More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3403 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_1805  ABC transporter related protein  61.63 
 
 
596 aa  731    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.759471  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3183  cyclic nucleotide-binding protein  89.34 
 
 
608 aa  1105    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1441  ABC transporter related protein  62.69 
 
 
606 aa  709    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.695725  normal  0.760619 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3403  ABC transporter related  100 
 
 
610 aa  1219    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1666  ABC transporter related  67.93 
 
 
606 aa  807    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.590055  normal  0.300337 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02150  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  60.57 
 
 
608 aa  714    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18490  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  63.21 
 
 
621 aa  699    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5528  ABC transporter related protein  52.72 
 
 
614 aa  610  1e-173  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4713  ABC transporter related  53.63 
 
 
616 aa  588  1e-167  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4826  ABC transporter related  50.17 
 
 
610 aa  578  1e-164  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.596215 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0831  ABC transporter related  51.42 
 
 
629 aa  576  1.0000000000000001e-163  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000188495 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4444  ABC transporter related  50 
 
 
610 aa  575  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.949596  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4531  ABC transporter related  50 
 
 
610 aa  575  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.319604  normal  0.425635 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3801  hypothetical protein  52.81 
 
 
615 aa  569  1e-161  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0520  ABC transporter related  53.21 
 
 
652 aa  564  1.0000000000000001e-159  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00806721  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1227  ABC transporter related  52.08 
 
 
619 aa  556  1e-157  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.141283  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1748  ABC transporter related  49.59 
 
 
605 aa  546  1e-154  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5005  ABC transporter-related protein  49.08 
 
 
606 aa  532  1e-150  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3786  ABC transporter related  48.69 
 
 
634 aa  532  1e-150  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4166  ABC transporter related  48.28 
 
 
633 aa  510  1e-143  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.24565  hitchhiker  0.00267368 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2921  ABC transporter related protein  40.92 
 
 
636 aa  422  1e-116  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0418  ABC transporter related protein  36.13 
 
 
600 aa  378  1e-103  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1201  ABC transporter related protein  35.14 
 
 
594 aa  373  1e-102  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  35.74 
 
 
597 aa  371  1e-101  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5296  ABC transporter related  40.75 
 
 
1522 aa  363  4e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2497  ABC transporter related  37.32 
 
 
614 aa  356  5.999999999999999e-97  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3782  ABC transporter related  34.47 
 
 
594 aa  356  6.999999999999999e-97  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.91836  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2717  ABC transporter related  37.24 
 
 
608 aa  356  6.999999999999999e-97  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0494  ABC transporter related  35.95 
 
 
611 aa  355  8.999999999999999e-97  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2627  ABC transporter related  37.48 
 
 
592 aa  354  2.9999999999999997e-96  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3416  ABC transporter-related protein  37.3 
 
 
602 aa  354  2.9999999999999997e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1540  multidrug ABC transporter ATPase/permease  36.28 
 
 
602 aa  350  4e-95  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.652681  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1249  ABC transporter, ATP-binding protein  34.04 
 
 
598 aa  349  9e-95  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159778 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3627  ABC transporter related  34.74 
 
 
617 aa  348  1e-94  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0387  ABC transporter related  34.11 
 
 
611 aa  348  2e-94  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.000000031667  normal  0.0347309 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0048  ABC transporter related  33.98 
 
 
598 aa  347  3e-94  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000163685  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0335  ABC transporter transmembrane region  32.99 
 
 
588 aa  345  1e-93  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6252  ABC transporter related  37.98 
 
 
1436 aa  344  2e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0419  ABC transporter-related protein  35.35 
 
 
608 aa  345  2e-93  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0718918 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  37.75 
 
 
598 aa  344  2.9999999999999997e-93  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19280  ABC transporter related  35.43 
 
 
609 aa  343  7e-93  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0648  ABC transporter related  35.37 
 
 
623 aa  341  2e-92  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.986523 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1469  ABC transporter related protein  32.65 
 
 
586 aa  340  4e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2254  ABC transporter related  36.91 
 
 
592 aa  340  5e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0101  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.44 
 
 
592 aa  339  8e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3344  ABC transporter related  36.58 
 
 
615 aa  339  8e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1430  ABC transporter related  32.99 
 
 
592 aa  338  9.999999999999999e-92  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0453  ATPase  32.39 
 
 
614 aa  338  1.9999999999999998e-91  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2181  ABC transporter related  31.46 
 
 
600 aa  338  1.9999999999999998e-91  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1250  ABC transporter related  36.6 
 
 
610 aa  337  2.9999999999999997e-91  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3551  ABC transporter related  36.03 
 
 
632 aa  336  7e-91  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.127969 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2371  ABC transporter, ATPase subunit  33.01 
 
 
622 aa  334  2e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0422  ABC transporter related  31.83 
 
 
613 aa  333  6e-90  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.333547  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1942  ABC transporter, transmembrane region  33.28 
 
 
594 aa  333  6e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1554  ABC transporter related  35.45 
 
 
612 aa  332  1e-89  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.138935  hitchhiker  0.00285078 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0313  ABC transporter, ATP-binding/membrane-spanning protein  32 
 
 
590 aa  332  2e-89  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0569  ABC transporter related  31.81 
 
 
597 aa  332  2e-89  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4668  ABC transporter, transmembrane region  31.12 
 
 
584 aa  332  2e-89  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0673  ABC transporter related  34.62 
 
 
650 aa  330  4e-89  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30570  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  37.03 
 
 
1257 aa  330  5.0000000000000004e-89  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3786  ABC transporter  32.93 
 
 
587 aa  329  8e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.469191  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1528  ABC transporter, transmembrane region  32.93 
 
 
587 aa  329  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00299054  normal  0.0159788 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2270  ABC transporter related  36.12 
 
 
619 aa  329  1.0000000000000001e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.903332  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1520  ABC transporter related  36.86 
 
 
597 aa  329  1.0000000000000001e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.887648  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1305  ABC transporter related  33.7 
 
 
598 aa  328  2.0000000000000001e-88  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2505  ABC transporter related protein  33.5 
 
 
607 aa  327  3e-88  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.152219  normal  0.502097 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5708  ABC transporter related  37.21 
 
 
764 aa  326  9e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.920431  normal  0.127768 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1776  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.7 
 
 
589 aa  326  9e-88  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184019  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0838  ABC transporter related  36.88 
 
 
640 aa  326  9e-88  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6290  ABC transporter related protein  34.47 
 
 
598 aa  325  1e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0034  ABC transporter related protein  33.22 
 
 
603 aa  324  2e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3466  ABC transporter ATP-binding/permease  32.42 
 
 
587 aa  323  5e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.197712  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3695  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.42 
 
 
587 aa  323  5e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000106018 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3740  ABC transporter permease/ATP-binding protein  32.42 
 
 
587 aa  323  5e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.037622  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4037  ABC transporter related protein  39.07 
 
 
764 aa  323  6e-87  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.238544  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3432  ABC transporter, ATP-binding protein  32.42 
 
 
587 aa  323  7e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000147455  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3384  ABC transporter, ATP-binding protein  32.42 
 
 
587 aa  323  7e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.603869  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1385  ABC transporter related  37.25 
 
 
622 aa  323  7e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3719  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.59 
 
 
587 aa  323  8e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3714  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.42 
 
 
587 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.207401  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2029  ABC transporter related  38.46 
 
 
1230 aa  321  1.9999999999999998e-86  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0033  ABC transporter related  32.78 
 
 
602 aa  320  3.9999999999999996e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0806  ABC transporter related  37.12 
 
 
666 aa  320  5e-86  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2049  ABC transporter related protein  34.78 
 
 
663 aa  320  5e-86  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.146206  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2669  ABC transporter related  31.84 
 
 
637 aa  320  6e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.871518  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0318  ABC transporter related  32.73 
 
 
603 aa  317  3e-85  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0017  ABC transporter related  32.61 
 
 
593 aa  318  3e-85  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7144  ABC transporter related  32.75 
 
 
632 aa  317  3e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0282  ABC transporter related protein  35.27 
 
 
600 aa  318  3e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2282  ABC transporter related  37.38 
 
 
609 aa  317  4e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1983  ABC transporter related  34.59 
 
 
629 aa  317  4e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0860642 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1549  ABC transporter related  34.17 
 
 
613 aa  317  5e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0873918  normal  0.0393082 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6412  ABC transporter related  38.24 
 
 
649 aa  317  5e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4080  ABC transporter related  34.82 
 
 
814 aa  316  7e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.256448  normal  0.875845 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4763  ABC transporter related  30.29 
 
 
591 aa  316  9e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.116722  normal  0.0159357 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2264  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.79 
 
 
596 aa  315  9.999999999999999e-85  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.828033  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3967  ABC transporter related  34.82 
 
 
768 aa  315  9.999999999999999e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0801  ABC transporter-like protein  32.19 
 
 
635 aa  316  9.999999999999999e-85  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.678319 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2584  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  33.99 
 
 
768 aa  315  1.9999999999999998e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3979  ABC transporter-related protein  36.31 
 
 
773 aa  315  1.9999999999999998e-84  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>