More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0379 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_1342  ABC transporter related  54.41 
 
 		 671 aa  709    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21670  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  64.85 
 
 		 670 aa  814    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2311  ABC transporter related  61.45 
 
 		 695 aa  782    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.28541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0348  ABC transporter related  55.7 
 
 		 663 aa  703    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.768573 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0806  ABC transporter related  61.58 
 
 		 666 aa  771    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0785  ABC transporter transmembrane region  62.44 
 
 		 701 aa  743    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.244223  hitchhiker  0.00200741 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3251  ABC transporter related  63.52 
 
 		 675 aa  738    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.135546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0972  ABC transporter transmembrane region  55.82 
 
 		 691 aa  692    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0935036 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6412  ABC transporter related  79.91 
 
 		 649 aa  1026    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2733  ABC transporter related  51.78 
 
 		 631 aa  661    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.021846  normal  0.190322 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21630  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  54.52 
 
 		 691 aa  677    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0379  ABC transporter related  100 
 
 		 653 aa  1307    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6290  ABC transporter related protein  54.01 
 
 		 598 aa  660    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09410  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  57.82 
 
 		 721 aa  719    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.129131  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3941  ABC transporter, transmembrane region  58.51 
 
 		 631 aa  685    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28700  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  51.71 
 
 		 677 aa  638    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11298  drug ABC transporter ATP-binding protein  58.55 
 
 		 631 aa  686    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3355  ABC transporter transmembrane region  63.04 
 
 		 672 aa  791    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2622  ABC transporter transmembrane region  56.49 
 
 		 606 aa  677    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.499231  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3754  ABC transporter transmembrane region  60.1 
 
 		 613 aa  700    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.116162  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0858  ABC transporter, transmembrane region  55.01 
 
 		 680 aa  708    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.438545  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1432  ABC transporter related protein  62.74 
 
 		 661 aa  782    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.590543  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3638  ABC transporter, transmembrane region  63.52 
 
 		 665 aa  781    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5937  ABC transporter related  63.71 
 
 		 765 aa  853    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.268315  normal  0.587315 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8742  carbohydrate ABC transporter  65.97 
 
 		 669 aa  837    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0737  ABC transporter related  62.28 
 
 		 652 aa  757    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4015  ABC transporter, transmembrane region  58.51 
 
 		 631 aa  685    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4441  ABC transporter, transmembrane region  58.87 
 
 		 642 aa  686    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27200  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  57.78 
 
 		 702 aa  726    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.663509  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2049  ABC transporter related protein  66.19 
 
 		 663 aa  838    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.146206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1071  ABC transporter related protein  55.15 
 
 		 733 aa  686    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3955  ABC transporter, transmembrane region  58.67 
 
 		 631 aa  686    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.375009  decreased coverage  0.0046772 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2250  ABC transporter, transmembrane region  59.22 
 
 		 634 aa  726    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.993927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0842  ABC transporter, transmembrane region  62.75 
 
 		 672 aa  777    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.111523 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4565  ABC transporter related protein  61.96 
 
 		 811 aa  775    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3822  ABC transporter transmembrane region  54.42 
 
 		 605 aa  612  9.999999999999999e-175  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.568746  hitchhiker  0.00518822 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0838  ABC transporter related  51.42 
 
 		 640 aa  604  1.0000000000000001e-171  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0985  ABC transporter, transmembrane region  46.96 
 
 		 636 aa  599  1e-170  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0133  ABC transporter, transmembrane region  47.52 
 
 		 613 aa  596  1e-169  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.260657  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0507  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  47.36 
 
 		 618 aa  595  1e-169  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0495  uncharacterized ABC transporter, ATPase component  47.43 
 
 		 618 aa  592  1e-168  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_964  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  46.47 
 
 		 637 aa  594  1e-168  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.600764  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1180  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  46.28 
 
 		 637 aa  585  1.0000000000000001e-165  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0148  ABC transporter related  45.58 
 
 		 628 aa  583  1.0000000000000001e-165  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2015  ABC transporter related  47.18 
 
 		 631 aa  582  1.0000000000000001e-165  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.945643  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0856  ABC transporter related  45.34 
 
 		 626 aa  574  1.0000000000000001e-162  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2433  ABC transporter related  46.38 
 
 		 624 aa  573  1.0000000000000001e-162  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0665672  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1192  ABC transporter related  44.91 
 
 		 625 aa  567  1e-160  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0632  ABC transporter related  45.65 
 
 		 627 aa  560  1e-158  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000138472  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1690  ABC transporter related  45.12 
 
 		 607 aa  560  1e-158  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0203  ABC transporter related  45.15 
 
 		 628 aa  558  1e-157  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000017604  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1379  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  43.56 
 
 		 615 aa  552  1e-156  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2077  ABC transporter related  51.06 
 
 		 621 aa  548  1e-155  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1818  ABC transporter related  48 
 
 		 601 aa  547  1e-154  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000170896 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1267  ABC transporter related  44.74 
 
 		 623 aa  543  1e-153  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00288622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0266  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  43.03 
 
 		 632 aa  539  9.999999999999999e-153  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.358191  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12850  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  43.31 
 
 		 608 aa  539  9.999999999999999e-153  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.813218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0471  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  43.25 
 
 		 593 aa  523  1e-147  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0344277  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1712  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  44.91 
 
 		 575 aa  515  1e-144  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3399  ABC transporter related  42.48 
 
 		 614 aa  514  1e-144  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0100  ABC transporter related  46.55 
 
 		 584 aa  513  1e-144  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.995912  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1337  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  47.1 
 
 		 589 aa  502  1e-141  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.511584  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2358  ABC transporter related  41.47 
 
 		 619 aa  504  1e-141  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.555356  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0367  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  47.84 
 
 		 593 aa  495  9.999999999999999e-139  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.823105  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0364  uncharacterized ABC transporter, ATPase component  48.02 
 
 		 593 aa  493  9.999999999999999e-139  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1525  multidrug ABC transporter ATPase/permease  42.02 
 
 		 607 aa  493  9.999999999999999e-139  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.024438  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0584  ABC transporter transmembrane region  42.25 
 
 		 582 aa  484  1e-135  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.321607  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3129  ABC transporter related protein  45.72 
 
 		 591 aa  479  1e-134  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.409554  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0579  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  42.56 
 
 		 595 aa  478  1e-133  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0417  ABC transporter related  39.48 
 
 		 597 aa  466  9.999999999999999e-131  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  39.45 
 
 		 597 aa  462  1e-129  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1682  ABC transporter related  40.71 
 
 		 613 aa  460  9.999999999999999e-129  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  39.29 
 
 		 597 aa  461  9.999999999999999e-129  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2475  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  43.87 
 
 		 598 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00961334  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2618  ABC transporter related  42.31 
 
 		 617 aa  455  1.0000000000000001e-126  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000100526  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2401  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  44.03 
 
 		 598 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2932  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  44.23 
 
 		 598 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00230756 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2276  ABC transporter ATP-binding/permease  44.08 
 
 		 598 aa  448  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.406907  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2236  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  44.08 
 
 		 598 aa  448  1.0000000000000001e-124  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0563945  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2193  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  43.88 
 
 		 598 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0325354  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2539  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  43.3 
 
 		 598 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2444  ABC transporter permease/ATP-binding protein  44.08 
 
 		 598 aa  448  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.290529  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2460  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  44.08 
 
 		 598 aa  448  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2429  ABC transporter related  42.26 
 
 		 619 aa  443  1e-123  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.572705  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1782  ABC transporter-related protein  43.87 
 
 		 605 aa  442  1e-123  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.563719  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0397  ABC transporter related protein  39.58 
 
 		 586 aa  443  1e-123  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000282557  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2350  ABC transporter related protein  45.17 
 
 		 620 aa  442  9.999999999999999e-123  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3379  ABC transporter transmembrane region  39.23 
 
 		 646 aa  439  9.999999999999999e-123  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0642  ABC transporter related  43.59 
 
 		 620 aa  436  1e-121  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.014004  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2250  ABC transporter related  44.42 
 
 		 598 aa  439  1e-121  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0582239  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1885  ABC transporter related protein  38.1 
 
 		 618 aa  435  1e-120  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0738  ABC transporter related  45.29 
 
 		 614 aa  434  1e-120  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0841  ABC transporter related  39.78 
 
 		 607 aa  433  1e-120  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2690  multidrug resistance ABC transporter  41.56 
 
 		 615 aa  426  1e-118  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0586583  normal  0.13127 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1500  ABC transporter related protein  41.27 
 
 		 630 aa  416  9.999999999999999e-116  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000079767  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2169  ABC transporter related  44.76 
 
 		 620 aa  411  1e-113  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2246  ABC transporter related  39.18 
 
 		 650 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2471  ABC transporter related protein  37.72 
 
 		 600 aa  398  1e-109  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0359  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  37.59 
 
 		 635 aa  394  1e-108  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.101068  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0822  ABC transporter related  37.57 
 
 		 640 aa  389  1e-107  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0882213  hitchhiker  0.0000266707 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>