More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1238 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE0359  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  55.08 
 
 		 635 aa  706    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.101068  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0822  ABC transporter related  53.41 
 
 		 640 aa  662    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0882213  hitchhiker  0.0000266707 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0885  ABC transporter related  63.85 
 
 		 638 aa  836    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0703423 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1948  multidrug ABC transporter ATPase/permease  50.52 
 
 		 671 aa  646    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.720417  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1238  ABC transporter related  100 
 
 		 631 aa  1303    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2246  ABC transporter related  58.97 
 
 		 650 aa  753    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1386  ABC transporter related  59.58 
 
 		 629 aa  737    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000285289  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1257  hypothetical protein  57.39 
 
 		 639 aa  696    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3148  ABC transporter related protein  73.26 
 
 		 632 aa  997    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1736  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  46.47 
 
 		 616 aa  555  1e-157  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1222  ABC transporter related protein  53.68 
 
 		 608 aa  553  1e-156  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1122  ABC transporter, ATP-binding protein  44.98 
 
 		 683 aa  525  1e-147  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.642926 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1500  ABC transporter related protein  45.02 
 
 		 630 aa  501  1e-140  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000079767  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0422  ABC transporter related  46.19 
 
 		 606 aa  496  1e-139  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1365  ABC transporter related  43.02 
 
 		 621 aa  494  9.999999999999999e-139  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000419806  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2350  ABC transporter related protein  43.64 
 
 		 620 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2690  multidrug resistance ABC transporter  40.22 
 
 		 615 aa  429  1e-119  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0586583  normal  0.13127 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2475  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  40 
 
 		 598 aa  419  1e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00961334  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2932  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  40 
 
 		 598 aa  422  1e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00230756 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2618  ABC transporter related  37.78 
 
 		 617 aa  419  1e-116  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000100526  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2539  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  39.65 
 
 		 598 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2276  ABC transporter ATP-binding/permease  39.29 
 
 		 598 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.406907  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2236  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  39.47 
 
 		 598 aa  418  9.999999999999999e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0563945  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2444  ABC transporter permease/ATP-binding protein  39.29 
 
 		 598 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.290529  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  40.61 
 
 		 597 aa  418  9.999999999999999e-116  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  40.61 
 
 		 597 aa  419  9.999999999999999e-116  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2460  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  39.29 
 
 		 598 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2401  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  39.47 
 
 		 598 aa  418  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2193  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  39.12 
 
 		 598 aa  415  1e-114  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0325354  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2169  ABC transporter related  38.27 
 
 		 620 aa  409  1e-113  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2733  ABC transporter related  37.26 
 
 		 631 aa  410  1e-113  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.021846  normal  0.190322 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0642  ABC transporter related  41.6 
 
 		 620 aa  410  1e-113  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.014004  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0856  ABC transporter related  38.55 
 
 		 626 aa  407  1.0000000000000001e-112  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1782  ABC transporter-related protein  40.14 
 
 		 605 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.563719  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2250  ABC transporter related  39.4 
 
 		 598 aa  404  1e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0582239  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0495  uncharacterized ABC transporter, ATPase component  37.92 
 
 		 618 aa  400  9.999999999999999e-111  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_964  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  38.1 
 
 		 637 aa  401  9.999999999999999e-111  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.600764  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0841  ABC transporter related  37.58 
 
 		 607 aa  400  9.999999999999999e-111  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1885  ABC transporter related protein  37.2 
 
 		 618 aa  402  9.999999999999999e-111  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1192  ABC transporter related  38.55 
 
 		 625 aa  397  1e-109  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0507  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  39.64 
 
 		 618 aa  398  1e-109  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0985  ABC transporter, transmembrane region  37.75 
 
 		 636 aa  396  1e-109  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1180  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  37.92 
 
 		 637 aa  395  1e-108  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0584  ABC transporter transmembrane region  40.07 
 
 		 582 aa  393  1e-108  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.321607  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0266  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  36.47 
 
 		 632 aa  393  1e-108  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.358191  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12850  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  38.01 
 
 		 608 aa  392  1e-108  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.813218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1342  ABC transporter related  39.14 
 
 		 671 aa  389  1e-106  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0133  ABC transporter, transmembrane region  36.77 
 
 		 613 aa  386  1e-106  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.260657  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2015  ABC transporter related  35.05 
 
 		 631 aa  386  1e-106  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.945643  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0203  ABC transporter related  37.18 
 
 		 628 aa  389  1e-106  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000017604  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0148  ABC transporter related  38.73 
 
 		 628 aa  387  1e-106  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2433  ABC transporter related  37.76 
 
 		 624 aa  384  1e-105  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0665672  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4565  ABC transporter related protein  36.44 
 
 		 811 aa  382  1e-105  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0806  ABC transporter related  37.11 
 
 		 666 aa  384  1e-105  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1267  ABC transporter related  38.98 
 
 		 623 aa  379  1e-104  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00288622  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21670  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  37.12 
 
 		 670 aa  380  1e-104  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2471  ABC transporter related protein  39.18 
 
 		 600 aa  379  1e-104  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2049  ABC transporter related protein  36.61 
 
 		 663 aa  377  1e-103  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.146206  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2311  ABC transporter related  37.88 
 
 		 695 aa  377  1e-103  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.28541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28700  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  36.55 
 
 		 677 aa  376  1e-103  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0471  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  36.06 
 
 		 593 aa  377  1e-103  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0344277  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6412  ABC transporter related  37.59 
 
 		 649 aa  379  1e-103  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8742  carbohydrate ABC transporter  37.03 
 
 		 669 aa  372  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2250  ABC transporter, transmembrane region  37.62 
 
 		 634 aa  374  1e-102  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.993927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2497  ABC transporter related  38.5 
 
 		 614 aa  375  1e-102  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0838  ABC transporter related  35.7 
 
 		 640 aa  370  1e-101  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2622  ABC transporter transmembrane region  38.37 
 
 		 606 aa  370  1e-101  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.499231  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1337  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.18 
 
 		 589 aa  367  1e-100  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.511584  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27200  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  37.28 
 
 		 702 aa  366  1e-100  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.663509  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0632  ABC transporter related  35.14 
 
 		 627 aa  367  1e-100  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000138472  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21630  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  37.52 
 
 		 691 aa  366  1e-100  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0949  ABC transporter related  40.49 
 
 		 625 aa  368  1e-100  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.128787  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0737  ABC transporter related  36.97 
 
 		 652 aa  366  1e-100  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2717  ABC transporter related  39.56 
 
 		 608 aa  367  1e-100  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1432  ABC transporter related protein  36.45 
 
 		 661 aa  365  1e-99  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.590543  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0738  ABC transporter related  38.45 
 
 		 614 aa  364  2e-99  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3355  ABC transporter transmembrane region  36.79 
 
 		 672 aa  364  2e-99  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3955  ABC transporter, transmembrane region  34.84 
 
 		 631 aa  363  4e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.375009  decreased coverage  0.0046772 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5937  ABC transporter related  35.88 
 
 		 765 aa  363  5.0000000000000005e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.268315  normal  0.587315 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0348  ABC transporter related  36.82 
 
 		 663 aa  362  8e-99  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.768573 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09410  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.73 
 
 		 721 aa  361  2e-98  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.129131  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3941  ABC transporter, transmembrane region  34.84 
 
 		 631 aa  361  3e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4015  ABC transporter, transmembrane region  34.84 
 
 		 631 aa  361  3e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1525  multidrug ABC transporter ATPase/permease  36.56 
 
 		 607 aa  360  4e-98  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.024438  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1379  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  37.75 
 
 		 615 aa  359  6e-98  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1712  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  37.89 
 
 		 575 aa  359  7e-98  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0379  ABC transporter related  36.52 
 
 		 653 aa  359  9e-98  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1690  ABC transporter related  36.54 
 
 		 607 aa  358  9.999999999999999e-98  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0842  ABC transporter, transmembrane region  35.73 
 
 		 672 aa  358  1.9999999999999998e-97  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.111523 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11298  drug ABC transporter ATP-binding protein  36.4 
 
 		 631 aa  357  2.9999999999999997e-97  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4441  ABC transporter, transmembrane region  37.14 
 
 		 642 aa  355  2e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6290  ABC transporter related protein  35.6 
 
 		 598 aa  354  2e-96  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0100  ABC transporter related  35.75 
 
 		 584 aa  354  2.9999999999999997e-96  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.995912  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0417  ABC transporter related  38.42 
 
 		 597 aa  354  4e-96  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2358  ABC transporter related  37.12 
 
 		 619 aa  353  4e-96  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.555356  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1430  ABC transporter related  35.68 
 
 		 592 aa  353  5e-96  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3638  ABC transporter, transmembrane region  37.11 
 
 		 665 aa  352  1e-95  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0785  ABC transporter transmembrane region  36.48 
 
 		 701 aa  351  2e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.244223  hitchhiker  0.00200741 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0579  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.99 
 
 		 595 aa  351  2e-95  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3754  ABC transporter transmembrane region  34.34 
 
 		 613 aa  350  5e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.116162  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>