More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0831 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_5528  ABC transporter related protein  54.42 
 
 		 614 aa  662    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3801  hypothetical protein  58.6 
 
 		 615 aa  661    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4444  ABC transporter related  52.92 
 
 		 610 aa  642    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.949596  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0831  ABC transporter related  100 
 
 		 629 aa  1256    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000188495 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4531  ABC transporter related  52.92 
 
 		 610 aa  642    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.319604  normal  0.425635 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4826  ABC transporter related  53.08 
 
 		 610 aa  644    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.596215 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3786  ABC transporter related  55.36 
 
 		 634 aa  645    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4713  ABC transporter related  55.47 
 
 		 616 aa  634  1e-180  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1666  ABC transporter related  53.74 
 
 		 606 aa  629  1e-179  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.590055  normal  0.300337 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1227  ABC transporter related  54.9 
 
 		 619 aa  627  1e-178  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.141283  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0520  ABC transporter related  55.36 
 
 		 652 aa  623  1e-177  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00806721  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1805  ABC transporter related protein  52.67 
 
 		 596 aa  609  1e-173  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.759471  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4166  ABC transporter related  55.45 
 
 		 633 aa  610  1e-173  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.24565  hitchhiker  0.00267368 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3183  cyclic nucleotide-binding protein  50.79 
 
 		 608 aa  600  1e-170  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3403  ABC transporter related  51.42 
 
 		 610 aa  601  1e-170  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1748  ABC transporter related  52.08 
 
 		 605 aa  595  1e-169  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5005  ABC transporter-related protein  52.17 
 
 		 606 aa  590  1e-167  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02150  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  50.42 
 
 		 608 aa  571  1e-161  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1441  ABC transporter related protein  51.99 
 
 		 606 aa  569  1e-161  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.695725  normal  0.760619 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18490  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  50.95 
 
 		 621 aa  555  1e-156  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2921  ABC transporter related protein  42.83 
 
 		 636 aa  426  1e-118  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0418  ABC transporter related protein  38.3 
 
 		 600 aa  379  1e-104  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1942  ABC transporter, transmembrane region  37.63 
 
 		 594 aa  379  1e-104  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3627  ABC transporter related  38.64 
 
 		 617 aa  381  1e-104  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  31.92 
 
 		 597 aa  382  1e-104  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1201  ABC transporter related protein  35.81 
 
 		 594 aa  379  1e-103  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2497  ABC transporter related  37.21 
 
 		 614 aa  379  1e-103  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1540  multidrug ABC transporter ATPase/permease  35.82 
 
 		 602 aa  372  1e-101  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.652681  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5296  ABC transporter related  38.69 
 
 		 1522 aa  369  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2717  ABC transporter related  39.14 
 
 		 608 aa  372  1e-101  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2505  ABC transporter related protein  35.89 
 
 		 607 aa  364  3e-99  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.152219  normal  0.502097 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0494  ABC transporter related  36.21 
 
 		 611 aa  359  7e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2627  ABC transporter related  35.98 
 
 		 592 aa  356  7.999999999999999e-97  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2181  ABC transporter related  33.78 
 
 		 600 aa  355  1e-96  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6252  ABC transporter related  37.93 
 
 		 1436 aa  354  2e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0648  ABC transporter related  38.39 
 
 		 623 aa  354  2e-96  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.986523 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0048  ABC transporter related  33.28 
 
 		 598 aa  353  5.9999999999999994e-96  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000163685  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3783  ABC transporter related  38.49 
 
 		 1301 aa  352  1e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0801  ABC transporter-like protein  34.3 
 
 		 635 aa  350  4e-95  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.678319 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0569  ABC transporter related  33.06 
 
 		 597 aa  350  5e-95  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30570  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  40.12 
 
 		 1257 aa  346  7e-94  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3782  ABC transporter related  32.35 
 
 		 594 aa  345  1e-93  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.91836  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1275  ABC transporter related protein  35.47 
 
 		 576 aa  344  2e-93  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1250  ABC transporter related  36.38 
 
 		 610 aa  343  5e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1776  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.05 
 
 		 589 aa  340  5e-92  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184019  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2109  ATPase  34.9 
 
 		 591 aa  339  8e-92  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.265654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0545  ABC transporter related  34.77 
 
 		 602 aa  338  9.999999999999999e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0387  ABC transporter related  34.57 
 
 		 611 aa  338  1.9999999999999998e-91  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.000000031667  normal  0.0347309 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0133  ABC transporter, transmembrane region  33.5 
 
 		 613 aa  338  1.9999999999999998e-91  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.260657  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1430  ABC transporter related  32.35 
 
 		 592 aa  338  1.9999999999999998e-91  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0806  ABC transporter related  38.03 
 
 		 666 aa  337  2.9999999999999997e-91  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0419  ABC transporter-related protein  32.36 
 
 		 608 aa  337  5e-91  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0718918 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0422  ABC transporter related  33.39 
 
 		 613 aa  336  7.999999999999999e-91  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.333547  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1180  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.73 
 
 		 637 aa  336  9e-91  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1761  ATPase  35.86 
 
 		 611 aa  335  1e-90  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.115592  normal  0.424794 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0985  ABC transporter, transmembrane region  33.06 
 
 		 636 aa  335  1e-90  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0453  ATPase  32.46 
 
 		 614 aa  335  2e-90  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1227  ABC transporter related  33.22 
 
 		 589 aa  335  2e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.175574 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0838  ABC transporter related  35.27 
 
 		 640 aa  334  3e-90  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13518  ATPase  32.55 
 
 		 587 aa  334  3e-90  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0842  ABC transporter, transmembrane region  39.37 
 
 		 672 aa  334  3e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.111523 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0335  ABC transporter transmembrane region  32.15 
 
 		 588 aa  333  5e-90  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3070  ABC transporter related  34.85 
 
 		 604 aa  333  7.000000000000001e-90  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.195979  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1342  ABC transporter related  32.02 
 
 		 671 aa  332  2e-89  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7144  ABC transporter related  33.28 
 
 		 632 aa  330  4e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8742  carbohydrate ABC transporter  36.51 
 
 		 669 aa  330  5.0000000000000004e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1249  ABC transporter, ATP-binding protein  33.28 
 
 		 598 aa  328  2.0000000000000001e-88  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159778 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2622  ABC transporter transmembrane region  37.57 
 
 		 606 aa  328  2.0000000000000001e-88  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.499231  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2733  ABC transporter related  32.68 
 
 		 631 aa  327  3e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.021846  normal  0.190322 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2250  ABC transporter, transmembrane region  39.31 
 
 		 634 aa  328  3e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.993927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4668  ABC transporter, transmembrane region  31.45 
 
 		 584 aa  327  3e-88  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6412  ABC transporter related  38.48 
 
 		 649 aa  327  4.0000000000000003e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_964  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.23 
 
 		 637 aa  327  5e-88  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.600764  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3416  ABC transporter-related protein  34.27 
 
 		 602 aa  327  5e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1469  ABC transporter related protein  32.83 
 
 		 586 aa  326  8.000000000000001e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2471  ABC transporter related protein  35.06 
 
 		 600 aa  325  1e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1034  ABC transporter related  37.97 
 
 		 1321 aa  325  1e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.229722 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10196  drug ABC transporter ATP-binding protein  36.13 
 
 		 1194 aa  325  1e-87  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2726  ABC transporter related  34.29 
 
 		 610 aa  325  2e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2254  ABC transporter related  34.65 
 
 		 592 aa  324  2e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  36.12 
 
 		 598 aa  325  2e-87  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3376  ABC transporter related  37.07 
 
 		 610 aa  324  3e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0443  ABC transporter related  34.65 
 
 		 588 aa  324  3e-87  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000201252  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19280  ABC transporter related  33.45 
 
 		 609 aa  324  3e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2371  ABC transporter, ATPase subunit  33.77 
 
 		 622 aa  323  5e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0507  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.05 
 
 		 618 aa  323  6e-87  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2282  ABC transporter related  36.06 
 
 		 609 aa  323  7e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0387  ABC transporter related  33.45 
 
 		 619 aa  323  7e-87  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.102241  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5646  ABC transporter related protein  35.11 
 
 		 596 aa  323  8e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0495  uncharacterized ABC transporter, ATPase component  34.05 
 
 		 618 aa  322  9.000000000000001e-87  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1429  ABC transporter related  35.65 
 
 		 1284 aa  322  9.999999999999999e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.442581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0841  ABC transporter related  33.45 
 
 		 607 aa  322  9.999999999999999e-87  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2781  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.99 
 
 		 609 aa  321  1.9999999999999998e-86  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000466613  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2539  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.4 
 
 		 598 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1885  ABC transporter related protein  30.74 
 
 		 618 aa  321  3e-86  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0047  ABC transporter-like protein  31.61 
 
 		 586 aa  321  3e-86  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.99996 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4565  ABC transporter related protein  36.03 
 
 		 811 aa  320  3e-86  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2006  ABC transporter related  38.3 
 
 		 575 aa  321  3e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.823185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2669  ABC transporter related  33 
 
 		 637 aa  320  3e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.871518  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0377  ABC transporter related  37.7 
 
 		 1264 aa  320  3e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.843886  normal  0.12564 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>