More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1983 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_1983  ABC transporter related  100 
 
 
629 aa  1269    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0860642 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19280  ABC transporter related  47.08 
 
 
609 aa  587  1e-166  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2781  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  42.16 
 
 
609 aa  524  1e-147  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000466613  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1770  ABC transporter related  39.71 
 
 
610 aa  513  1e-144  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.686344  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1305  ABC transporter related  40.9 
 
 
598 aa  478  1e-133  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3627  ABC transporter related  43.53 
 
 
617 aa  385  1e-106  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  37.24 
 
 
597 aa  384  1e-105  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1201  ABC transporter related protein  39.69 
 
 
594 aa  369  1e-101  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2282  ABC transporter related  38.76 
 
 
609 aa  365  1e-99  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1885  ABC transporter related protein  36.76 
 
 
618 aa  362  9e-99  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0569  ABC transporter related  32.75 
 
 
597 aa  353  7e-96  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2497  ABC transporter related  38.65 
 
 
614 aa  352  1e-95  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1249  ABC transporter, ATP-binding protein  38.02 
 
 
598 aa  350  3e-95  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159778 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0418  ABC transporter related protein  40.11 
 
 
600 aa  348  2e-94  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0033  ABC transporter related  36.54 
 
 
602 aa  347  5e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0034  ABC transporter related protein  36.7 
 
 
603 aa  345  1e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0494  ABC transporter related  39.12 
 
 
611 aa  345  2e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3782  ABC transporter related  36.23 
 
 
594 aa  344  2.9999999999999997e-93  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.91836  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2717  ABC transporter related  38.42 
 
 
608 aa  343  5e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0949  ABC transporter related  36.8 
 
 
625 aa  341  2.9999999999999998e-92  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.128787  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2627  ABC transporter related  39.15 
 
 
592 aa  340  5e-92  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0801  ABC transporter-like protein  34.06 
 
 
635 aa  340  5.9999999999999996e-92  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.678319 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2350  ABC transporter related protein  38.85 
 
 
620 aa  338  9.999999999999999e-92  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4763  ABC transporter related  35.16 
 
 
591 aa  338  1.9999999999999998e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.116722  normal  0.0159357 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2475  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.24 
 
 
598 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00961334  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1540  multidrug ABC transporter ATPase/permease  33.33 
 
 
602 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.652681  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0101  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  39.31 
 
 
592 aa  337  3.9999999999999995e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2618  ABC transporter related  35.57 
 
 
617 aa  337  3.9999999999999995e-91  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000100526  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2932  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.06 
 
 
598 aa  337  5e-91  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00230756 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0673  ABC transporter related  36.75 
 
 
650 aa  336  5.999999999999999e-91  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1776  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.91 
 
 
589 aa  336  5.999999999999999e-91  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184019  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2401  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.18 
 
 
598 aa  337  5.999999999999999e-91  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0048  ABC transporter related  34.92 
 
 
598 aa  336  5.999999999999999e-91  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000163685  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2371  ABC transporter, ATPase subunit  37.48 
 
 
622 aa  336  7e-91  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2539  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.24 
 
 
598 aa  336  9e-91  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1080  ABC transporter related  39.93 
 
 
601 aa  335  2e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00169898 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2236  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  34.06 
 
 
598 aa  334  3e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0563945  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2276  ABC transporter ATP-binding/permease  34.06 
 
 
598 aa  333  4e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.406907  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2460  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.06 
 
 
598 aa  333  4e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2444  ABC transporter permease/ATP-binding protein  34.06 
 
 
598 aa  333  4e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.290529  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1805  ABC transporter related protein  36.31 
 
 
596 aa  332  9e-90  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.759471  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2181  ABC transporter related  33.91 
 
 
600 aa  332  1e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2193  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  33.88 
 
 
598 aa  332  1e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0325354  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1430  ABC transporter related  35.24 
 
 
592 aa  332  1e-89  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1250  ABC transporter related  39.37 
 
 
610 aa  332  2e-89  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2613  ABC transporter, transmembrane region  35.22 
 
 
625 aa  331  2e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.200186  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  37.93 
 
 
598 aa  331  3e-89  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3551  ABC transporter related  36 
 
 
632 aa  330  4e-89  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.127969 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1455  ABC transporter related  38.06 
 
 
625 aa  330  6e-89  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0282  ABC transporter related protein  37.07 
 
 
600 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2584  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  36.46 
 
 
768 aa  328  2.0000000000000001e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1469  ABC transporter related protein  33.39 
 
 
586 aa  328  3e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0422  ABC transporter related  36.13 
 
 
606 aa  326  7e-88  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3416  ABC transporter-related protein  38.58 
 
 
602 aa  326  8.000000000000001e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  34.8 
 
 
597 aa  325  1e-87  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0160  ABC transporter related  36.93 
 
 
616 aa  325  1e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7144  ABC transporter related  33.82 
 
 
632 aa  324  2e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  34.61 
 
 
597 aa  325  2e-87  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2457  ABC transporter related  38.06 
 
 
602 aa  325  2e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2270  ABC transporter related  35.74 
 
 
619 aa  324  3e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.903332  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0642  ABC transporter related  34.21 
 
 
620 aa  323  5e-87  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.014004  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2921  ABC transporter related protein  38.76 
 
 
636 aa  323  8e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2250  ABC transporter related  34.42 
 
 
598 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0582239  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3262  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  34.61 
 
 
764 aa  322  9.999999999999999e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3070  ABC transporter related  34.59 
 
 
604 aa  322  1.9999999999999998e-86  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.195979  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4668  ABC transporter, transmembrane region  31.62 
 
 
584 aa  321  1.9999999999999998e-86  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2669  ABC transporter related  35.27 
 
 
637 aa  321  3e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.871518  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3403  ABC transporter related  35.17 
 
 
610 aa  321  3e-86  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0705  ABC transporter-related protein  36.15 
 
 
784 aa  320  3.9999999999999996e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0313  ABC transporter, ATP-binding/membrane-spanning protein  34.18 
 
 
590 aa  320  3.9999999999999996e-86  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3967  ABC transporter related  36.08 
 
 
768 aa  320  3.9999999999999996e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1942  ABC transporter, transmembrane region  36.89 
 
 
594 aa  320  5e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1761  ATPase  32.52 
 
 
611 aa  320  5e-86  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.115592  normal  0.424794 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0453  ATPase  34.35 
 
 
614 aa  320  5e-86  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4080  ABC transporter related  36.08 
 
 
814 aa  320  5e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.256448  normal  0.875845 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0387  ABC transporter related  31.94 
 
 
611 aa  319  7.999999999999999e-86  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.000000031667  normal  0.0347309 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4444  ABC transporter related  35.19 
 
 
610 aa  319  1e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.949596  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4531  ABC transporter related  35.19 
 
 
610 aa  319  1e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.319604  normal  0.425635 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  33.46 
 
 
556 aa  318  2e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4826  ABC transporter related  35.07 
 
 
610 aa  318  2e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.596215 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3432  ABC transporter, ATP-binding protein  35.45 
 
 
587 aa  317  4e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000147455  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5995  ABC transporter related  36.64 
 
 
632 aa  317  6e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.210924  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3786  ABC transporter  35.52 
 
 
587 aa  316  7e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.469191  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3466  ABC transporter ATP-binding/permease  35.45 
 
 
587 aa  316  7e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.197712  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3740  ABC transporter permease/ATP-binding protein  35.45 
 
 
587 aa  316  7e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.037622  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1782  ABC transporter-related protein  34.2 
 
 
605 aa  316  7e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.563719  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3695  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.45 
 
 
587 aa  316  7e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000106018 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3384  ABC transporter, ATP-binding protein  35.26 
 
 
587 aa  316  9e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.603869  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1275  ABC transporter related protein  34.11 
 
 
576 aa  315  9.999999999999999e-85  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1666  ABC transporter related  35.45 
 
 
606 aa  315  9.999999999999999e-85  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.590055  normal  0.300337 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5528  ABC transporter related protein  34.85 
 
 
614 aa  315  9.999999999999999e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1180  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.56 
 
 
637 aa  314  2.9999999999999996e-84  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1528  ABC transporter, transmembrane region  35.52 
 
 
587 aa  314  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00299054  normal  0.0159788 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3719  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.45 
 
 
587 aa  314  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0017  ABC transporter related  33.7 
 
 
593 aa  314  3.9999999999999997e-84  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2505  ABC transporter related protein  34.75 
 
 
607 aa  313  3.9999999999999997e-84  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.152219  normal  0.502097 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3183  cyclic nucleotide-binding protein  35.43 
 
 
608 aa  313  3.9999999999999997e-84  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2922  ABC transporter related protein  36.06 
 
 
581 aa  313  4.999999999999999e-84  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.364865  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3714  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.26 
 
 
587 aa  313  5.999999999999999e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.207401  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0495  uncharacterized ABC transporter, ATPase component  34 
 
 
618 aa  312  1e-83  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>