More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A2969 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_10196  drug ABC transporter ATP-binding protein  38.12 
 
 		 1194 aa  666    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1884  ABC transporter related protein  37.36 
 
 		 1332 aa  669    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3072  ATP binding cassette  98.52 
 
 		 1218 aa  2425    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1516  ABC transporter related  38.1 
 
 		 1231 aa  664    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.347232 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2886  ATP binding cassette  99.26 
 
 		 1218 aa  2439    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2950  ATP-binding protein  98.19 
 
 		 1218 aa  2420    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.03128e-16 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2916  ATP binding cassette  98.52 
 
 		 1218 aa  2417    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.352142  normal  0.12308 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0377  ABC transporter related  36.16 
 
 		 1264 aa  692    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.843886  normal  0.12564 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2969  ATP binding cassette  100 
 
 		 1218 aa  2459    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00365409 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3783  ABC transporter related  37.8 
 
 		 1301 aa  698    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377067  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4692  ABC transporter related protein  41.99 
 
 		 1218 aa  807    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.131662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1429  ABC transporter related  41.78 
 
 		 1284 aa  823    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.442581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30570  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  42.15 
 
 		 1257 aa  872    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2029  ABC transporter related  35.19 
 
 		 1230 aa  543  9.999999999999999e-153  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6252  ABC transporter related  45.7 
 
 		 1436 aa  471  1.0000000000000001e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1034  ABC transporter related  44.14 
 
 		 1321 aa  416  1e-114  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.229722 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5296  ABC transporter related  40.9 
 
 		 1522 aa  407  1.0000000000000001e-112  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3493  ABC transporter related  32.43 
 
 		 1179 aa  342  2.9999999999999998e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3442  cysteine ABC transporter permease/ATP-binding protein  32.5 
 
 		 1179 aa  336  2e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.507362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4285  ABC transporter related  32.36 
 
 		 1179 aa  335  2e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4081  ABC transporter, transmembrane region, type 1  32.36 
 
 		 1179 aa  335  2e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1962  ABC efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  30.44 
 
 		 1201 aa  335  3e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.072256  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02349  ATP-binding cassette multidrug transport protein ATRC [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9Y8G2]  29.85 
 
 		 1284 aa  320  1e-85  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.506788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0338  ABC transporter related  26.54 
 
 		 1194 aa  320  1e-85  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1486  ABC transporter related  30.1 
 
 		 1228 aa  313  1e-83  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3403  ABC transporter related  34.99 
 
 		 610 aa  301  5e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4432  ABC transporter related  34.59 
 
 		 601 aa  297  7e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0842  ABC transporter, transmembrane region  36.51 
 
 		 672 aa  290  1e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.111523 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5005  ABC transporter-related protein  35.15 
 
 		 606 aa  289  2e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4200  ABC transporter related  34.91 
 
 		 566 aa  288  4e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.737412  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  30.85 
 
 		 597 aa  287  8e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2922  ABC transporter related protein  36.81 
 
 		 581 aa  287  8e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.364865  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4444  ABC transporter related  33.11 
 
 		 610 aa  286  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.949596  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2921  ABC transporter related protein  34.68 
 
 		 636 aa  286  2.0000000000000002e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4531  ABC transporter related  33.11 
 
 		 610 aa  286  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.319604  normal  0.425635 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0453  ATPase  32.84 
 
 		 614 aa  285  3.0000000000000004e-75  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1469  ABC transporter related protein  31.34 
 
 		 586 aa  285  4.0000000000000003e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3017  ABC transporter, transmembrane region  34.12 
 
 		 602 aa  285  5.000000000000001e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0138128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2109  ATPase  32.76 
 
 		 591 aa  285  5.000000000000001e-75  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.265654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4826  ABC transporter related  32.94 
 
 		 610 aa  285  5.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.596215 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0828  ABC transporter related  33.09 
 
 		 596 aa  284  7.000000000000001e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.61579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5528  ABC transporter related protein  34.95 
 
 		 614 aa  283  1e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1375  ABC transporter related  33.09 
 
 		 651 aa  283  1e-74  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.250681  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  33.21 
 
 		 556 aa  282  2e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3183  cyclic nucleotide-binding protein  35.27 
 
 		 608 aa  282  2e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2250  ABC transporter related  31.04 
 
 		 598 aa  283  2e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0582239  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2276  ABC transporter ATP-binding/permease  31.63 
 
 		 598 aa  282  3e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.406907  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2460  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.63 
 
 		 598 aa  282  3e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2444  ABC transporter permease/ATP-binding protein  31.63 
 
 		 598 aa  282  3e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.290529  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1071  ABC transporter related protein  34.15 
 
 		 733 aa  282  3e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2539  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.44 
 
 		 598 aa  281  4e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2371  ABC transporter, ATPase subunit  34.52 
 
 		 622 aa  281  4e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2236  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  31.63 
 
 		 598 aa  281  5e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0563945  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1818  ABC transporter related  35.23 
 
 		 601 aa  281  6e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000170896 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1201  ABC transporter related protein  30.88 
 
 		 594 aa  281  8e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2475  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.06 
 
 		 598 aa  280  1e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00961334  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2193  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  31.25 
 
 		 598 aa  279  2e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0325354  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4763  ABC transporter related  28.98 
 
 		 591 aa  280  2e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.116722  normal  0.0159357 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1141  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  30.86 
 
 		 586 aa  279  3e-73  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3174  ABC transporter related  33.33 
 
 		 601 aa  278  4e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1549  ABC transporter related  32.97 
 
 		 613 aa  278  4e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0873918  normal  0.0393082 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0115  ABC transporter, transmembrane region  32.01 
 
 		 625 aa  278  5e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0419  ABC transporter-related protein  34.22 
 
 		 608 aa  278  5e-73  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0718918 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6290  ABC transporter related protein  34.14 
 
 		 598 aa  278  6e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0475  ABC transporter related  33.46 
 
 		 584 aa  278  7e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00181463  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2181  ABC transporter related  31.63 
 
 		 600 aa  278  7e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0313  ABC transporter, ATP-binding/membrane-spanning protein  31.1 
 
 		 590 aa  277  9e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2401  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.76 
 
 		 598 aa  277  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2944  ABC transporter related  33.14 
 
 		 601 aa  277  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.631806 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2932  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.76 
 
 		 598 aa  276  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00230756 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1748  ABC transporter related  34.66 
 
 		 605 aa  276  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09342  ABC multidrug transporter (Eurofung)  27.13 
 
 		 1323 aa  275  3e-72  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18490  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  36.76 
 
 		 621 aa  275  4.0000000000000004e-72  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0520  ABC transporter related  34.84 
 
 		 652 aa  275  5.000000000000001e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00806721  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4565  ABC transporter related protein  33.63 
 
 		 811 aa  275  5.000000000000001e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1954  ABC transporter related  33.1 
 
 		 578 aa  275  6e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1920  ABC transporter related  33.1 
 
 		 578 aa  275  6e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0737  ABC transporter related  34.59 
 
 		 652 aa  273  1e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1227  ABC transporter related  33.91 
 
 		 619 aa  273  1e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.141283  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12850  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  32.82 
 
 		 608 aa  273  1e-71  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.813218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0417  ABC transporter related  31.07 
 
 		 660 aa  273  1e-71  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4166  ABC transporter related  35.79 
 
 		 633 aa  273  2e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.24565  hitchhiker  0.00267368 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2187  ABC transporter related  33.59 
 
 		 595 aa  273  2e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0335  ABC transporter transmembrane region  29.84 
 
 		 588 aa  273  2e-71  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3627  ABC transporter related  30.44 
 
 		 617 aa  271  4e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4426  ABC transporter related  33.33 
 
 		 603 aa  272  4e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.368028  normal  0.0987215 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4713  ABC transporter related  36.17 
 
 		 616 aa  271  5.9999999999999995e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5708  ABC transporter related  34.38 
 
 		 764 aa  271  7e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.920431  normal  0.127768 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2049  ABC transporter related protein  33.33 
 
 		 663 aa  270  1e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.146206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0289  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  32.44 
 
 		 600 aa  269  2e-70  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2627  ABC transporter related  33.33 
 
 		 592 aa  269  2e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0418  ABC transporter related protein  34.36 
 
 		 600 aa  269  2e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0387  ABC transporter related  32.4 
 
 		 619 aa  269  2e-70  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.102241  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0806  ABC transporter related  31.59 
 
 		 666 aa  269  2.9999999999999995e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2618  ABC transporter related  31.54 
 
 		 617 aa  269  2.9999999999999995e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000100526  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1721  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC- E) family, permease/ATP-binding protein CydC  30.17 
 
 		 993 aa  269  2.9999999999999995e-70  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.489544 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5646  ABC transporter related protein  32.71 
 
 		 596 aa  268  4e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1643  ATPase  33.8 
 
 		 601 aa  268  5e-70  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3626  ABC transporter related  34.99 
 
 		 588 aa  268  5e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.058238  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3955  ABC transporter, transmembrane region  34.88 
 
 		 631 aa  268  5e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.375009  decreased coverage  0.0046772 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>