More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3638 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_28700  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  59.25 
 
 
677 aa  736    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1071  ABC transporter related protein  59.62 
 
 
733 aa  748    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8742  carbohydrate ABC transporter  70.42 
 
 
669 aa  894    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3355  ABC transporter transmembrane region  87.5 
 
 
672 aa  1126    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2733  ABC transporter related  52.81 
 
 
631 aa  680    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.021846  normal  0.190322 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11298  drug ABC transporter ATP-binding protein  59.78 
 
 
631 aa  724    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4565  ABC transporter related protein  61.75 
 
 
811 aa  788    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2622  ABC transporter transmembrane region  59.97 
 
 
606 aa  745    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.499231  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3251  ABC transporter related  55.19 
 
 
675 aa  665    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.135546  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3822  ABC transporter transmembrane region  58.71 
 
 
605 aa  688    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.568746  hitchhiker  0.00518822 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1432  ABC transporter related protein  62.76 
 
 
661 aa  763    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.590543  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0379  ABC transporter related  62.46 
 
 
653 aa  795    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3941  ABC transporter, transmembrane region  61.86 
 
 
631 aa  771    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0348  ABC transporter related  60.48 
 
 
663 aa  774    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.768573 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09410  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  63.49 
 
 
721 aa  793    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.129131  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0806  ABC transporter related  71.36 
 
 
666 aa  897    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0785  ABC transporter transmembrane region  67.17 
 
 
701 aa  805    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.244223  hitchhiker  0.00200741 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21670  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  67.58 
 
 
670 aa  826    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2049  ABC transporter related protein  64.18 
 
 
663 aa  801    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.146206  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6290  ABC transporter related protein  51.91 
 
 
598 aa  640    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0858  ABC transporter, transmembrane region  64.25 
 
 
680 aa  823    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.438545  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3638  ABC transporter, transmembrane region  100 
 
 
665 aa  1333    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27200  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  62.26 
 
 
702 aa  811    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.663509  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1342  ABC transporter related  55.4 
 
 
671 aa  741    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0972  ABC transporter transmembrane region  64.04 
 
 
691 aa  811    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0935036 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0737  ABC transporter related  64.46 
 
 
652 aa  810    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4015  ABC transporter, transmembrane region  61.86 
 
 
631 aa  771    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4441  ABC transporter, transmembrane region  60.83 
 
 
642 aa  723    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21630  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  62.92 
 
 
691 aa  788    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3754  ABC transporter transmembrane region  66.83 
 
 
613 aa  775    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.116162  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2311  ABC transporter related  63.84 
 
 
695 aa  804    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.28541  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3955  ABC transporter, transmembrane region  61.7 
 
 
631 aa  770    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.375009  decreased coverage  0.0046772 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2250  ABC transporter, transmembrane region  63.19 
 
 
634 aa  786    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.993927  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0842  ABC transporter, transmembrane region  67.83 
 
 
672 aa  842    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.111523 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5937  ABC transporter related  59.23 
 
 
765 aa  758    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.268315  normal  0.587315 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6412  ABC transporter related  61.76 
 
 
649 aa  786    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_002936  DET1180  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  48.4 
 
 
637 aa  612  9.999999999999999e-175  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0133  ABC transporter, transmembrane region  49.35 
 
 
613 aa  615  9.999999999999999e-175  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.260657  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_964  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  47.76 
 
 
637 aa  612  9.999999999999999e-175  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.600764  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0507  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  48.38 
 
 
618 aa  609  1e-173  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0495  uncharacterized ABC transporter, ATPase component  48.38 
 
 
618 aa  608  1e-173  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0985  ABC transporter, transmembrane region  47.92 
 
 
636 aa  610  1e-173  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0148  ABC transporter related  47.82 
 
 
628 aa  603  1.0000000000000001e-171  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0838  ABC transporter related  49.37 
 
 
640 aa  602  1.0000000000000001e-171  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2433  ABC transporter related  50.16 
 
 
624 aa  604  1.0000000000000001e-171  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0665672  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0856  ABC transporter related  47.26 
 
 
626 aa  596  1e-169  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1192  ABC transporter related  45.14 
 
 
625 aa  596  1e-169  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12850  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  46.78 
 
 
608 aa  594  1e-168  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.813218  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1267  ABC transporter related  47.04 
 
 
623 aa  593  1e-168  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00288622  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2015  ABC transporter related  47.25 
 
 
631 aa  580  1e-164  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.945643  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0203  ABC transporter related  47.33 
 
 
628 aa  578  1e-164  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000017604  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2077  ABC transporter related  51.88 
 
 
621 aa  581  1e-164  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1690  ABC transporter related  46.17 
 
 
607 aa  577  1.0000000000000001e-163  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1818  ABC transporter related  51.14 
 
 
601 aa  577  1.0000000000000001e-163  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000170896 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0632  ABC transporter related  48.71 
 
 
627 aa  572  1.0000000000000001e-162  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000138472  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1379  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  44.86 
 
 
615 aa  567  1e-160  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0266  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  44.07 
 
 
632 aa  561  1e-158  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.358191  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3399  ABC transporter related  43.91 
 
 
614 aa  552  1e-156  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1712  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  44.8 
 
 
575 aa  529  1e-149  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1525  multidrug ABC transporter ATPase/permease  44.82 
 
 
607 aa  521  1e-146  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.024438  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0471  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  44.55 
 
 
593 aa  520  1e-146  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0344277  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0417  ABC transporter related  44.41 
 
 
597 aa  520  1e-146  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0364  uncharacterized ABC transporter, ATPase component  50 
 
 
593 aa  516  1.0000000000000001e-145  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1337  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  43.93 
 
 
589 aa  512  1e-144  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.511584  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2358  ABC transporter related  43.4 
 
 
619 aa  514  1e-144  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.555356  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0367  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  49.91 
 
 
593 aa  513  1e-144  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.823105  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0100  ABC transporter related  46.37 
 
 
584 aa  509  1e-143  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.995912  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3129  ABC transporter related protein  46.22 
 
 
591 aa  509  1e-143  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.409554  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0584  ABC transporter transmembrane region  45.45 
 
 
582 aa  491  1e-137  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.321607  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2618  ABC transporter related  47 
 
 
617 aa  492  1e-137  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000100526  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  40.03 
 
 
597 aa  483  1e-135  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0579  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  42.51 
 
 
595 aa  484  1e-135  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2350  ABC transporter related protein  48.28 
 
 
620 aa  484  1e-135  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1682  ABC transporter related  43.34 
 
 
613 aa  483  1e-135  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  40.03 
 
 
597 aa  483  1e-135  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3634  ABC transporter related  86.57 
 
 
257 aa  477  1e-133  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1885  ABC transporter related protein  41.23 
 
 
618 aa  473  1e-132  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2690  multidrug resistance ABC transporter  45.35 
 
 
615 aa  466  9.999999999999999e-131  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0586583  normal  0.13127 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0642  ABC transporter related  45.56 
 
 
620 aa  465  1e-129  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.014004  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2475  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  44.08 
 
 
598 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00961334  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2932  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  44.38 
 
 
598 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00230756 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2401  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  39.69 
 
 
598 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2539  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  44.08 
 
 
598 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0841  ABC transporter related  40.84 
 
 
607 aa  454  1.0000000000000001e-126  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0397  ABC transporter related protein  39.84 
 
 
586 aa  455  1.0000000000000001e-126  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000282557  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2460  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  43.32 
 
 
598 aa  452  1e-125  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2276  ABC transporter ATP-binding/permease  43.32 
 
 
598 aa  452  1e-125  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.406907  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2236  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  43.32 
 
 
598 aa  451  1e-125  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0563945  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2193  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  43.13 
 
 
598 aa  449  1e-125  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0325354  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2444  ABC transporter permease/ATP-binding protein  43.32 
 
 
598 aa  452  1e-125  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.290529  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2250  ABC transporter related  44 
 
 
598 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0582239  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0738  ABC transporter related  43.31 
 
 
614 aa  444  1e-123  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2429  ABC transporter related  41.71 
 
 
619 aa  439  9.999999999999999e-123  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.572705  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2471  ABC transporter related protein  41.21 
 
 
600 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1782  ABC transporter-related protein  38.09 
 
 
605 aa  440  9.999999999999999e-123  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.563719  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3379  ABC transporter transmembrane region  41.82 
 
 
646 aa  439  1e-121  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1500  ABC transporter related protein  42.83 
 
 
630 aa  436  1e-121  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000079767  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2169  ABC transporter related  46.46 
 
 
620 aa  434  1e-120  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0800  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  40.23 
 
 
582 aa  433  1e-120  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0359  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  40.82 
 
 
635 aa  426  1e-118  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.101068  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>