More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_3967 on replicon NC_010678
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_3262  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  72.36 
 
 		 764 aa  1103    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2584  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  83.79 
 
 		 768 aa  1279    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4080  ABC transporter related  100 
 
 		 814 aa  1559    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.256448  normal  0.875845 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1060  ABC transporter related  70.87 
 
 		 760 aa  1004    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.120719  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4037  ABC transporter related protein  55.14 
 
 		 764 aa  776    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.238544  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2254  ABC transporter related  71.97 
 
 		 782 aa  1073    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1316  ABC transporter related  71.7 
 
 		 784 aa  1053    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.512065  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1417  ABC transporter related  72.04 
 
 		 782 aa  1066    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.111222 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0705  ABC transporter-related protein  89.11 
 
 		 784 aa  1306    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5708  ABC transporter related  71.6 
 
 		 764 aa  1026    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.920431  normal  0.127768 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4038  ABC transporter-related protein  72.14 
 
 		 726 aa  998    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000838789 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3967  ABC transporter related  100 
 
 		 768 aa  1559    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0637  ABC transporter related  70.91 
 
 		 770 aa  1014    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.57887  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3979  ABC transporter-related protein  68.95 
 
 		 773 aa  1004    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1007  ABC transporter related  70.99 
 
 		 784 aa  1035    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.29536 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0658  ABC transporter related  71.37 
 
 		 750 aa  1008    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4991  ABC transporter related  66.58 
 
 		 808 aa  969    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1021  putative ABC transporter  72.32 
 
 		 778 aa  1063    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.338231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0672  ABC transporter related  68.86 
 
 		 777 aa  1011    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.264122  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  37.09 
 
 		 597 aa  406  1.0000000000000001e-112  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  40.94 
 
 		 598 aa  404  1e-111  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  38.42 
 
 		 575 aa  395  1e-108  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2350  ABC transporter related protein  37.02 
 
 		 620 aa  392  1e-107  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0684  ABC transporter related  39.55 
 
 		 598 aa  392  1e-107  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000210902  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1525  ABC transporter related  35.76 
 
 		 581 aa  387  1e-106  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.628149  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0569  ABC transporter related  34.85 
 
 		 597 aa  383  1e-105  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1342  ABC transporter related  39.81 
 
 		 671 aa  385  1e-105  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0466  ABC transporter related  37.41 
 
 		 588 aa  386  1e-105  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1385  ABC transporter related  39.76 
 
 		 600 aa  384  1e-105  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0831464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2717  ABC transporter related  38.77 
 
 		 608 aa  385  1e-105  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2497  ABC transporter related  40.34 
 
 		 614 aa  385  1e-105  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0985  ABC transporter, transmembrane region  35.85 
 
 		 636 aa  383  1e-105  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2618  ABC transporter related  33.97 
 
 		 617 aa  379  1e-104  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000100526  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0048  ABC transporter related  33.55 
 
 		 598 aa  380  1e-104  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000163685  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2371  ABC transporter, ATPase subunit  36.38 
 
 		 622 aa  380  1e-104  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0047  ABC transporter related  34.73 
 
 		 580 aa  380  1e-104  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00438981  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_964  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.14 
 
 		 637 aa  381  1e-104  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.600764  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1245  ABC transporter related  35.59 
 
 		 594 aa  376  1e-103  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00497584  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  38.86 
 
 		 556 aa  376  1e-103  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  34.36 
 
 		 597 aa  378  1e-103  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  34.53 
 
 		 597 aa  379  1e-103  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1180  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.7 
 
 		 637 aa  374  1e-102  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6290  ABC transporter related protein  36.81 
 
 		 598 aa  375  1e-102  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2733  ABC transporter related  34.14 
 
 		 631 aa  373  1e-102  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.021846  normal  0.190322 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0825  ABC transporter related  34.9 
 
 		 575 aa  374  1e-102  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4793  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.35 
 
 		 586 aa  373  1e-102  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.646278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2616  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  37.96 
 
 		 577 aa  374  1e-102  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0639798  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0247  ABC transporter related  38.42 
 
 		 586 aa  374  1e-102  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.306695  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0583  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.3 
 
 		 586 aa  370  1e-101  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0418  ABC transporter related protein  39.25 
 
 		 600 aa  370  1e-101  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1430  ABC transporter related  35.8 
 
 		 592 aa  370  1e-101  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0439  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  36.13 
 
 		 586 aa  371  1e-101  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.214785  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0435  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  35.78 
 
 		 586 aa  370  1e-101  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.290198  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2181  ABC transporter related  34.06 
 
 		 600 aa  372  1e-101  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2282  ABC transporter related  37.85 
 
 		 609 aa  371  1e-101  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0511  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.13 
 
 		 586 aa  371  1e-101  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2260  ABC transporter ATP-binding protein  37.72 
 
 		 571 aa  369  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3627  ABC transporter related  36.13 
 
 		 617 aa  367  1e-100  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0584  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.13 
 
 		 586 aa  368  1e-100  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0450  ABC transporter-related protein  36.61 
 
 		 586 aa  368  1e-100  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0496  ABC transporter ATP-binding/permease  35.95 
 
 		 586 aa  369  1e-100  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.384636  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0148  ABC transporter related  34.42 
 
 		 628 aa  369  1e-100  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0444  ABC transporter related  35.78 
 
 		 586 aa  366  1e-100  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0528  ABC transporter permease/ATP-binding protein  35.95 
 
 		 586 aa  369  1e-100  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.249641  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1080  ABC transporter related  39.79 
 
 		 601 aa  368  1e-100  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169898 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0133  ABC transporter, transmembrane region  35.59 
 
 		 613 aa  368  1e-100  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.260657  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0838  ABC transporter related  35.86 
 
 		 640 aa  366  1e-100  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3781  ABC transporter related  32.59 
 
 		 588 aa  366  1e-100  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000284212  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1540  multidrug ABC transporter ATPase/permease  33.78 
 
 		 602 aa  368  1e-100  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.652681  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0532  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.78 
 
 		 586 aa  369  1e-100  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.117534  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1429  ABC transporter related  34.49 
 
 		 581 aa  364  3e-99  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0642  ABC transporter related  33.22 
 
 		 620 aa  363  9e-99  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.014004  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0841  ABC transporter related  36.68 
 
 		 607 aa  362  1e-98  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0544  ABC transporter related  34.94 
 
 		 587 aa  361  2e-98  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1259  ATP-binding transport protein; multicopy suppressor of HtrB  35.24 
 
 		 579 aa  361  3e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1201  ABC transporter related protein  34.38 
 
 		 594 aa  361  3e-98  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1249  ABC transporter, ATP-binding protein  35.56 
 
 		 598 aa  360  8e-98  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159778 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2475  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.93 
 
 		 598 aa  359  9.999999999999999e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00961334  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0203  ABC transporter related  34.51 
 
 		 628 aa  358  1.9999999999999998e-97  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000017604  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2932  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.88 
 
 		 598 aa  358  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00230756 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0949  ABC transporter related  36.22 
 
 		 625 aa  358  1.9999999999999998e-97  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.128787  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2401  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.6 
 
 		 598 aa  358  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6252  ABC transporter related  37.72 
 
 		 1436 aa  358  1.9999999999999998e-97  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4432  ABC transporter related  36.17 
 
 		 601 aa  357  3.9999999999999996e-97  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1091  ABC transporter related  32.5 
 
 		 870 aa  356  6.999999999999999e-97  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1942  ABC transporter, transmembrane region  35.81 
 
 		 594 aa  355  1e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2669  ABC transporter related  36.1 
 
 		 637 aa  356  1e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.871518  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0387  ABC transporter related  35.53 
 
 		 611 aa  354  2.9999999999999997e-96  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.000000031667  normal  0.0347309 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3782  ABC transporter related  33.05 
 
 		 594 aa  354  2.9999999999999997e-96  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.91836  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0672  ABC transporter related  39.88 
 
 		 578 aa  354  4e-96  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3786  ABC transporter  35.8 
 
 		 587 aa  354  4e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.469191  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2539  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.75 
 
 		 598 aa  354  4e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0475  ABC transporter related  38.43 
 
 		 584 aa  353  5e-96  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00181463  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2627  ABC transporter related  37.87 
 
 		 592 aa  353  5.9999999999999994e-96  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2332  ABC transporter-related protein  35.23 
 
 		 587 aa  353  7e-96  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000229781  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5937  ABC transporter related  38.26 
 
 		 765 aa  352  1e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.268315  normal  0.587315 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2836  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  35.57 
 
 		 585 aa  352  1e-95  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.333651  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2389  ABC transporter, permease protein/ATP-binding protein  36.94 
 
 		 572 aa  352  2e-95  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000145644  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0100  ABC transporter related  33.96 
 
 		 584 aa  351  2e-95  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.995912  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1528  ABC transporter, transmembrane region  35.28 
 
 		 587 aa  351  3e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00299054  normal  0.0159788 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>