More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2936 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_2242  ABC transporter related protein  54.12 
 
 
658 aa  639    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.406073  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3017  ABC transporter related protein  53.82 
 
 
639 aa  677    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0078  ABC transporter related  54.42 
 
 
648 aa  661    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.213516  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4471  ABC transporter related protein  55.63 
 
 
629 aa  698    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0660374  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0913  ABC transporter related  54.17 
 
 
678 aa  684    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.00146704 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1262  ABC transporter related  54.43 
 
 
644 aa  671    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2936  ABC transporter related  100 
 
 
638 aa  1286    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0417  ABC transporter related  52.16 
 
 
660 aa  651    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0441  ABC transporter related protein  54.39 
 
 
650 aa  682    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1375  ABC transporter related  50.08 
 
 
651 aa  622  1e-177  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.250681  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0402  ABC transporter related  49.23 
 
 
645 aa  597  1e-169  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.176731  normal  0.164805 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0115  ABC transporter, transmembrane region  41.67 
 
 
625 aa  450  1e-125  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5646  ABC transporter related protein  42.37 
 
 
596 aa  449  1e-125  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2109  ATPase  40.7 
 
 
591 aa  447  1.0000000000000001e-124  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.265654  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2187  ABC transporter related  41.67 
 
 
595 aa  441  9.999999999999999e-123  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4432  ABC transporter related  39.73 
 
 
601 aa  436  1e-121  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3017  ABC transporter, transmembrane region  40.69 
 
 
602 aa  436  1e-121  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0138128  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4426  ABC transporter related  40.1 
 
 
603 aa  431  1e-119  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.368028  normal  0.0987215 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3174  ABC transporter related  37.75 
 
 
601 aa  425  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2944  ABC transporter related  37.58 
 
 
601 aa  424  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.631806 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0828  ABC transporter related  38.59 
 
 
596 aa  416  9.999999999999999e-116  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.61579  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0975  ABC transporter related  38.69 
 
 
585 aa  405  1.0000000000000001e-112  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.685046  hitchhiker  0.000181513 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0306  ABC transporter related protein  41.31 
 
 
620 aa  409  1.0000000000000001e-112  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.233124 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4137  ABC transporter related protein  36.21 
 
 
718 aa  407  1.0000000000000001e-112  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11901  multidrug ABC transporter  36.46 
 
 
590 aa  407  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14811  multidrug ABC transporter  38.12 
 
 
596 aa  407  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.25024  normal  0.341749 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0649  ATPase  37.6 
 
 
596 aa  405  1e-111  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.110083  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1643  ATPase  38.7 
 
 
601 aa  402  1e-111  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10871  multidrug ABC transporter  36.74 
 
 
596 aa  404  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.405422 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12051  multidrug ABC transporter  36.8 
 
 
590 aa  405  1e-111  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12061  multidrug ABC transporter  36.46 
 
 
590 aa  396  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1110  ATPase  36.29 
 
 
590 aa  394  1e-108  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.551514  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1402  ATPase  38.19 
 
 
619 aa  389  1e-107  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.387875  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1550  ABC transporter related  39.5 
 
 
589 aa  387  1e-106  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.759268  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  38.34 
 
 
575 aa  379  1e-103  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  37.82 
 
 
598 aa  375  1e-102  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0466  ABC transporter related  40.82 
 
 
588 aa  372  1e-102  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  39.69 
 
 
556 aa  370  1e-101  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0337  ABC transporter related  35.48 
 
 
582 aa  370  1e-101  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3334  ABC transporter related  35.52 
 
 
584 aa  367  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3583  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0684  ABC transporter related  39.77 
 
 
598 aa  364  3e-99  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000210902  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3627  ABC transporter related  37.48 
 
 
617 aa  362  1e-98  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  35.25 
 
 
597 aa  360  4e-98  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21520  ABC transporter related  38.94 
 
 
468 aa  357  5e-97  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1080  ABC transporter related  34.39 
 
 
601 aa  356  5.999999999999999e-97  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00169898 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1520  hypothetical protein  35.75 
 
 
595 aa  353  5e-96  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1896  ABC transporter related  34.61 
 
 
572 aa  353  7e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.332587  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0247  ABC transporter related  39.11 
 
 
586 aa  352  1e-95  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.306695  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1525  ABC transporter related  34.49 
 
 
581 aa  352  1e-95  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.628149  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5268  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.37 
 
 
571 aa  352  2e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5030  ABC transporter ATP-binding/permease  35.37 
 
 
571 aa  352  2e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0487117  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4860  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  35.37 
 
 
571 aa  352  2e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.201042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4875  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  35.37 
 
 
571 aa  352  2e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259113  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5411  ABC transporter permease/ATP-binding protein  35.37 
 
 
571 aa  352  2e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3262  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  35.55 
 
 
764 aa  350  3e-95  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5343  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.19 
 
 
571 aa  350  4e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5298  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.19 
 
 
571 aa  350  5e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3025  ABC transporter related  34.12 
 
 
582 aa  350  6e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5658  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.84 
 
 
571 aa  348  2e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2189  ABC transporter related protein  33.8 
 
 
572 aa  347  4e-94  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.480877  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3501  ABC transporter related  37.5 
 
 
575 aa  347  4e-94  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6412  ABC transporter related  35.7 
 
 
649 aa  347  4e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5285  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.19 
 
 
571 aa  347  5e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2497  ABC transporter related  36.4 
 
 
614 aa  345  1e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1942  ABC transporter, transmembrane region  38.63 
 
 
594 aa  345  1e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2528  ABC transporter related  36.57 
 
 
580 aa  345  1e-93  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000757065  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2264  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.74 
 
 
596 aa  345  2e-93  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.828033  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2584  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  35.79 
 
 
768 aa  345  2e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2006  ABC transporter related  38.45 
 
 
575 aa  344  2e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.823185  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0544  ABC transporter related  35.19 
 
 
587 aa  344  2e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3398  ABC transporter related  40.58 
 
 
598 aa  344  2.9999999999999997e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273417  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2433  ABC transporter related  31.29 
 
 
624 aa  343  5e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0665672  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2616  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  35 
 
 
577 aa  343  7e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0639798  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2225  ABC transporter related  37.45 
 
 
612 aa  343  7e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.164174  normal  0.618003 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0552  ABC transporter related  36.03 
 
 
589 aa  342  1e-92  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1417  ABC transporter related  34.82 
 
 
782 aa  342  2e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.111222 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1455  ABC transporter related  37.02 
 
 
625 aa  340  2.9999999999999998e-92  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4974  ABC transporter related  34.67 
 
 
571 aa  341  2.9999999999999998e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1363  ABC transporter related  35.83 
 
 
636 aa  340  5.9999999999999996e-92  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000676834  normal  0.402453 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5708  ABC transporter related  35.44 
 
 
764 aa  339  9.999999999999999e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.920431  normal  0.127768 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4405  ABC transporter related  35.61 
 
 
568 aa  339  9.999999999999999e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.292842 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2622  ABC transporter transmembrane region  34.47 
 
 
606 aa  339  9.999999999999999e-92  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.499231  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0475  ABC transporter related  36.23 
 
 
584 aa  338  1.9999999999999998e-91  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00181463  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1403  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.87 
 
 
578 aa  337  2.9999999999999997e-91  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3351  ABC transporter related  32.38 
 
 
579 aa  338  2.9999999999999997e-91  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.773989  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1954  ABC transporter related  36.9 
 
 
610 aa  338  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.111523 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0507  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.65 
 
 
618 aa  338  2.9999999999999997e-91  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2618  ABC transporter related  34.45 
 
 
617 aa  337  2.9999999999999997e-91  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000100526  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2717  ABC transporter related  38.65 
 
 
608 aa  337  3.9999999999999995e-91  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2049  ABC transporter related protein  36.44 
 
 
663 aa  337  3.9999999999999995e-91  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.146206  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0981  ABC transporter related  35.32 
 
 
576 aa  336  7.999999999999999e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1454  ABC transporter related  38.07 
 
 
641 aa  335  1e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1316  ABC transporter related  35.08 
 
 
784 aa  335  1e-90  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.512065  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5995  ABC transporter related  36.49 
 
 
632 aa  335  1e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.210924  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1216  ABC transporter related  40.31 
 
 
597 aa  335  1e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.791805  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2733  ABC transporter related  32.77 
 
 
631 aa  335  2e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.021846  normal  0.190322 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27200  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.72 
 
 
702 aa  334  2e-90  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.663509  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0495  uncharacterized ABC transporter, ATPase component  31.48 
 
 
618 aa  335  2e-90  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4565  ABC transporter related protein  32.27 
 
 
811 aa  335  2e-90  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0672  ABC transporter related  35.44 
 
 
777 aa  335  2e-90  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.264122  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>