More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5528 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_3801  hypothetical protein  58.43 
 
 		 615 aa  662    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4444  ABC transporter related  53.72 
 
 		 610 aa  647    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.949596  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4166  ABC transporter related  60.62 
 
 		 633 aa  665    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.24565  hitchhiker  0.00267368 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1227  ABC transporter related  57.94 
 
 		 619 aa  663    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.141283  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4531  ABC transporter related  53.72 
 
 		 610 aa  647    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.319604  normal  0.425635 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4826  ABC transporter related  53.55 
 
 		 610 aa  645    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.596215 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5528  ABC transporter related protein  100 
 
 		 614 aa  1230    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3786  ABC transporter related  60.2 
 
 		 634 aa  689    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0831  ABC transporter related  53.94 
 
 		 629 aa  629  1e-179  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000188495 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1748  ABC transporter related  54.79 
 
 		 605 aa  623  1e-177  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0520  ABC transporter related  54.88 
 
 		 652 aa  612  9.999999999999999e-175  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00806721  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5005  ABC transporter-related protein  54.26 
 
 		 606 aa  607  9.999999999999999e-173  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3403  ABC transporter related  52.72 
 
 		 610 aa  604  1.0000000000000001e-171  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3183  cyclic nucleotide-binding protein  51.74 
 
 		 608 aa  598  1e-170  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1666  ABC transporter related  53.42 
 
 		 606 aa  595  1e-169  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.590055  normal  0.300337 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1805  ABC transporter related protein  54.11 
 
 		 596 aa  585  1e-166  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.759471  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4713  ABC transporter related  52.61 
 
 		 616 aa  577  1.0000000000000001e-163  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1441  ABC transporter related protein  53.55 
 
 		 606 aa  574  1.0000000000000001e-162  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.695725  normal  0.760619 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02150  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  50.33 
 
 		 608 aa  571  1e-161  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18490  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  51.19 
 
 		 621 aa  546  1e-154  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2921  ABC transporter related protein  44.43 
 
 		 636 aa  450  1e-125  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2497  ABC transporter related  40.37 
 
 		 614 aa  406  1.0000000000000001e-112  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  36.01 
 
 		 597 aa  405  1e-111  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3627  ABC transporter related  39.3 
 
 		 617 aa  400  9.999999999999999e-111  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0418  ABC transporter related protein  39.63 
 
 		 600 aa  389  1e-107  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1201  ABC transporter related protein  37.08 
 
 		 594 aa  392  1e-107  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2717  ABC transporter related  40.17 
 
 		 608 aa  390  1e-107  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2181  ABC transporter related  33.5 
 
 		 600 aa  384  1e-105  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0048  ABC transporter related  35.11 
 
 		 598 aa  380  1e-104  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000163685  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1942  ABC transporter, transmembrane region  37.83 
 
 		 594 aa  381  1e-104  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5296  ABC transporter related  40.1 
 
 		 1522 aa  374  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3416  ABC transporter-related protein  38.63 
 
 		 602 aa  375  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2254  ABC transporter related  38.07 
 
 		 592 aa  372  1e-102  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7144  ABC transporter related  35.51 
 
 		 632 aa  375  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3344  ABC transporter related  38 
 
 		 615 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0545  ABC transporter related  37.77 
 
 		 602 aa  370  1e-101  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19280  ABC transporter related  35.24 
 
 		 609 aa  367  1e-100  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2627  ABC transporter related  38.34 
 
 		 592 aa  367  1e-100  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0494  ABC transporter related  36.39 
 
 		 611 aa  366  1e-100  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2282  ABC transporter related  37.32 
 
 		 609 aa  368  1e-100  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0569  ABC transporter related  33.81 
 
 		 597 aa  367  1e-100  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2505  ABC transporter related protein  36.96 
 
 		 607 aa  368  1e-100  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.152219  normal  0.502097 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1430  ABC transporter related  34.44 
 
 		 592 aa  365  2e-99  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0101  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  38.98 
 
 		 592 aa  364  3e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5995  ABC transporter related  35.9 
 
 		 632 aa  362  8e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.210924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2669  ABC transporter related  36.3 
 
 		 637 aa  359  7e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.871518  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2371  ABC transporter, ATPase subunit  35.11 
 
 		 622 aa  359  8e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0801  ABC transporter-like protein  36.03 
 
 		 635 aa  359  9e-98  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.678319 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0419  ABC transporter-related protein  34.34 
 
 		 608 aa  359  9e-98  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0718918 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2613  ABC transporter, transmembrane region  35.76 
 
 		 625 aa  358  1.9999999999999998e-97  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.200186  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0017  ABC transporter related  34.75 
 
 		 593 aa  357  2.9999999999999997e-97  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0033  ABC transporter related  36.72 
 
 		 602 aa  356  5e-97  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6252  ABC transporter related  39.89 
 
 		 1436 aa  357  5e-97  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3782  ABC transporter related  33.68 
 
 		 594 aa  356  5e-97  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.91836  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1520  ABC transporter related  36.65 
 
 		 597 aa  355  8.999999999999999e-97  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.887648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1761  ATPase  34.7 
 
 		 611 aa  355  1e-96  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.115592  normal  0.424794 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0453  ATPase  33.39 
 
 		 614 aa  355  1e-96  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1429  ABC transporter related  38.25 
 
 		 1284 aa  355  1e-96  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.442581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0034  ABC transporter related protein  35.87 
 
 		 603 aa  353  5e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0648  ABC transporter related  37.87 
 
 		 623 aa  352  1e-95  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.986523 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0422  ABC transporter related  32.45 
 
 		 613 aa  352  1e-95  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.333547  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0313  ABC transporter, ATP-binding/membrane-spanning protein  33.04 
 
 		 590 aa  352  1e-95  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1250  ABC transporter related  35.91 
 
 		 610 aa  350  3e-95  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3783  ABC transporter related  39.38 
 
 		 1301 aa  350  5e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3872  ABC transporter related  34.49 
 
 		 585 aa  350  6e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1390  ABC transporter related  34.87 
 
 		 602 aa  348  2e-94  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.838756  normal  0.671981 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0160  ABC transporter related  35.2 
 
 		 616 aa  347  4e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30570  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  38.32 
 
 		 1257 aa  347  5e-94  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0768  ABC transporter related  36.02 
 
 		 610 aa  346  6e-94  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1554  ABC transporter related  35.6 
 
 		 612 aa  346  7e-94  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.138935  hitchhiker  0.00285078 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0617  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.02 
 
 		 609 aa  346  7e-94  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1540  multidrug ABC transporter ATPase/permease  34.39 
 
 		 602 aa  345  1e-93  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.652681  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3081  ABC multidrug efflux transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  38.24 
 
 		 567 aa  345  2e-93  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0387  ABC transporter related  33.39 
 
 		 619 aa  345  2e-93  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.102241  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0387  ABC transporter related  34.66 
 
 		 611 aa  345  2e-93  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.000000031667  normal  0.0347309 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3808  ABC transporter related  38.42 
 
 		 567 aa  344  2.9999999999999997e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0584709  normal  0.445528 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0841  ABC transporter related  34.35 
 
 		 607 aa  343  5e-93  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3067  ABC transporter related  36.52 
 
 		 621 aa  341  2e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.134342  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0047  ABC transporter-like protein  33.22 
 
 		 586 aa  341  2.9999999999999998e-92  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.99996 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0282  ABC transporter related protein  38.67 
 
 		 600 aa  339  7e-92  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0443  ABC transporter related  32.76 
 
 		 588 aa  338  9.999999999999999e-92  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000201252  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1776  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.4 
 
 		 589 aa  339  9.999999999999999e-92  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184019  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0377  ABC transporter related  39.31 
 
 		 1264 aa  339  9.999999999999999e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.843886  normal  0.12564 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0082  ATPase  36.55 
 
 		 582 aa  338  1.9999999999999998e-91  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1549  ABC transporter related  35.2 
 
 		 613 aa  338  1.9999999999999998e-91  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0873918  normal  0.0393082 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0673  ABC transporter related  35.48 
 
 		 650 aa  337  2.9999999999999997e-91  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3932  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  39.96 
 
 		 567 aa  337  5e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.130383  normal  0.874644 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  37.06 
 
 		 598 aa  336  5.999999999999999e-91  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_002936  DET1180  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.72 
 
 		 637 aa  336  7e-91  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1275  ABC transporter related protein  34.97 
 
 		 576 aa  336  7.999999999999999e-91  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0985  ABC transporter, transmembrane region  34.15 
 
 		 636 aa  335  2e-90  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0740  ABC transporter related protein  37.99 
 
 		 615 aa  333  5e-90  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0838  ABC transporter related  35.09 
 
 		 640 aa  333  6e-90  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2250  ABC transporter, transmembrane region  39.34 
 
 		 634 aa  333  7.000000000000001e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.993927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5708  ABC transporter related  35.17 
 
 		 764 aa  333  8e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.920431  normal  0.127768 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4692  ABC transporter related protein  38.53 
 
 		 1218 aa  332  1e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.131662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10196  drug ABC transporter ATP-binding protein  38.1 
 
 		 1194 aa  332  1e-89  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_964  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.78 
 
 		 637 aa  332  1e-89  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.600764  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1363  ABC transporter related  35.98 
 
 		 636 aa  332  2e-89  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000676834  normal  0.402453 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0806  ABC transporter related  38.85 
 
 		 666 aa  332  2e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>