More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3786 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4444  ABC transporter related  55.65 
 
 		 610 aa  652    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.949596  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5528  ABC transporter related protein  60.2 
 
 		 614 aa  726    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4166  ABC transporter related  90.38 
 
 		 633 aa  1018    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.24565  hitchhiker  0.00267368 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3801  hypothetical protein  58.54 
 
 		 615 aa  646    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1227  ABC transporter related  59.67 
 
 		 619 aa  665    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.141283  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0831  ABC transporter related  55.36 
 
 		 629 aa  645    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000188495 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4531  ABC transporter related  55.65 
 
 		 610 aa  652    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.319604  normal  0.425635 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4826  ABC transporter related  55.48 
 
 		 610 aa  649    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.596215 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3786  ABC transporter related  100 
 
 		 634 aa  1247    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1748  ABC transporter related  56.84 
 
 		 605 aa  624  1e-177  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5005  ABC transporter-related protein  57.07 
 
 		 606 aa  616  1e-175  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4713  ABC transporter related  54.07 
 
 		 616 aa  594  1e-168  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0520  ABC transporter related  53.29 
 
 		 652 aa  586  1e-166  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00806721  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1805  ABC transporter related protein  54.37 
 
 		 596 aa  577  1.0000000000000001e-163  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.759471  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1666  ABC transporter related  52.09 
 
 		 606 aa  570  1e-161  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.590055  normal  0.300337 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3183  cyclic nucleotide-binding protein  49.67 
 
 		 608 aa  567  1e-160  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3403  ABC transporter related  48.69 
 
 		 610 aa  551  1e-155  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1441  ABC transporter related protein  52.11 
 
 		 606 aa  545  1e-154  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.695725  normal  0.760619 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02150  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  48.36 
 
 		 608 aa  540  9.999999999999999e-153  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18490  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  51.45 
 
 		 621 aa  524  1e-147  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3627  ABC transporter related  41.54 
 
 		 617 aa  420  1e-116  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2921  ABC transporter related protein  42.13 
 
 		 636 aa  404  1e-111  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  35.19 
 
 		 597 aa  403  1e-111  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2627  ABC transporter related  39.61 
 
 		 592 aa  394  1e-108  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5296  ABC transporter related  41.32 
 
 		 1522 aa  391  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0048  ABC transporter related  36.09 
 
 		 598 aa  386  1e-106  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000163685  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1201  ABC transporter related protein  36.65 
 
 		 594 aa  384  1e-105  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2497  ABC transporter related  40.36 
 
 		 614 aa  385  1e-105  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1942  ABC transporter, transmembrane region  38.45 
 
 		 594 aa  378  1e-103  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0418  ABC transporter related protein  39.82 
 
 		 600 aa  378  1e-103  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2717  ABC transporter related  39.9 
 
 		 608 aa  372  1e-102  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0545  ABC transporter related  37.81 
 
 		 602 aa  369  1e-101  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2254  ABC transporter related  38.32 
 
 		 592 aa  371  1e-101  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  39.86 
 
 		 598 aa  366  1e-100  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2181  ABC transporter related  33.92 
 
 		 600 aa  365  1e-100  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30570  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  42.08 
 
 		 1257 aa  367  1e-100  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2282  ABC transporter related  41.34 
 
 		 609 aa  364  2e-99  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0494  ABC transporter related  36.92 
 
 		 611 aa  361  2e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0033  ABC transporter related  36.59 
 
 		 602 aa  361  3e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6252  ABC transporter related  39.75 
 
 		 1436 aa  360  5e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0101  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  38.2 
 
 		 592 aa  359  8e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0034  ABC transporter related protein  36.11 
 
 		 603 aa  359  9e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3783  ABC transporter related  38.83 
 
 		 1301 aa  359  9.999999999999999e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0569  ABC transporter related  33.8 
 
 		 597 aa  357  3.9999999999999996e-97  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2505  ABC transporter related protein  35.28 
 
 		 607 aa  357  3.9999999999999996e-97  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.152219  normal  0.502097 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0801  ABC transporter-like protein  34.16 
 
 		 635 aa  356  8.999999999999999e-97  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.678319 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4692  ABC transporter related protein  39.23 
 
 		 1218 aa  355  1e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.131662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0419  ABC transporter-related protein  33.98 
 
 		 608 aa  353  4e-96  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0718918 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3782  ABC transporter related  32.21 
 
 		 594 aa  353  5e-96  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.91836  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1250  ABC transporter related  37.07 
 
 		 610 aa  352  1e-95  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0841  ABC transporter related  35.31 
 
 		 607 aa  352  1e-95  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0282  ABC transporter related protein  38.46 
 
 		 600 aa  352  1e-95  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1430  ABC transporter related  33.84 
 
 		 592 aa  352  1e-95  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2350  ABC transporter related protein  40.04 
 
 		 620 aa  351  2e-95  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3416  ABC transporter-related protein  36.62 
 
 		 602 aa  351  3e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1540  multidrug ABC transporter ATPase/permease  36.46 
 
 		 602 aa  349  9e-95  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.652681  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1429  ABC transporter related  38.77 
 
 		 1284 aa  348  2e-94  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.442581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1390  ABC transporter related  33.72 
 
 		 602 aa  347  3e-94  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.838756  normal  0.671981 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0838  ABC transporter related  35.84 
 
 		 640 aa  347  3e-94  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0673  ABC transporter related  35.35 
 
 		 650 aa  346  7e-94  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5995  ABC transporter related  36.19 
 
 		 632 aa  345  1e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.210924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2371  ABC transporter, ATPase subunit  35.19 
 
 		 622 aa  345  1e-93  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0648  ABC transporter related  37.92 
 
 		 623 aa  345  1e-93  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.986523 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7144  ABC transporter related  35.94 
 
 		 632 aa  345  1e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1180  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.64 
 
 		 637 aa  345  2e-93  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19280  ABC transporter related  34.55 
 
 		 609 aa  344  2.9999999999999997e-93  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0842  ABC transporter, transmembrane region  40.58 
 
 		 672 aa  344  2.9999999999999997e-93  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.111523 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0387  ABC transporter related  34.39 
 
 		 611 aa  343  5e-93  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.000000031667  normal  0.0347309 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0422  ABC transporter related  31.99 
 
 		 613 aa  343  8e-93  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.333547  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2669  ABC transporter related  34.62 
 
 		 637 aa  342  9e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.871518  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0985  ABC transporter, transmembrane region  34.3 
 
 		 636 aa  342  9e-93  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13518  ATPase  31.92 
 
 		 587 aa  341  2e-92  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1342  ABC transporter related  36.38 
 
 		 671 aa  341  2.9999999999999998e-92  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3872  ABC transporter related  35.17 
 
 		 585 aa  340  4e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0387  ABC transporter related  32.79 
 
 		 619 aa  340  4e-92  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.102241  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_964  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.79 
 
 		 637 aa  340  4e-92  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.600764  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2389  ABC transporter, permease protein/ATP-binding protein  35.03 
 
 		 572 aa  340  5.9999999999999996e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000145644  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2487  ABC transporter related  35.03 
 
 		 572 aa  340  7e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.461616  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0806  ABC transporter related  37.67 
 
 		 666 aa  338  9.999999999999999e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0335  ABC transporter transmembrane region  31.29 
 
 		 588 aa  338  2.9999999999999997e-91  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0453  ATPase  31.81 
 
 		 614 aa  337  3.9999999999999995e-91  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3334  ABC transporter related  36.82 
 
 		 584 aa  337  5.999999999999999e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3583  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0047  ABC transporter-like protein  32.19 
 
 		 586 aa  336  7.999999999999999e-91  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.99996 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3344  ABC transporter related  37.33 
 
 		 615 aa  335  2e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1674  ABC transporter permease/ATP-binding protein  34.83 
 
 		 572 aa  335  2e-90  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0264422  normal  0.294375 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0160  ABC transporter related  34.34 
 
 		 616 aa  335  2e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0768  ABC transporter related  40.12 
 
 		 610 aa  334  2e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0617  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  40.12 
 
 		 609 aa  334  2e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0313  ABC transporter, ATP-binding/membrane-spanning protein  31.98 
 
 		 590 aa  333  4e-90  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0782  ATPase  39.26 
 
 		 598 aa  333  5e-90  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.461775 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2109  ATPase  34.56 
 
 		 591 aa  333  6e-90  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.265654  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1245  ABC transporter related  32.7 
 
 		 594 aa  332  1e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00497584  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2471  ABC transporter related protein  34.57 
 
 		 600 aa  332  2e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4668  ABC transporter, transmembrane region  32.72 
 
 		 584 aa  330  3e-89  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1363  ABC transporter related  36.88 
 
 		 636 aa  330  4e-89  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000676834  normal  0.402453 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2781  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.58 
 
 		 609 aa  330  5.0000000000000004e-89  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000466613  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2015  ABC transporter related  33.56 
 
 		 631 aa  330  6e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.945643  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1761  ATPase  32.84 
 
 		 611 aa  329  1.0000000000000001e-88  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.115592  normal  0.424794 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3786  ABC transporter  32.98 
 
 		 587 aa  329  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.469191  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1776  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.48 
 
 		 589 aa  328  2.0000000000000001e-88  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184019  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>