More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_4827 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4445  ABC transporter related  98.15 
 
 
650 aa  1238    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.789394  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4532  ABC transporter related  98.15 
 
 
650 aa  1238    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.329885  normal  0.446055 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5006  ABC transporter-related protein  83.44 
 
 
634 aa  1025    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4827  ABC transporter related  100 
 
 
641 aa  1282    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.42011 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1747  ABC transporter related  83.54 
 
 
633 aa  1065    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1226  ABC transporter, transmembrane region  58.49 
 
 
595 aa  615  1e-175  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.56473  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3802  lipid A export ATP-binding protein  57.91 
 
 
615 aa  606  9.999999999999999e-173  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.360172  normal  0.799293 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0830  ABC transporter related  48.97 
 
 
612 aa  554  1e-156  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000934514 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5527  ABC transporter related protein  49.48 
 
 
604 aa  542  1e-153  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4165  ABC transporter related  52.9 
 
 
607 aa  531  1e-149  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.131788  hitchhiker  0.00284668 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4712  ABC transporter related  48.21 
 
 
631 aa  514  1e-144  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.576376  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3785  ABC transporter related  51.79 
 
 
605 aa  504  1e-141  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0519  ABC transporter related  48.45 
 
 
589 aa  481  1e-134  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00043092  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3182  ABC transporter related  43 
 
 
602 aa  424  1e-117  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1665  ABC transporter related  44.04 
 
 
632 aa  420  1e-116  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0337818  normal  0.438153 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1440  ABC transporter related protein  44.64 
 
 
596 aa  413  1e-114  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.531129 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1806  ABC transporter related protein  45.13 
 
 
650 aa  398  1e-109  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0745976  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02160  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  41.77 
 
 
608 aa  394  1e-108  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2922  ABC transporter related protein  38.94 
 
 
581 aa  359  7e-98  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.364865  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18480  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  40.3 
 
 
612 aa  356  6.999999999999999e-97  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1954  ABC transporter related  34.84 
 
 
578 aa  340  7e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1920  ABC transporter related  34.84 
 
 
578 aa  340  7e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1403  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.91 
 
 
578 aa  330  4e-89  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2499  ABC transporter transmembrane region  35.36 
 
 
601 aa  329  8e-89  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2719  ABC transporter related  35.97 
 
 
606 aa  329  1.0000000000000001e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1034  ABC transporter related  37.52 
 
 
1321 aa  325  2e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.229722 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0684  ABC transporter related  33.45 
 
 
598 aa  322  9.999999999999999e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000210902  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1777  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.65 
 
 
573 aa  315  1.9999999999999998e-84  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00514902  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1429  ABC transporter related  37.21 
 
 
1284 aa  313  4.999999999999999e-84  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.442581  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3626  ABC transporter related  32.2 
 
 
588 aa  313  4.999999999999999e-84  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.058238  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0444  ABC transporter related  31.85 
 
 
586 aa  313  7.999999999999999e-84  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0532  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.08 
 
 
586 aa  311  2e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.117534  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2448  ABC transporter, ATP-binding  33.46 
 
 
594 aa  311  2.9999999999999997e-83  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.946245 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1454  ABC transporter related  36.12 
 
 
641 aa  311  2.9999999999999997e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4793  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.91 
 
 
586 aa  308  3e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.646278  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0568  ABC transporter related  32.68 
 
 
578 aa  307  3e-82  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2283  ABC transporter related  33.03 
 
 
589 aa  306  5.0000000000000004e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5296  ABC transporter related  37.18 
 
 
1522 aa  306  6e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0584  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.47 
 
 
586 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0439  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  30.47 
 
 
586 aa  303  5.000000000000001e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.214785  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0511  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.47 
 
 
586 aa  303  5.000000000000001e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0583  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.6 
 
 
586 aa  303  6.000000000000001e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1890  ABC transporter related  33.33 
 
 
586 aa  303  9e-81  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0664725  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1525  ABC transporter related  30.14 
 
 
581 aa  303  9e-81  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.628149  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0496  ABC transporter ATP-binding/permease  30.3 
 
 
586 aa  301  2e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.384636  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2497  ABC transporter related  33.33 
 
 
614 aa  301  2e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0528  ABC transporter permease/ATP-binding protein  30.3 
 
 
586 aa  301  2e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.249641  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0475  ABC transporter related  31.17 
 
 
584 aa  301  2e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00181463  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1776  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.92 
 
 
589 aa  301  3e-80  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184019  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10196  drug ABC transporter ATP-binding protein  34.33 
 
 
1194 aa  301  3e-80  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0435  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  30.47 
 
 
586 aa  300  5e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.290198  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3296  ABC transporter related  30.96 
 
 
588 aa  300  5e-80  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2921  ABC transporter related protein  34.39 
 
 
636 aa  298  2e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  33.46 
 
 
556 aa  297  3e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0569  ABC transporter related  30.65 
 
 
597 aa  297  4e-79  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  29.17 
 
 
597 aa  297  4e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2717  ABC transporter related  34.1 
 
 
608 aa  297  5e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6331  ABC transporter related protein  32.56 
 
 
593 aa  296  9e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  34.08 
 
 
598 aa  296  1e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0948  ABC transporter related  36.33 
 
 
642 aa  296  1e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.336517  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1942  ABC transporter, transmembrane region  31.72 
 
 
594 aa  295  2e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2260  ABC transporter ATP-binding protein  33.27 
 
 
571 aa  293  5e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1941  ABC transporter, transmembrane region  32.08 
 
 
592 aa  293  5e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.121107  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1430  ABC transporter related  33.33 
 
 
592 aa  293  7e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1080  ABC transporter related  35.04 
 
 
601 aa  293  9e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00169898 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1305  ABC transporter related  31.89 
 
 
598 aa  292  1e-77  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0837  ABC transporter related  31.45 
 
 
575 aa  291  2e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3783  ABC transporter related  34.04 
 
 
1301 aa  291  2e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377067  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1540  multidrug ABC transporter ATPase/permease  31.79 
 
 
602 aa  291  2e-77  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.652681  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6413  ABC transporter related  34.97 
 
 
577 aa  291  2e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.637608  normal  0.411769 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4902  ABC transporter related protein  32.74 
 
 
628 aa  291  2e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2628  ABC transporter related  34.01 
 
 
583 aa  291  2e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2616  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  31.86 
 
 
577 aa  290  6e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0639798  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1259  ATP-binding transport protein; multicopy suppressor of HtrB  33.39 
 
 
579 aa  290  8e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0378  ABC transporter related  32.92 
 
 
577 aa  289  1e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19280  ABC transporter related  30.59 
 
 
609 aa  289  1e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2349  ABC transporter-related protein  34.45 
 
 
571 aa  288  2e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6252  ABC transporter related  36.35 
 
 
1436 aa  288  2e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0047  ABC transporter related  29.08 
 
 
580 aa  288  2e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00438981  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3979  ABC transporter-related protein  32.94 
 
 
773 aa  288  2e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4923  ABC transporter related  32.54 
 
 
593 aa  288  2e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0406307 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1060  ABC transporter related  33.55 
 
 
760 aa  287  2.9999999999999996e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.120719  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1201  ABC transporter related protein  31.15 
 
 
594 aa  288  2.9999999999999996e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0450  ABC transporter-related protein  30.55 
 
 
586 aa  287  4e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0841  ABC transporter related  33.21 
 
 
607 aa  287  4e-76  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2836  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  31.54 
 
 
585 aa  287  5e-76  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.333651  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1262  ABC transporter related  33.33 
 
 
644 aa  286  5.999999999999999e-76  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1429  ABC transporter related  31 
 
 
581 aa  286  8e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2584  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  31.73 
 
 
768 aa  286  9e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30570  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  36.08 
 
 
1257 aa  286  9e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0453  ATPase  30.86 
 
 
614 aa  285  1.0000000000000001e-75  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5708  ABC transporter related  33.06 
 
 
764 aa  285  1.0000000000000001e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.920431  normal  0.127768 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0544  ABC transporter related  31.16 
 
 
587 aa  285  1.0000000000000001e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3231  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  32.86 
 
 
572 aa  286  1.0000000000000001e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.659501  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0417  ABC transporter related  32.03 
 
 
660 aa  285  2.0000000000000002e-75  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21680  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  32.4 
 
 
579 aa  284  4.0000000000000003e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0641  ABC transporter related  31.22 
 
 
577 aa  284  4.0000000000000003e-75  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.061779  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0505  hypothetical protein  28.89 
 
 
606 aa  283  5.000000000000001e-75  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2505  ABC transporter related protein  34.13 
 
 
607 aa  283  7.000000000000001e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.152219  normal  0.502097 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1502  ATPase  32.46 
 
 
587 aa  282  1e-74  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>