More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1034 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A3072  ATP binding cassette  38.99 
 
 		 1218 aa  786    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2886  ATP binding cassette  38.87 
 
 		 1218 aa  777    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2969  ATP binding cassette  38.79 
 
 		 1218 aa  767    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00365409 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2950  ATP-binding protein  39.24 
 
 		 1218 aa  793    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.03128e-16 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2029  ABC transporter related  41.36 
 
 		 1230 aa  780    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1034  ABC transporter related  100 
 
 		 1321 aa  2559    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.229722 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30570  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  54.38 
 
 		 1257 aa  1200    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1429  ABC transporter related  54.63 
 
 		 1284 aa  1191    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.442581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6252  ABC transporter related  58.63 
 
 		 1436 aa  645    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4692  ABC transporter related protein  50.63 
 
 		 1218 aa  997    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.131662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3783  ABC transporter related  57.12 
 
 		 1301 aa  1228    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1516  ABC transporter related  56.71 
 
 		 1231 aa  1086    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.347232 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1884  ABC transporter related protein  46.74 
 
 		 1332 aa  952    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5296  ABC transporter related  61.34 
 
 		 1522 aa  665    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0377  ABC transporter related  50.4 
 
 		 1264 aa  547  1e-154  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.843886  normal  0.12564 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10196  drug ABC transporter ATP-binding protein  50 
 
 		 1194 aa  498  1e-139  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2916  ATP binding cassette  44.21 
 
 		 1218 aa  434  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.352142  normal  0.12308 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2921  ABC transporter related protein  43.86 
 
 		 636 aa  406  1e-111  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1201  ABC transporter related protein  37.08 
 
 		 594 aa  402  9.999999999999999e-111  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2505  ABC transporter related protein  39.63 
 
 		 607 aa  394  1e-108  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.152219  normal  0.502097 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0801  ABC transporter-like protein  38.92 
 
 		 635 aa  392  1e-107  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.678319 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4444  ABC transporter related  39.65 
 
 		 610 aa  389  1e-106  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.949596  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4531  ABC transporter related  39.65 
 
 		 610 aa  389  1e-106  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.319604  normal  0.425635 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4826  ABC transporter related  39.65 
 
 		 610 aa  389  1e-106  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.596215 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3627  ABC transporter related  38.79 
 
 		 617 aa  389  1e-106  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2922  ABC transporter related protein  42.26 
 
 		 581 aa  377  1e-103  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.364865  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  34.47 
 
 		 597 aa  375  1e-102  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0387  ABC transporter related  36.74 
 
 		 611 aa  373  1e-101  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.000000031667  normal  0.0347309 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2497  ABC transporter related  40.54 
 
 		 614 aa  369  1e-100  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2717  ABC transporter related  39.12 
 
 		 608 aa  368  1e-100  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3626  ABC transporter related  40.57 
 
 		 588 aa  366  1e-99  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.058238  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2627  ABC transporter related  37.94 
 
 		 592 aa  366  2e-99  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0047  ABC transporter related  35.19 
 
 		 580 aa  362  2e-98  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00438981  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1454  ABC transporter related  38.19 
 
 		 641 aa  363  2e-98  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0418  ABC transporter related protein  37.35 
 
 		 600 aa  361  4e-98  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2669  ABC transporter related  37.05 
 
 		 637 aa  361  5e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.871518  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0648  ABC transporter related  39.05 
 
 		 623 aa  361  6e-98  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.986523 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1748  ABC transporter related  40.21 
 
 		 605 aa  361  6e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5528  ABC transporter related protein  39.02 
 
 		 614 aa  359  1.9999999999999998e-97  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1666  ABC transporter related  41.91 
 
 		 606 aa  358  2.9999999999999997e-97  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.590055  normal  0.300337 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2282  ABC transporter related  38.04 
 
 		 609 aa  356  1e-96  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5005  ABC transporter-related protein  40.14 
 
 		 606 aa  357  1e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1805  ABC transporter related protein  41.88 
 
 		 596 aa  356  2e-96  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.759471  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0494  ABC transporter related  35.31 
 
 		 611 aa  355  2.9999999999999997e-96  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0313  ABC transporter, ATP-binding/membrane-spanning protein  32.73 
 
 		 590 aa  355  4e-96  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0544  ABC transporter related  36.36 
 
 		 587 aa  353  1e-95  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1954  ABC transporter related  36.68 
 
 		 578 aa  352  3e-95  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  39.1 
 
 		 598 aa  352  3e-95  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1920  ABC transporter related  36.68 
 
 		 578 aa  352  3e-95  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7144  ABC transporter related  35.58 
 
 		 632 aa  351  6e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  36.22 
 
 		 575 aa  351  6e-95  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2371  ABC transporter, ATPase subunit  35.84 
 
 		 622 aa  350  1e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1942  ABC transporter, transmembrane region  37.62 
 
 		 594 aa  349  2e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0048  ABC transporter related  32.76 
 
 		 598 aa  348  3e-94  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000163685  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5995  ABC transporter related  35.56 
 
 		 632 aa  348  4e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.210924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1227  ABC transporter related  39.11 
 
 		 619 aa  348  5e-94  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.141283  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0831  ABC transporter related  37.93 
 
 		 629 aa  347  7e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000188495 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1250  ABC transporter related  36.05 
 
 		 610 aa  346  1e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1080  ABC transporter related  38.97 
 
 		 601 aa  345  2.9999999999999997e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169898 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3801  hypothetical protein  39.68 
 
 		 615 aa  345  4e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4445  ABC transporter related  37.24 
 
 		 650 aa  345  5e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.789394  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4532  ABC transporter related  37.24 
 
 		 650 aa  345  5e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.329885  normal  0.446055 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1469  ABC transporter related protein  32.08 
 
 		 586 aa  344  7e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  33.66 
 
 		 597 aa  344  8e-93  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  33.66 
 
 		 597 aa  343  9e-93  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2499  ABC transporter transmembrane region  38.09 
 
 		 601 aa  343  1e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2719  ABC transporter related  39.34 
 
 		 606 aa  343  1e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1403  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.95 
 
 		 578 aa  342  2e-92  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0520  ABC transporter related  40.84 
 
 		 652 aa  342  2e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00806721  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4827  ABC transporter related  37.63 
 
 		 641 aa  343  2e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.42011 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  36.73 
 
 		 556 aa  341  4e-92  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0453  ATPase  33.05 
 
 		 614 aa  341  5e-92  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0684  ABC transporter related  37.85 
 
 		 598 aa  341  5e-92  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000210902  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1525  ABC transporter related  34.35 
 
 		 581 aa  341  5.9999999999999996e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.628149  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0033  ABC transporter related  36.81 
 
 		 602 aa  340  9.999999999999999e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0419  ABC transporter-related protein  34.18 
 
 		 608 aa  339  1.9999999999999998e-91  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0718918 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4763  ABC transporter related  31.34 
 
 		 591 aa  338  2.9999999999999997e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.116722  normal  0.0159357 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02150  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  36.64 
 
 		 608 aa  338  2.9999999999999997e-91  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2282  putative ABC transporter ATP-binding protein  34.18 
 
 		 566 aa  338  2.9999999999999997e-91  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3416  ABC transporter-related protein  36.67 
 
 		 602 aa  338  5e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2580  ABC transporter, ATP-binding protein/permease protein  34.18 
 
 		 566 aa  338  5e-91  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1429  ABC transporter related  33.81 
 
 		 581 aa  338  5.999999999999999e-91  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19280  ABC transporter related  33.78 
 
 		 609 aa  337  7e-91  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12850  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  32.55 
 
 		 608 aa  337  7.999999999999999e-91  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.813218  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0034  ABC transporter related protein  36.38 
 
 		 603 aa  337  9e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0443  ABC transporter related  32.86 
 
 		 588 aa  337  1e-90  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000201252  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0417  ABC transporter related  36.65 
 
 		 660 aa  336  2e-90  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5708  ABC transporter related  36.28 
 
 		 764 aa  335  3e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.920431  normal  0.127768 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1776  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.23 
 
 		 589 aa  335  3e-90  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184019  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0830  ABC transporter related  37.02 
 
 		 612 aa  335  4e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000934514 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0475  ABC transporter related  37.85 
 
 		 584 aa  334  5e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00181463  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1747  ABC transporter related  37.8 
 
 		 633 aa  334  8e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1306  ABC transporter related  37.55 
 
 		 582 aa  334  9e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3081  ABC multidrug efflux transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  36.28 
 
 		 567 aa  333  1e-89  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13518  ATPase  30.76 
 
 		 587 aa  333  1e-89  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0532  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.24 
 
 		 586 aa  333  1e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.117534  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3808  ABC transporter related  36.28 
 
 		 567 aa  333  1e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0584709  normal  0.445528 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5285  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.22 
 
 		 571 aa  332  2e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3782  ABC transporter related  31.09 
 
 		 594 aa  333  2e-89  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.91836  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5658  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.4 
 
 		 571 aa  333  2e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>