More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1770 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_1770  ABC transporter related  100 
 
 
610 aa  1247    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.686344  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19280  ABC transporter related  52.75 
 
 
609 aa  674    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2781  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  42.93 
 
 
609 aa  528  1e-149  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000466613  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1305  ABC transporter related  45.11 
 
 
598 aa  526  1e-148  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1983  ABC transporter related  39.71 
 
 
629 aa  494  9.999999999999999e-139  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0860642 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3627  ABC transporter related  36.23 
 
 
617 aa  398  1e-109  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  34.95 
 
 
597 aa  393  1e-108  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0569  ABC transporter related  35 
 
 
597 aa  372  1e-102  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2717  ABC transporter related  37.84 
 
 
608 aa  375  1e-102  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2497  ABC transporter related  36.65 
 
 
614 aa  370  1e-101  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1201  ABC transporter related protein  34.27 
 
 
594 aa  369  1e-101  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2505  ABC transporter related protein  33.71 
 
 
607 aa  364  3e-99  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.152219  normal  0.502097 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2181  ABC transporter related  35.68 
 
 
600 aa  358  9.999999999999999e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1776  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.55 
 
 
589 aa  358  1.9999999999999998e-97  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184019  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2618  ABC transporter related  35.11 
 
 
617 aa  355  2e-96  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000100526  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2282  ABC transporter related  34.22 
 
 
609 aa  353  5e-96  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0949  ABC transporter related  37.77 
 
 
625 aa  353  5e-96  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.128787  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1245  ABC transporter related  35.4 
 
 
594 aa  351  2e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00497584  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0494  ABC transporter related  33.11 
 
 
611 aa  351  2e-95  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4826  ABC transporter related  33.51 
 
 
610 aa  350  3e-95  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.596215 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2921  ABC transporter related protein  36.36 
 
 
636 aa  349  7e-95  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4444  ABC transporter related  33.33 
 
 
610 aa  348  2e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.949596  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4531  ABC transporter related  33.33 
 
 
610 aa  348  2e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.319604  normal  0.425635 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0801  ABC transporter-like protein  32.75 
 
 
635 aa  346  8.999999999999999e-94  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.678319 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2627  ABC transporter related  33.28 
 
 
592 aa  344  2.9999999999999997e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1540  multidrug ABC transporter ATPase/permease  32.45 
 
 
602 aa  342  1e-92  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.652681  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1249  ABC transporter, ATP-binding protein  33.51 
 
 
598 aa  341  2e-92  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159778 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3786  ABC transporter  33.1 
 
 
587 aa  341  2e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.469191  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0033  ABC transporter related  31.67 
 
 
602 aa  341  2.9999999999999998e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1455  ABC transporter related  33.49 
 
 
625 aa  340  4e-92  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2932  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.25 
 
 
598 aa  339  8e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00230756 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1528  ABC transporter, transmembrane region  33.1 
 
 
587 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00299054  normal  0.0159788 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3782  ABC transporter related  33.72 
 
 
594 aa  338  9.999999999999999e-92  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.91836  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2126  ABC transporter related protein  33.96 
 
 
592 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2669  ABC transporter related  32.39 
 
 
637 aa  338  1.9999999999999998e-91  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.871518  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2613  ABC transporter, transmembrane region  32.3 
 
 
625 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.200186  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1250  ABC transporter related  33.5 
 
 
610 aa  338  1.9999999999999998e-91  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0034  ABC transporter related protein  31.47 
 
 
603 aa  338  1.9999999999999998e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2401  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.08 
 
 
598 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2371  ABC transporter, ATPase subunit  33.6 
 
 
622 aa  337  2.9999999999999997e-91  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0017  ABC transporter related  36.68 
 
 
593 aa  337  2.9999999999999997e-91  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2350  ABC transporter related protein  35.41 
 
 
620 aa  337  3.9999999999999995e-91  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0048  ABC transporter related  33.95 
 
 
598 aa  337  3.9999999999999995e-91  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000163685  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1430  ABC transporter related  34.67 
 
 
592 aa  337  5.999999999999999e-91  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2389  ABC transporter, permease protein/ATP-binding protein  36 
 
 
572 aa  335  1e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000145644  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2487  ABC transporter related  36 
 
 
572 aa  335  1e-90  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.461616  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3466  ABC transporter ATP-binding/permease  33.96 
 
 
587 aa  334  2e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.197712  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3432  ABC transporter, ATP-binding protein  33.96 
 
 
587 aa  335  2e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000147455  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3384  ABC transporter, ATP-binding protein  33.96 
 
 
587 aa  335  2e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.603869  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3695  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.96 
 
 
587 aa  334  2e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000106018 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0453  ATPase  32.88 
 
 
614 aa  335  2e-90  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3740  ABC transporter permease/ATP-binding protein  33.96 
 
 
587 aa  334  2e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.037622  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1520  ABC transporter related  32.53 
 
 
597 aa  334  3e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.887648  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2539  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.22 
 
 
598 aa  333  4e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1674  ABC transporter permease/ATP-binding protein  36 
 
 
572 aa  333  4e-90  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0264422  normal  0.294375 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0335  ABC transporter transmembrane region  34.31 
 
 
588 aa  333  6e-90  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3719  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.45 
 
 
587 aa  332  1e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7144  ABC transporter related  31.58 
 
 
632 aa  331  2e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  30.61 
 
 
597 aa  331  2e-89  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  30.43 
 
 
597 aa  331  3e-89  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0673  ABC transporter related  38.06 
 
 
650 aa  331  3e-89  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2528  ABC transporter related  35.18 
 
 
580 aa  330  4e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000757065  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2475  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.22 
 
 
598 aa  330  5.0000000000000004e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00961334  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5995  ABC transporter related  32.05 
 
 
632 aa  330  5.0000000000000004e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.210924  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3714  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.45 
 
 
587 aa  330  6e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.207401  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0740  ABC transporter related protein  32.34 
 
 
615 aa  329  8e-89  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0313  ABC transporter, ATP-binding/membrane-spanning protein  33.84 
 
 
590 aa  328  1.0000000000000001e-88  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1942  ABC transporter, transmembrane region  31.24 
 
 
594 aa  328  2.0000000000000001e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0160  ABC transporter related  31.66 
 
 
616 aa  328  2.0000000000000001e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0856  ABC transporter related  35.71 
 
 
626 aa  328  2.0000000000000001e-88  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0418  ABC transporter related protein  33.45 
 
 
600 aa  327  3e-88  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3501  ABC transporter related  34.58 
 
 
575 aa  327  3e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2332  ABC transporter-related protein  32.43 
 
 
587 aa  326  9e-88  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000229781  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1469  ABC transporter related protein  32 
 
 
586 aa  325  1e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13518  ATPase  33.11 
 
 
587 aa  325  2e-87  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  35.73 
 
 
556 aa  325  2e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1390  ABC transporter related  30.23 
 
 
602 aa  324  2e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.838756  normal  0.671981 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0443  ABC transporter related  33.78 
 
 
588 aa  324  3e-87  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000201252  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5285  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.66 
 
 
571 aa  323  5e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30570  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.6 
 
 
1257 aa  322  9.999999999999999e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0642  ABC transporter related  32.83 
 
 
620 aa  322  9.999999999999999e-87  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.014004  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5030  ABC transporter ATP-binding/permease  34.48 
 
 
571 aa  322  1.9999999999999998e-86  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0487117  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4974  ABC transporter related  34.66 
 
 
571 aa  322  1.9999999999999998e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2726  ABC transporter related  34.01 
 
 
610 aa  321  1.9999999999999998e-86  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5411  ABC transporter permease/ATP-binding protein  34.48 
 
 
571 aa  322  1.9999999999999998e-86  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5343  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.48 
 
 
571 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3376  ABC transporter related  34.01 
 
 
610 aa  321  1.9999999999999998e-86  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0841  ABC transporter related  32.81 
 
 
607 aa  322  1.9999999999999998e-86  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5005  ABC transporter-related protein  33.33 
 
 
606 aa  322  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5298  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.48 
 
 
571 aa  322  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1337  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.34 
 
 
589 aa  321  3e-86  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.511584  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4860  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  34.48 
 
 
571 aa  321  3e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.201042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4875  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  34.48 
 
 
571 aa  321  3e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259113  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0348  ABC transporter related  36.2 
 
 
663 aa  321  3e-86  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.768573 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5268  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.48 
 
 
571 aa  321  3e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1896  ABC transporter related  34.2 
 
 
572 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.332587  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2460  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.16 
 
 
598 aa  320  5e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2276  ABC transporter ATP-binding/permease  33.16 
 
 
598 aa  320  5e-86  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.406907  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2444  ABC transporter permease/ATP-binding protein  33.16 
 
 
598 aa  320  5e-86  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.290529  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2250  ABC transporter related  32.82 
 
 
598 aa  320  5e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0582239  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>