More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A2254 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012791  Vapar_1060  ABC transporter related  67.26 
 
 
760 aa  960    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.120719  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4080  ABC transporter related  70.55 
 
 
814 aa  1071    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.256448  normal  0.875845 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3262  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  70.44 
 
 
764 aa  1089    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2584  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  71.73 
 
 
768 aa  1069    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2254  ABC transporter related  100 
 
 
782 aa  1583    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1316  ABC transporter related  68.66 
 
 
784 aa  1001    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.512065  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1417  ABC transporter related  67.25 
 
 
782 aa  994    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.111222 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0705  ABC transporter-related protein  72.02 
 
 
784 aa  1046    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5708  ABC transporter related  66.58 
 
 
764 aa  942    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.920431  normal  0.127768 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4038  ABC transporter-related protein  68.22 
 
 
726 aa  941    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000838789 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3967  ABC transporter related  72.1 
 
 
768 aa  1068    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4037  ABC transporter related protein  53.17 
 
 
764 aa  731    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.238544  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3979  ABC transporter-related protein  66.89 
 
 
773 aa  949    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1007  ABC transporter related  67.64 
 
 
784 aa  988    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.29536 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0658  ABC transporter related  68.49 
 
 
750 aa  954    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4991  ABC transporter related  62.83 
 
 
808 aa  885    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1021  putative ABC transporter  70.19 
 
 
778 aa  986    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.338231  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0672  ABC transporter related  64.23 
 
 
777 aa  930    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.264122  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0637  ABC transporter related  67.92 
 
 
770 aa  959    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.57887  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  37.21 
 
 
597 aa  407  1.0000000000000001e-112  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1342  ABC transporter related  39.78 
 
 
671 aa  392  1e-107  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1385  ABC transporter related  41.22 
 
 
600 aa  389  1e-106  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0831464  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0684  ABC transporter related  40.07 
 
 
598 aa  384  1e-105  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000210902  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2717  ABC transporter related  37.74 
 
 
608 aa  380  1e-104  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  36.03 
 
 
597 aa  378  1e-103  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  40.1 
 
 
598 aa  378  1e-103  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  36.2 
 
 
597 aa  379  1e-103  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1525  ABC transporter related  36.05 
 
 
581 aa  379  1e-103  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.628149  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2618  ABC transporter related  35.76 
 
 
617 aa  376  1e-102  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000100526  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2733  ABC transporter related  35.4 
 
 
631 aa  374  1e-102  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.021846  normal  0.190322 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2497  ABC transporter related  38.93 
 
 
614 aa  375  1e-102  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2181  ABC transporter related  34.95 
 
 
600 aa  372  1e-101  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0047  ABC transporter related  35.83 
 
 
580 aa  371  1e-101  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00438981  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  36.68 
 
 
575 aa  371  1e-101  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1259  ATP-binding transport protein; multicopy suppressor of HtrB  35.36 
 
 
579 aa  368  1e-100  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1430  ABC transporter related  35.54 
 
 
592 aa  369  1e-100  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2371  ABC transporter, ATPase subunit  36.1 
 
 
622 aa  366  1e-100  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2616  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  36.6 
 
 
577 aa  367  1e-100  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0639798  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0825  ABC transporter related  36.7 
 
 
575 aa  368  1e-100  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0048  ABC transporter related  36.07 
 
 
598 aa  365  2e-99  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000163685  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2350  ABC transporter related protein  37.33 
 
 
620 aa  365  2e-99  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0466  ABC transporter related  36.29 
 
 
588 aa  364  4e-99  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1091  ABC transporter related  36.64 
 
 
870 aa  363  5.0000000000000005e-99  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0642  ABC transporter related  34.94 
 
 
620 aa  363  5.0000000000000005e-99  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.014004  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1080  ABC transporter related  40.5 
 
 
601 aa  363  5.0000000000000005e-99  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00169898 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0439  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  35.65 
 
 
586 aa  363  6e-99  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.214785  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1245  ABC transporter related  35.1 
 
 
594 aa  363  6e-99  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00497584  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0511  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.65 
 
 
586 aa  363  6e-99  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0544  ABC transporter related  35.96 
 
 
587 aa  363  9e-99  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0583  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.83 
 
 
586 aa  363  9e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0418  ABC transporter related protein  39.57 
 
 
600 aa  362  1e-98  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0584  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.69 
 
 
586 aa  362  2e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0435  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  35.52 
 
 
586 aa  361  2e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.290198  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1540  multidrug ABC transporter ATPase/permease  34.78 
 
 
602 aa  362  2e-98  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.652681  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3786  ABC transporter  36.44 
 
 
587 aa  362  2e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.469191  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0532  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.3 
 
 
586 aa  361  3e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.117534  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0496  ABC transporter ATP-binding/permease  35.48 
 
 
586 aa  361  3e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.384636  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0569  ABC transporter related  35.24 
 
 
597 aa  361  3e-98  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0528  ABC transporter permease/ATP-binding protein  35.48 
 
 
586 aa  361  3e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.249641  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1201  ABC transporter related protein  34.2 
 
 
594 aa  360  4e-98  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3627  ABC transporter related  37.89 
 
 
617 aa  360  6e-98  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0444  ABC transporter related  36 
 
 
586 aa  360  6e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  38.34 
 
 
556 aa  359  9e-98  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1528  ABC transporter, transmembrane region  36.61 
 
 
587 aa  359  9e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00299054  normal  0.0159788 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2627  ABC transporter related  38.74 
 
 
592 aa  358  1.9999999999999998e-97  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0082  ATPase  37.26 
 
 
582 aa  357  5e-97  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0247  ABC transporter related  37.88 
 
 
586 aa  356  8.999999999999999e-97  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.306695  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4793  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.84 
 
 
586 aa  355  2e-96  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.646278  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2471  ABC transporter related protein  35.81 
 
 
600 aa  353  5.9999999999999994e-96  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3379  ABC transporter transmembrane region  34.83 
 
 
646 aa  353  7e-96  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3714  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.84 
 
 
587 aa  352  1e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.207401  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0949  ABC transporter related  39.67 
 
 
625 aa  352  1e-95  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.128787  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2260  ABC transporter ATP-binding protein  37.18 
 
 
571 aa  352  2e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2475  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.62 
 
 
598 aa  351  2e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00961334  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3384  ABC transporter, ATP-binding protein  36.27 
 
 
587 aa  352  2e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.603869  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3781  ABC transporter related  32.14 
 
 
588 aa  351  2e-95  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000284212  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0133  ABC transporter, transmembrane region  36.01 
 
 
613 aa  351  2e-95  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.260657  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0148  ABC transporter related  34.1 
 
 
628 aa  352  2e-95  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2921  ABC transporter related protein  36.16 
 
 
636 aa  352  2e-95  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4432  ABC transporter related  36.01 
 
 
601 aa  352  2e-95  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3398  ABC transporter related  39.06 
 
 
598 aa  351  3e-95  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273417  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0450  ABC transporter-related protein  34.92 
 
 
586 aa  351  3e-95  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0838  ABC transporter related  35.32 
 
 
640 aa  351  3e-95  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2332  ABC transporter-related protein  34.67 
 
 
587 aa  351  3e-95  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000229781  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3466  ABC transporter ATP-binding/permease  36.1 
 
 
587 aa  351  4e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.197712  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3432  ABC transporter, ATP-binding protein  36.1 
 
 
587 aa  351  4e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000147455  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3695  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.1 
 
 
587 aa  351  4e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000106018 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3740  ABC transporter permease/ATP-binding protein  36.1 
 
 
587 aa  351  4e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.037622  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2282  ABC transporter related  36.92 
 
 
609 aa  350  5e-95  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19280  ABC transporter related  35.31 
 
 
609 aa  350  5e-95  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1429  ABC transporter related  33.73 
 
 
581 aa  350  5e-95  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0475  ABC transporter related  36.57 
 
 
584 aa  350  6e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00181463  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3719  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.84 
 
 
587 aa  350  7e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1455  ABC transporter related  36.08 
 
 
625 aa  350  7e-95  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1942  ABC transporter, transmembrane region  35.14 
 
 
594 aa  349  1e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3782  ABC transporter related  33.51 
 
 
594 aa  349  1e-94  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.91836  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0673  ABC transporter related  37.13 
 
 
650 aa  348  3e-94  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2932  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.76 
 
 
598 aa  348  3e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00230756 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3501  ABC transporter related  37.38 
 
 
575 aa  347  4e-94  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0985  ABC transporter, transmembrane region  33.45 
 
 
636 aa  347  4e-94  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>