More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1402 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_2944  ABC transporter related  60.74 
 
 
601 aa  753    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.631806 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0649  ATPase  63.34 
 
 
596 aa  769    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.110083  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3017  ABC transporter, transmembrane region  61.06 
 
 
602 aa  711    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0138128  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1402  ATPase  100 
 
 
619 aa  1246    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.387875  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1643  ATPase  79.87 
 
 
601 aa  966    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1110  ATPase  59.9 
 
 
590 aa  736    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.551514  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2109  ATPase  64.9 
 
 
591 aa  770    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.265654  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4426  ABC transporter related  61.11 
 
 
603 aa  740    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.368028  normal  0.0987215 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3174  ABC transporter related  60.91 
 
 
601 aa  754    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0828  ABC transporter related  58.36 
 
 
596 aa  708    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.61579  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2187  ABC transporter related  55.87 
 
 
595 aa  662    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12051  multidrug ABC transporter  60.59 
 
 
590 aa  748    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11901  multidrug ABC transporter  61.27 
 
 
590 aa  764    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14811  multidrug ABC transporter  62.48 
 
 
596 aa  773    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.25024  normal  0.341749 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12061  multidrug ABC transporter  60.24 
 
 
590 aa  739    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4432  ABC transporter related  60.72 
 
 
601 aa  729    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5646  ABC transporter related protein  59.52 
 
 
596 aa  687    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10871  multidrug ABC transporter  65.06 
 
 
596 aa  787    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.405422 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0115  ABC transporter, transmembrane region  52.96 
 
 
625 aa  634  1e-180  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0306  ABC transporter related protein  53.16 
 
 
620 aa  577  1.0000000000000001e-163  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.233124 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1520  hypothetical protein  46.08 
 
 
595 aa  521  1e-146  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0441  ABC transporter related protein  40.4 
 
 
650 aa  444  1e-123  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0417  ABC transporter related  40.29 
 
 
660 aa  437  1e-121  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1262  ABC transporter related  41.79 
 
 
644 aa  432  1e-120  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0078  ABC transporter related  43.55 
 
 
648 aa  419  1e-116  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.213516  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1375  ABC transporter related  38.18 
 
 
651 aa  412  1e-114  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.250681  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3603  ABC transporter related  40.76 
 
 
962 aa  404  1e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0813652  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2242  ABC transporter related protein  40.11 
 
 
658 aa  400  9.999999999999999e-111  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.406073  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4137  ABC transporter related protein  34.44 
 
 
718 aa  401  9.999999999999999e-111  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2936  ABC transporter related  38.19 
 
 
638 aa  397  1e-109  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4471  ABC transporter related protein  38.76 
 
 
629 aa  392  1e-108  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0660374  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3174  ABC transporter related  38.93 
 
 
750 aa  389  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3017  ABC transporter related protein  37.01 
 
 
639 aa  382  1e-105  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1550  ABC transporter related  38.95 
 
 
589 aa  383  1e-105  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.759268  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0975  ABC transporter related  35.71 
 
 
585 aa  374  1e-102  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.685046  hitchhiker  0.000181513 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  35.26 
 
 
575 aa  367  1e-100  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4974  ABC transporter related  32.13 
 
 
571 aa  352  8.999999999999999e-96  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  36.11 
 
 
556 aa  351  2e-95  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0913  ABC transporter related  35.66 
 
 
678 aa  351  3e-95  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.00146704 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  37.18 
 
 
598 aa  350  4e-95  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3334  ABC transporter related  34.52 
 
 
584 aa  350  5e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3583  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5030  ABC transporter ATP-binding/permease  31.79 
 
 
571 aa  348  1e-94  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0487117  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4860  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  31.79 
 
 
571 aa  349  1e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.201042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4875  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  31.79 
 
 
571 aa  349  1e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259113  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5411  ABC transporter permease/ATP-binding protein  31.79 
 
 
571 aa  348  1e-94  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5268  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.79 
 
 
571 aa  349  1e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5658  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.79 
 
 
571 aa  348  2e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1306  ABC transporter related  36.22 
 
 
582 aa  347  4e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5298  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.62 
 
 
571 aa  347  4e-94  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5343  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.79 
 
 
571 aa  346  6e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0402  ABC transporter related  35.61 
 
 
645 aa  345  1e-93  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.176731  normal  0.164805 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5285  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.02 
 
 
571 aa  345  2e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1942  ABC transporter, transmembrane region  34 
 
 
594 aa  344  2e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2922  ABC transporter related protein  37.09 
 
 
581 aa  343  7e-93  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.364865  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0047  ABC transporter related  31.9 
 
 
580 aa  342  1e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00438981  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  32.76 
 
 
597 aa  342  1e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1363  ABC transporter related  32.32 
 
 
636 aa  341  2e-92  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000676834  normal  0.402453 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3351  ABC transporter related  32.19 
 
 
579 aa  341  2e-92  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.773989  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8742  carbohydrate ABC transporter  34.67 
 
 
669 aa  340  2.9999999999999998e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1954  ABC transporter related  34.99 
 
 
610 aa  340  5e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.111523 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2389  ABC transporter, permease protein/ATP-binding protein  31.86 
 
 
572 aa  338  9.999999999999999e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000145644  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0494  ABC transporter related  34.98 
 
 
611 aa  338  1.9999999999999998e-91  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2487  ABC transporter related  31.86 
 
 
572 aa  338  1.9999999999999998e-91  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.461616  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1674  ABC transporter permease/ATP-binding protein  31.86 
 
 
572 aa  338  1.9999999999999998e-91  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0264422  normal  0.294375 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3501  ABC transporter related  35.33 
 
 
575 aa  337  2.9999999999999997e-91  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2181  ABC transporter related  32.78 
 
 
600 aa  334  3e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0981  ABC transporter related  32.93 
 
 
576 aa  334  3e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2278  ABC transporter related  35.11 
 
 
582 aa  333  5e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.682256  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4405  ABC transporter related  32.87 
 
 
568 aa  333  5e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.292842 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2622  ABC transporter transmembrane region  36.44 
 
 
606 aa  332  8e-90  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.499231  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1896  ABC transporter related  32.87 
 
 
572 aa  332  1e-89  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.332587  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1201  ABC transporter related protein  33.68 
 
 
594 aa  331  2e-89  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30570  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  38.27 
 
 
1257 aa  331  2e-89  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2001  ABC transporter related  34.47 
 
 
582 aa  331  3e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.201401  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1429  ABC transporter related  31.88 
 
 
581 aa  330  3e-89  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1525  ABC transporter related  32.31 
 
 
581 aa  330  4e-89  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.628149  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0466  ABC transporter related  36.08 
 
 
588 aa  329  9e-89  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6252  ABC transporter related  38.43 
 
 
1436 aa  329  1.0000000000000001e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2733  ABC transporter related  32.83 
 
 
631 aa  329  1.0000000000000001e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.021846  normal  0.190322 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3081  ABC multidrug efflux transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  34.26 
 
 
567 aa  328  2.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1143  ABC transporter related  34.14 
 
 
565 aa  328  2.0000000000000001e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.4551 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3808  ABC transporter related  34.26 
 
 
567 aa  328  2.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0584709  normal  0.445528 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4200  ABC transporter related  34.14 
 
 
566 aa  327  3e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.737412  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3932  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.2 
 
 
567 aa  327  4.0000000000000003e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.130383  normal  0.874644 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3781  ABC transporter related  31.97 
 
 
588 aa  327  5e-88  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000284212  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1514  ABC transporter, ATPase subunit  33.16 
 
 
591 aa  327  5e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.143347  normal  0.756975 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4923  ABC transporter related  31.75 
 
 
593 aa  327  5e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0406307 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1342  ABC transporter related  33.17 
 
 
671 aa  326  7e-88  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0082  ATPase  36.01 
 
 
582 aa  326  9e-88  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0337  ABC transporter related  32.25 
 
 
582 aa  326  1e-87  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0856  ABC transporter related  29.5 
 
 
626 aa  325  1e-87  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2580  ABC transporter, ATP-binding protein/permease protein  30.53 
 
 
566 aa  325  2e-87  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2282  putative ABC transporter ATP-binding protein  30.19 
 
 
566 aa  325  2e-87  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2528  ABC transporter related  30.58 
 
 
580 aa  323  5e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000757065  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0806  ABC transporter related  35.74 
 
 
666 aa  323  8e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1259  ATP-binding transport protein; multicopy suppressor of HtrB  34.25 
 
 
579 aa  322  1.9999999999999998e-86  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2189  ABC transporter related protein  32.13 
 
 
572 aa  321  3e-86  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.480877  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2350  ABC transporter related protein  36.22 
 
 
620 aa  320  3.9999999999999996e-86  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3416  ABC transporter-related protein  36.04 
 
 
602 aa  320  6e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0841  ABC transporter related  33.22 
 
 
607 aa  319  1e-85  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>