More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1375 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_1375  ABC transporter related  100 
 
 
651 aa  1303    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.250681  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0078  ABC transporter related  54.84 
 
 
648 aa  689    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.213516  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2242  ABC transporter related protein  52.8 
 
 
658 aa  646    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.406073  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1262  ABC transporter related  56.18 
 
 
644 aa  712    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0441  ABC transporter related protein  53.3 
 
 
650 aa  678    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0417  ABC transporter related  54.2 
 
 
660 aa  713    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2936  ABC transporter related  50.08 
 
 
638 aa  622  1e-177  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4471  ABC transporter related protein  49.36 
 
 
629 aa  619  1e-176  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0660374  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3017  ABC transporter related protein  47.03 
 
 
639 aa  578  1.0000000000000001e-163  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0913  ABC transporter related  47.92 
 
 
678 aa  578  1.0000000000000001e-163  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.00146704 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0402  ABC transporter related  44.22 
 
 
645 aa  527  1e-148  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.176731  normal  0.164805 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2109  ATPase  43.2 
 
 
591 aa  481  1e-134  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.265654  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4137  ABC transporter related protein  39.71 
 
 
718 aa  480  1e-134  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5646  ABC transporter related protein  40.23 
 
 
596 aa  445  1e-123  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2944  ABC transporter related  38.84 
 
 
601 aa  437  1e-121  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.631806 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11901  multidrug ABC transporter  38.14 
 
 
590 aa  438  1e-121  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3174  ABC transporter related  38.84 
 
 
601 aa  436  1e-121  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4426  ABC transporter related  40.23 
 
 
603 aa  437  1e-121  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.368028  normal  0.0987215 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4432  ABC transporter related  39.97 
 
 
601 aa  434  1e-120  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3017  ABC transporter, transmembrane region  40.89 
 
 
602 aa  431  1e-119  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0138128  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0115  ABC transporter, transmembrane region  40.07 
 
 
625 aa  432  1e-119  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2187  ABC transporter related  40.56 
 
 
595 aa  424  1e-117  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0828  ABC transporter related  38.35 
 
 
596 aa  419  1e-116  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.61579  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12051  multidrug ABC transporter  36.43 
 
 
590 aa  421  1e-116  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12061  multidrug ABC transporter  36.25 
 
 
590 aa  421  1e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1110  ATPase  36.32 
 
 
590 aa  416  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.551514  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10871  multidrug ABC transporter  37.38 
 
 
596 aa  418  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.405422 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0306  ABC transporter related protein  40.46 
 
 
620 aa  411  1e-113  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.233124 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0975  ABC transporter related  37.54 
 
 
585 aa  406  1.0000000000000001e-112  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.685046  hitchhiker  0.000181513 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1402  ATPase  38.18 
 
 
619 aa  406  1.0000000000000001e-112  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.387875  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1550  ABC transporter related  40.99 
 
 
589 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.759268  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0649  ATPase  35.25 
 
 
596 aa  400  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.110083  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14811  multidrug ABC transporter  35.81 
 
 
596 aa  401  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.25024  normal  0.341749 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1643  ATPase  37.85 
 
 
601 aa  395  1e-108  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1520  hypothetical protein  35.06 
 
 
595 aa  379  1e-103  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5343  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.77 
 
 
571 aa  363  4e-99  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4860  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  35.61 
 
 
571 aa  362  8e-99  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.201042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4875  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  35.61 
 
 
571 aa  362  8e-99  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259113  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5658  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.82 
 
 
571 aa  363  8e-99  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5268  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.61 
 
 
571 aa  362  8e-99  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5030  ABC transporter ATP-binding/permease  35.61 
 
 
571 aa  362  1e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0487117  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5411  ABC transporter permease/ATP-binding protein  35.61 
 
 
571 aa  362  1e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5298  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.61 
 
 
571 aa  362  1e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0552  ABC transporter related  36.31 
 
 
589 aa  358  9.999999999999999e-98  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5285  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.44 
 
 
571 aa  358  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4974  ABC transporter related  35.32 
 
 
571 aa  358  1.9999999999999998e-97  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  35.98 
 
 
575 aa  353  8e-96  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0466  ABC transporter related  36.59 
 
 
588 aa  351  2e-95  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6412  ABC transporter related  38.4 
 
 
649 aa  350  4e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2539  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.62 
 
 
598 aa  349  1e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2932  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.8 
 
 
598 aa  348  2e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00230756 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1942  ABC transporter, transmembrane region  36.82 
 
 
594 aa  347  3e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2719  ABC transporter related  36.3 
 
 
606 aa  347  4e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0806  ABC transporter related  36.88 
 
 
666 aa  347  5e-94  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2475  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.43 
 
 
598 aa  346  6e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00961334  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2401  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.62 
 
 
598 aa  345  1e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  35.67 
 
 
598 aa  345  2e-93  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0337  ABC transporter related  33.62 
 
 
582 aa  345  2e-93  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2193  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  34.43 
 
 
598 aa  342  1e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0325354  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2499  ABC transporter transmembrane region  36.77 
 
 
601 aa  342  1e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2282  ABC transporter related  40 
 
 
609 aa  342  2e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2618  ABC transporter related  33.44 
 
 
617 aa  341  2e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000100526  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0418  ABC transporter related protein  37.43 
 
 
600 aa  341  2.9999999999999998e-92  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2497  ABC transporter related  37.62 
 
 
614 aa  341  2.9999999999999998e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3025  ABC transporter related  33.66 
 
 
582 aa  341  2.9999999999999998e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20180  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.87 
 
 
634 aa  341  2.9999999999999998e-92  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.28848 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2250  ABC transporter related  35.16 
 
 
598 aa  340  4e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0582239  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2236  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  34.07 
 
 
598 aa  340  5.9999999999999996e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0563945  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2276  ABC transporter ATP-binding/permease  34.07 
 
 
598 aa  339  8e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.406907  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2444  ABC transporter permease/ATP-binding protein  34.07 
 
 
598 aa  339  8e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.290529  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2460  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.07 
 
 
598 aa  339  8e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0133  ABC transporter, transmembrane region  33.17 
 
 
613 aa  339  9.999999999999999e-92  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.260657  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2049  ABC transporter related protein  37.22 
 
 
663 aa  338  9.999999999999999e-92  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.146206  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0684  ABC transporter related  36.98 
 
 
598 aa  338  9.999999999999999e-92  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000210902  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2350  ABC transporter related protein  38.93 
 
 
620 aa  337  2.9999999999999997e-91  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2283  ABC transporter related  34.62 
 
 
589 aa  337  2.9999999999999997e-91  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2580  ABC transporter, ATP-binding protein/permease protein  34.16 
 
 
566 aa  337  5e-91  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4565  ABC transporter related protein  36.55 
 
 
811 aa  337  5e-91  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2282  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.63 
 
 
566 aa  335  1e-90  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0148  ABC transporter related  36.24 
 
 
628 aa  335  2e-90  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3979  ABC transporter-related protein  38.12 
 
 
773 aa  335  2e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0972  ABC transporter transmembrane region  33.72 
 
 
691 aa  334  3e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0935036 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1782  ABC transporter-related protein  33.16 
 
 
605 aa  333  4e-90  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.563719  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2717  ABC transporter related  38.43 
 
 
608 aa  333  4e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12850  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.61 
 
 
608 aa  333  5e-90  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.813218  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3262  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  33.55 
 
 
764 aa  332  9e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2371  ABC transporter, ATPase subunit  33.12 
 
 
622 aa  332  1e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1525  ABC transporter related  33.9 
 
 
581 aa  332  1e-89  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.628149  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0842  ABC transporter, transmembrane region  36.45 
 
 
672 aa  332  1e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.111523 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0379  ABC transporter related  37.48 
 
 
653 aa  331  2e-89  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1201  ABC transporter related protein  35.95 
 
 
594 aa  331  2e-89  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8742  carbohydrate ABC transporter  36.26 
 
 
669 aa  332  2e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0544  ABC transporter related  33.89 
 
 
587 aa  331  2e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2733  ABC transporter related  32.84 
 
 
631 aa  331  3e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.021846  normal  0.190322 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0737  ABC transporter related  36.35 
 
 
652 aa  331  3e-89  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09410  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.22 
 
 
721 aa  330  4e-89  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.129131  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3334  ABC transporter related  35.15 
 
 
584 aa  330  5.0000000000000004e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3583  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1690  ABC transporter related  34.91 
 
 
607 aa  330  5.0000000000000004e-89  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0247  ABC transporter related  36.83 
 
 
586 aa  330  6e-89  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.306695  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  33.75 
 
 
597 aa  330  6e-89  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>