More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0387 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_0422  ABC transporter related  76.86 
 
 
613 aa  955    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.333547  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1761  ATPase  73.45 
 
 
611 aa  914    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.115592  normal  0.424794 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0453  ATPase  73.94 
 
 
614 aa  929    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0387  ABC transporter related  70.12 
 
 
611 aa  894    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.000000031667  normal  0.0347309 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0318  ABC transporter related  74.25 
 
 
603 aa  935    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0419  ABC transporter-related protein  70.38 
 
 
608 aa  872    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0718918 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0387  ABC transporter related  100 
 
 
619 aa  1263    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.102241  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0418  ABC transporter related protein  49.08 
 
 
600 aa  592  1e-168  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1469  ABC transporter related protein  47 
 
 
586 aa  577  1.0000000000000001e-163  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0313  ABC transporter, ATP-binding/membrane-spanning protein  47.74 
 
 
590 aa  577  1.0000000000000001e-163  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1201  ABC transporter related protein  44.73 
 
 
594 aa  552  1e-156  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4763  ABC transporter related  46.3 
 
 
591 aa  552  1e-156  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.116722  normal  0.0159357 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0669  ABC transporter related  46.91 
 
 
588 aa  546  1e-154  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.921203  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1227  ABC transporter related  44.81 
 
 
589 aa  531  1e-149  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.175574 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0160  ABC transporter related  42.76 
 
 
616 aa  523  1e-147  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2371  ABC transporter, ATPase subunit  43.75 
 
 
622 aa  521  1e-146  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0034  ABC transporter related protein  42.01 
 
 
603 aa  507  9.999999999999999e-143  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0033  ABC transporter related  42.59 
 
 
602 aa  507  9.999999999999999e-143  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3416  ABC transporter-related protein  43.46 
 
 
602 aa  507  9.999999999999999e-143  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13518  ATPase  42.44 
 
 
587 aa  500  1e-140  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0047  ABC transporter-like protein  43.43 
 
 
586 aa  497  1e-139  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.99996 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0101  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  43.86 
 
 
592 aa  497  1e-139  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2181  ABC transporter related  42.86 
 
 
600 aa  495  9.999999999999999e-139  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0335  ABC transporter transmembrane region  41.75 
 
 
588 aa  477  1e-133  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2505  ABC transporter related protein  39.9 
 
 
607 aa  469  1.0000000000000001e-131  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.152219  normal  0.502097 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2613  ABC transporter, transmembrane region  40.33 
 
 
625 aa  467  9.999999999999999e-131  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.200186  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4668  ABC transporter, transmembrane region  39.79 
 
 
584 aa  460  9.999999999999999e-129  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0494  ABC transporter related  39.04 
 
 
611 aa  460  9.999999999999999e-129  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1250  ABC transporter related  39.3 
 
 
610 aa  455  1e-127  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0673  ABC transporter related  43.57 
 
 
650 aa  453  1.0000000000000001e-126  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0443  ABC transporter related  37.8 
 
 
588 aa  454  1.0000000000000001e-126  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000201252  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0801  ABC transporter-like protein  38.41 
 
 
635 aa  452  1.0000000000000001e-126  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.678319 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2627  ABC transporter related  38.89 
 
 
592 aa  451  1e-125  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  38.82 
 
 
597 aa  436  1e-121  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0648  ABC transporter related  38.41 
 
 
623 aa  435  1e-120  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.986523 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1390  ABC transporter related  37.54 
 
 
602 aa  419  1e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.838756  normal  0.671981 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  39.02 
 
 
597 aa  415  1e-114  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3786  ABC transporter  38.07 
 
 
587 aa  413  1e-114  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.469191  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  39.02 
 
 
597 aa  415  1e-114  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0048  ABC transporter related  38.79 
 
 
598 aa  413  1e-114  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000163685  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1528  ABC transporter, transmembrane region  38.25 
 
 
587 aa  412  1e-114  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00299054  normal  0.0159788 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3067  ABC transporter related  36.8 
 
 
621 aa  410  1e-113  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.134342  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2332  ABC transporter-related protein  37.59 
 
 
587 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000229781  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3466  ABC transporter ATP-binding/permease  37.79 
 
 
587 aa  403  1e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.197712  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3384  ABC transporter, ATP-binding protein  37.79 
 
 
587 aa  403  1e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.603869  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3695  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  37.79 
 
 
587 aa  403  1e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000106018 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3740  ABC transporter permease/ATP-binding protein  37.79 
 
 
587 aa  403  1e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.037622  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0880  ABC transporter related  37.54 
 
 
579 aa  402  1e-111  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000184481  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0545  ABC transporter related  38.1 
 
 
602 aa  404  1e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0902  ABC transporter related  37.54 
 
 
579 aa  402  1e-111  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00896089  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2282  ABC transporter related  36.83 
 
 
609 aa  399  9.999999999999999e-111  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3714  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  37.79 
 
 
587 aa  402  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.207401  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3432  ABC transporter, ATP-binding protein  37.61 
 
 
587 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000147455  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3719  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  37.79 
 
 
587 aa  402  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1359  ABC transporter related  38.68 
 
 
608 aa  397  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2497  ABC transporter related  37.69 
 
 
614 aa  397  1e-109  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1776  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.93 
 
 
589 aa  397  1e-109  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184019  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1245  ABC transporter related  38.72 
 
 
594 aa  397  1e-109  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00497584  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1382  ABC transporter related  36.01 
 
 
578 aa  398  1e-109  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.372914  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3627  ABC transporter related  38.03 
 
 
617 aa  399  1e-109  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2618  ABC transporter related  37.88 
 
 
617 aa  398  1e-109  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000100526  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19280  ABC transporter related  35.95 
 
 
609 aa  397  1e-109  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0118  ABC transporter related  36.22 
 
 
645 aa  394  1e-108  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00403697  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2126  ABC transporter related protein  39.62 
 
 
592 aa  394  1e-108  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2717  ABC transporter related  38.77 
 
 
608 aa  395  1e-108  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3813  ABC transporter related protein  37.63 
 
 
642 aa  394  1e-108  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.206928  normal  0.202717 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0017  ABC transporter related  36.72 
 
 
593 aa  390  1e-107  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3365  ABC transporter related  37.43 
 
 
587 aa  389  1e-107  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000714306  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2306  ABC transporter related  37.54 
 
 
610 aa  390  1e-107  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.306403 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0841  ABC transporter related  36.46 
 
 
607 aa  390  1e-107  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2475  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.44 
 
 
598 aa  387  1e-106  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00961334  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2539  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  37.06 
 
 
598 aa  388  1e-106  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0642  ABC transporter related  38.2 
 
 
620 aa  386  1e-106  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.014004  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3782  ABC transporter related  37.24 
 
 
594 aa  388  1e-106  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.91836  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1540  multidrug ABC transporter ATPase/permease  38.07 
 
 
602 aa  389  1e-106  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.652681  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0569  ABC transporter related  36.03 
 
 
597 aa  384  1e-105  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0963  ABC transporter related  36.17 
 
 
599 aa  383  1e-105  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.798601  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1942  ABC transporter, transmembrane region  37.89 
 
 
594 aa  384  1e-105  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2932  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.07 
 
 
598 aa  383  1e-105  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00230756 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2250  ABC transporter related  38.19 
 
 
598 aa  382  1e-104  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0582239  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2276  ABC transporter ATP-binding/permease  37.36 
 
 
598 aa  382  1e-104  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.406907  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2236  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  37.36 
 
 
598 aa  381  1e-104  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0563945  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2444  ABC transporter permease/ATP-binding protein  37.36 
 
 
598 aa  382  1e-104  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.290529  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2460  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  37.36 
 
 
598 aa  382  1e-104  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2401  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.73 
 
 
598 aa  380  1e-104  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2193  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  37.17 
 
 
598 aa  378  1e-103  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0325354  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2350  ABC transporter related protein  38.49 
 
 
620 aa  379  1e-103  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2921  ABC transporter related protein  37.74 
 
 
636 aa  377  1e-103  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1430  ABC transporter related  36.8 
 
 
592 aa  379  1e-103  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2726  ABC transporter related  37.14 
 
 
610 aa  372  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0039  putative ATP-binding component of a transport system  36.76 
 
 
588 aa  374  1e-102  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0738965  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1782  ABC transporter-related protein  35.8 
 
 
605 aa  375  1e-102  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.563719  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0817  ABC transporter related  40.96 
 
 
629 aa  372  1e-102  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.527463  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1429  ABC transporter related  36.44 
 
 
581 aa  373  1e-102  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3376  ABC transporter related  37.14 
 
 
610 aa  373  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1337  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.15 
 
 
589 aa  369  1e-100  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.511584  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1385  ABC transporter related  35.92 
 
 
622 aa  367  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1455  ABC transporter related  35.73 
 
 
625 aa  367  1e-100  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1342  ABC transporter related  39.23 
 
 
671 aa  368  1e-100  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2254  ABC transporter related  34.49 
 
 
592 aa  368  1e-100  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>