More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0520 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_5528  ABC transporter related protein  54.88 
 
 		 614 aa  645    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4444  ABC transporter related  56.39 
 
 		 610 aa  644    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.949596  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0520  ABC transporter related  100 
 
 		 652 aa  1284    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00806721  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4531  ABC transporter related  56.39 
 
 		 610 aa  644    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.319604  normal  0.425635 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4826  ABC transporter related  56.07 
 
 		 610 aa  643    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.596215 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4713  ABC transporter related  58.27 
 
 		 616 aa  634  1e-180  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0831  ABC transporter related  55.36 
 
 		 629 aa  627  1e-178  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000188495 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3801  hypothetical protein  56.36 
 
 		 615 aa  605  9.999999999999999e-173  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1666  ABC transporter related  55.76 
 
 		 606 aa  604  1.0000000000000001e-171  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.590055  normal  0.300337 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1441  ABC transporter related protein  56.62 
 
 		 606 aa  599  1e-170  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.695725  normal  0.760619 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3786  ABC transporter related  52.26 
 
 		 634 aa  598  1e-170  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1748  ABC transporter related  55.45 
 
 		 605 aa  592  1e-168  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3183  cyclic nucleotide-binding protein  52.82 
 
 		 608 aa  591  1e-167  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4166  ABC transporter related  52.97 
 
 		 633 aa  586  1e-166  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.24565  hitchhiker  0.00267368 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5005  ABC transporter-related protein  55.02 
 
 		 606 aa  586  1e-166  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1805  ABC transporter related protein  54.75 
 
 		 596 aa  585  1e-166  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.759471  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1227  ABC transporter related  55.22 
 
 		 619 aa  583  1.0000000000000001e-165  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.141283  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3403  ABC transporter related  52.15 
 
 		 610 aa  578  1e-164  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18490  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  53.02 
 
 		 621 aa  562  1.0000000000000001e-159  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02150  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  48.6 
 
 		 608 aa  557  1e-157  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2921  ABC transporter related protein  44.52 
 
 		 636 aa  446  1.0000000000000001e-124  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  36.88 
 
 		 597 aa  404  1e-111  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2497  ABC transporter related  41.21 
 
 		 614 aa  394  1e-108  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3627  ABC transporter related  40.6 
 
 		 617 aa  389  1e-107  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2717  ABC transporter related  41.62 
 
 		 608 aa  391  1e-107  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0418  ABC transporter related protein  39.42 
 
 		 600 aa  386  1e-106  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1201  ABC transporter related protein  38.42 
 
 		 594 aa  387  1e-106  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6252  ABC transporter related  42.34 
 
 		 1436 aa  376  1e-103  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5296  ABC transporter related  40.82 
 
 		 1522 aa  376  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2627  ABC transporter related  41.01 
 
 		 592 aa  375  1e-102  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2282  ABC transporter related  39.18 
 
 		 609 aa  368  1e-100  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1430  ABC transporter related  36.07 
 
 		 592 aa  368  1e-100  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0048  ABC transporter related  35.12 
 
 		 598 aa  366  1e-100  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000163685  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30570  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  43.06 
 
 		 1257 aa  365  2e-99  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1540  multidrug ABC transporter ATPase/permease  36.89 
 
 		 602 aa  363  5.0000000000000005e-99  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.652681  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1942  ABC transporter, transmembrane region  38.25 
 
 		 594 aa  360  3e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3782  ABC transporter related  33.9 
 
 		 594 aa  359  9.999999999999999e-98  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.91836  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2181  ABC transporter related  34.93 
 
 		 600 aa  356  8.999999999999999e-97  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0377  ABC transporter related  40.36 
 
 		 1264 aa  354  2.9999999999999997e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.843886  normal  0.12564 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0419  ABC transporter-related protein  34.68 
 
 		 608 aa  353  5e-96  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0718918 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0494  ABC transporter related  37.25 
 
 		 611 aa  352  1e-95  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  38.18 
 
 		 598 aa  350  5e-95  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1554  ABC transporter related  36.95 
 
 		 612 aa  350  5e-95  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.138935  hitchhiker  0.00285078 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0801  ABC transporter-like protein  35.56 
 
 		 635 aa  349  8e-95  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.678319 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3783  ABC transporter related  39.76 
 
 		 1301 aa  347  3e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1250  ABC transporter related  38.59 
 
 		 610 aa  346  6e-94  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7144  ABC transporter related  36.65 
 
 		 632 aa  346  1e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3344  ABC transporter related  38.05 
 
 		 615 aa  345  1e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2350  ABC transporter related protein  39.11 
 
 		 620 aa  345  2e-93  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4692  ABC transporter related protein  43 
 
 		 1218 aa  345  2e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.131662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3872  ABC transporter related  35.73 
 
 		 585 aa  343  5.999999999999999e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0569  ABC transporter related  33.62 
 
 		 597 aa  341  2e-92  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0017  ABC transporter related  34.33 
 
 		 593 aa  342  2e-92  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2505  ABC transporter related protein  36.16 
 
 		 607 aa  340  5.9999999999999996e-92  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.152219  normal  0.502097 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5995  ABC transporter related  35.14 
 
 		 632 aa  339  9.999999999999999e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.210924  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0101  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  38.83 
 
 		 592 aa  338  1.9999999999999998e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1249  ABC transporter, ATP-binding protein  34.02 
 
 		 598 aa  336  7e-91  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159778 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2254  ABC transporter related  37.61 
 
 		 592 aa  336  7.999999999999999e-91  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1305  ABC transporter related  35.86 
 
 		 598 aa  335  1e-90  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2669  ABC transporter related  35.14 
 
 		 637 aa  335  1e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.871518  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3081  ABC multidrug efflux transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  38.38 
 
 		 567 aa  335  2e-90  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0838  ABC transporter related  35.83 
 
 		 640 aa  334  3e-90  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6290  ABC transporter related protein  37.06 
 
 		 598 aa  334  3e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2471  ABC transporter related protein  34.74 
 
 		 600 aa  334  4e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8742  carbohydrate ABC transporter  37.57 
 
 		 669 aa  334  4e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0617  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  37.5 
 
 		 609 aa  333  6e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0768  ABC transporter related  37.5 
 
 		 610 aa  333  7.000000000000001e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3416  ABC transporter-related protein  36.18 
 
 		 602 aa  333  7.000000000000001e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3808  ABC transporter related  38.2 
 
 		 567 aa  333  7.000000000000001e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0584709  normal  0.445528 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0673  ABC transporter related  36.27 
 
 		 650 aa  332  1e-89  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0439  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  33.98 
 
 		 586 aa  332  1e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.214785  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1455  ABC transporter related  36.33 
 
 		 625 aa  332  1e-89  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0511  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.98 
 
 		 586 aa  332  1e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2306  ABC transporter related  36.85 
 
 		 610 aa  331  2e-89  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.306403 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4037  ABC transporter related protein  35.97 
 
 		 764 aa  331  2e-89  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.238544  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3376  ABC transporter related  38.43 
 
 		 610 aa  331  2e-89  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1896  ABC transporter related  33.91 
 
 		 572 aa  332  2e-89  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.332587  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0648  ABC transporter related  38.57 
 
 		 623 aa  331  3e-89  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.986523 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2726  ABC transporter related  38.43 
 
 		 610 aa  331  3e-89  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0806  ABC transporter related  37.62 
 
 		 666 aa  330  4e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0496  ABC transporter ATP-binding/permease  33.8 
 
 		 586 aa  330  5.0000000000000004e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.384636  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0528  ABC transporter permease/ATP-binding protein  33.8 
 
 		 586 aa  330  5.0000000000000004e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.249641  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0584  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.63 
 
 		 586 aa  330  5.0000000000000004e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0545  ABC transporter related  34.84 
 
 		 602 aa  330  7e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0672  ABC transporter related  37.8 
 
 		 777 aa  330  7e-89  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.264122  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0387  ABC transporter related  33.92 
 
 		 611 aa  328  1.0000000000000001e-88  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.000000031667  normal  0.0347309 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0583  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.63 
 
 		 586 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2389  ABC transporter, permease protein/ATP-binding protein  32.05 
 
 		 572 aa  329  1.0000000000000001e-88  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000145644  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0435  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  33.63 
 
 		 586 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.290198  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0475  ABC transporter related  35.89 
 
 		 584 aa  329  1.0000000000000001e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00181463  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3786  ABC transporter  33.74 
 
 		 587 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.469191  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2487  ABC transporter related  32.05 
 
 		 572 aa  329  1.0000000000000001e-88  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.461616  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0785  ABC transporter transmembrane region  38.73 
 
 		 701 aa  328  2.0000000000000001e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.244223  hitchhiker  0.00200741 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0532  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.27 
 
 		 586 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.117534  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0133  ABC transporter, transmembrane region  31.87 
 
 		 613 aa  328  2.0000000000000001e-88  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.260657  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3351  ABC transporter related  32.32 
 
 		 579 aa  328  2.0000000000000001e-88  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.773989  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0949  ABC transporter related  39.63 
 
 		 625 aa  328  2.0000000000000001e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.128787  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2029  ABC transporter related  39.15 
 
 		 1230 aa  327  3e-88  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1776  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.09 
 
 		 589 aa  327  3e-88  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184019  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1520  ABC transporter related  36.8 
 
 		 597 aa  327  3e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.887648  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>