More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_2029 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1429  ABC transporter related  44.98 
 
 		 1284 aa  904    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.442581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0377  ABC transporter related  38.95 
 
 		 1264 aa  705    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.843886  normal  0.12564 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30570  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  42.48 
 
 		 1257 aa  813    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1034  ABC transporter related  41.88 
 
 		 1321 aa  799    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.229722 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1516  ABC transporter related  44.43 
 
 		 1231 aa  790    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.347232 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1884  ABC transporter related protein  39.9 
 
 		 1332 aa  664    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2029  ABC transporter related  100 
 
 		 1230 aa  2390    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3783  ABC transporter related  41.09 
 
 		 1301 aa  788    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377067  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4692  ABC transporter related protein  41.08 
 
 		 1218 aa  721    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.131662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2950  ATP-binding protein  35.1 
 
 		 1218 aa  606  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.03128e-16 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3072  ATP binding cassette  35.16 
 
 		 1218 aa  609  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2969  ATP binding cassette  35.27 
 
 		 1218 aa  603  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00365409 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2886  ATP binding cassette  35.1 
 
 		 1218 aa  593  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2916  ATP binding cassette  35 
 
 		 1218 aa  587  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.352142  normal  0.12308 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6252  ABC transporter related  44.11 
 
 		 1436 aa  454  1.0000000000000001e-126  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5296  ABC transporter related  45.69 
 
 		 1522 aa  449  1.0000000000000001e-124  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10196  drug ABC transporter ATP-binding protein  43.68 
 
 		 1194 aa  402  9.999999999999999e-111  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2921  ABC transporter related protein  42.22 
 
 		 636 aa  391  1e-107  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1201  ABC transporter related protein  36.07 
 
 		 594 aa  388  1e-106  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2497  ABC transporter related  40.68 
 
 		 614 aa  386  1e-105  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4444  ABC transporter related  39.9 
 
 		 610 aa  381  1e-104  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.949596  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4531  ABC transporter related  39.9 
 
 		 610 aa  381  1e-104  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.319604  normal  0.425635 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4826  ABC transporter related  40 
 
 		 610 aa  380  1e-104  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.596215 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  32.53 
 
 		 597 aa  377  1e-103  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2717  ABC transporter related  39.97 
 
 		 608 aa  378  1e-103  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0801  ABC transporter-like protein  37.33 
 
 		 635 aa  375  1e-102  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.678319 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2371  ABC transporter, ATPase subunit  36.05 
 
 		 622 aa  372  1e-101  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5528  ABC transporter related protein  39.3 
 
 		 614 aa  370  1e-101  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0313  ABC transporter, ATP-binding/membrane-spanning protein  33.45 
 
 		 590 aa  364  7.0000000000000005e-99  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2181  ABC transporter related  34.18 
 
 		 600 aa  364  7.0000000000000005e-99  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0494  ABC transporter related  37.33 
 
 		 611 aa  362  3e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2505  ABC transporter related protein  36.93 
 
 		 607 aa  361  4e-98  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.152219  normal  0.502097 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2627  ABC transporter related  38.32 
 
 		 592 aa  361  5e-98  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0048  ABC transporter related  32.19 
 
 		 598 aa  360  9.999999999999999e-98  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000163685  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19280  ABC transporter related  36.26 
 
 		 609 aa  359  1.9999999999999998e-97  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0418  ABC transporter related protein  36.17 
 
 		 600 aa  358  3.9999999999999996e-97  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4285  ABC transporter related  34.98 
 
 		 1179 aa  357  7.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4081  ABC transporter, transmembrane region, type 1  34.98 
 
 		 1179 aa  357  7.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3493  ABC transporter related  35.18 
 
 		 1179 aa  354  7e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1962  ABC efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  34.8 
 
 		 1201 aa  354  8e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.072256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3442  cysteine ABC transporter permease/ATP-binding protein  34.95 
 
 		 1179 aa  353  8e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.507362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1748  ABC transporter related  41.57 
 
 		 605 aa  353  8e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02300  ABC-transporterMultidrug resistance protein MDR ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9Y8G1]  27.51 
 
 		 1343 aa  353  1e-95  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.567277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1227  ABC transporter related  40.35 
 
 		 619 aa  352  2e-95  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.141283  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1540  multidrug ABC transporter ATPase/permease  35.59 
 
 		 602 aa  352  3e-95  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.652681  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3416  ABC transporter-related protein  37.85 
 
 		 602 aa  351  5e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3801  hypothetical protein  40.63 
 
 		 615 aa  351  5e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1250  ABC transporter related  36.35 
 
 		 610 aa  351  5e-95  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18490  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  41.47 
 
 		 621 aa  349  2e-94  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1469  ABC transporter related protein  33.8 
 
 		 586 aa  348  4e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02349  ATP-binding cassette multidrug transport protein ATRC [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9Y8G2]  28.88 
 
 		 1284 aa  348  5e-94  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.506788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0648  ABC transporter related  38.45 
 
 		 623 aa  347  1e-93  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.986523 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0669  ABC transporter related  32.74 
 
 		 588 aa  346  2e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.921203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3627  ABC transporter related  37.14 
 
 		 617 aa  345  2e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4763  ABC transporter related  32.58 
 
 		 591 aa  346  2e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.116722  normal  0.0159357 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1942  ABC transporter, transmembrane region  35.82 
 
 		 594 aa  345  2.9999999999999997e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3183  cyclic nucleotide-binding protein  39.61 
 
 		 608 aa  345  2.9999999999999997e-93  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0387  ABC transporter related  34.92 
 
 		 611 aa  345  4e-93  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.000000031667  normal  0.0347309 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0419  ABC transporter-related protein  35.15 
 
 		 608 aa  343  1e-92  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0718918 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5005  ABC transporter-related protein  40.13 
 
 		 606 aa  343  1e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0453  ATPase  33.75 
 
 		 614 aa  343  2e-92  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0318  ABC transporter related  35.27 
 
 		 603 aa  342  2e-92  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3403  ABC transporter related  38.7 
 
 		 610 aa  341  4e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0520  ABC transporter related  40.32 
 
 		 652 aa  340  9.999999999999999e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00806721  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1776  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.19 
 
 		 589 aa  338  2.9999999999999997e-91  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184019  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2282  ABC transporter related  38.15 
 
 		 609 aa  338  2.9999999999999997e-91  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2254  ABC transporter related  36.51 
 
 		 592 aa  337  5.999999999999999e-91  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02150  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  36.42 
 
 		 608 aa  337  9e-91  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3782  ABC transporter related  33.63 
 
 		 594 aa  337  1e-90  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.91836  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0101  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  38.29 
 
 		 592 aa  336  2e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1441  ABC transporter related protein  40.82 
 
 		 606 aa  336  2e-90  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.695725  normal  0.760619 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0033  ABC transporter related  36.17 
 
 		 602 aa  336  2e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1227  ABC transporter related  31.99 
 
 		 589 aa  335  3e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.175574 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1805  ABC transporter related protein  41.18 
 
 		 596 aa  335  4e-90  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.759471  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1761  ATPase  35.74 
 
 		 611 aa  333  9e-90  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.115592  normal  0.424794 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0034  ABC transporter related protein  35.76 
 
 		 603 aa  333  1e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2922  ABC transporter related protein  41.14 
 
 		 581 aa  332  2e-89  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.364865  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2669  ABC transporter related  34.74 
 
 		 637 aa  332  3e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.871518  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0039  putative ATP-binding component of a transport system  39.11 
 
 		 588 aa  331  5.0000000000000004e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0738965  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4080  ABC transporter related  35.62 
 
 		 814 aa  331  5.0000000000000004e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.256448  normal  0.875845 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0545  ABC transporter related  33.28 
 
 		 602 aa  331  5.0000000000000004e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0831  ABC transporter related  37.59 
 
 		 629 aa  331  6e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000188495 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3967  ABC transporter related  35.62 
 
 		 768 aa  331  6e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1666  ABC transporter related  37.95 
 
 		 606 aa  328  5e-88  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.590055  normal  0.300337 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0443  ABC transporter related  31.95 
 
 		 588 aa  327  8.000000000000001e-88  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000201252  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1249  ABC transporter, ATP-binding protein  33.15 
 
 		 598 aa  326  1e-87  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159778 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  37.35 
 
 		 598 aa  326  2e-87  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0422  ABC transporter related  32.98 
 
 		 613 aa  325  3e-87  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.333547  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4860  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  33.27 
 
 		 571 aa  324  5e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.201042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4875  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  33.27 
 
 		 571 aa  324  5e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259113  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5268  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.27 
 
 		 571 aa  324  5e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2332  ABC transporter-related protein  32.21 
 
 		 587 aa  324  8e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000229781  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2584  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  34.66 
 
 		 768 aa  323  9.999999999999999e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5298  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.08 
 
 		 571 aa  323  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5658  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.46 
 
 		 571 aa  323  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5030  ABC transporter ATP-binding/permease  33.27 
 
 		 571 aa  323  1.9999999999999998e-86  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0487117  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5411  ABC transporter permease/ATP-binding protein  33.27 
 
 		 571 aa  323  1.9999999999999998e-86  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7144  ABC transporter related  34.34 
 
 		 632 aa  322  1.9999999999999998e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5343  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.08 
 
 		 571 aa  322  3e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5285  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.08 
 
 		 571 aa  322  3.9999999999999996e-86  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>