More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_3416 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0101  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  81.03 
 
 		 592 aa  946    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0160  ABC transporter related  75.32 
 
 		 616 aa  900    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0034  ABC transporter related protein  70.74 
 
 		 603 aa  862    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3067  ABC transporter related  60.39 
 
 		 621 aa  661    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.134342  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3416  ABC transporter-related protein  100 
 
 		 602 aa  1201    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0033  ABC transporter related  69.7 
 
 		 602 aa  852    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2613  ABC transporter, transmembrane region  62.91 
 
 		 625 aa  756    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.200186  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1201  ABC transporter related protein  48.48 
 
 		 594 aa  587  1e-166  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2371  ABC transporter, ATPase subunit  46.38 
 
 		 622 aa  552  1e-156  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0418  ABC transporter related protein  45.79 
 
 		 600 aa  529  1e-149  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0387  ABC transporter related  45.38 
 
 		 611 aa  526  1e-148  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.000000031667  normal  0.0347309 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0422  ABC transporter related  43.72 
 
 		 613 aa  519  1e-146  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.333547  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1761  ATPase  43.59 
 
 		 611 aa  520  1e-146  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.115592  normal  0.424794 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0453  ATPase  42.59 
 
 		 614 aa  520  1e-146  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0318  ABC transporter related  43.84 
 
 		 603 aa  514  1e-144  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0387  ABC transporter related  43.46 
 
 		 619 aa  512  1e-144  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.102241  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2181  ABC transporter related  42.76 
 
 		 600 aa  509  1e-143  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0419  ABC transporter-related protein  44.69 
 
 		 608 aa  508  1e-143  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0718918 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0494  ABC transporter related  45.8 
 
 		 611 aa  498  1e-139  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2627  ABC transporter related  45.39 
 
 		 592 aa  494  9.999999999999999e-139  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1469  ABC transporter related protein  40.54 
 
 		 586 aa  482  1e-135  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3813  ABC transporter related protein  45.44 
 
 		 642 aa  480  1e-134  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.206928  normal  0.202717 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1250  ABC transporter related  44.83 
 
 		 610 aa  480  1e-134  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2505  ABC transporter related protein  41.63 
 
 		 607 aa  476  1e-133  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.152219  normal  0.502097 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4763  ABC transporter related  39.52 
 
 		 591 aa  475  1e-133  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.116722  normal  0.0159357 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0801  ABC transporter-like protein  40.41 
 
 		 635 aa  477  1e-133  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.678319 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0039  putative ATP-binding component of a transport system  46.34 
 
 		 588 aa  473  1e-132  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0738965  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0313  ABC transporter, ATP-binding/membrane-spanning protein  39.39 
 
 		 590 aa  463  1e-129  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13518  ATPase  40.37 
 
 		 587 aa  462  1e-129  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0669  ABC transporter related  40.68 
 
 		 588 aa  462  1e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.921203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0648  ABC transporter related  42.05 
 
 		 623 aa  454  1.0000000000000001e-126  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.986523 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1227  ABC transporter related  38.51 
 
 		 589 aa  450  1e-125  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.175574 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1390  ABC transporter related  41.76 
 
 		 602 aa  447  1.0000000000000001e-124  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.838756  normal  0.671981 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0443  ABC transporter related  38.53 
 
 		 588 aa  445  1e-123  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000201252  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2726  ABC transporter related  41.43 
 
 		 610 aa  439  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3376  ABC transporter related  41.6 
 
 		 610 aa  440  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1359  ABC transporter related  41.28 
 
 		 608 aa  437  1e-121  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3627  ABC transporter related  42.23 
 
 		 617 aa  435  1e-121  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0673  ABC transporter related  44.69 
 
 		 650 aa  438  1e-121  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0335  ABC transporter transmembrane region  40.41 
 
 		 588 aa  436  1e-121  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1245  ABC transporter related  38.49 
 
 		 594 aa  429  1e-119  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00497584  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  38.07 
 
 		 597 aa  431  1e-119  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0047  ABC transporter-like protein  36.71 
 
 		 586 aa  429  1e-119  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.99996 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4668  ABC transporter, transmembrane region  37.69 
 
 		 584 aa  432  1e-119  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2497  ABC transporter related  41.55 
 
 		 614 aa  427  1e-118  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4342  ABC transporter, transmembrane region  41.88 
 
 		 626 aa  424  1e-117  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.441734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1467  ABC transporter related  39.9 
 
 		 603 aa  424  1e-117  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000245046  normal  0.820859 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3786  ABC transporter  36.72 
 
 		 587 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.469191  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3384  ABC transporter, ATP-binding protein  37.31 
 
 		 587 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.603869  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2126  ABC transporter related protein  39.07 
 
 		 592 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3714  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  37.13 
 
 		 587 aa  414  1e-114  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.207401  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3466  ABC transporter ATP-binding/permease  37.13 
 
 		 587 aa  414  1e-114  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.197712  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3432  ABC transporter, ATP-binding protein  37.13 
 
 		 587 aa  415  1e-114  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000147455  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3740  ABC transporter permease/ATP-binding protein  37.13 
 
 		 587 aa  414  1e-114  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.037622  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3695  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  37.13 
 
 		 587 aa  414  1e-114  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000106018 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2306  ABC transporter related  38.79 
 
 		 610 aa  414  1e-114  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.306403 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1528  ABC transporter, transmembrane region  36.38 
 
 		 587 aa  413  1e-114  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00299054  normal  0.0159788 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1385  ABC transporter related  42.41 
 
 		 622 aa  412  1e-114  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3872  ABC transporter related  38.54 
 
 		 585 aa  411  1e-113  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3035  ABC transporter-like protein protein  39.11 
 
 		 626 aa  409  1e-113  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3719  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.96 
 
 		 587 aa  412  1e-113  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2717  ABC transporter related  40.71 
 
 		 608 aa  406  1.0000000000000001e-112  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2332  ABC transporter-related protein  36.68 
 
 		 587 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000229781  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3365  ABC transporter related  37.44 
 
 		 587 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000714306  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19280  ABC transporter related  36.6 
 
 		 609 aa  405  1e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1285  ABC transporter related protein  40.79 
 
 		 585 aa  402  1e-111  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.652863  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2669  ABC transporter related  39.17 
 
 		 637 aa  405  1e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.871518  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0048  ABC transporter related  37.93 
 
 		 598 aa  400  9.999999999999999e-111  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000163685  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0782  ATPase  38.95 
 
 		 598 aa  397  1e-109  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.461775 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1382  ABC transporter related  36.69 
 
 		 578 aa  399  1e-109  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.372914  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7144  ABC transporter related  38.83 
 
 		 632 aa  399  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5995  ABC transporter related  39.17 
 
 		 632 aa  395  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.210924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0963  ABC transporter related  36.99 
 
 		 599 aa  394  1e-108  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.798601  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1430  ABC transporter related  36.87 
 
 		 592 aa  394  1e-108  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1942  ABC transporter, transmembrane region  38.87 
 
 		 594 aa  392  1e-108  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2254  ABC transporter related  37.63 
 
 		 592 aa  391  1e-107  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3227  ABC transporter-related protein  38.85 
 
 		 675 aa  387  1e-106  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1776  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.73 
 
 		 589 aa  389  1e-106  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184019  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5528  ABC transporter related protein  38.8 
 
 		 614 aa  383  1e-105  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2618  ABC transporter related  34.78 
 
 		 617 aa  379  1e-104  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000100526  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0461  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.65 
 
 		 579 aa  380  1e-104  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0282  ABC transporter related protein  39.32 
 
 		 600 aa  380  1e-104  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0902  ABC transporter related  37.52 
 
 		 579 aa  379  1e-104  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00896089  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1455  ABC transporter related  36.88 
 
 		 625 aa  379  1e-104  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  36.77 
 
 		 597 aa  382  1e-104  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2921  ABC transporter related protein  40.03 
 
 		 636 aa  380  1e-104  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0880  ABC transporter related  37.52 
 
 		 579 aa  379  1e-104  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000184481  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  36.77 
 
 		 597 aa  381  1e-104  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1275  ABC transporter related protein  38.24 
 
 		 576 aa  381  1e-104  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3126  ABC transporter related  45.01 
 
 		 592 aa  379  1e-104  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0841  ABC transporter related  37.5 
 
 		 607 aa  381  1e-104  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2848  ABC transporter related  37.42 
 
 		 606 aa  380  1e-104  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0334718  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3782  ABC transporter related  35.3 
 
 		 594 aa  378  1e-103  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.91836  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0569  ABC transporter related  35.67 
 
 		 597 aa  377  1e-103  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0444  ABC transporter related  35.08 
 
 		 586 aa  379  1e-103  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2350  ABC transporter related protein  40 
 
 		 620 aa  374  1e-102  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2282  ABC transporter related  38.82 
 
 		 609 aa  374  1e-102  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  39.39 
 
 		 598 aa  374  1e-102  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0583  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.25 
 
 		 586 aa  369  1e-101  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1520  ABC transporter related  38.01 
 
 		 597 aa  371  1e-101  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.887648  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>