More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1385 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1385  ABC transporter related  100 
 
 		 600 aa  1177    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0831464  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  62.48 
 
 		 598 aa  731    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0684  ABC transporter related  47.98 
 
 		 598 aa  534  1e-150  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000210902  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1080  ABC transporter related  48.81 
 
 		 601 aa  501  1e-140  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169898 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3398  ABC transporter related  47.46 
 
 		 598 aa  489  1e-137  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1216  ABC transporter related  46.58 
 
 		 597 aa  478  1e-133  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.791805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2815  ABC transporter related  42.13 
 
 		 594 aa  474  1e-132  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.264488  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2086  ABC transporter related  43.3 
 
 		 597 aa  463  1e-129  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  43.06 
 
 		 556 aa  459  9.999999999999999e-129  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4067  ABC transporter related  42.36 
 
 		 596 aa  459  9.999999999999999e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00142757  normal  0.169154 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5540  ABC transporter related protein  42.33 
 
 		 601 aa  461  9.999999999999999e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.27279 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4203  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  45.92 
 
 		 650 aa  458  1e-127  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.089699 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4133  ABC transporter related  44.33 
 
 		 614 aa  458  1e-127  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.293166 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2069  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  40.83 
 
 		 597 aa  455  1.0000000000000001e-126  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3238  ABC transporter related  44.78 
 
 		 594 aa  449  1e-125  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00207534  normal  0.825064 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1442  ABC transporter related  44.46 
 
 		 606 aa  444  1e-123  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2746  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  43.26 
 
 		 627 aa  441  9.999999999999999e-123  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0546982 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0825  ABC transporter related  41.42 
 
 		 575 aa  440  9.999999999999999e-123  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2159  ABC transporter related  43.43 
 
 		 603 aa  440  9.999999999999999e-123  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.912689  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1461  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  41.06 
 
 		 605 aa  438  1e-121  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0186  ABC transporter related protein  43.85 
 
 		 623 aa  438  1e-121  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.437337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06023  ABC efflux transporter permease/ATP-binding protein  39.42 
 
 		 586 aa  432  1e-120  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3667  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  42.41 
 
 		 608 aa  433  1e-120  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3546  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  42.76 
 
 		 600 aa  433  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000242  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease component  39.8 
 
 		 586 aa  430  1e-119  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2049  ABC transporter, transmembrane region  45.69 
 
 		 616 aa  430  1e-119  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6942  ABC transporter ATP-binding protein  42.01 
 
 		 619 aa  431  1e-119  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.676963 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3544  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  42.28 
 
 		 629 aa  431  1e-119  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1828  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  43.32 
 
 		 600 aa  429  1e-119  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.924491 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1510  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  42.69 
 
 		 628 aa  432  1e-119  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.639878 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3025  ABC transporter related  41.82 
 
 		 582 aa  429  1e-119  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1362  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  46.37 
 
 		 580 aa  426  1e-118  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3249  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  43.03 
 
 		 600 aa  427  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.305361 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2096  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  42.1 
 
 		 616 aa  427  1e-118  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.163444  hitchhiker  0.0014118 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0285  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  39.35 
 
 		 601 aa  422  1e-117  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.451102  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4431  ABC transporter related  45.21 
 
 		 581 aa  424  1e-117  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2153  ABC transporter ATP-binding protein  42.18 
 
 		 586 aa  425  1e-117  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4490  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  39.76 
 
 		 641 aa  424  1e-117  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4342  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  39.76 
 
 		 639 aa  423  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.180584  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2061  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  38.7 
 
 		 586 aa  420  1e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000211326  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2260  ABC transporter ATP-binding protein  41.03 
 
 		 571 aa  419  1e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2040  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  38.7 
 
 		 586 aa  419  1e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0635761  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2067  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  41.67 
 
 		 586 aa  420  1e-116  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5367  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  45.8 
 
 		 614 aa  419  1e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.765695  decreased coverage  0.00185624 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1789  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  38.87 
 
 		 586 aa  422  1e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.11697  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2313  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  45.47 
 
 		 622 aa  419  1e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0680321 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1771  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  38.4 
 
 		 586 aa  419  1e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1990  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  38.7 
 
 		 586 aa  422  1e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.43486e-48 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1259  ATP-binding transport protein; multicopy suppressor of HtrB  38.83 
 
 		 579 aa  422  1e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1262  ABC transporter-related protein  43.22 
 
 		 601 aa  419  1e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000140001 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1512  ABC transporter related  43.95 
 
 		 611 aa  422  1e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00861332  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1607  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  45.21 
 
 		 590 aa  417  9.999999999999999e-116  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.343192 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3326  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  45.99 
 
 		 600 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1060  ABC transporter related  41.92 
 
 		 760 aa  416  9.999999999999999e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.120719  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3434  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  39.29 
 
 		 582 aa  418  9.999999999999999e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3098  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  40.24 
 
 		 606 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01193  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  43.73 
 
 		 589 aa  417  9.999999999999999e-116  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.169603  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2002  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  44.24 
 
 		 597 aa  417  9.999999999999999e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0989  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  40.45 
 
 		 634 aa  414  1e-114  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3626  ABC transporter related  42.44 
 
 		 588 aa  414  1e-114  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.058238  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0797  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  40.49 
 
 		 632 aa  413  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.732522 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2936  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  40.66 
 
 		 593 aa  413  1e-114  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1961  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  38.36 
 
 		 586 aa  415  1e-114  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0303984  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2662  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  41.85 
 
 		 597 aa  413  1e-114  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1823  ABC transporter related  37.41 
 
 		 586 aa  414  1e-114  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2242  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  44.03 
 
 		 595 aa  414  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.35119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3367  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  38.36 
 
 		 586 aa  415  1e-114  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.487064  hitchhiker  1.72644e-17 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3087  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  39.93 
 
 		 620 aa  414  1e-114  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3627  ABC transporter related  41.54 
 
 		 617 aa  411  1e-113  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1715  ABC transporter, ATP binding/permease protein  40.41 
 
 		 599 aa  409  1e-113  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.6745  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3151  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  41.44 
 
 		 619 aa  409  1e-113  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1316  ABC transporter related  41.47 
 
 		 784 aa  409  1e-113  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.512065  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1202  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  41.45 
 
 		 608 aa  409  1e-113  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.238414  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2350  ABC transporter related protein  43.1 
 
 		 620 aa  409  1e-113  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2497  ABC transporter related  41.85 
 
 		 614 aa  407  1.0000000000000001e-112  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3493  ABC transporter related  43.41 
 
 		 594 aa  407  1.0000000000000001e-112  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.68417  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1021  putative ABC transporter  40.95 
 
 		 778 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.338231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2349  ABC transporter-related protein  41.35 
 
 		 571 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0337  ABC transporter related  37.22 
 
 		 582 aa  406  1.0000000000000001e-112  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2635  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  44.95 
 
 		 618 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.239281 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1657  ABC transporter, ATP binding/permease protein  40.76 
 
 		 681 aa  407  1.0000000000000001e-112  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01701  ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  41.07 
 
 		 625 aa  404  1e-111  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2584  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  40.35 
 
 		 768 aa  403  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4038  ABC transporter-related protein  41.96 
 
 		 726 aa  405  1e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000838789 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4001  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  39.14 
 
 		 617 aa  405  1e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.530118 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3698  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  39.48 
 
 		 637 aa  405  1e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2356  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  44.77 
 
 		 618 aa  404  1e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.249841 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0672  ABC transporter related  40.03 
 
 		 777 aa  401  9.999999999999999e-111  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.264122  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5708  ABC transporter related  40.07 
 
 		 764 aa  399  9.999999999999999e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.920431  normal  0.127768 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0844  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  46 
 
 		 605 aa  402  9.999999999999999e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2254  ABC transporter related  41.22 
 
 		 782 aa  402  9.999999999999999e-111  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0332  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  41.01 
 
 		 586 aa  402  9.999999999999999e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2618  ABC transporter related  39.52 
 
 		 617 aa  401  9.999999999999999e-111  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000100526  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4330  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  45.09 
 
 		 605 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.630595 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2616  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  38.62 
 
 		 577 aa  399  9.999999999999999e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0639798  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2584  ABC transporter related  41.07 
 
 		 611 aa  399  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.784039  normal  0.174103 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3979  ABC transporter-related protein  41.65 
 
 		 773 aa  401  9.999999999999999e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1830  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter  40 
 
 		 589 aa  398  1e-109  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1007  ABC transporter related  41.74 
 
 		 784 aa  398  1e-109  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.29536 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0289  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  37.65 
 
 		 600 aa  398  1e-109  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>