More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0740 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0740  ABC transporter related protein  100 
 
 		 615 aa  1250    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0911  ABC transporter related  53.54 
 
 		 640 aa  662    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0397453  normal  0.790565 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  38.57 
 
 		 597 aa  436  1e-121  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2282  ABC transporter related  40.1 
 
 		 609 aa  406  1.0000000000000001e-112  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3627  ABC transporter related  39.59 
 
 		 617 aa  404  1e-111  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1201  ABC transporter related protein  39.09 
 
 		 594 aa  401  9.999999999999999e-111  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2717  ABC transporter related  41.18 
 
 		 608 aa  392  1e-107  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2505  ABC transporter related protein  38.64 
 
 		 607 aa  387  1e-106  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.152219  normal  0.502097 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2497  ABC transporter related  41.6 
 
 		 614 aa  380  1e-104  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0801  ABC transporter-like protein  36.26 
 
 		 635 aa  376  1e-103  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.678319 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7144  ABC transporter related  37.17 
 
 		 632 aa  372  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2921  ABC transporter related protein  37.63 
 
 		 636 aa  375  1e-102  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1942  ABC transporter, transmembrane region  41.41 
 
 		 594 aa  375  1e-102  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1540  multidrug ABC transporter ATPase/permease  36.3 
 
 		 602 aa  371  1e-101  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.652681  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1430  ABC transporter related  36.03 
 
 		 592 aa  371  1e-101  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2669  ABC transporter related  36.9 
 
 		 637 aa  367  1e-100  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.871518  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0313  ABC transporter, ATP-binding/membrane-spanning protein  35.88 
 
 		 590 aa  369  1e-100  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1455  ABC transporter related  39.88 
 
 		 625 aa  364  2e-99  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13518  ATPase  34.77 
 
 		 587 aa  364  3e-99  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0569  ABC transporter related  34.36 
 
 		 597 aa  363  6e-99  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5995  ABC transporter related  36.84 
 
 		 632 aa  362  1e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.210924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3782  ABC transporter related  34.64 
 
 		 594 aa  361  2e-98  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.91836  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19280  ABC transporter related  36.01 
 
 		 609 aa  361  2e-98  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2181  ABC transporter related  35.03 
 
 		 600 aa  360  3e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2350  ABC transporter related protein  39.23 
 
 		 620 aa  360  3e-98  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0949  ABC transporter related  40.72 
 
 		 625 aa  357  2.9999999999999997e-97  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.128787  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2371  ABC transporter, ATPase subunit  34.3 
 
 		 622 aa  355  2e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0048  ABC transporter related  37.62 
 
 		 598 aa  353  4e-96  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000163685  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1249  ABC transporter, ATP-binding protein  33.84 
 
 		 598 aa  353  7e-96  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159778 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1776  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.33 
 
 		 589 aa  353  7e-96  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184019  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1549  ABC transporter related  39.96 
 
 		 613 aa  352  1e-95  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0873918  normal  0.0393082 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0648  ABC transporter related  34.52 
 
 		 623 aa  352  1e-95  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.986523 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0418  ABC transporter related protein  36.77 
 
 		 600 aa  352  2e-95  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0494  ABC transporter related  36.27 
 
 		 611 aa  351  2e-95  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2627  ABC transporter related  37.07 
 
 		 592 aa  349  1e-94  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1305  ABC transporter related  38.13 
 
 		 598 aa  347  5e-94  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  35.73 
 
 		 597 aa  345  1e-93  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  35.73 
 
 		 597 aa  345  1e-93  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3344  ABC transporter related  36.32 
 
 		 615 aa  344  2e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4763  ABC transporter related  32.92 
 
 		 591 aa  343  7e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.116722  normal  0.0159357 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2719  ABC transporter related  37.14 
 
 		 606 aa  341  2e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4668  ABC transporter, transmembrane region  31.91 
 
 		 584 aa  340  5.9999999999999996e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1390  ABC transporter related  36.32 
 
 		 602 aa  339  8e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.838756  normal  0.671981 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1554  ABC transporter related  36.53 
 
 		 612 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.138935  hitchhiker  0.00285078 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0017  ABC transporter related  36.12 
 
 		 593 aa  338  9.999999999999999e-92  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0841  ABC transporter related  35.38 
 
 		 607 aa  339  9.999999999999999e-92  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4826  ABC transporter related  37.33 
 
 		 610 aa  339  9.999999999999999e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.596215 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4444  ABC transporter related  37.13 
 
 		 610 aa  338  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.949596  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4531  ABC transporter related  37.13 
 
 		 610 aa  338  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.319604  normal  0.425635 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2499  ABC transporter transmembrane region  36.18 
 
 		 601 aa  337  2.9999999999999997e-91  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1227  ABC transporter related  34.19 
 
 		 589 aa  337  3.9999999999999995e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.175574 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2471  ABC transporter related protein  34.09 
 
 		 600 aa  336  7.999999999999999e-91  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1250  ABC transporter related  36 
 
 		 610 aa  335  1e-90  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0673  ABC transporter related  38.14 
 
 		 650 aa  333  5e-90  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5528  ABC transporter related protein  37.99 
 
 		 614 aa  333  5e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1469  ABC transporter related protein  31.73 
 
 		 586 aa  333  8e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3070  ABC transporter related  36.58 
 
 		 604 aa  331  2e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.195979  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2389  ABC transporter, permease protein/ATP-binding protein  33.33 
 
 		 572 aa  330  3e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000145644  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0669  ABC transporter related  34.83 
 
 		 588 aa  331  3e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.921203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0453  ATPase  32.59 
 
 		 614 aa  330  4e-89  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2487  ABC transporter related  33.33 
 
 		 572 aa  330  5.0000000000000004e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.461616  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1080  ABC transporter related  38.09 
 
 		 601 aa  330  5.0000000000000004e-89  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169898 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2270  ABC transporter related  35.89 
 
 		 619 aa  330  5.0000000000000004e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.903332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0834  ABC transporter related  37.76 
 
 		 677 aa  329  7e-89  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.34775  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1770  ABC transporter related  32.34 
 
 		 610 aa  329  8e-89  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.686344  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1674  ABC transporter permease/ATP-binding protein  33.33 
 
 		 572 aa  329  1.0000000000000001e-88  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0264422  normal  0.294375 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0684  ABC transporter related  35 
 
 		 598 aa  328  2.0000000000000001e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000210902  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0033  ABC transporter related  35.28 
 
 		 602 aa  328  3e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0397  ABC transporter related protein  33.22 
 
 		 586 aa  327  3e-88  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000282557  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5005  ABC transporter-related protein  38.28 
 
 		 606 aa  327  5e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0443  ABC transporter related  33.74 
 
 		 588 aa  326  7e-88  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000201252  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0047  ABC transporter-like protein  32.99 
 
 		 586 aa  326  7e-88  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.99996 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0047  ABC transporter related  34.62 
 
 		 580 aa  326  9e-88  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00438981  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3081  ABC multidrug efflux transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  36.76 
 
 		 567 aa  325  1e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2392  ABC transporter related  35.46 
 
 		 580 aa  325  1e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3626  ABC transporter related  37.02 
 
 		 588 aa  325  1e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.058238  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3808  ABC transporter related  36.76 
 
 		 567 aa  325  1e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0584709  normal  0.445528 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1761  ATPase  32.76 
 
 		 611 aa  325  2e-87  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.115592  normal  0.424794 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30570  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  37.17 
 
 		 1257 aa  325  2e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0034  ABC transporter related protein  35.17 
 
 		 603 aa  325  2e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1896  ABC transporter related  33.91 
 
 		 572 aa  324  2e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.332587  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2618  ABC transporter related  36.53 
 
 		 617 aa  324  3e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000100526  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1520  ABC transporter related  37.46 
 
 		 597 aa  324  3e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.887648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3551  ABC transporter related  35.19 
 
 		 632 aa  324  3e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.127969 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  36.64 
 
 		 598 aa  324  4e-87  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0738  ABC transporter related  38.19 
 
 		 614 aa  323  4e-87  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2444  ABC transporter related  35.28 
 
 		 580 aa  323  5e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.385044 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0642  ABC transporter related  36.59 
 
 		 620 aa  323  6e-87  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.014004  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3501  ABC transporter related  36.53 
 
 		 575 aa  323  7e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2781  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.61 
 
 		 609 aa  322  9.000000000000001e-87  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000466613  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1158  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  36.42 
 
 		 614 aa  322  9.000000000000001e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0064562  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1275  ABC transporter related protein  33.88 
 
 		 576 aa  322  9.999999999999999e-87  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0422  ABC transporter related  32.66 
 
 		 613 aa  322  9.999999999999999e-87  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.333547  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0335  ABC transporter transmembrane region  32.08 
 
 		 588 aa  322  9.999999999999999e-87  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  35.38 
 
 		 556 aa  321  1.9999999999999998e-86  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1748  ABC transporter related  37.47 
 
 		 605 aa  322  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3932  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.18 
 
 		 567 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.130383  normal  0.874644 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0544  ABC transporter related  34.05 
 
 		 587 aa  320  7e-86  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  37.22 
 
 		 575 aa  318  1e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2254  ABC transporter related  37.3 
 
 		 592 aa  318  2e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>