More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_30570 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5296  ABC transporter related  53.73 
 
 		 1522 aa  1238    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4692  ABC transporter related protein  56.8 
 
 		 1218 aa  1162    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.131662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2950  ATP-binding protein  42.63 
 
 		 1218 aa  916    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.03128e-16 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30570  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  100 
 
 		 1257 aa  2449    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1884  ABC transporter related protein  49.49 
 
 		 1332 aa  1016    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0377  ABC transporter related  48.44 
 
 		 1264 aa  1006    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.843886  normal  0.12564 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3783  ABC transporter related  53.28 
 
 		 1301 aa  1128    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6252  ABC transporter related  69.71 
 
 		 1436 aa  815    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1034  ABC transporter related  54.69 
 
 		 1321 aa  1179    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.229722 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2029  ABC transporter related  42.54 
 
 		 1230 aa  782    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1429  ABC transporter related  58.9 
 
 		 1284 aa  1290    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.442581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2969  ATP binding cassette  42.39 
 
 		 1218 aa  899    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00365409 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2886  ATP binding cassette  42.47 
 
 		 1218 aa  903    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3072  ATP binding cassette  42.63 
 
 		 1218 aa  913    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1516  ABC transporter related  53.85 
 
 		 1231 aa  1011    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.347232 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2916  ATP binding cassette  42.69 
 
 		 1218 aa  902    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.352142  normal  0.12308 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10196  drug ABC transporter ATP-binding protein  46.32 
 
 		 1194 aa  462  9.999999999999999e-129  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3442  cysteine ABC transporter permease/ATP-binding protein  36.36 
 
 		 1179 aa  438  1e-121  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.507362  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2921  ABC transporter related protein  42.71 
 
 		 636 aa  424  1e-117  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4826  ABC transporter related  41.93 
 
 		 610 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.596215 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4444  ABC transporter related  40.99 
 
 		 610 aa  415  1e-114  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.949596  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4531  ABC transporter related  40.99 
 
 		 610 aa  415  1e-114  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.319604  normal  0.425635 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1486  ABC transporter related  32.99 
 
 		 1228 aa  410  1e-113  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0338  ABC transporter related  30.61 
 
 		 1194 aa  406  1e-111  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0418  ABC transporter related protein  39.13 
 
 		 600 aa  397  1e-109  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3801  hypothetical protein  43.7 
 
 		 615 aa  397  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0520  ABC transporter related  43.11 
 
 		 652 aa  395  1e-108  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00806721  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02300  ABC-transporterMultidrug resistance protein MDR ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9Y8G1]  33.3 
 
 		 1343 aa  391  1e-107  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.567277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1227  ABC transporter related  42.86 
 
 		 619 aa  391  1e-107  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.141283  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2717  ABC transporter related  40.81 
 
 		 608 aa  392  1e-107  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  33.61 
 
 		 597 aa  387  1e-106  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1201  ABC transporter related protein  37.46 
 
 		 594 aa  389  1e-106  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2627  ABC transporter related  39.08 
 
 		 592 aa  385  1e-105  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2497  ABC transporter related  43.14 
 
 		 614 aa  384  1e-105  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1748  ABC transporter related  41.48 
 
 		 605 aa  384  1e-105  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5528  ABC transporter related protein  39.2 
 
 		 614 aa  382  1e-104  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3627  ABC transporter related  38.74 
 
 		 617 aa  380  1e-104  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3786  ABC transporter related  42.78 
 
 		 634 aa  382  1e-104  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3782  ABC transporter related  34.76 
 
 		 594 aa  379  1e-103  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.91836  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5005  ABC transporter-related protein  42.38 
 
 		 606 aa  377  1e-103  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2505  ABC transporter related protein  38.12 
 
 		 607 aa  376  1e-102  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.152219  normal  0.502097 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2282  ABC transporter related  40.42 
 
 		 609 aa  374  1e-102  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0419  ABC transporter-related protein  35.03 
 
 		 608 aa  374  1e-102  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0718918 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0033  ABC transporter related  39.25 
 
 		 602 aa  377  1e-102  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0313  ABC transporter, ATP-binding/membrane-spanning protein  33.87 
 
 		 590 aa  373  1e-101  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4166  ABC transporter related  44.89 
 
 		 633 aa  368  1e-100  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.24565  hitchhiker  0.00267368 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0034  ABC transporter related protein  38.83 
 
 		 603 aa  369  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2922  ABC transporter related protein  39.96 
 
 		 581 aa  367  1e-99  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.364865  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0047  ABC transporter related  36.4 
 
 		 580 aa  366  1e-99  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00438981  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2669  ABC transporter related  36.48 
 
 		 637 aa  366  2e-99  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.871518  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  40.85 
 
 		 598 aa  365  2e-99  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1454  ABC transporter related  39.92 
 
 		 641 aa  365  3e-99  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02150  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  38.74 
 
 		 608 aa  365  3e-99  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1666  ABC transporter related  40.59 
 
 		 606 aa  363  8e-99  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.590055  normal  0.300337 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4713  ABC transporter related  42.31 
 
 		 616 aa  363  1e-98  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2371  ABC transporter, ATPase subunit  36.44 
 
 		 622 aa  363  1e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0831  ABC transporter related  38.37 
 
 		 629 aa  363  1e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000188495 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0443  ABC transporter related  34.83 
 
 		 588 aa  362  2e-98  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000201252  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1805  ABC transporter related protein  39.72 
 
 		 596 aa  360  9e-98  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.759471  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5995  ABC transporter related  36.44 
 
 		 632 aa  359  1.9999999999999998e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.210924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1249  ABC transporter, ATP-binding protein  34.63 
 
 		 598 aa  358  1.9999999999999998e-97  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159778 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0494  ABC transporter related  35.92 
 
 		 611 aa  358  2.9999999999999997e-97  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4763  ABC transporter related  32.98 
 
 		 591 aa  357  5.999999999999999e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.116722  normal  0.0159357 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7144  ABC transporter related  35.77 
 
 		 632 aa  356  1e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1430  ABC transporter related  34.97 
 
 		 592 aa  356  1e-96  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4432  ABC transporter related  34.77 
 
 		 601 aa  355  2e-96  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1250  ABC transporter related  37.89 
 
 		 610 aa  356  2e-96  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0048  ABC transporter related  33.39 
 
 		 598 aa  355  2.9999999999999997e-96  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000163685  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2181  ABC transporter related  35.94 
 
 		 600 aa  355  4e-96  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1942  ABC transporter, transmembrane region  40.21 
 
 		 594 aa  354  5e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0387  ABC transporter related  35.25 
 
 		 611 aa  353  8.999999999999999e-96  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.000000031667  normal  0.0347309 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3416  ABC transporter-related protein  37.95 
 
 		 602 aa  352  2e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0422  ABC transporter related  34.36 
 
 		 613 aa  352  3e-95  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.333547  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1469  ABC transporter related protein  34.28 
 
 		 586 aa  352  3e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1776  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.95 
 
 		 589 aa  351  4e-95  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184019  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1441  ABC transporter related protein  41.61 
 
 		 606 aa  351  5e-95  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.695725  normal  0.760619 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0453  ATPase  33.97 
 
 		 614 aa  350  8e-95  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13518  ATPase  32.69 
 
 		 587 aa  350  8e-95  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3403  ABC transporter related  37.5 
 
 		 610 aa  350  9e-95  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0828  ABC transporter related  36.55 
 
 		 596 aa  350  1e-94  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.61579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0648  ABC transporter related  40.24 
 
 		 623 aa  349  2e-94  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.986523 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3344  ABC transporter related  37.69 
 
 		 615 aa  348  5e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0545  ABC transporter related  35.65 
 
 		 602 aa  347  7e-94  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3183  cyclic nucleotide-binding protein  36.99 
 
 		 608 aa  346  1e-93  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19280  ABC transporter related  33.6 
 
 		 609 aa  346  1e-93  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0949  ABC transporter related  39.58 
 
 		 625 aa  346  1e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.128787  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2270  ABC transporter related  36.32 
 
 		 619 aa  346  1e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.903332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1375  ABC transporter related  36.81 
 
 		 651 aa  346  2e-93  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.250681  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1402  ATPase  36.27 
 
 		 619 aa  345  2.9999999999999997e-93  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.387875  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1540  multidrug ABC transporter ATPase/permease  35.49 
 
 		 602 aa  345  2.9999999999999997e-93  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.652681  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3551  ABC transporter related  36.06 
 
 		 632 aa  345  2.9999999999999997e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.127969 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3334  ABC transporter related  36.06 
 
 		 584 aa  345  2.9999999999999997e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3583  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  34.45 
 
 		 556 aa  345  4e-93  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4037  ABC transporter related protein  38.71 
 
 		 764 aa  345  4e-93  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.238544  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1761  ATPase  32.98 
 
 		 611 aa  344  8e-93  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.115592  normal  0.424794 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2067  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  37.18 
 
 		 586 aa  343  2e-92  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0740  ABC transporter related protein  36.87 
 
 		 615 aa  342  2e-92  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2153  ABC transporter ATP-binding protein  37.23 
 
 		 586 aa  342  2e-92  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0569  ABC transporter related  32.4 
 
 		 597 aa  342  2.9999999999999998e-92  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3626  ABC transporter related  38.43 
 
 		 588 aa  342  2.9999999999999998e-92  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.058238  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>