More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_3344 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007947  Mfla_1549  ABC transporter related  64.2 
 
 		 613 aa  783    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0873918  normal  0.0393082 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1554  ABC transporter related  62.29 
 
 		 612 aa  750    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.138935  hitchhiker  0.00285078 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3344  ABC transporter related  100 
 
 		 615 aa  1215    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5528  ABC transporter related protein  38 
 
 		 614 aa  369  1e-101  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4444  ABC transporter related  38.43 
 
 		 610 aa  367  1e-100  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.949596  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1227  ABC transporter related  40.42 
 
 		 619 aa  367  1e-100  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.141283  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4531  ABC transporter related  38.43 
 
 		 610 aa  367  1e-100  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.319604  normal  0.425635 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4826  ABC transporter related  38.43 
 
 		 610 aa  367  1e-100  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.596215 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2282  ABC transporter related  42.32 
 
 		 609 aa  360  4e-98  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2627  ABC transporter related  38.87 
 
 		 592 aa  352  1e-95  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1201  ABC transporter related protein  33.17 
 
 		 594 aa  351  3e-95  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  33.62 
 
 		 597 aa  349  8e-95  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0418  ABC transporter related protein  36.93 
 
 		 600 aa  347  4e-94  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2921  ABC transporter related protein  38.49 
 
 		 636 aa  346  7e-94  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02150  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  38.37 
 
 		 608 aa  345  1e-93  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0740  ABC transporter related protein  36.32 
 
 		 615 aa  344  2e-93  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2505  ABC transporter related protein  36.38 
 
 		 607 aa  342  1e-92  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.152219  normal  0.502097 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0387  ABC transporter related  34.29 
 
 		 611 aa  340  4e-92  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.000000031667  normal  0.0347309 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3403  ABC transporter related  39.55 
 
 		 610 aa  338  9.999999999999999e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3801  hypothetical protein  36.66 
 
 		 615 aa  337  3.9999999999999995e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3334  ABC transporter related  37.45 
 
 		 584 aa  337  3.9999999999999995e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3583  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3183  cyclic nucleotide-binding protein  39.75 
 
 		 608 aa  336  5.999999999999999e-91  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0648  ABC transporter related  36.99 
 
 		 623 aa  335  1e-90  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.986523 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5005  ABC transporter-related protein  36.78 
 
 		 606 aa  335  2e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1748  ABC transporter related  36.59 
 
 		 605 aa  335  2e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2497  ABC transporter related  38.37 
 
 		 614 aa  334  3e-90  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2389  ABC transporter, permease protein/ATP-binding protein  32.76 
 
 		 572 aa  333  4e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000145644  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1674  ABC transporter permease/ATP-binding protein  32.76 
 
 		 572 aa  333  5e-90  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0264422  normal  0.294375 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1342  ABC transporter related  35.08 
 
 		 671 aa  333  5e-90  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2487  ABC transporter related  32.76 
 
 		 572 aa  333  5e-90  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.461616  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2350  ABC transporter related protein  36.99 
 
 		 620 aa  333  6e-90  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0453  ATPase  34.06 
 
 		 614 aa  333  8e-90  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1666  ABC transporter related  40.36 
 
 		 606 aa  331  3e-89  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.590055  normal  0.300337 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1805  ABC transporter related protein  40.82 
 
 		 596 aa  330  4e-89  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.759471  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0048  ABC transporter related  34.27 
 
 		 598 aa  330  5.0000000000000004e-89  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000163685  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18490  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  38.63 
 
 		 621 aa  330  5.0000000000000004e-89  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1469  ABC transporter related protein  33.78 
 
 		 586 aa  330  5.0000000000000004e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0419  ABC transporter-related protein  33.51 
 
 		 608 aa  330  6e-89  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0718918 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1776  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.53 
 
 		 589 aa  330  7e-89  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184019  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2717  ABC transporter related  38.48 
 
 		 608 aa  329  8e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4405  ABC transporter related  34.97 
 
 		 568 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.292842 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0494  ABC transporter related  38.16 
 
 		 611 aa  329  1.0000000000000001e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0520  ABC transporter related  38.99 
 
 		 652 aa  328  2.0000000000000001e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00806721  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0017  ABC transporter related  33.73 
 
 		 593 aa  327  3e-88  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0801  ABC transporter-like protein  34.74 
 
 		 635 aa  327  4.0000000000000003e-88  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.678319 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  33.33 
 
 		 597 aa  325  1e-87  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  33.33 
 
 		 597 aa  325  1e-87  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4038  ABC transporter-related protein  37.37 
 
 		 726 aa  324  2e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000838789 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1250  ABC transporter related  37.96 
 
 		 610 aa  324  3e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2181  ABC transporter related  31.25 
 
 		 600 aa  324  4e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2189  ABC transporter related protein  32.01 
 
 		 572 aa  324  4e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.480877  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1896  ABC transporter related  32.53 
 
 		 572 aa  323  4e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.332587  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4668  ABC transporter, transmembrane region  30.1 
 
 		 584 aa  323  4e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5937  ABC transporter related  37.48 
 
 		 765 aa  323  6e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.268315  normal  0.587315 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30570  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  38.24 
 
 		 1257 aa  322  9.999999999999999e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0422  ABC transporter related  34 
 
 		 613 aa  322  9.999999999999999e-87  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.333547  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1942  ABC transporter, transmembrane region  33.5 
 
 		 594 aa  322  9.999999999999999e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1021  putative ABC transporter  37.33 
 
 		 778 aa  322  1.9999999999999998e-86  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.338231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0669  ABC transporter related  31.88 
 
 		 588 aa  321  3e-86  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.921203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3967  ABC transporter related  36.02 
 
 		 768 aa  320  6e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4080  ABC transporter related  36.02 
 
 		 814 aa  320  6e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.256448  normal  0.875845 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0443  ABC transporter related  32.81 
 
 		 588 aa  320  7e-86  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000201252  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2250  ABC transporter, transmembrane region  37.33 
 
 		 634 aa  319  7e-86  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.993927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0348  ABC transporter related  36.14 
 
 		 663 aa  318  1e-85  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.768573 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5708  ABC transporter related  35.88 
 
 		 764 aa  318  2e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.920431  normal  0.127768 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0569  ABC transporter related  31.2 
 
 		 597 aa  318  2e-85  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3955  ABC transporter, transmembrane region  37.55 
 
 		 631 aa  318  2e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.375009  decreased coverage  0.0046772 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0838  ABC transporter related  36.92 
 
 		 640 aa  318  3e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3627  ABC transporter related  34.61 
 
 		 617 aa  317  5e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1007  ABC transporter related  36.22 
 
 		 784 aa  316  6e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.29536 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2932  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.17 
 
 		 598 aa  316  8e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00230756 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2401  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.34 
 
 		 598 aa  316  8e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1432  ABC transporter related protein  37.71 
 
 		 661 aa  315  9.999999999999999e-85  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.590543  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6412  ABC transporter related  38.32 
 
 		 649 aa  315  9.999999999999999e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0981  ABC transporter related  33.82 
 
 		 576 aa  315  1.9999999999999998e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1540  multidrug ABC transporter ATPase/permease  31.67 
 
 		 602 aa  315  1.9999999999999998e-84  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.652681  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  33.39 
 
 		 598 aa  314  2.9999999999999996e-84  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1782  ABC transporter-related protein  29.7 
 
 		 605 aa  314  2.9999999999999996e-84  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.563719  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1316  ABC transporter related  35.24 
 
 		 784 aa  314  2.9999999999999996e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.512065  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4565  ABC transporter related protein  37.27 
 
 		 811 aa  314  2.9999999999999996e-84  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2584  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  35.11 
 
 		 768 aa  314  3.9999999999999997e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3941  ABC transporter, transmembrane region  37.16 
 
 		 631 aa  313  3.9999999999999997e-84  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1060  ABC transporter related  35.95 
 
 		 760 aa  313  3.9999999999999997e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.120719  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4015  ABC transporter, transmembrane region  37.16 
 
 		 631 aa  313  3.9999999999999997e-84  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0545  ABC transporter related  33.44 
 
 		 602 aa  313  4.999999999999999e-84  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1885  ABC transporter related protein  30.44 
 
 		 618 aa  313  4.999999999999999e-84  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5646  ABC transporter related protein  39.05 
 
 		 596 aa  313  4.999999999999999e-84  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13518  ATPase  30.73 
 
 		 587 aa  313  5.999999999999999e-84  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2539  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.04 
 
 		 598 aa  313  6.999999999999999e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2475  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  29.86 
 
 		 598 aa  312  1e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00961334  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2311  ABC transporter related  34.28 
 
 		 695 aa  312  1e-83  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.28541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6290  ABC transporter related protein  35.85 
 
 		 598 aa  312  1e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1306  ABC transporter related  38.63 
 
 		 582 aa  312  1e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4763  ABC transporter related  31.21 
 
 		 591 aa  312  1e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.116722  normal  0.0159357 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2733  ABC transporter related  32.15 
 
 		 631 aa  311  2e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.021846  normal  0.190322 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0911  ABC transporter related  37.69 
 
 		 640 aa  311  2e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0397453  normal  0.790565 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0806  ABC transporter related  36.45 
 
 		 666 aa  311  2e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28700  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  36.38 
 
 		 677 aa  311  2e-83  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0842  ABC transporter, transmembrane region  35.71 
 
 		 672 aa  311  2e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.111523 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8742  carbohydrate ABC transporter  36.33 
 
 		 669 aa  310  4e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>