More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5995 on replicon NC_011366
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011366  Rleg2_5995  ABC transporter related  100 
 
 
632 aa  1289    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.210924  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2669  ABC transporter related  80.38 
 
 
637 aa  1041    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.871518  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7144  ABC transporter related  96.2 
 
 
632 aa  1243    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1201  ABC transporter related protein  41.64 
 
 
594 aa  466  9.999999999999999e-131  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3627  ABC transporter related  43.15 
 
 
617 aa  461  9.999999999999999e-129  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2505  ABC transporter related protein  40.26 
 
 
607 aa  446  1.0000000000000001e-124  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.152219  normal  0.502097 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  39.02 
 
 
597 aa  433  1e-120  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2627  ABC transporter related  39.05 
 
 
592 aa  431  1e-119  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2497  ABC transporter related  40.41 
 
 
614 aa  432  1e-119  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0801  ABC transporter-like protein  37.26 
 
 
635 aa  428  1e-118  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.678319 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2181  ABC transporter related  40.87 
 
 
600 aa  419  1e-116  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2371  ABC transporter, ATPase subunit  38.68 
 
 
622 aa  416  9.999999999999999e-116  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2717  ABC transporter related  39.52 
 
 
608 aa  410  1e-113  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19280  ABC transporter related  37.21 
 
 
609 aa  408  1.0000000000000001e-112  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2282  ABC transporter related  39.32 
 
 
609 aa  399  9.999999999999999e-111  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0033  ABC transporter related  38.26 
 
 
602 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0494  ABC transporter related  36.59 
 
 
611 aa  400  9.999999999999999e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3416  ABC transporter-related protein  39.17 
 
 
602 aa  394  1e-108  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0648  ABC transporter related  36.89 
 
 
623 aa  395  1e-108  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.986523 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0101  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  38.97 
 
 
592 aa  389  1e-107  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0017  ABC transporter related  37.85 
 
 
593 aa  389  1e-107  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0034  ABC transporter related protein  37.86 
 
 
603 aa  390  1e-107  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1455  ABC transporter related  36.97 
 
 
625 aa  391  1e-107  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3782  ABC transporter related  36.05 
 
 
594 aa  392  1e-107  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.91836  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1942  ABC transporter, transmembrane region  37.35 
 
 
594 aa  386  1e-106  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2254  ABC transporter related  37.96 
 
 
592 aa  389  1e-106  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0418  ABC transporter related protein  37.82 
 
 
600 aa  388  1e-106  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0545  ABC transporter related  36.6 
 
 
602 aa  384  1e-105  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0569  ABC transporter related  34.57 
 
 
597 aa  385  1e-105  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1250  ABC transporter related  36.39 
 
 
610 aa  385  1e-105  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2613  ABC transporter, transmembrane region  37.98 
 
 
625 aa  385  1e-105  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.200186  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0443  ABC transporter related  35.6 
 
 
588 aa  385  1e-105  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000201252  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2471  ABC transporter related protein  37.74 
 
 
600 aa  380  1e-104  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2475  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.47 
 
 
598 aa  376  1e-103  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00961334  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0160  ABC transporter related  36.89 
 
 
616 aa  376  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1430  ABC transporter related  36.33 
 
 
592 aa  378  1e-103  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2539  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.65 
 
 
598 aa  376  1e-103  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0669  ABC transporter related  35.73 
 
 
588 aa  375  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.921203  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4763  ABC transporter related  35.41 
 
 
591 aa  375  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.116722  normal  0.0159357 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1469  ABC transporter related protein  35.65 
 
 
586 aa  375  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4444  ABC transporter related  36.51 
 
 
610 aa  374  1e-102  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.949596  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  37.05 
 
 
598 aa  374  1e-102  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4531  ABC transporter related  36.51 
 
 
610 aa  374  1e-102  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.319604  normal  0.425635 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2618  ABC transporter related  36.3 
 
 
617 aa  375  1e-102  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000100526  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1776  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.75 
 
 
589 aa  371  1e-101  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184019  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  35.94 
 
 
597 aa  370  1e-101  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  35.94 
 
 
597 aa  370  1e-101  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0673  ABC transporter related  38.9 
 
 
650 aa  370  1e-101  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0617  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.82 
 
 
609 aa  370  1e-101  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0048  ABC transporter related  35.16 
 
 
598 aa  369  1e-101  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000163685  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0282  ABC transporter related protein  38.28 
 
 
600 aa  369  1e-101  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4826  ABC transporter related  36.59 
 
 
610 aa  372  1e-101  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.596215 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0768  ABC transporter related  36.82 
 
 
610 aa  370  1e-101  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0740  ABC transporter related protein  36.89 
 
 
615 aa  367  1e-100  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1227  ABC transporter related  33.56 
 
 
589 aa  369  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.175574 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2193  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  36.82 
 
 
598 aa  366  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0325354  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3786  ABC transporter  36.03 
 
 
587 aa  368  1e-100  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.469191  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1305  ABC transporter related  36.4 
 
 
598 aa  366  1e-100  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  37.72 
 
 
556 aa  366  1e-100  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2932  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.08 
 
 
598 aa  367  1e-100  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00230756 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2350  ABC transporter related protein  39.81 
 
 
620 aa  366  1e-100  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1528  ABC transporter, transmembrane region  35.73 
 
 
587 aa  366  1e-100  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00299054  normal  0.0159788 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1249  ABC transporter, ATP-binding protein  36.14 
 
 
598 aa  369  1e-100  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159778 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5528  ABC transporter related protein  35.9 
 
 
614 aa  367  1e-100  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1540  multidrug ABC transporter ATPase/permease  36.12 
 
 
602 aa  367  1e-100  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.652681  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3365  ABC transporter related  36.68 
 
 
587 aa  364  2e-99  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000714306  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0453  ATPase  34.4 
 
 
614 aa  364  2e-99  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2401  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.27 
 
 
598 aa  365  2e-99  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3466  ABC transporter ATP-binding/permease  35.9 
 
 
587 aa  364  3e-99  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.197712  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3384  ABC transporter, ATP-binding protein  35.9 
 
 
587 aa  364  3e-99  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.603869  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3740  ABC transporter permease/ATP-binding protein  35.9 
 
 
587 aa  364  3e-99  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.037622  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3695  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.9 
 
 
587 aa  364  3e-99  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000106018 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0949  ABC transporter related  41.67 
 
 
625 aa  363  4e-99  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.128787  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3432  ABC transporter, ATP-binding protein  35.9 
 
 
587 aa  363  4e-99  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000147455  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3719  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.9 
 
 
587 aa  363  4e-99  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1761  ATPase  35.57 
 
 
611 aa  363  4e-99  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.115592  normal  0.424794 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0422  ABC transporter related  34.97 
 
 
613 aa  362  8e-99  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.333547  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3067  ABC transporter related  35.62 
 
 
621 aa  362  1e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.134342  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0642  ABC transporter related  35.73 
 
 
620 aa  362  1e-98  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.014004  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13518  ATPase  35.54 
 
 
587 aa  362  1e-98  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3714  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.73 
 
 
587 aa  361  3e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.207401  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2276  ABC transporter ATP-binding/permease  35.79 
 
 
598 aa  361  3e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.406907  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2236  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  35.79 
 
 
598 aa  360  3e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0563945  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2444  ABC transporter permease/ATP-binding protein  35.79 
 
 
598 aa  361  3e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.290529  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2460  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.79 
 
 
598 aa  361  3e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2250  ABC transporter related  35.95 
 
 
598 aa  357  5e-97  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0582239  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0313  ABC transporter, ATP-binding/membrane-spanning protein  35.34 
 
 
590 aa  356  5.999999999999999e-97  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0387  ABC transporter related  34.56 
 
 
611 aa  355  1e-96  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.000000031667  normal  0.0347309 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3872  ABC transporter related  33.63 
 
 
585 aa  353  5.9999999999999994e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30570  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  36.27 
 
 
1257 aa  352  1e-95  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2332  ABC transporter-related protein  35.38 
 
 
587 aa  352  1e-95  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000229781  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0579  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.45 
 
 
595 aa  351  2e-95  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0817  ABC transporter related  35.74 
 
 
629 aa  351  2e-95  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.527463  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0419  ABC transporter-related protein  34.08 
 
 
608 aa  350  7e-95  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0718918 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1954  ABC transporter related  34.94 
 
 
578 aa  349  7e-95  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1920  ABC transporter related  34.94 
 
 
578 aa  349  7e-95  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1390  ABC transporter related  34.46 
 
 
602 aa  348  2e-94  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.838756  normal  0.671981 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1262  ABC transporter related  34.46 
 
 
644 aa  348  2e-94  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4668  ABC transporter, transmembrane region  32.94 
 
 
584 aa  347  3e-94  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1782  ABC transporter-related protein  34.91 
 
 
605 aa  347  4e-94  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.563719  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>