More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0738 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013203  Apar_0738  ABC transporter related  100 
 
 
614 aa  1256    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2429  ABC transporter related  48.95 
 
 
619 aa  585  1e-166  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.572705  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0397  ABC transporter related protein  49.74 
 
 
586 aa  585  1e-166  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000282557  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0584  ABC transporter transmembrane region  44.19 
 
 
582 aa  530  1e-149  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.321607  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21670  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  46.95 
 
 
670 aa  480  1e-134  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  41.88 
 
 
597 aa  475  1e-133  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  41.88 
 
 
597 aa  476  1e-133  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2733  ABC transporter related  41.24 
 
 
631 aa  474  1e-132  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.021846  normal  0.190322 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09410  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  44.36 
 
 
721 aa  469  1.0000000000000001e-131  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.129131  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0838  ABC transporter related  41.3 
 
 
640 aa  467  9.999999999999999e-131  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0133  ABC transporter, transmembrane region  39.97 
 
 
613 aa  466  9.999999999999999e-131  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.260657  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2049  ABC transporter related protein  44.72 
 
 
663 aa  466  9.999999999999999e-131  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.146206  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1342  ABC transporter related  43.93 
 
 
671 aa  466  9.999999999999999e-131  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4565  ABC transporter related protein  46.11 
 
 
811 aa  464  1e-129  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0856  ABC transporter related  41.65 
 
 
626 aa  456  1e-127  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27200  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  44.27 
 
 
702 aa  457  1e-127  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.663509  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12850  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  44.72 
 
 
608 aa  457  1e-127  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.813218  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0507  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  41.15 
 
 
618 aa  457  1e-127  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0495  uncharacterized ABC transporter, ATPase component  41.15 
 
 
618 aa  457  1e-127  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0806  ABC transporter related  43.21 
 
 
666 aa  456  1e-127  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0148  ABC transporter related  38.85 
 
 
628 aa  457  1e-127  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2618  ABC transporter related  42.17 
 
 
617 aa  456  1e-127  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000100526  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0842  ABC transporter, transmembrane region  44.31 
 
 
672 aa  456  1e-127  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.111523 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1885  ABC transporter related protein  40.73 
 
 
618 aa  452  1.0000000000000001e-126  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6412  ABC transporter related  45.75 
 
 
649 aa  455  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3129  ABC transporter related protein  41.85 
 
 
591 aa  454  1.0000000000000001e-126  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.409554  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0985  ABC transporter, transmembrane region  39.21 
 
 
636 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1432  ABC transporter related protein  42.86 
 
 
661 aa  450  1e-125  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.590543  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2690  multidrug resistance ABC transporter  43.54 
 
 
615 aa  451  1e-125  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0586583  normal  0.13127 
 
 
-
 
NC_002936  DET1180  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  38.7 
 
 
637 aa  448  1.0000000000000001e-124  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2475  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  39.8 
 
 
598 aa  448  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00961334  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1070  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  42.47 
 
 
577 aa  446  1.0000000000000001e-124  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00802304  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1337  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  39.02 
 
 
589 aa  449  1.0000000000000001e-124  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.511584  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_964  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  38.18 
 
 
637 aa  448  1.0000000000000001e-124  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.600764  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28700  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  39.86 
 
 
677 aa  446  1.0000000000000001e-124  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2311  ABC transporter related  43.62 
 
 
695 aa  447  1.0000000000000001e-124  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.28541  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1379  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  40.99 
 
 
615 aa  449  1.0000000000000001e-124  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0800  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  41.46 
 
 
582 aa  445  1.0000000000000001e-124  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0737  ABC transporter related  43.39 
 
 
652 aa  448  1.0000000000000001e-124  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3355  ABC transporter transmembrane region  38.79 
 
 
672 aa  444  1e-123  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2622  ABC transporter transmembrane region  44.84 
 
 
606 aa  443  1e-123  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.499231  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2539  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  40.1 
 
 
598 aa  442  1e-123  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0379  ABC transporter related  45.29 
 
 
653 aa  444  1e-123  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2350  ABC transporter related protein  44.08 
 
 
620 aa  445  1e-123  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0471  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  39.32 
 
 
593 aa  445  1e-123  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0344277  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0785  ABC transporter transmembrane region  45.66 
 
 
701 aa  442  1e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.244223  hitchhiker  0.00200741 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6290  ABC transporter related protein  42.11 
 
 
598 aa  441  9.999999999999999e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2932  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  39.26 
 
 
598 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00230756 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1267  ABC transporter related  45.4 
 
 
623 aa  441  9.999999999999999e-123  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00288622  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2276  ABC transporter ATP-binding/permease  41.47 
 
 
598 aa  440  9.999999999999999e-123  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.406907  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2460  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  41.47 
 
 
598 aa  440  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2236  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  41.65 
 
 
598 aa  442  9.999999999999999e-123  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0563945  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2193  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  41.47 
 
 
598 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0325354  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2444  ABC transporter permease/ATP-binding protein  41.47 
 
 
598 aa  440  9.999999999999999e-123  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.290529  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3251  ABC transporter related  44.78 
 
 
675 aa  441  9.999999999999999e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.135546  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5937  ABC transporter related  44.21 
 
 
765 aa  437  1e-121  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.268315  normal  0.587315 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0203  ABC transporter related  39.97 
 
 
628 aa  437  1e-121  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000017604  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8742  carbohydrate ABC transporter  43.31 
 
 
669 aa  438  1e-121  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0100  ABC transporter related  39.52 
 
 
584 aa  436  1e-121  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.995912  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0642  ABC transporter related  40.97 
 
 
620 aa  438  1e-121  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.014004  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3638  ABC transporter, transmembrane region  43.31 
 
 
665 aa  436  1e-121  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3754  ABC transporter transmembrane region  41.16 
 
 
613 aa  436  1e-121  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.116162  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2401  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  38.76 
 
 
598 aa  436  1e-121  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0632  ABC transporter related  40.92 
 
 
627 aa  434  1e-120  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000138472  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0348  ABC transporter related  41.73 
 
 
663 aa  432  1e-119  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.768573 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3822  ABC transporter transmembrane region  42.08 
 
 
605 aa  431  1e-119  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.568746  hitchhiker  0.00518822 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2015  ABC transporter related  38.91 
 
 
631 aa  430  1e-119  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.945643  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1192  ABC transporter related  37.97 
 
 
625 aa  431  1e-119  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1782  ABC transporter-related protein  40.67 
 
 
605 aa  424  1e-117  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.563719  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0367  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  40.96 
 
 
593 aa  424  1e-117  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.823105  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0266  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  39.04 
 
 
632 aa  425  1e-117  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.358191  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2433  ABC transporter related  44.42 
 
 
624 aa  424  1e-117  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0665672  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0972  ABC transporter transmembrane region  41.84 
 
 
691 aa  425  1e-117  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0935036 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1071  ABC transporter related protein  38.99 
 
 
733 aa  423  1e-117  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3399  ABC transporter related  38.34 
 
 
614 aa  421  1e-116  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2250  ABC transporter related  40.22 
 
 
598 aa  422  1e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0582239  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3941  ABC transporter, transmembrane region  43.6 
 
 
631 aa  419  1e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0364  uncharacterized ABC transporter, ATPase component  40.77 
 
 
593 aa  421  1e-116  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0579  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  39.52 
 
 
595 aa  420  1e-116  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4015  ABC transporter, transmembrane region  43.6 
 
 
631 aa  419  1e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2250  ABC transporter, transmembrane region  43.43 
 
 
634 aa  421  1e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.993927  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1712  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  40 
 
 
575 aa  417  9.999999999999999e-116  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21630  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  39.82 
 
 
691 aa  417  9.999999999999999e-116  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0841  ABC transporter related  38.9 
 
 
607 aa  417  9.999999999999999e-116  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1690  ABC transporter related  39.06 
 
 
607 aa  416  9.999999999999999e-116  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3955  ABC transporter, transmembrane region  43.41 
 
 
631 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.375009  decreased coverage  0.0046772 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2169  ABC transporter related  44.85 
 
 
620 aa  418  9.999999999999999e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0417  ABC transporter related  41.67 
 
 
597 aa  414  1e-114  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2358  ABC transporter related  42.39 
 
 
619 aa  415  1e-114  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.555356  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0858  ABC transporter, transmembrane region  41.47 
 
 
680 aa  414  1e-114  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.438545  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4441  ABC transporter, transmembrane region  43.2 
 
 
642 aa  412  1e-114  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3379  ABC transporter transmembrane region  38.66 
 
 
646 aa  415  1e-114  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2471  ABC transporter related protein  37.63 
 
 
600 aa  414  1e-114  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1525  multidrug ABC transporter ATPase/permease  41.54 
 
 
607 aa  415  1e-114  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.024438  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2497  ABC transporter related  39.26 
 
 
614 aa  406  1.0000000000000001e-112  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2077  ABC transporter related  40.1 
 
 
621 aa  402  1e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11298  drug ABC transporter ATP-binding protein  41.94 
 
 
631 aa  399  1e-109  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2717  ABC transporter related  40.88 
 
 
608 aa  399  1e-109  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0822  ABC transporter related  40.78 
 
 
640 aa  395  1e-108  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0882213  hitchhiker  0.0000266707 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1500  ABC transporter related protein  41.82 
 
 
630 aa  393  1e-108  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000079767  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>