More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0100 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0367  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  62.44 
 
 		 593 aa  718    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.823105  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0364  uncharacterized ABC transporter, ATPase component  62.61 
 
 		 593 aa  721    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0100  ABC transporter related  100 
 
 		 584 aa  1190    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.995912  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3129  ABC transporter related protein  54.22 
 
 		 591 aa  619  1e-176  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.409554  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2733  ABC transporter related  50.34 
 
 		 631 aa  601  1e-170  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.021846  normal  0.190322 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1337  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  49.91 
 
 		 589 aa  593  1e-168  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.511584  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0507  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  50.17 
 
 		 618 aa  594  1e-168  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0495  uncharacterized ABC transporter, ATPase component  50.6 
 
 		 618 aa  593  1e-168  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0985  ABC transporter, transmembrane region  48.97 
 
 		 636 aa  587  1e-166  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1180  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  49.05 
 
 		 637 aa  585  1.0000000000000001e-165  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_964  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  48.45 
 
 		 637 aa  579  1e-164  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.600764  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1192  ABC transporter related  49.57 
 
 		 625 aa  573  1.0000000000000001e-162  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0838  ABC transporter related  48.7 
 
 		 640 aa  567  1e-160  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0579  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  49.65 
 
 		 595 aa  567  1e-160  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2433  ABC transporter related  50.6 
 
 		 624 aa  559  1e-158  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0665672  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0133  ABC transporter, transmembrane region  48.71 
 
 		 613 aa  560  1e-158  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.260657  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0632  ABC transporter related  49.32 
 
 		 627 aa  555  1e-157  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000138472  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0856  ABC transporter related  48.13 
 
 		 626 aa  554  1e-156  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0203  ABC transporter related  49.06 
 
 		 628 aa  555  1e-156  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000017604  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2015  ABC transporter related  45.02 
 
 		 631 aa  554  1e-156  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.945643  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1342  ABC transporter related  46.66 
 
 		 671 aa  552  1e-156  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0148  ABC transporter related  47.01 
 
 		 628 aa  537  1e-151  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0806  ABC transporter related  47.48 
 
 		 666 aa  538  1e-151  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4565  ABC transporter related protein  46.38 
 
 		 811 aa  532  1e-150  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12850  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  45.84 
 
 		 608 aa  529  1e-149  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.813218  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2049  ABC transporter related protein  45.3 
 
 		 663 aa  525  1e-147  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.146206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21670  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  46.27 
 
 		 670 aa  524  1e-147  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0737  ABC transporter related  47.4 
 
 		 652 aa  520  1e-146  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1267  ABC transporter related  45.44 
 
 		 623 aa  517  1.0000000000000001e-145  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00288622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6412  ABC transporter related  44.69 
 
 		 649 aa  515  1.0000000000000001e-145  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8742  carbohydrate ABC transporter  46.49 
 
 		 669 aa  517  1.0000000000000001e-145  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5937  ABC transporter related  45.79 
 
 		 765 aa  514  1e-144  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.268315  normal  0.587315 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0842  ABC transporter, transmembrane region  46.54 
 
 		 672 aa  511  1e-143  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.111523 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0379  ABC transporter related  46.73 
 
 		 653 aa  508  1e-143  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3355  ABC transporter transmembrane region  45.47 
 
 		 672 aa  502  1e-141  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2622  ABC transporter transmembrane region  44.47 
 
 		 606 aa  500  1e-140  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.499231  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3754  ABC transporter transmembrane region  45.25 
 
 		 613 aa  500  1e-140  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.116162  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2311  ABC transporter related  44.04 
 
 		 695 aa  497  1e-139  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.28541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1432  ABC transporter related protein  44.26 
 
 		 661 aa  495  1e-139  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.590543  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6290  ABC transporter related protein  44.4 
 
 		 598 aa  493  9.999999999999999e-139  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09410  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  43.68 
 
 		 721 aa  495  9.999999999999999e-139  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.129131  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3638  ABC transporter, transmembrane region  46.37 
 
 		 665 aa  493  9.999999999999999e-139  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0785  ABC transporter transmembrane region  48.68 
 
 		 701 aa  491  1e-137  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.244223  hitchhiker  0.00200741 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3955  ABC transporter, transmembrane region  45.87 
 
 		 631 aa  485  1e-136  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.375009  decreased coverage  0.0046772 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2250  ABC transporter, transmembrane region  44.23 
 
 		 634 aa  488  1e-136  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.993927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2358  ABC transporter related  42.81 
 
 		 619 aa  486  1e-136  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.555356  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3941  ABC transporter, transmembrane region  46.07 
 
 		 631 aa  485  1e-135  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4015  ABC transporter, transmembrane region  46.07 
 
 		 631 aa  485  1e-135  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0471  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  44.25 
 
 		 593 aa  479  1e-134  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0344277  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0858  ABC transporter, transmembrane region  43.62 
 
 		 680 aa  480  1e-134  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.438545  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0348  ABC transporter related  40.69 
 
 		 663 aa  475  1e-133  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.768573 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3399  ABC transporter related  41.81 
 
 		 614 aa  476  1e-133  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1525  multidrug ABC transporter ATPase/permease  42.35 
 
 		 607 aa  476  1e-133  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.024438  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0972  ABC transporter transmembrane region  43.47 
 
 		 691 aa  477  1e-133  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0935036 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1379  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  42.71 
 
 		 615 aa  472  1e-132  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1071  ABC transporter related protein  44.26 
 
 		 733 aa  471  1.0000000000000001e-131  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3251  ABC transporter related  43.33 
 
 		 675 aa  469  1.0000000000000001e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.135546  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21630  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  41.58 
 
 		 691 aa  466  9.999999999999999e-131  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28700  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  40.99 
 
 		 677 aa  466  9.999999999999999e-131  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27200  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  42.41 
 
 		 702 aa  468  9.999999999999999e-131  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.663509  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1712  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  43.68 
 
 		 575 aa  466  9.999999999999999e-131  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3379  ABC transporter transmembrane region  41.65 
 
 		 646 aa  468  9.999999999999999e-131  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0584  ABC transporter transmembrane region  42.32 
 
 		 582 aa  463  1e-129  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.321607  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11298  drug ABC transporter ATP-binding protein  44.53 
 
 		 631 aa  464  1e-129  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2618  ABC transporter related  41.38 
 
 		 617 aa  459  9.999999999999999e-129  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000100526  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1690  ABC transporter related  42.61 
 
 		 607 aa  461  9.999999999999999e-129  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2350  ABC transporter related protein  43.02 
 
 		 620 aa  461  9.999999999999999e-129  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4441  ABC transporter, transmembrane region  43.52 
 
 		 642 aa  462  9.999999999999999e-129  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0417  ABC transporter related  41.11 
 
 		 597 aa  449  1e-125  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1682  ABC transporter related  42.71 
 
 		 613 aa  447  1.0000000000000001e-124  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2429  ABC transporter related  44.83 
 
 		 619 aa  443  1e-123  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.572705  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2475  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  42.83 
 
 		 598 aa  436  1e-121  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00961334  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2539  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  43.02 
 
 		 598 aa  437  1e-121  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0266  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  39.5 
 
 		 632 aa  437  1e-121  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.358191  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  38.55 
 
 		 597 aa  436  1e-121  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0397  ABC transporter related protein  41.43 
 
 		 586 aa  438  1e-121  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000282557  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2460  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  43.36 
 
 		 598 aa  433  1e-120  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2276  ABC transporter ATP-binding/permease  43.36 
 
 		 598 aa  433  1e-120  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.406907  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  38.55 
 
 		 597 aa  435  1e-120  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2932  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  42.64 
 
 		 598 aa  432  1e-120  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00230756 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2236  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  43.36 
 
 		 598 aa  433  1e-120  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0563945  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2444  ABC transporter permease/ATP-binding protein  43.36 
 
 		 598 aa  433  1e-120  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.290529  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2401  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  42.83 
 
 		 598 aa  433  1e-120  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2193  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  42.83 
 
 		 598 aa  430  1e-119  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0325354  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0642  ABC transporter related  44.27 
 
 		 620 aa  431  1e-119  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.014004  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3822  ABC transporter transmembrane region  41.7 
 
 		 605 aa  429  1e-119  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.568746  hitchhiker  0.00518822 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0738  ABC transporter related  39.52 
 
 		 614 aa  426  1e-118  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1782  ABC transporter-related protein  42.94 
 
 		 605 aa  422  1e-116  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.563719  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2250  ABC transporter related  43.02 
 
 		 598 aa  422  1e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0582239  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1885  ABC transporter related protein  39.11 
 
 		 618 aa  421  1e-116  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2077  ABC transporter related  40.23 
 
 		 621 aa  420  1e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2690  multidrug resistance ABC transporter  42.08 
 
 		 615 aa  415  1e-114  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0586583  normal  0.13127 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1818  ABC transporter related  40.94 
 
 		 601 aa  406  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000170896 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2169  ABC transporter related  42.86 
 
 		 620 aa  408  1.0000000000000001e-112  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0526  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  38.91 
 
 		 592 aa  405  1.0000000000000001e-112  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000230499  normal  0.803212 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1500  ABC transporter related protein  41.49 
 
 		 630 aa  402  1e-111  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000079767  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2471  ABC transporter related protein  37.5 
 
 		 600 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0841  ABC transporter related  36.35 
 
 		 607 aa  397  1e-109  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2246  ABC transporter related  34.66 
 
 		 650 aa  390  1e-107  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1386  ABC transporter related  35.76 
 
 		 629 aa  391  1e-107  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000285289  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>