000000001e-159  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0453  ATPase  44.91 
 
 		 614 aa  560  1e-158  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4668  ABC transporter, transmembrane region  45.5 
 
 		 584 aa  557  1e-157  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1201  ABC transporter related protein  44.2 
 
 		 594 aa  552  1e-156  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0387  ABC transporter related  44.77 
 
 		 611 aa  553  1e-156  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.000000031667  normal  0.0347309 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0387  ABC transporter related  46.3 
 
 		 619 aa  555  1e-156  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.102241  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0419  ABC transporter-related protein  45.99 
 
 		 608 aa  540  9.999999999999999e-153  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0718918 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0318  ABC transporter related  43.05 
 
 		 603 aa  531  1e-149  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2181  ABC transporter related  44.48 
 
 		 600 aa  509  1e-143  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2371  ABC transporter, ATPase subunit  40.79 
 
 		 622 aa  500  1e-140  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2627  ABC transporter related  40.31 
 
 		 592 aa  475  1e-133  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0034  ABC transporter related protein  38.89 
 
 		 603 aa  477  1e-133  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3416  ABC transporter-related protein  39.52 
 
 		 602 aa  472  1e-132  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0160  ABC transporter related  39.17 
 
 		 616 aa  473  1e-132  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2613  ABC transporter, transmembrane region  38.98 
 
 		 625 aa  474  1e-132  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.200186  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0494  ABC transporter related  38.34 
 
 		 611 aa  473  1e-132  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0101  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  39.86 
 
 		 592 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0801  ABC transporter-like protein  36.72 
 
 		 635 aa  470  1.0000000000000001e-131  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.678319 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0648  ABC transporter related  40.49 
 
 		 623 aa  469  1.0000000000000001e-131  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.986523 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1250  ABC transporter related  37.71 
 
 		 610 aa  469  1.0000000000000001e-131  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0033  ABC transporter related  38.45 
 
 		 602 aa  467  9.999999999999999e-131  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2505  ABC transporter related protein  38.12 
 
 		 607 aa  466  9.999999999999999e-131  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.152219  normal  0.502097 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  39.79 
 
 		 597 aa  451  1e-125  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0443  ABC transporter related  38.95 
 
 		 588 aa  442  9.999999999999999e-123  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000201252  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2497  ABC transporter related  37.46 
 
 		 614 aa  440  9.999999999999999e-123  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0673  ABC transporter related  43.69 
 
 		 650 aa  439  9.999999999999999e-123  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2717  ABC transporter related  38.14 
 
 		 608 aa  437  1e-121  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3714  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  40.21 
 
 		 587 aa  432  1e-120  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.207401  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3786  ABC transporter  39.51 
 
 		 587 aa  432  1e-120  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.469191  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3719  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  40.21 
 
 		 587 aa  431  1e-119  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3466  ABC transporter ATP-binding/permease  39.69 
 
 		 587 aa  428  1e-118  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.197712  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3432  ABC transporter, ATP-binding protein  39.51 
 
 		 587 aa  426  1e-118  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000147455  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3384  ABC transporter, ATP-binding protein  39.51 
 
 		 587 aa  427  1e-118  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.603869  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3695  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  39.69 
 
 		 587 aa  428  1e-118  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000106018 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3740  ABC transporter permease/ATP-binding protein  39.69 
 
 		 587 aa  428  1e-118  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.037622  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2332  ABC transporter-related protein  39.34 
 
 		 587 aa  427  1e-118  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000229781  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1528  ABC transporter, transmembrane region  39.34 
 
 		 587 aa  428  1e-118  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00299054  normal  0.0159788 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3365  ABC transporter related  40.42 
 
 		 587 aa  420  1e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000714306  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1359  ABC transporter related  38.89 
 
 		 608 aa  421  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3067  ABC transporter related  35.62 
 
 		 621 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.134342  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3627  ABC transporter related  37.09 
 
 		 617 aa  418  9.999999999999999e-116  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2618  ABC transporter related  37.22 
 
 		 617 aa  417  9.999999999999999e-116  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000100526  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0048  ABC transporter related  36 
 
 		 598 aa  413  1e-114  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000163685  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0569  ABC transporter related  36.36 
 
 		 597 aa  413  1e-114  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2282  ABC transporter related  37.7 
 
 		 609 aa  411  1e-113  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19280  ABC transporter related  36.29 
 
 		 609 aa  410  1e-113  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  35.92 
 
 		 597 aa  410  1e-113  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  35.92 
 
 		 597 aa  410  1e-113  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0545  ABC transporter related  37.24 
 
 		 602 aa  409  1e-113  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0017  ABC transporter related  38.48 
 
 		 593 aa  408  1.0000000000000001e-112  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1776  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.91 
 
 		 589 aa  409  1.0000000000000001e-112  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184019  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2306  ABC transporter related  37.24 
 
 		 610 aa  402  1e-111  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.306403 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3376  ABC transporter related  42 
 
 		 610 aa  402  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1920  ABC transporter related  36.35 
 
 		 578 aa  399  9.999999999999999e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1385  ABC transporter related  40.95 
 
 		 622 aa  399  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0902  ABC transporter related  37.41 
 
 		 579 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00896089  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0880  ABC transporter related  37.41 
 
 		 579 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000184481  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2726  ABC transporter related  42 
 
 		 610 aa  401  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1954  ABC transporter related  36.35 
 
 		 578 aa  399  9.999999999999999e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3872  ABC transporter related  36.98 
 
 		 585 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3782  ABC transporter related  37.67 
 
 		 594 aa  401  9.999999999999999e-111  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.91836  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1430  ABC transporter related  36.13 
 
 		 592 aa  397  1e-109  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1942  ABC transporter, transmembrane region  37.41 
 
 		 594 aa  397  1e-109  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1382  ABC transporter related  35.25 
 
 		 578 aa  394  1e-108  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.372914  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1455  ABC transporter related  38.02 
 
 		 625 aa  392  1e-108  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1540  multidrug ABC transporter ATPase/permease  36.25 
 
 		 602 aa  393  1e-108  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.652681  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1285  ABC transporter related protein  34.1 
 
 		 585 aa  393  1e-108  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.652863  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1390  ABC transporter related  35.9 
 
 		 602 aa  395  1e-108  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.838756  normal  0.671981 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1403  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.81 
 
 		 578 aa  391  1e-107  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  34.66 
 
 		 598 aa  391  1e-107  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1305  ABC transporter related  38.79 
 
 		 598 aa  390  1e-107  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1656  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  38.42 
 
 		 581 aa  389  1e-107  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2126  ABC transporter related protein  38.29 
 
 		 592 aa  389  1e-107  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2475  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.91 
 
 		 598 aa  387  1e-106  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00961334  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2921  ABC transporter related protein  36.67 
 
 		 636 aa  388  1e-106  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2669  ABC transporter related  35.69 
 
 		 637 aa  385  1e-106  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.871518  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2254  ABC transporter related  35.69 
 
 		 592 aa  387  1e-106  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0282  ABC transporter related protein  37.12 
 
 		 600 aa  385  1e-105  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1249  ABC transporter, ATP-binding protein  34.6 
 
 		 598 aa  382  1e-105  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159778 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1245  ABC transporter related  36.43 
 
 		 594 aa  385  1e-105  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00497584  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2401  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.39 
 
 		 598 aa  380  1e-104  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2539  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.39 
 
 		 598 aa  380  1e-104  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0289  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  34.68 
 
 		 600 aa  380  1e-104  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3813  ABC transporter related protein  35.71 
 
 		 642 aa  380  1e-104  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.206928  normal  0.202717 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7144  ABC transporter related  34.63 
 
 		 632 aa  379  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0461  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.44 
 
 		 579 aa  378  1e-103  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2932  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.04 
 
 		 598 aa  378  1e-103  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00230756 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2616  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  35.13 
 
 		 577 aa  376  1e-103  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0639798  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5995  ABC transporter related  35.58 
 
 		 632 aa  377  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.210924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0963  ABC transporter related  34.84 
 
 		 599 aa  375  1e-102  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.798601  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>