More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1643 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0649  ATPase  63.44 
 
 		 596 aa  783    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.110083  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4426  ABC transporter related  61.33 
 
 		 603 aa  721    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.368028  normal  0.0987215 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3017  ABC transporter, transmembrane region  57.91 
 
 		 602 aa  679    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0138128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0115  ABC transporter, transmembrane region  54.19 
 
 		 625 aa  642    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1402  ATPase  79.87 
 
 		 619 aa  946    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.387875  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5646  ABC transporter related protein  56.61 
 
 		 596 aa  652    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1643  ATPase  100 
 
 		 601 aa  1199    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1110  ATPase  59.01 
 
 		 590 aa  742    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.551514  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2109  ATPase  64.43 
 
 		 591 aa  745    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.265654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3174  ABC transporter related  59.93 
 
 		 601 aa  722    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4432  ABC transporter related  58.57 
 
 		 601 aa  699    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0828  ABC transporter related  56.17 
 
 		 596 aa  689    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.61579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10871  multidrug ABC transporter  63.33 
 
 		 596 aa  769    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.405422 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2944  ABC transporter related  59.93 
 
 		 601 aa  723    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.631806 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2187  ABC transporter related  55.57 
 
 		 595 aa  648    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12051  multidrug ABC transporter  59.86 
 
 		 590 aa  758    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11901  multidrug ABC transporter  58.84 
 
 		 590 aa  759    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14811  multidrug ABC transporter  63.27 
 
 		 596 aa  786    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.25024  normal  0.341749 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12061  multidrug ABC transporter  59.52 
 
 		 590 aa  747    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0306  ABC transporter related protein  52.03 
 
 		 620 aa  551  1e-155  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.233124 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1520  hypothetical protein  45.28 
 
 		 595 aa  503  1e-141  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0441  ABC transporter related protein  40.36 
 
 		 650 aa  435  1e-120  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0417  ABC transporter related  39.74 
 
 		 660 aa  430  1e-119  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1262  ABC transporter related  41.67 
 
 		 644 aa  414  1e-114  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2936  ABC transporter related  38.7 
 
 		 638 aa  402  1e-111  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0078  ABC transporter related  42.58 
 
 		 648 aa  404  1e-111  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.213516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4137  ABC transporter related protein  35.65 
 
 		 718 aa  397  1e-109  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1375  ABC transporter related  37.85 
 
 		 651 aa  395  1e-108  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.250681  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2242  ABC transporter related protein  40.49 
 
 		 658 aa  390  1e-107  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.406073  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3174  ABC transporter related  39.87 
 
 		 750 aa  389  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4471  ABC transporter related protein  38.01 
 
 		 629 aa  379  1e-104  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0660374  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3603  ABC transporter related  42.03 
 
 		 962 aa  380  1e-104  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0813652  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0975  ABC transporter related  37.39 
 
 		 585 aa  380  1e-104  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.685046  hitchhiker  0.000181513 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3017  ABC transporter related protein  37.68 
 
 		 639 aa  373  1e-102  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1550  ABC transporter related  40.13 
 
 		 589 aa  365  1e-100  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.759268  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  36.14 
 
 		 575 aa  357  3.9999999999999996e-97  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0402  ABC transporter related  35.97 
 
 		 645 aa  353  7e-96  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.176731  normal  0.164805 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1954  ABC transporter related  36.49 
 
 		 610 aa  348  2e-94  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.111523 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4974  ABC transporter related  31.97 
 
 		 571 aa  345  2e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5030  ABC transporter ATP-binding/permease  31.79 
 
 		 571 aa  344  2.9999999999999997e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0487117  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4860  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  31.79 
 
 		 571 aa  344  2.9999999999999997e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.201042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4875  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  31.79 
 
 		 571 aa  344  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259113  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5411  ABC transporter permease/ATP-binding protein  31.79 
 
 		 571 aa  344  2.9999999999999997e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5268  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.79 
 
 		 571 aa  344  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5343  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.13 
 
 		 571 aa  343  5.999999999999999e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5658  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.14 
 
 		 571 aa  343  5.999999999999999e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5298  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.62 
 
 		 571 aa  342  8e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5285  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.62 
 
 		 571 aa  340  4e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  35.59 
 
 		 598 aa  338  1.9999999999999998e-91  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3334  ABC transporter related  34.08 
 
 		 584 aa  337  2.9999999999999997e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3583  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0913  ABC transporter related  34.49 
 
 		 678 aa  336  7.999999999999999e-91  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00146704 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1306  ABC transporter related  36.25 
 
 		 582 aa  335  1e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0981  ABC transporter related  33.97 
 
 		 576 aa  333  5e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4200  ABC transporter related  36.76 
 
 		 566 aa  332  1e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.737412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2278  ABC transporter related  36.03 
 
 		 582 aa  332  2e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.682256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2001  ABC transporter related  36.03 
 
 		 582 aa  330  6e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.201401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4405  ABC transporter related  33.33 
 
 		 568 aa  327  3e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.292842 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0466  ABC transporter related  35.66 
 
 		 588 aa  327  5e-88  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  34.26 
 
 		 556 aa  325  2e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1896  ABC transporter related  33.28 
 
 		 572 aa  324  2e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.332587  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1942  ABC transporter, transmembrane region  34.18 
 
 		 594 aa  323  7e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3351  ABC transporter related  32.36 
 
 		 579 aa  323  7e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.773989  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30570  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  38.07 
 
 		 1257 aa  322  9.999999999999999e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1201  ABC transporter related protein  32.53 
 
 		 594 aa  318  1e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2189  ABC transporter related protein  32.7 
 
 		 572 aa  318  2e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.480877  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3932  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.4 
 
 		 567 aa  317  3e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.130383  normal  0.874644 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1811  ABC transporter related  32.99 
 
 		 572 aa  317  5e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00064367  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0028  ABC transporter related  33.11 
 
 		 615 aa  317  5e-85  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3501  ABC transporter related  35.28 
 
 		 575 aa  317  5e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2389  ABC transporter, permease protein/ATP-binding protein  31.59 
 
 		 572 aa  317  5e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000145644  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3081  ABC multidrug efflux transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  35.3 
 
 		 567 aa  317  6e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2487  ABC transporter related  31.59 
 
 		 572 aa  317  6e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.461616  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3808  ABC transporter related  35.3 
 
 		 567 aa  317  6e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0584709  normal  0.445528 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1674  ABC transporter permease/ATP-binding protein  31.59 
 
 		 572 aa  316  7e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0264422  normal  0.294375 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1363  ABC transporter related  31.01 
 
 		 636 aa  316  7e-85  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000676834  normal  0.402453 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1342  ABC transporter related  32.07 
 
 		 671 aa  316  7e-85  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1525  ABC transporter related  30.85 
 
 		 581 aa  315  9.999999999999999e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.628149  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1143  ABC transporter related  33.97 
 
 		 565 aa  313  5.999999999999999e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.4551 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2922  ABC transporter related protein  36.13 
 
 		 581 aa  311  1e-83  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.364865  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8742  carbohydrate ABC transporter  33.5 
 
 		 669 aa  312  1e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3781  ABC transporter related  32.11 
 
 		 588 aa  311  2e-83  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000284212  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3786  ABC transporter  34.24 
 
 		 587 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.469191  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0247  ABC transporter related  35.16 
 
 		 586 aa  311  2.9999999999999997e-83  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.306695  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  31.97 
 
 		 597 aa  310  2.9999999999999997e-83  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1429  ABC transporter related  31.16 
 
 		 581 aa  310  4e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0418  ABC transporter related protein  34.62 
 
 		 600 aa  310  6.999999999999999e-83  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3365  ABC transporter related  34.51 
 
 		 587 aa  310  6.999999999999999e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000714306  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0047  ABC transporter related  31.85 
 
 		 580 aa  309  1.0000000000000001e-82  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00438981  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0419  ABC transporter-related protein  31.36 
 
 		 608 aa  309  1.0000000000000001e-82  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0718918 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0841  ABC transporter related  32.66 
 
 		 607 aa  308  1.0000000000000001e-82  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1528  ABC transporter, transmembrane region  34.07 
 
 		 587 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00299054  normal  0.0159788 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3714  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.28 
 
 		 587 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.207401  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0082  ATPase  34.98 
 
 		 582 aa  308  2.0000000000000002e-82  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0494  ABC transporter related  35.46 
 
 		 611 aa  308  2.0000000000000002e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3025  ABC transporter related  34.25 
 
 		 582 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0387  ABC transporter-related protein  33.65 
 
 		 634 aa  307  3e-82  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.112413  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6252  ABC transporter related  37.6 
 
 		 1436 aa  307  3e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1706  ABC transporter related  31.4 
 
 		 586 aa  307  4.0000000000000004e-82  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000217452  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3432  ABC transporter, ATP-binding protein  33.16 
 
 		 587 aa  306  6e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000147455  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3740  ABC transporter permease/ATP-binding protein  33.16 
 
 		 587 aa  306  7e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.037622  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>