More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0422 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0422  ABC transporter related  100 
 
 		 606 aa  1230    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2246  ABC transporter related  47.07 
 
 		 650 aa  568  1e-161  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1386  ABC transporter related  50.63 
 
 		 629 aa  571  1e-161  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000285289  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1948  multidrug ABC transporter ATPase/permease  44.34 
 
 		 671 aa  541  9.999999999999999e-153  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.720417  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1257  hypothetical protein  47.04 
 
 		 639 aa  538  9.999999999999999e-153  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1500  ABC transporter related protein  47.39 
 
 		 630 aa  541  9.999999999999999e-153  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000079767  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3148  ABC transporter related protein  47.55 
 
 		 632 aa  535  1e-150  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1736  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  47.79 
 
 		 616 aa  526  1e-148  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0359  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  45.82 
 
 		 635 aa  523  1e-147  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.101068  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1222  ABC transporter related protein  50.09 
 
 		 608 aa  523  1e-147  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0822  ABC transporter related  45.64 
 
 		 640 aa  516  1.0000000000000001e-145  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0882213  hitchhiker  0.0000266707 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1238  ABC transporter related  46.19 
 
 		 631 aa  516  1.0000000000000001e-145  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0885  ABC transporter related  47.13 
 
 		 638 aa  515  1e-144  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0703423 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1365  ABC transporter related  44.17 
 
 		 621 aa  512  1e-144  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000419806  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1122  ABC transporter, ATP-binding protein  41.11 
 
 		 683 aa  490  1e-137  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.642926 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2350  ABC transporter related protein  45.88 
 
 		 620 aa  478  1e-133  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2475  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  39.97 
 
 		 598 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00961334  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2401  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  40.3 
 
 		 598 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2932  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  40.2 
 
 		 598 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00230756 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1782  ABC transporter-related protein  40.7 
 
 		 605 aa  456  1e-127  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.563719  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2618  ABC transporter related  39.93 
 
 		 617 aa  454  1.0000000000000001e-126  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000100526  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2539  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  39.8 
 
 		 598 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2250  ABC transporter related  39.87 
 
 		 598 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0582239  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  39.42 
 
 		 597 aa  444  1e-123  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  39.42 
 
 		 597 aa  444  1e-123  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2733  ABC transporter related  39.63 
 
 		 631 aa  445  1e-123  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.021846  normal  0.190322 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2236  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  39.8 
 
 		 598 aa  440  9.999999999999999e-123  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0563945  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2193  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  39.64 
 
 		 598 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0325354  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0841  ABC transporter related  40.54 
 
 		 607 aa  439  9.999999999999999e-123  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2276  ABC transporter ATP-binding/permease  39.64 
 
 		 598 aa  438  1e-121  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.406907  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2460  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  39.64 
 
 		 598 aa  438  1e-121  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2444  ABC transporter permease/ATP-binding protein  39.64 
 
 		 598 aa  438  1e-121  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.290529  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0985  ABC transporter, transmembrane region  39.22 
 
 		 636 aa  437  1e-121  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0856  ABC transporter related  37.77 
 
 		 626 aa  430  1e-119  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0266  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  40.67 
 
 		 632 aa  430  1e-119  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.358191  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_964  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  38.24 
 
 		 637 aa  430  1e-119  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.600764  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1180  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  38.4 
 
 		 637 aa  428  1e-118  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0507  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  40.59 
 
 		 618 aa  426  1e-118  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0495  uncharacterized ABC transporter, ATPase component  40.77 
 
 		 618 aa  428  1e-118  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2622  ABC transporter transmembrane region  40.59 
 
 		 606 aa  426  1e-118  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.499231  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0642  ABC transporter related  40.37 
 
 		 620 aa  423  1e-117  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.014004  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28700  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  40.11 
 
 		 677 aa  423  1e-117  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09410  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  40.85 
 
 		 721 aa  422  1e-117  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.129131  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1192  ABC transporter related  37.6 
 
 		 625 aa  423  1e-117  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0584  ABC transporter transmembrane region  39.33 
 
 		 582 aa  425  1e-117  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.321607  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1267  ABC transporter related  40.4 
 
 		 623 aa  421  1e-116  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00288622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2690  multidrug resistance ABC transporter  40.24 
 
 		 615 aa  421  1e-116  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0586583  normal  0.13127 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0367  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  42.64 
 
 		 593 aa  417  9.999999999999999e-116  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.823105  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0203  ABC transporter related  38.57 
 
 		 628 aa  414  1e-114  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000017604  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2169  ABC transporter related  42.72 
 
 		 620 aa  415  1e-114  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0364  uncharacterized ABC transporter, ATPase component  42.83 
 
 		 593 aa  414  1e-114  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2471  ABC transporter related protein  39.43 
 
 		 600 aa  414  1e-114  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1342  ABC transporter related  39.13 
 
 		 671 aa  410  1e-113  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0838  ABC transporter related  37.75 
 
 		 640 aa  410  1e-113  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0632  ABC transporter related  38.31 
 
 		 627 aa  408  1.0000000000000001e-112  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000138472  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21630  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  39.67 
 
 		 691 aa  406  1.0000000000000001e-112  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12850  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  38.1 
 
 		 608 aa  407  1.0000000000000001e-112  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.813218  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2015  ABC transporter related  36.66 
 
 		 631 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.945643  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0100  ABC transporter related  40.46 
 
 		 584 aa  406  1.0000000000000001e-112  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.995912  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1337  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  38.38 
 
 		 589 aa  404  1e-111  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.511584  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1885  ABC transporter related protein  38.53 
 
 		 618 aa  405  1e-111  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2433  ABC transporter related  38.46 
 
 		 624 aa  404  1e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0665672  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0348  ABC transporter related  38.94 
 
 		 663 aa  399  9.999999999999999e-111  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.768573 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1525  multidrug ABC transporter ATPase/permease  39.25 
 
 		 607 aa  396  1e-109  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.024438  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3355  ABC transporter transmembrane region  39.59 
 
 		 672 aa  397  1e-109  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1712  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  39.5 
 
 		 575 aa  398  1e-109  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0417  ABC transporter related  40.18 
 
 		 597 aa  396  1e-109  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0972  ABC transporter transmembrane region  39.89 
 
 		 691 aa  397  1e-109  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0935036 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6412  ABC transporter related  38.88 
 
 		 649 aa  392  1e-108  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8742  carbohydrate ABC transporter  37.75 
 
 		 669 aa  393  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3941  ABC transporter, transmembrane region  39.53 
 
 		 631 aa  393  1e-108  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4015  ABC transporter, transmembrane region  39.53 
 
 		 631 aa  393  1e-108  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0133  ABC transporter, transmembrane region  37.82 
 
 		 613 aa  394  1e-108  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.260657  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2250  ABC transporter, transmembrane region  40 
 
 		 634 aa  394  1e-108  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.993927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27200  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  38.52 
 
 		 702 aa  392  1e-107  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.663509  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0379  ABC transporter related  37.34 
 
 		 653 aa  390  1e-107  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1379  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  36.42 
 
 		 615 aa  389  1e-107  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2049  ABC transporter related protein  39.96 
 
 		 663 aa  390  1e-107  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.146206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3955  ABC transporter, transmembrane region  39.18 
 
 		 631 aa  390  1e-107  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.375009  decreased coverage  0.0046772 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0148  ABC transporter related  35.62 
 
 		 628 aa  385  1e-106  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2717  ABC transporter related  37.04 
 
 		 608 aa  387  1e-106  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1690  ABC transporter related  36.92 
 
 		 607 aa  389  1e-106  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2358  ABC transporter related  39.58 
 
 		 619 aa  386  1e-106  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.555356  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0806  ABC transporter related  38.78 
 
 		 666 aa  388  1e-106  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2497  ABC transporter related  37.08 
 
 		 614 aa  387  1e-106  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1432  ABC transporter related protein  39.53 
 
 		 661 aa  387  1e-106  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.590543  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4441  ABC transporter, transmembrane region  41.68 
 
 		 642 aa  386  1e-106  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3129  ABC transporter related protein  39.07 
 
 		 591 aa  387  1e-106  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.409554  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2429  ABC transporter related  38.52 
 
 		 619 aa  384  1e-105  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.572705  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0579  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  39.06 
 
 		 595 aa  383  1e-105  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0858  ABC transporter, transmembrane region  40.48 
 
 		 680 aa  384  1e-105  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.438545  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3754  ABC transporter transmembrane region  38.61 
 
 		 613 aa  383  1e-105  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.116162  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0842  ABC transporter, transmembrane region  39.76 
 
 		 672 aa  384  1e-105  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.111523 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1455  ABC transporter related  39.63 
 
 		 625 aa  382  1e-105  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21670  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  38.32 
 
 		 670 aa  379  1e-104  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3638  ABC transporter, transmembrane region  38.88 
 
 		 665 aa  380  1e-104  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  35.85 
 
 		 597 aa  379  1e-104  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5937  ABC transporter related  37.43 
 
 		 765 aa  379  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.268315  normal  0.587315 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3379  ABC transporter transmembrane region  36.77 
 
 		 646 aa  379  1e-104  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3399  ABC transporter related  35.58 
 
 		 614 aa  376  1e-103  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>