More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0078 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_0078  ABC transporter related  100 
 
 		 648 aa  1309    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.213516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4471  ABC transporter related protein  53.12 
 
 		 629 aa  650    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0660374  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1262  ABC transporter related  70.62 
 
 		 644 aa  908    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0441  ABC transporter related protein  77.57 
 
 		 650 aa  1020    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0417  ABC transporter related  67.68 
 
 		 660 aa  881    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1375  ABC transporter related  54.84 
 
 		 651 aa  721    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.250681  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2936  ABC transporter related  54.42 
 
 		 638 aa  695    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3017  ABC transporter related protein  52.72 
 
 		 639 aa  645    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2242  ABC transporter related protein  70.75 
 
 		 658 aa  902    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.406073  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0913  ABC transporter related  50.82 
 
 		 678 aa  636    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00146704 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0402  ABC transporter related  49.53 
 
 		 645 aa  608  9.999999999999999e-173  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.176731  normal  0.164805 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4432  ABC transporter related  42.81 
 
 		 601 aa  502  1e-141  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2944  ABC transporter related  41.93 
 
 		 601 aa  489  1e-137  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.631806 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3174  ABC transporter related  41.76 
 
 		 601 aa  487  1e-136  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5646  ABC transporter related protein  43.09 
 
 		 596 aa  487  1e-136  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4137  ABC transporter related protein  42.65 
 
 		 718 aa  488  1e-136  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0306  ABC transporter related protein  44.21 
 
 		 620 aa  483  1e-135  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.233124 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3017  ABC transporter, transmembrane region  42.67 
 
 		 602 aa  485  1e-135  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0138128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2109  ATPase  41.38 
 
 		 591 aa  484  1e-135  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.265654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4426  ABC transporter related  42.05 
 
 		 603 aa  471  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.368028  normal  0.0987215 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2187  ABC transporter related  43.65 
 
 		 595 aa  469  9.999999999999999e-131  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0115  ABC transporter, transmembrane region  42.35 
 
 		 625 aa  461  9.999999999999999e-129  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0828  ABC transporter related  41.91 
 
 		 596 aa  461  9.999999999999999e-129  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.61579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10871  multidrug ABC transporter  39.87 
 
 		 596 aa  456  1e-127  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.405422 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11901  multidrug ABC transporter  40.17 
 
 		 590 aa  456  1e-127  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12061  multidrug ABC transporter  39.31 
 
 		 590 aa  457  1e-127  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12051  multidrug ABC transporter  38.98 
 
 		 590 aa  455  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1110  ATPase  38.77 
 
 		 590 aa  451  1e-125  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.551514  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0975  ABC transporter related  41.23 
 
 		 585 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.685046  hitchhiker  0.000181513 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14811  multidrug ABC transporter  39.08 
 
 		 596 aa  443  1e-123  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.25024  normal  0.341749 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0649  ATPase  38.92 
 
 		 596 aa  437  1e-121  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.110083  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1402  ATPase  41.38 
 
 		 619 aa  437  1e-121  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.387875  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1643  ATPase  40.07 
 
 		 601 aa  429  1e-119  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1550  ABC transporter related  41.72 
 
 		 589 aa  419  1e-116  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.759268  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  38.2 
 
 		 598 aa  406  1.0000000000000001e-112  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1520  hypothetical protein  37.13 
 
 		 595 aa  396  1e-109  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  38.46 
 
 		 575 aa  383  1e-105  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0466  ABC transporter related  40.74 
 
 		 588 aa  379  1e-103  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2497  ABC transporter related  38.25 
 
 		 614 aa  375  1e-102  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3627  ABC transporter related  37.91 
 
 		 617 aa  371  1e-101  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2733  ABC transporter related  35.21 
 
 		 631 aa  372  1e-101  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.021846  normal  0.190322 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2719  ABC transporter related  39.56 
 
 		 606 aa  371  1e-101  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2528  ABC transporter related  36.42 
 
 		 580 aa  370  1e-101  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000757065  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1942  ABC transporter, transmembrane region  35.8 
 
 		 594 aa  372  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3334  ABC transporter related  38.7 
 
 		 584 aa  370  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3583  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2717  ABC transporter related  36.07 
 
 		 608 aa  369  1e-101  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6412  ABC transporter related  39.64 
 
 		 649 aa  370  1e-101  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0684  ABC transporter related  39.61 
 
 		 598 aa  369  1e-101  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000210902  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0133  ABC transporter, transmembrane region  35.03 
 
 		 613 aa  372  1e-101  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.260657  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5030  ABC transporter ATP-binding/permease  35.49 
 
 		 571 aa  367  1e-100  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0487117  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4860  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  35.49 
 
 		 571 aa  367  1e-100  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.201042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4875  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  35.49 
 
 		 571 aa  367  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259113  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5411  ABC transporter permease/ATP-binding protein  35.49 
 
 		 571 aa  367  1e-100  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2015  ABC transporter related  34.1 
 
 		 631 aa  367  1e-100  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.945643  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2371  ABC transporter, ATPase subunit  34.99 
 
 		 622 aa  366  1e-100  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1454  ABC transporter related  39.16 
 
 		 641 aa  367  1e-100  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5343  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.49 
 
 		 571 aa  368  1e-100  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0507  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.32 
 
 		 618 aa  366  1e-100  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0495  uncharacterized ABC transporter, ATPase component  34.49 
 
 		 618 aa  366  1e-100  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5268  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.49 
 
 		 571 aa  367  1e-100  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5298  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.32 
 
 		 571 aa  366  1e-100  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5285  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.32 
 
 		 571 aa  364  3e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0247  ABC transporter related  40.31 
 
 		 586 aa  363  4e-99  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.306695  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2499  ABC transporter transmembrane region  36.92 
 
 		 601 aa  363  5.0000000000000005e-99  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5658  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.32 
 
 		 571 aa  363  7.0000000000000005e-99  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0632  ABC transporter related  36.81 
 
 		 627 aa  362  8e-99  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000138472  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2932  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.53 
 
 		 598 aa  362  8e-99  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00230756 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2401  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.53 
 
 		 598 aa  362  1e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1080  ABC transporter related  37.6 
 
 		 601 aa  362  1e-98  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169898 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1192  ABC transporter related  35.17 
 
 		 625 aa  361  2e-98  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2580  ABC transporter, ATP-binding protein/permease protein  36.62 
 
 		 566 aa  362  2e-98  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1201  ABC transporter related protein  34.56 
 
 		 594 aa  361  2e-98  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1180  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.72 
 
 		 637 aa  360  3e-98  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2264  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  38.65 
 
 		 596 aa  360  3e-98  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.828033  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1259  ATP-binding transport protein; multicopy suppressor of HtrB  36.01 
 
 		 579 aa  361  3e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1363  ABC transporter related  37.82 
 
 		 636 aa  360  3e-98  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000676834  normal  0.402453 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1525  ABC transporter related  36.09 
 
 		 581 aa  360  3e-98  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.628149  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2539  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.01 
 
 		 598 aa  360  5e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3025  ABC transporter related  39.96 
 
 		 582 aa  360  6e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0337  ABC transporter related  34.4 
 
 		 582 aa  359  7e-98  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1342  ABC transporter related  35.99 
 
 		 671 aa  359  9.999999999999999e-98  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_964  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.45 
 
 		 637 aa  359  9.999999999999999e-98  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.600764  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0737  ABC transporter related  37.91 
 
 		 652 aa  359  9.999999999999999e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09410  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.65 
 
 		 721 aa  359  9.999999999999999e-98  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.129131  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2282  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.27 
 
 		 566 aa  358  1.9999999999999998e-97  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0841  ABC transporter related  35.86 
 
 		 607 aa  358  1.9999999999999998e-97  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2475  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.46 
 
 		 598 aa  357  2.9999999999999997e-97  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00961334  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4974  ABC transporter related  34.87 
 
 		 571 aa  357  2.9999999999999997e-97  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2283  ABC transporter related  37.27 
 
 		 589 aa  357  3.9999999999999996e-97  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0985  ABC transporter, transmembrane region  33.06 
 
 		 636 aa  357  3.9999999999999996e-97  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0544  ABC transporter related  36.84 
 
 		 587 aa  356  6.999999999999999e-97  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3351  ABC transporter related  33.39 
 
 		 579 aa  356  8.999999999999999e-97  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.773989  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0948  ABC transporter related  39.39 
 
 		 642 aa  356  8.999999999999999e-97  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.336517  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12850  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  37.64 
 
 		 608 aa  355  1e-96  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.813218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0858  ABC transporter, transmembrane region  33.87 
 
 		 680 aa  354  2e-96  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.438545  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0203  ABC transporter related  37.19 
 
 		 628 aa  355  2e-96  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000017604  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0806  ABC transporter related  37.86 
 
 		 666 aa  353  4e-96  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1520  ABC transporter related  37.09 
 
 		 597 aa  353  4e-96  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.887648  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5708  ABC transporter related  38.75 
 
 		 764 aa  353  5e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.920431  normal  0.127768 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3355  ABC transporter transmembrane region  37.18 
 
 		 672 aa  353  5e-96  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>