More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1305 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_1305  ABC transporter related  100 
 
 
598 aa  1211    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19280  ABC transporter related  50.83 
 
 
609 aa  622  1e-177  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2781  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  46.55 
 
 
609 aa  536  1e-151  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000466613  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1770  ABC transporter related  45.11 
 
 
610 aa  534  1e-150  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.686344  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1983  ABC transporter related  40.9 
 
 
629 aa  467  9.999999999999999e-131  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0860642 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  40.14 
 
 
597 aa  440  9.999999999999999e-123  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0569  ABC transporter related  39.08 
 
 
597 aa  429  1e-119  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0642  ABC transporter related  43.65 
 
 
620 aa  422  1e-117  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.014004  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3627  ABC transporter related  39.04 
 
 
617 aa  420  1e-116  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1201  ABC transporter related protein  38.75 
 
 
594 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2717  ABC transporter related  38.32 
 
 
608 aa  414  1e-114  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1776  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  39.86 
 
 
589 aa  412  1e-113  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184019  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2497  ABC transporter related  38.77 
 
 
614 aa  408  1.0000000000000001e-112  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2475  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  39.26 
 
 
598 aa  402  1e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00961334  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2932  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  39.93 
 
 
598 aa  404  1e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00230756 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0017  ABC transporter related  40.65 
 
 
593 aa  404  1e-111  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2401  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  39.24 
 
 
598 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2618  ABC transporter related  39.22 
 
 
617 aa  401  9.999999999999999e-111  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000100526  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2539  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  39.51 
 
 
598 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2350  ABC transporter related protein  39.89 
 
 
620 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0048  ABC transporter related  37.88 
 
 
598 aa  396  1e-109  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000163685  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2276  ABC transporter ATP-binding/permease  38.91 
 
 
598 aa  393  1e-108  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.406907  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2236  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  38.91 
 
 
598 aa  392  1e-108  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0563945  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2444  ABC transporter permease/ATP-binding protein  38.91 
 
 
598 aa  393  1e-108  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.290529  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4763  ABC transporter related  38.72 
 
 
591 aa  392  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.116722  normal  0.0159357 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2460  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  38.91 
 
 
598 aa  393  1e-108  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2193  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  38.56 
 
 
598 aa  390  1e-107  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0325354  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0841  ABC transporter related  36.98 
 
 
607 aa  389  1e-107  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2181  ABC transporter related  40.03 
 
 
600 aa  387  1e-106  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  37.63 
 
 
597 aa  385  1e-106  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1782  ABC transporter-related protein  38.87 
 
 
605 aa  387  1e-106  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.563719  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1469  ABC transporter related protein  36.71 
 
 
586 aa  385  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  37.63 
 
 
597 aa  385  1e-106  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2250  ABC transporter related  38.83 
 
 
598 aa  383  1e-105  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0582239  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1540  multidrug ABC transporter ATPase/permease  38 
 
 
602 aa  379  1e-104  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.652681  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1942  ABC transporter, transmembrane region  37.69 
 
 
594 aa  379  1e-104  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1342  ABC transporter related  40.77 
 
 
671 aa  380  1e-104  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2471  ABC transporter related protein  38.2 
 
 
600 aa  381  1e-104  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1455  ABC transporter related  36.39 
 
 
625 aa  377  1e-103  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  38.72 
 
 
556 aa  379  1e-103  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2627  ABC transporter related  36.92 
 
 
592 aa  373  1e-102  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1249  ABC transporter, ATP-binding protein  37.46 
 
 
598 aa  373  1e-102  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159778 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1885  ABC transporter related protein  36.89 
 
 
618 aa  374  1e-102  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0579  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  36.64 
 
 
595 aa  375  1e-102  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0133  ABC transporter, transmembrane region  40.86 
 
 
613 aa  375  1e-102  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.260657  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7144  ABC transporter related  36.4 
 
 
632 aa  374  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2282  ABC transporter related  37.69 
 
 
609 aa  370  1e-101  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0856  ABC transporter related  39.33 
 
 
626 aa  369  1e-101  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0825  ABC transporter related  37.06 
 
 
575 aa  372  1e-101  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0397  ABC transporter related protein  37.37 
 
 
586 aa  372  1e-101  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000282557  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2505  ABC transporter related protein  35.05 
 
 
607 aa  369  1e-101  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.152219  normal  0.502097 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3782  ABC transporter related  36.64 
 
 
594 aa  367  1e-100  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.91836  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0313  ABC transporter, ATP-binding/membrane-spanning protein  37.87 
 
 
590 aa  366  1e-100  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0348  ABC transporter related  41.72 
 
 
663 aa  367  1e-100  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.768573 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1337  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.52 
 
 
589 aa  365  1e-99  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.511584  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0418  ABC transporter related protein  38.21 
 
 
600 aa  365  1e-99  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0949  ABC transporter related  39.47 
 
 
625 aa  365  1e-99  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.128787  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5937  ABC transporter related  40.62 
 
 
765 aa  364  2e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.268315  normal  0.587315 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2622  ABC transporter transmembrane region  40.49 
 
 
606 aa  364  2e-99  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.499231  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2429  ABC transporter related  40 
 
 
619 aa  365  2e-99  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.572705  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28700  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  40.46 
 
 
677 aa  365  2e-99  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0507  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  40.95 
 
 
618 aa  364  3e-99  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0495  uncharacterized ABC transporter, ATPase component  40.95 
 
 
618 aa  364  3e-99  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27200  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  40.9 
 
 
702 aa  363  4e-99  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.663509  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5995  ABC transporter related  36.21 
 
 
632 aa  363  4e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.210924  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2690  multidrug resistance ABC transporter  41.15 
 
 
615 aa  363  5.0000000000000005e-99  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0586583  normal  0.13127 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2733  ABC transporter related  42.65 
 
 
631 aa  362  9e-99  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.021846  normal  0.190322 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0494  ABC transporter related  33.56 
 
 
611 aa  362  1e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4668  ABC transporter, transmembrane region  35.42 
 
 
584 aa  362  1e-98  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3398  ABC transporter related  37.43 
 
 
598 aa  361  2e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273417  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2371  ABC transporter, ATPase subunit  35.24 
 
 
622 aa  361  2e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2669  ABC transporter related  35.48 
 
 
637 aa  360  3e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.871518  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2921  ABC transporter related protein  36.64 
 
 
636 aa  360  4e-98  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0387  ABC transporter related  35.52 
 
 
611 aa  360  4e-98  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.000000031667  normal  0.0347309 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0033  ABC transporter related  34.98 
 
 
602 aa  359  8e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6290  ABC transporter related protein  38.6 
 
 
598 aa  358  1.9999999999999998e-97  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09410  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  40.08 
 
 
721 aa  356  6.999999999999999e-97  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.129131  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_964  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.03 
 
 
637 aa  355  1e-96  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.600764  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1736  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  37.9 
 
 
616 aa  355  1e-96  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3638  ABC transporter, transmembrane region  42.12 
 
 
665 aa  355  1e-96  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0419  ABC transporter-related protein  35.48 
 
 
608 aa  354  2e-96  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0718918 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1500  ABC transporter related protein  37.82 
 
 
630 aa  354  2.9999999999999997e-96  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000079767  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0801  ABC transporter-like protein  32.53 
 
 
635 aa  353  5e-96  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.678319 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0858  ABC transporter, transmembrane region  39.19 
 
 
680 aa  353  5.9999999999999994e-96  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.438545  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1180  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  38.01 
 
 
637 aa  353  7e-96  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0335  ABC transporter transmembrane region  35.34 
 
 
588 aa  353  7e-96  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0034  ABC transporter related protein  34.92 
 
 
603 aa  353  7e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  33.28 
 
 
598 aa  352  1e-95  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0806  ABC transporter related  38.97 
 
 
666 aa  352  1e-95  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3355  ABC transporter transmembrane region  41.61 
 
 
672 aa  352  1e-95  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0422  ABC transporter related  36.41 
 
 
606 aa  352  1e-95  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0475  ABC transporter related  35.81 
 
 
584 aa  351  2e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00181463  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0148  ABC transporter related  37.33 
 
 
628 aa  351  2e-95  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2169  ABC transporter related  39.48 
 
 
620 aa  350  3e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0367  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  37.78 
 
 
593 aa  350  3e-95  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.823105  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6412  ABC transporter related  39.1 
 
 
649 aa  350  4e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0544  ABC transporter related  35.78 
 
 
587 aa  350  4e-95  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0648  ABC transporter related  34.54 
 
 
623 aa  350  5e-95  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.986523 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2616  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  34.97 
 
 
577 aa  350  5e-95  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0639798  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0985  ABC transporter, transmembrane region  37.23 
 
 
636 aa  350  5e-95  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>