More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4713 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4713  ABC transporter related  100 
 
 		 616 aa  1189    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0831  ABC transporter related  55.47 
 
 		 629 aa  613  9.999999999999999e-175  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000188495 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0520  ABC transporter related  58.27 
 
 		 652 aa  613  9.999999999999999e-175  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00806721  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3183  cyclic nucleotide-binding protein  53.72 
 
 		 608 aa  599  1e-170  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5528  ABC transporter related protein  52.61 
 
 		 614 aa  597  1e-169  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3801  hypothetical protein  56.48 
 
 		 615 aa  594  1e-168  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3403  ABC transporter related  53.63 
 
 		 610 aa  590  1e-167  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3786  ABC transporter related  54.07 
 
 		 634 aa  589  1e-167  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4166  ABC transporter related  53.98 
 
 		 633 aa  585  1e-166  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.24565  hitchhiker  0.00267368 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1666  ABC transporter related  54.18 
 
 		 606 aa  588  1e-166  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.590055  normal  0.300337 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4826  ABC transporter related  51.81 
 
 		 610 aa  582  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.596215 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1805  ABC transporter related protein  53.01 
 
 		 596 aa  580  1e-164  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.759471  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4444  ABC transporter related  51.64 
 
 		 610 aa  578  1e-164  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.949596  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4531  ABC transporter related  51.64 
 
 		 610 aa  578  1e-164  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.319604  normal  0.425635 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1227  ABC transporter related  53.8 
 
 		 619 aa  569  1e-161  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.141283  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02150  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  50.08 
 
 		 608 aa  565  1e-160  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1441  ABC transporter related protein  55.52 
 
 		 606 aa  560  1e-158  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.695725  normal  0.760619 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5005  ABC transporter-related protein  52.73 
 
 		 606 aa  550  1e-155  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18490  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  53.33 
 
 		 621 aa  548  1e-154  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1748  ABC transporter related  53.07 
 
 		 605 aa  546  1e-154  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2921  ABC transporter related protein  41.33 
 
 		 636 aa  393  1e-108  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5296  ABC transporter related  41.67 
 
 		 1522 aa  367  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2627  ABC transporter related  40.19 
 
 		 592 aa  365  2e-99  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0418  ABC transporter related protein  38.01 
 
 		 600 aa  362  1e-98  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  34.5 
 
 		 597 aa  362  1e-98  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2497  ABC transporter related  40.4 
 
 		 614 aa  358  1.9999999999999998e-97  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1201  ABC transporter related protein  35.63 
 
 		 594 aa  358  1.9999999999999998e-97  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30570  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  44.69 
 
 		 1257 aa  357  5e-97  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1942  ABC transporter, transmembrane region  37.26 
 
 		 594 aa  356  5.999999999999999e-97  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3627  ABC transporter related  37.34 
 
 		 617 aa  355  1e-96  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6252  ABC transporter related  41 
 
 		 1436 aa  345  2e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3782  ABC transporter related  33.62 
 
 		 594 aa  343  4e-93  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.91836  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0494  ABC transporter related  39.52 
 
 		 611 aa  343  8e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1250  ABC transporter related  37.44 
 
 		 610 aa  341  2.9999999999999998e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0048  ABC transporter related  34.13 
 
 		 598 aa  341  2.9999999999999998e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000163685  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2717  ABC transporter related  40.55 
 
 		 608 aa  340  4e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2282  ABC transporter related  38.21 
 
 		 609 aa  336  9e-91  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0881  ATPase  37.65 
 
 		 592 aa  334  2e-90  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2181  ABC transporter related  33.62 
 
 		 600 aa  335  2e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2726  ABC transporter related  37.1 
 
 		 610 aa  333  8e-90  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3376  ABC transporter related  37.1 
 
 		 610 aa  333  8e-90  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1776  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.77 
 
 		 589 aa  332  1e-89  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184019  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0801  ABC transporter-like protein  35.73 
 
 		 635 aa  332  1e-89  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.678319 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08241  putative multidrug efflux ABC transporter  38.25 
 
 		 598 aa  331  3e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4692  ABC transporter related protein  41.54 
 
 		 1218 aa  330  4e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.131662  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2505  ABC transporter related protein  36.03 
 
 		 607 aa  330  6e-89  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.152219  normal  0.502097 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0377  ABC transporter related  40.28 
 
 		 1264 aa  329  1.0000000000000001e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.843886  normal  0.12564 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1429  ABC transporter related  39.38 
 
 		 1284 aa  328  1.0000000000000001e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.442581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0648  ABC transporter related  38.29 
 
 		 623 aa  328  1.0000000000000001e-88  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.986523 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1554  ABC transporter related  37.98 
 
 		 612 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.138935  hitchhiker  0.00285078 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1385  ABC transporter related  36.57 
 
 		 622 aa  328  2.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2371  ABC transporter, ATPase subunit  34.21 
 
 		 622 aa  328  2.0000000000000001e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0782  ATPase  38.93 
 
 		 598 aa  327  4.0000000000000003e-88  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.461775 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2254  ABC transporter related  36.3 
 
 		 592 aa  327  5e-88  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3416  ABC transporter-related protein  37.16 
 
 		 602 aa  326  6e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1430  ABC transporter related  32.88 
 
 		 592 aa  326  7e-88  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1528  ABC transporter, transmembrane region  33.04 
 
 		 587 aa  326  7e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00299054  normal  0.0159788 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3783  ABC transporter related  38.7 
 
 		 1301 aa  325  1e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3786  ABC transporter  33.04 
 
 		 587 aa  325  2e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.469191  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1359  ABC transporter related  37.68 
 
 		 608 aa  325  2e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1469  ABC transporter related protein  33.75 
 
 		 586 aa  324  3e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2306  ABC transporter related  34.07 
 
 		 610 aa  324  3e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.306403 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0545  ABC transporter related  35.38 
 
 		 602 aa  323  4e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3365  ABC transporter related  34.65 
 
 		 587 aa  323  5e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000714306  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0101  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  37.41 
 
 		 592 aa  322  1.9999999999999998e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2270  ABC transporter related  37.16 
 
 		 619 aa  321  1.9999999999999998e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.903332  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3466  ABC transporter ATP-binding/permease  33.39 
 
 		 587 aa  322  1.9999999999999998e-86  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.197712  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0335  ABC transporter transmembrane region  31.6 
 
 		 588 aa  321  1.9999999999999998e-86  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7144  ABC transporter related  34.54 
 
 		 632 aa  322  1.9999999999999998e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0968  ATPase  37.73 
 
 		 592 aa  322  1.9999999999999998e-86  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.191746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3740  ABC transporter permease/ATP-binding protein  33.39 
 
 		 587 aa  322  1.9999999999999998e-86  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.037622  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3695  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.39 
 
 		 587 aa  322  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000106018 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3432  ABC transporter, ATP-binding protein  33.39 
 
 		 587 aa  321  3e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000147455  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3384  ABC transporter, ATP-binding protein  33.22 
 
 		 587 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.603869  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2781  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.27 
 
 		 609 aa  320  6e-86  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000466613  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3719  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.57 
 
 		 587 aa  320  6e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3355  ABC transporter transmembrane region  39.47 
 
 		 672 aa  320  6e-86  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3551  ABC transporter related  37.54 
 
 		 632 aa  320  7e-86  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.127969 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0033  ABC transporter related  34.84 
 
 		 602 aa  319  9e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3714  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.39 
 
 		 587 aa  319  1e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.207401  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3334  ABC transporter related  35.56 
 
 		 584 aa  319  1e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3583  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0569  ABC transporter related  32.69 
 
 		 597 aa  318  2e-85  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10196  drug ABC transporter ATP-binding protein  39.12 
 
 		 1194 aa  318  2e-85  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1891  multidrug ABC transporter  35.26 
 
 		 598 aa  318  3e-85  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5995  ABC transporter related  34.54 
 
 		 632 aa  317  3e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.210924  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2622  ABC transporter transmembrane region  38.13 
 
 		 606 aa  317  4e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.499231  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06161  putative multidrug efflux ABC transporter  35.53 
 
 		 598 aa  317  4e-85  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.898813  normal  0.601088 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0842  ABC transporter, transmembrane region  39.06 
 
 		 672 aa  317  4e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.111523 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2669  ABC transporter related  34.72 
 
 		 637 aa  317  5e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.871518  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0313  ABC transporter, ATP-binding/membrane-spanning protein  35.03 
 
 		 590 aa  317  5e-85  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2332  ABC transporter-related protein  32.52 
 
 		 587 aa  317  5e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000229781  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0806  ABC transporter related  37.14 
 
 		 666 aa  317  5e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0419  ABC transporter-related protein  34.42 
 
 		 608 aa  317  6e-85  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0718918 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0034  ABC transporter related protein  34.38 
 
 		 603 aa  316  7e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0047  ABC transporter-like protein  33.27 
 
 		 586 aa  316  8e-85  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.99996 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2350  ABC transporter related protein  38.78 
 
 		 620 aa  316  9e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0443  ABC transporter related  33.81 
 
 		 588 aa  315  9.999999999999999e-85  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000201252  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2250  ABC transporter, transmembrane region  39.45 
 
 		 634 aa  315  9.999999999999999e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.993927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3081  ABC multidrug efflux transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  37.02 
 
 		 567 aa  315  1.9999999999999998e-84  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3344  ABC transporter related  39.29 
 
 		 615 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>