More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3783 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_2029  ABC transporter related  41.21 
 
 
1230 aa  775    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2886  ATP binding cassette  38.04 
 
 
1218 aa  733    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2969  ATP binding cassette  38.14 
 
 
1218 aa  721    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00365409 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4692  ABC transporter related protein  46.89 
 
 
1218 aa  920    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.131662  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1034  ABC transporter related  55.71 
 
 
1321 aa  1223    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.229722 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1884  ABC transporter related protein  47.36 
 
 
1332 aa  946    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2950  ATP-binding protein  37.96 
 
 
1218 aa  743    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  1.03128e-16 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3783  ABC transporter related  100 
 
 
1301 aa  2548    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377067  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1429  ABC transporter related  53.67 
 
 
1284 aa  1128    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.442581  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30570  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  53.28 
 
 
1257 aa  1141    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3072  ATP binding cassette  37.73 
 
 
1218 aa  735    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5296  ABC transporter related  54.91 
 
 
1522 aa  1254    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0377  ABC transporter related  48.48 
 
 
1264 aa  1006    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.843886  normal  0.12564 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1516  ABC transporter related  56.2 
 
 
1231 aa  1084    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.347232 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6252  ABC transporter related  56.51 
 
 
1436 aa  627  1e-178  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10196  drug ABC transporter ATP-binding protein  50.26 
 
 
1194 aa  492  1e-137  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4444  ABC transporter related  41.35 
 
 
610 aa  414  1e-114  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.949596  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4531  ABC transporter related  41.35 
 
 
610 aa  414  1e-114  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.319604  normal  0.425635 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4826  ABC transporter related  41.18 
 
 
610 aa  413  1e-113  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.596215 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2921  ABC transporter related protein  42.23 
 
 
636 aa  405  1e-111  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1201  ABC transporter related protein  36.91 
 
 
594 aa  391  1e-107  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3627  ABC transporter related  39.02 
 
 
617 aa  390  1e-107  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2916  ATP binding cassette  39.93 
 
 
1218 aa  385  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.352142  normal  0.12308 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  35.15 
 
 
597 aa  382  1e-104  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02300  ABC-transporterMultidrug resistance protein MDR ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9Y8G1]  28.1 
 
 
1343 aa  378  1e-103  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.567277  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2505  ABC transporter related protein  38.34 
 
 
607 aa  379  1e-103  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.152219  normal  0.502097 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5005  ABC transporter-related protein  41.58 
 
 
606 aa  377  1e-103  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1942  ABC transporter, transmembrane region  37.92 
 
 
594 aa  374  1e-102  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1748  ABC transporter related  40.37 
 
 
605 aa  375  1e-102  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1486  ABC transporter related  31.04 
 
 
1228 aa  373  1e-101  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5528  ABC transporter related protein  39.38 
 
 
614 aa  371  1e-101  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2717  ABC transporter related  39.72 
 
 
608 aa  372  1e-101  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0418  ABC transporter related protein  38.01 
 
 
600 aa  368  1e-100  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0801  ABC transporter-like protein  37.83 
 
 
635 aa  370  1e-100  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.678319 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2497  ABC transporter related  40.41 
 
 
614 aa  369  1e-100  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1227  ABC transporter related  39.55 
 
 
619 aa  361  4e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.141283  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2371  ABC transporter, ATPase subunit  35.79 
 
 
622 aa  359  1.9999999999999998e-97  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0648  ABC transporter related  36.51 
 
 
623 aa  357  5.999999999999999e-97  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.986523 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3442  cysteine ABC transporter permease/ATP-binding protein  33.73 
 
 
1179 aa  357  1e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.507362  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0831  ABC transporter related  38.28 
 
 
629 aa  356  1e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000188495 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1666  ABC transporter related  37.61 
 
 
606 aa  356  1e-96  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.590055  normal  0.300337 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0387  ABC transporter related  33.9 
 
 
611 aa  353  8e-96  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.000000031667  normal  0.0347309 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0033  ABC transporter related  36.87 
 
 
602 aa  353  8e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1805  ABC transporter related protein  38.97 
 
 
596 aa  353  8.999999999999999e-96  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.759471  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3801  hypothetical protein  41.08 
 
 
615 aa  353  1e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0048  ABC transporter related  33.92 
 
 
598 aa  352  3e-95  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000163685  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0047  ABC transporter related  34.7 
 
 
580 aa  351  4e-95  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00438981  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1469  ABC transporter related protein  33.16 
 
 
586 aa  351  5e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0520  ABC transporter related  39.72 
 
 
652 aa  350  1e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00806721  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3786  ABC transporter related  38.78 
 
 
634 aa  350  1e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0569  ABC transporter related  33.67 
 
 
597 aa  349  3e-94  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0034  ABC transporter related protein  36.11 
 
 
603 aa  347  6e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02150  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  36.46 
 
 
608 aa  347  6e-94  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2282  ABC transporter related  37.74 
 
 
609 aa  347  1e-93  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1306  ABC transporter related  37.88 
 
 
582 aa  347  1e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4763  ABC transporter related  31.69 
 
 
591 aa  345  2e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.116722  normal  0.0159357 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2922  ABC transporter related protein  40.39 
 
 
581 aa  346  2e-93  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.364865  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1540  multidrug ABC transporter ATPase/permease  36.01 
 
 
602 aa  344  5.999999999999999e-93  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.652681  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0494  ABC transporter related  36.27 
 
 
611 aa  344  5.999999999999999e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3808  ABC transporter related  37.46 
 
 
567 aa  343  1e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0584709  normal  0.445528 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3334  ABC transporter related  36.95 
 
 
584 aa  343  1e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3583  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13518  ATPase  32.52 
 
 
587 aa  342  2e-92  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0417  ABC transporter related  37.45 
 
 
660 aa  342  2e-92  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1776  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.07 
 
 
589 aa  342  2.9999999999999998e-92  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184019  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3782  ABC transporter related  32.88 
 
 
594 aa  342  4e-92  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.91836  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3081  ABC multidrug efflux transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  37.21 
 
 
567 aa  340  8e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1250  ABC transporter related  37.13 
 
 
610 aa  340  8e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0545  ABC transporter related  34.92 
 
 
602 aa  340  9.999999999999999e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0768  ABC transporter related  37.71 
 
 
610 aa  340  9.999999999999999e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0335  ABC transporter transmembrane region  32.17 
 
 
588 aa  340  9.999999999999999e-92  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1249  ABC transporter, ATP-binding protein  33.22 
 
 
598 aa  339  1.9999999999999998e-91  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159778 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5995  ABC transporter related  33.86 
 
 
632 aa  339  1.9999999999999998e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.210924  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0617  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  37.71 
 
 
609 aa  339  1.9999999999999998e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2669  ABC transporter related  35.08 
 
 
637 aa  338  2.9999999999999997e-91  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.871518  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7144  ABC transporter related  33.86 
 
 
632 aa  338  2.9999999999999997e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0313  ABC transporter, ATP-binding/membrane-spanning protein  32.51 
 
 
590 aa  338  5.999999999999999e-91  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3416  ABC transporter-related protein  37.59 
 
 
602 aa  337  7.999999999999999e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2719  ABC transporter related  36.41 
 
 
606 aa  337  7.999999999999999e-91  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1262  ABC transporter related  36.62 
 
 
644 aa  337  1e-90  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0453  ATPase  32.71 
 
 
614 aa  336  2e-90  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2181  ABC transporter related  32.64 
 
 
600 aa  336  2e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5298  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.16 
 
 
571 aa  336  2e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4860  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  33.16 
 
 
571 aa  335  4e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.201042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4875  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  33.16 
 
 
571 aa  335  4e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259113  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5268  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.16 
 
 
571 aa  335  4e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2499  ABC transporter transmembrane region  35.71 
 
 
601 aa  335  4e-90  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0387  ABC transporter related  33.84 
 
 
619 aa  335  4e-90  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.102241  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1896  ABC transporter related  34.51 
 
 
572 aa  334  6e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.332587  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0422  ABC transporter related  33.33 
 
 
613 aa  334  6e-90  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.333547  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0419  ABC transporter-related protein  32.45 
 
 
608 aa  334  7.000000000000001e-90  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0718918 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2627  ABC transporter related  36.43 
 
 
592 aa  334  7.000000000000001e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5030  ABC transporter ATP-binding/permease  32.81 
 
 
571 aa  333  9e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0487117  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5411  ABC transporter permease/ATP-binding protein  32.81 
 
 
571 aa  333  9e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5343  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.33 
 
 
571 aa  333  1e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2528  ABC transporter related  31.46 
 
 
580 aa  333  1e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000757065  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18490  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  36.44 
 
 
621 aa  333  1e-89  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5285  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.98 
 
 
571 aa  332  2e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0981  ABC transporter related  35.07 
 
 
576 aa  333  2e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5658  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.1 
 
 
571 aa  332  2e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3626  ABC transporter related  35.65 
 
 
588 aa  332  2e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.058238  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>