More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_1122 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_1122  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 683 aa  1405    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.642926 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1948  multidrug ABC transporter ATPase/permease  58.43 
 
 		 671 aa  805    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.720417  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2246  ABC transporter related  50.08 
 
 		 650 aa  666    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0359  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  47.43 
 
 		 635 aa  622  1e-177  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.101068  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1386  ABC transporter related  45.71 
 
 		 629 aa  584  1.0000000000000001e-165  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000285289  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1257  hypothetical protein  46.56 
 
 		 639 aa  567  1e-160  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0822  ABC transporter related  44.05 
 
 		 640 aa  561  1e-158  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0882213  hitchhiker  0.0000266707 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3148  ABC transporter related protein  44.46 
 
 		 632 aa  547  1e-154  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0885  ABC transporter related  44.18 
 
 		 638 aa  543  1e-153  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0703423 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1238  ABC transporter related  43.12 
 
 		 631 aa  536  1e-151  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1222  ABC transporter related protein  42.69 
 
 		 608 aa  518  1.0000000000000001e-145  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1736  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  42.45 
 
 		 616 aa  515  1e-144  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0422  ABC transporter related  41.11 
 
 		 606 aa  476  1e-133  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1365  ABC transporter related  38.27 
 
 		 621 aa  469  1.0000000000000001e-131  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000419806  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1500  ABC transporter related protein  37.74 
 
 		 630 aa  431  1e-119  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000079767  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  33.88 
 
 		 597 aa  397  1e-109  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  33.88 
 
 		 597 aa  397  1e-109  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2932  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.18 
 
 		 598 aa  389  1e-107  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00230756 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2401  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.33 
 
 		 598 aa  389  1e-106  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2539  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.18 
 
 		 598 aa  384  1e-105  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2475  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.73 
 
 		 598 aa  380  1e-104  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00961334  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21630  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  36.21 
 
 		 691 aa  382  1e-104  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2236  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  34.13 
 
 		 598 aa  376  1e-103  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0563945  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2276  ABC transporter ATP-binding/permease  33.97 
 
 		 598 aa  374  1e-102  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.406907  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2444  ABC transporter permease/ATP-binding protein  33.97 
 
 		 598 aa  374  1e-102  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.290529  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2460  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.97 
 
 		 598 aa  374  1e-102  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2193  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  33.65 
 
 		 598 aa  372  1e-101  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0325354  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28700  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  32.83 
 
 		 677 aa  366  1e-100  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2250  ABC transporter related  32.43 
 
 		 598 aa  366  1e-99  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0582239  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1180  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.64 
 
 		 637 aa  357  3.9999999999999996e-97  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_964  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.04 
 
 		 637 aa  356  7.999999999999999e-97  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.600764  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4441  ABC transporter, transmembrane region  35 
 
 		 642 aa  345  2e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1337  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.41 
 
 		 589 aa  342  1e-92  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.511584  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0266  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.28 
 
 		 632 aa  342  1e-92  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.358191  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1885  ABC transporter related protein  31.93 
 
 		 618 aa  331  3e-89  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0379  ABC transporter related  31.9 
 
 		 653 aa  316  9.999999999999999e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2618  ABC transporter related  59.75 
 
 		 617 aa  305  1.0000000000000001e-81  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000100526  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2350  ABC transporter related protein  61.86 
 
 		 620 aa  303  5.000000000000001e-81  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0048  ABC transporter related  30.41 
 
 		 598 aa  299  1e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000163685  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1245  ABC transporter related  30.64 
 
 		 594 aa  298  3e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00497584  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19280  ABC transporter related  34.29 
 
 		 609 aa  295  3e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0642  ABC transporter related  52.67 
 
 		 620 aa  292  1e-77  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.014004  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0949  ABC transporter related  55.31 
 
 		 625 aa  293  1e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.128787  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2719  ABC transporter related  31.66 
 
 		 606 aa  290  7e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0801  ABC transporter-like protein  27.79 
 
 		 635 aa  289  1e-76  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.678319 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0203  ABC transporter related  56.97 
 
 		 628 aa  289  1e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000017604  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2499  ABC transporter transmembrane region  30.09 
 
 		 601 aa  286  9e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2250  ABC transporter, transmembrane region  55.74 
 
 		 634 aa  284  4.0000000000000003e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.993927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0632  ABC transporter related  55.74 
 
 		 627 aa  283  7.000000000000001e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000138472  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2733  ABC transporter related  52.45 
 
 		 631 aa  283  8.000000000000001e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.021846  normal  0.190322 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2283  ABC transporter related  30.89 
 
 		 589 aa  283  9e-75  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2282  ABC transporter related  54.43 
 
 		 609 aa  282  1e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2433  ABC transporter related  55.37 
 
 		 624 aa  281  2e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0665672  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0507  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  57.44 
 
 		 618 aa  281  2e-74  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0495  uncharacterized ABC transporter, ATPase component  57.44 
 
 		 618 aa  281  2e-74  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0579  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  30.65 
 
 		 595 aa  281  2e-74  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2169  ABC transporter related  55.56 
 
 		 620 aa  280  9e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2781  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.98 
 
 		 609 aa  279  1e-73  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000466613  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0348  ABC transporter related  49.45 
 
 		 663 aa  279  1e-73  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.768573 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0364  uncharacterized ABC transporter, ATPase component  56.41 
 
 		 593 aa  278  4e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2613  ABC transporter, transmembrane region  31.18 
 
 		 625 aa  277  4e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.200186  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1983  ABC transporter related  30.35 
 
 		 629 aa  277  5e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0860642 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0033  ABC transporter related  31.77 
 
 		 602 aa  277  6e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1342  ABC transporter related  54.24 
 
 		 671 aa  276  7e-73  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3941  ABC transporter, transmembrane region  54.89 
 
 		 631 aa  276  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4015  ABC transporter, transmembrane region  54.89 
 
 		 631 aa  276  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0367  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  55.98 
 
 		 593 aa  275  2.0000000000000002e-72  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.823105  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0985  ABC transporter, transmembrane region  53.31 
 
 		 636 aa  275  3e-72  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3955  ABC transporter, transmembrane region  54.47 
 
 		 631 aa  274  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.375009  decreased coverage  0.0046772 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2497  ABC transporter related  56.38 
 
 		 614 aa  274  5.000000000000001e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0841  ABC transporter related  54.7 
 
 		 607 aa  274  5.000000000000001e-72  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2717  ABC transporter related  55.51 
 
 		 608 aa  273  6e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1539  multidrug ABC transporter ATPase/permease  30.02 
 
 		 636 aa  273  7e-72  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2049  ABC transporter related protein  53.81 
 
 		 663 aa  272  2e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.146206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1455  ABC transporter related  56.78 
 
 		 625 aa  272  2e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0858  ABC transporter, transmembrane region  49.43 
 
 		 680 aa  271  2.9999999999999997e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.438545  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0856  ABC transporter related  49.13 
 
 		 626 aa  270  4e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0806  ABC transporter related  52.63 
 
 		 666 aa  270  7e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0569  ABC transporter related  50.62 
 
 		 597 aa  270  8.999999999999999e-71  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0417  ABC transporter related  31.22 
 
 		 660 aa  269  1e-70  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  47.33 
 
 		 556 aa  269  1e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1227  ABC transporter related  30.34 
 
 		 589 aa  268  2e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.175574 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3782  ABC transporter related  53.42 
 
 		 594 aa  268  2.9999999999999995e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.91836  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1192  ABC transporter related  54.32 
 
 		 625 aa  268  2.9999999999999995e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1363  ABC transporter related  29.48 
 
 		 636 aa  267  4e-70  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000676834  normal  0.402453 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2471  ABC transporter related protein  55.93 
 
 		 600 aa  267  5.999999999999999e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1249  ABC transporter, ATP-binding protein  53.36 
 
 		 598 aa  267  5.999999999999999e-70  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159778 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3754  ABC transporter transmembrane region  52.32 
 
 		 613 aa  266  7e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.116162  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0972  ABC transporter transmembrane region  47.69 
 
 		 691 aa  266  8e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0935036 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0648  ABC transporter related  29.27 
 
 		 623 aa  266  8.999999999999999e-70  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.986523 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0017  ABC transporter related  53.52 
 
 		 593 aa  266  1e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0148  ABC transporter related  54.98 
 
 		 628 aa  266  1e-69  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1430  ABC transporter related  51.69 
 
 		 592 aa  266  1e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2622  ABC transporter transmembrane region  53.94 
 
 		 606 aa  266  1e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.499231  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  53.81 
 
 		 598 aa  265  2e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1429  ABC transporter related  28.55 
 
 		 581 aa  265  2e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2690  multidrug resistance ABC transporter  54.4 
 
 		 615 aa  265  3e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0586583  normal  0.13127 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1776  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  54.62 
 
 		 589 aa  264  3e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184019  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21670  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  52.24 
 
 		 670 aa  265  3e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1432  ABC transporter related protein  53.59 
 
 		 661 aa  265  3e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.590543  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>