More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3782 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_3782  ABC transporter related  100 
 
 
594 aa  1211    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.91836  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1430  ABC transporter related  57.5 
 
 
592 aa  690    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  50.25 
 
 
597 aa  615  1e-175  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1540  multidrug ABC transporter ATPase/permease  50.25 
 
 
602 aa  605  9.999999999999999e-173  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.652681  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1249  ABC transporter, ATP-binding protein  47.55 
 
 
598 aa  561  1e-158  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159778 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0569  ABC transporter related  45.28 
 
 
597 aa  531  1e-149  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2282  ABC transporter related  44.44 
 
 
609 aa  531  1e-149  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0017  ABC transporter related  44.58 
 
 
593 aa  516  1.0000000000000001e-145  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1776  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  45.67 
 
 
589 aa  514  1e-144  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184019  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0048  ABC transporter related  42.15 
 
 
598 aa  484  1e-135  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000163685  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1201  ABC transporter related protein  40.75 
 
 
594 aa  459  9.999999999999999e-129  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3627  ABC transporter related  40.41 
 
 
617 aa  436  1e-121  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0642  ABC transporter related  42.46 
 
 
620 aa  428  1e-118  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.014004  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2717  ABC transporter related  40.79 
 
 
608 aa  428  1e-118  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2181  ABC transporter related  39.86 
 
 
600 aa  419  1e-116  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2618  ABC transporter related  38.42 
 
 
617 aa  421  1e-116  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000100526  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2350  ABC transporter related protein  39.65 
 
 
620 aa  421  1e-116  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2497  ABC transporter related  38.93 
 
 
614 aa  419  1e-116  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0418  ABC transporter related protein  38.58 
 
 
600 aa  409  1e-113  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2690  multidrug resistance ABC transporter  41.01 
 
 
615 aa  410  1e-113  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0586583  normal  0.13127 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19280  ABC transporter related  37.1 
 
 
609 aa  410  1e-113  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2669  ABC transporter related  38.29 
 
 
637 aa  410  1e-113  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.871518  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2475  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  37.59 
 
 
598 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00961334  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2539  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  37.87 
 
 
598 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2401  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  38.05 
 
 
598 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2932  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  37.87 
 
 
598 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00230756 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13518  ATPase  36.81 
 
 
587 aa  403  1e-111  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2193  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  37.71 
 
 
598 aa  403  1e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0325354  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1942  ABC transporter, transmembrane region  38.92 
 
 
594 aa  403  1e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0494  ABC transporter related  35.91 
 
 
611 aa  405  1e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2627  ABC transporter related  37.33 
 
 
592 aa  402  1e-111  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2276  ABC transporter ATP-binding/permease  37.54 
 
 
598 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.406907  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2236  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  37.54 
 
 
598 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0563945  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2444  ABC transporter permease/ATP-binding protein  37.54 
 
 
598 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.290529  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2460  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  37.54 
 
 
598 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0949  ABC transporter related  42.42 
 
 
625 aa  400  9.999999999999999e-111  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.128787  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0841  ABC transporter related  36.7 
 
 
607 aa  400  9.999999999999999e-111  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2781  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.85 
 
 
609 aa  399  1e-109  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000466613  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0335  ABC transporter transmembrane region  36.93 
 
 
588 aa  396  1e-109  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2505  ABC transporter related protein  33.67 
 
 
607 aa  393  1e-108  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.152219  normal  0.502097 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2250  ABC transporter related  38.39 
 
 
598 aa  394  1e-108  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0582239  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2921  ABC transporter related protein  37 
 
 
636 aa  395  1e-108  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1250  ABC transporter related  36.63 
 
 
610 aa  393  1e-108  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5995  ABC transporter related  36.05 
 
 
632 aa  391  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.210924  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4763  ABC transporter related  37.67 
 
 
591 aa  390  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.116722  normal  0.0159357 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1761  ATPase  37.35 
 
 
611 aa  392  1e-107  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.115592  normal  0.424794 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2471  ABC transporter related protein  36.06 
 
 
600 aa  391  1e-107  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0387  ABC transporter related  37.37 
 
 
611 aa  389  1e-107  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.000000031667  normal  0.0347309 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1455  ABC transporter related  36.99 
 
 
625 aa  390  1e-107  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7144  ABC transporter related  35.88 
 
 
632 aa  391  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1227  ABC transporter related  36.04 
 
 
589 aa  387  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.175574 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0422  ABC transporter related  37.89 
 
 
613 aa  387  1e-106  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.333547  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0313  ABC transporter, ATP-binding/membrane-spanning protein  37.39 
 
 
590 aa  389  1e-106  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1342  ABC transporter related  39.88 
 
 
671 aa  387  1e-106  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0419  ABC transporter-related protein  39.26 
 
 
608 aa  386  1e-106  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0718918 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  36.95 
 
 
597 aa  388  1e-106  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  36.95 
 
 
597 aa  388  1e-106  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4668  ABC transporter, transmembrane region  36.46 
 
 
584 aa  389  1e-106  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1469  ABC transporter related protein  35.76 
 
 
586 aa  382  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0034  ABC transporter related protein  35.23 
 
 
603 aa  382  1e-105  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1782  ABC transporter-related protein  36.65 
 
 
605 aa  382  1e-105  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.563719  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2371  ABC transporter, ATPase subunit  34.55 
 
 
622 aa  383  1e-105  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2169  ABC transporter related  40.69 
 
 
620 aa  380  1e-104  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0453  ATPase  37.02 
 
 
614 aa  381  1e-104  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0033  ABC transporter related  35.13 
 
 
602 aa  381  1e-104  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0387  ABC transporter related  37.24 
 
 
619 aa  380  1e-104  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.102241  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0443  ABC transporter related  37.63 
 
 
588 aa  380  1e-104  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000201252  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0669  ABC transporter related  37.26 
 
 
588 aa  379  1e-103  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.921203  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2613  ABC transporter, transmembrane region  34.7 
 
 
625 aa  379  1e-103  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.200186  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1885  ABC transporter related protein  35.59 
 
 
618 aa  377  1e-103  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0801  ABC transporter-like protein  32.8 
 
 
635 aa  375  1e-102  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.678319 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0397  ABC transporter related protein  36.85 
 
 
586 aa  373  1e-102  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000282557  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0133  ABC transporter, transmembrane region  35.1 
 
 
613 aa  372  1e-102  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.260657  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1245  ABC transporter related  36.18 
 
 
594 aa  373  1e-102  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00497584  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2246  ABC transporter related  34.51 
 
 
650 aa  373  1e-102  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0856  ABC transporter related  36.63 
 
 
626 aa  373  1e-102  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0101  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.1 
 
 
592 aa  372  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0684  ABC transporter related  34.6 
 
 
598 aa  371  1e-101  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000210902  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3416  ABC transporter-related protein  35.3 
 
 
602 aa  372  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3786  ABC transporter  34.72 
 
 
587 aa  371  1e-101  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.469191  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1386  ABC transporter related  35.91 
 
 
629 aa  371  1e-101  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000285289  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0348  ABC transporter related  39.47 
 
 
663 aa  367  1e-100  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.768573 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0673  ABC transporter related  41.51 
 
 
650 aa  365  1e-100  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0507  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.64 
 
 
618 aa  368  1e-100  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0495  uncharacterized ABC transporter, ATPase component  36.64 
 
 
618 aa  366  1e-100  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1528  ABC transporter, transmembrane region  34.55 
 
 
587 aa  367  1e-100  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00299054  normal  0.0159788 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1520  ABC transporter related  36.44 
 
 
597 aa  369  1e-100  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.887648  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0160  ABC transporter related  33.83 
 
 
616 aa  365  1e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  35.21 
 
 
556 aa  364  2e-99  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3466  ABC transporter ATP-binding/permease  34.61 
 
 
587 aa  364  2e-99  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.197712  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3695  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.61 
 
 
587 aa  364  2e-99  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000106018 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3432  ABC transporter, ATP-binding protein  34.61 
 
 
587 aa  364  2e-99  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000147455  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3384  ABC transporter, ATP-binding protein  34.43 
 
 
587 aa  364  2e-99  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.603869  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0475  ABC transporter related  38.62 
 
 
584 aa  364  2e-99  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00181463  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3740  ABC transporter permease/ATP-binding protein  34.61 
 
 
587 aa  364  2e-99  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.037622  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1227  ABC transporter related  34.38 
 
 
619 aa  363  3e-99  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.141283  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2733  ABC transporter related  34.48 
 
 
631 aa  363  3e-99  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.021846  normal  0.190322 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0584  ABC transporter transmembrane region  36.25 
 
 
582 aa  363  4e-99  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.321607  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4444  ABC transporter related  34.15 
 
 
610 aa  363  4e-99  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.949596  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4531  ABC transporter related  34.15 
 
 
610 aa  363  4e-99  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.319604  normal  0.425635 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>