More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1441 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_02150  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  58.67 
 
 
608 aa  667    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1666  ABC transporter related  66.83 
 
 
606 aa  725    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.590055  normal  0.300337 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3403  ABC transporter related  62.69 
 
 
610 aa  716    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1805  ABC transporter related protein  67.13 
 
 
596 aa  730    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.759471  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1441  ABC transporter related protein  100 
 
 
606 aa  1167    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.695725  normal  0.760619 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3183  cyclic nucleotide-binding protein  63.39 
 
 
608 aa  724    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18490  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  59.04 
 
 
621 aa  594  1e-168  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0520  ABC transporter related  57.54 
 
 
652 aa  585  1e-166  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00806721  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5528  ABC transporter related protein  53.96 
 
 
614 aa  582  1.0000000000000001e-165  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3801  hypothetical protein  54.74 
 
 
615 aa  569  1e-161  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4444  ABC transporter related  51.4 
 
 
610 aa  568  1e-160  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.949596  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4531  ABC transporter related  51.4 
 
 
610 aa  568  1e-160  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.319604  normal  0.425635 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4826  ABC transporter related  52.55 
 
 
610 aa  568  1e-160  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.596215 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4713  ABC transporter related  55.52 
 
 
616 aa  560  1e-158  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1227  ABC transporter related  54.7 
 
 
619 aa  550  1e-155  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.141283  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0831  ABC transporter related  51.75 
 
 
629 aa  548  1e-154  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000188495 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1748  ABC transporter related  53.14 
 
 
605 aa  538  1e-151  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3786  ABC transporter related  52.11 
 
 
634 aa  533  1e-150  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5005  ABC transporter-related protein  52.15 
 
 
606 aa  524  1e-147  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4166  ABC transporter related  52.03 
 
 
633 aa  513  1e-144  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.24565  hitchhiker  0.00267368 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2921  ABC transporter related protein  43.03 
 
 
636 aa  417  9.999999999999999e-116  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0418  ABC transporter related protein  38.24 
 
 
600 aa  381  1e-104  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3627  ABC transporter related  38.21 
 
 
617 aa  377  1e-103  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1201  ABC transporter related protein  35.92 
 
 
594 aa  365  1e-99  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  32.66 
 
 
597 aa  353  7e-96  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  37.87 
 
 
598 aa  347  3e-94  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2497  ABC transporter related  38.04 
 
 
614 aa  347  4e-94  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0048  ABC transporter related  33.1 
 
 
598 aa  346  6e-94  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000163685  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2717  ABC transporter related  39.41 
 
 
608 aa  346  6e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0494  ABC transporter related  37.37 
 
 
611 aa  346  8.999999999999999e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0838  ABC transporter related  38.21 
 
 
640 aa  342  1e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5296  ABC transporter related  40.1 
 
 
1522 aa  340  4e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1540  multidrug ABC transporter ATPase/permease  34.36 
 
 
602 aa  340  5e-92  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.652681  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3782  ABC transporter related  32.78 
 
 
594 aa  335  1e-90  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.91836  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0387  ABC transporter related  35.01 
 
 
611 aa  335  2e-90  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.000000031667  normal  0.0347309 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2254  ABC transporter related  38.13 
 
 
592 aa  334  2e-90  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1250  ABC transporter related  39.33 
 
 
610 aa  334  2e-90  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13518  ATPase  35.31 
 
 
587 aa  334  3e-90  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30570  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  41.18 
 
 
1257 aa  333  4e-90  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0282  ABC transporter related protein  37.37 
 
 
600 aa  333  5e-90  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0648  ABC transporter related  37.01 
 
 
623 aa  332  1e-89  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.986523 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1305  ABC transporter related  34.57 
 
 
598 aa  331  2e-89  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5937  ABC transporter related  38.9 
 
 
765 aa  330  4e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.268315  normal  0.587315 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0569  ABC transporter related  32.01 
 
 
597 aa  330  6e-89  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2627  ABC transporter related  37.95 
 
 
592 aa  329  7e-89  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2181  ABC transporter related  33.33 
 
 
600 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0313  ABC transporter, ATP-binding/membrane-spanning protein  34.94 
 
 
590 aa  328  2.0000000000000001e-88  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1249  ABC transporter, ATP-binding protein  32.54 
 
 
598 aa  328  2.0000000000000001e-88  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159778 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1430  ABC transporter related  32.3 
 
 
592 aa  327  3e-88  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6252  ABC transporter related  41.12 
 
 
1436 aa  327  3e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1776  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.73 
 
 
589 aa  327  5e-88  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184019  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3416  ABC transporter-related protein  38.14 
 
 
602 aa  325  2e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0377  ABC transporter related  38.64 
 
 
1264 aa  324  2e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.843886  normal  0.12564 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1385  ABC transporter related  36.04 
 
 
622 aa  324  3e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0419  ABC transporter-related protein  34.99 
 
 
608 aa  324  3e-87  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0718918 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3783  ABC transporter related  39.62 
 
 
1301 aa  323  5e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377067  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1942  ABC transporter, transmembrane region  38.87 
 
 
594 aa  322  1.9999999999999998e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6412  ABC transporter related  39.07 
 
 
649 aa  321  1.9999999999999998e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2371  ABC transporter, ATPase subunit  34.34 
 
 
622 aa  320  3.9999999999999996e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1554  ABC transporter related  35.24 
 
 
612 aa  320  6e-86  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.138935  hitchhiker  0.00285078 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0806  ABC transporter related  36.33 
 
 
666 aa  319  1e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0101  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  38.35 
 
 
592 aa  318  2e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19280  ABC transporter related  33.1 
 
 
609 aa  318  2e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4692  ABC transporter related protein  40.52 
 
 
1218 aa  318  2e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.131662  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1359  ABC transporter related  33.67 
 
 
608 aa  318  2e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2505  ABC transporter related protein  34.08 
 
 
607 aa  317  3e-85  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.152219  normal  0.502097 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0740  ABC transporter related protein  35.62 
 
 
615 aa  317  3e-85  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0335  ABC transporter transmembrane region  31.97 
 
 
588 aa  317  3e-85  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0453  ATPase  34.57 
 
 
614 aa  317  4e-85  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0017  ABC transporter related  33.88 
 
 
593 aa  317  4e-85  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1180  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.53 
 
 
637 aa  317  5e-85  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0842  ABC transporter, transmembrane region  40.12 
 
 
672 aa  316  6e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.111523 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4668  ABC transporter, transmembrane region  31.33 
 
 
584 aa  316  6e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1342  ABC transporter related  33.94 
 
 
671 aa  316  7e-85  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6290  ABC transporter related protein  37.8 
 
 
598 aa  315  9.999999999999999e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2726  ABC transporter related  35.69 
 
 
610 aa  315  1.9999999999999998e-84  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3376  ABC transporter related  35.69 
 
 
610 aa  315  1.9999999999999998e-84  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0785  ABC transporter transmembrane region  40.08 
 
 
701 aa  314  2.9999999999999996e-84  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.244223  hitchhiker  0.00200741 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_964  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.95 
 
 
637 aa  314  3.9999999999999997e-84  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.600764  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1520  ABC transporter related  36.21 
 
 
597 aa  313  3.9999999999999997e-84  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.887648  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2733  ABC transporter related  34.11 
 
 
631 aa  313  6.999999999999999e-84  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.021846  normal  0.190322 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2781  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.78 
 
 
609 aa  312  1e-83  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000466613  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2049  ABC transporter related protein  38.05 
 
 
663 aa  311  2e-83  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.146206  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2029  ABC transporter related  42.24 
 
 
1230 aa  311  2e-83  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0985  ABC transporter, transmembrane region  32.37 
 
 
636 aa  311  2e-83  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2306  ABC transporter related  31.31 
 
 
610 aa  311  2.9999999999999997e-83  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.306403 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0768  ABC transporter related  39.29 
 
 
610 aa  310  4e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1120  ABC transporter, transmembrane region  37.83 
 
 
617 aa  310  4e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0902217  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0617  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  39.29 
 
 
609 aa  310  4e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2264  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.94 
 
 
596 aa  309  1.0000000000000001e-82  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.828033  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1516  ABC transporter related  41.07 
 
 
1231 aa  308  1.0000000000000001e-82  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.347232 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8742  carbohydrate ABC transporter  37.8 
 
 
669 aa  309  1.0000000000000001e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0441  ABC transporter related protein  37.14 
 
 
650 aa  308  1.0000000000000001e-82  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2475  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.08 
 
 
598 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00961334  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2401  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.6 
 
 
598 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2932  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.24 
 
 
598 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00230756 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1227  ABC transporter related  32.51 
 
 
589 aa  308  2.0000000000000002e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.175574 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1275  ABC transporter related protein  32.93 
 
 
576 aa  307  3e-82  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0379  ABC transporter related  37.77 
 
 
653 aa  307  3e-82  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2282  ABC transporter related  35.58 
 
 
609 aa  307  4.0000000000000004e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>