More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3603 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3174  ABC transporter related  68.14 
 
 		 750 aa  855    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3603  ABC transporter related  100 
 
 		 962 aa  1845    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0813652  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5646  ABC transporter related protein  42.93 
 
 		 596 aa  440  9.999999999999999e-123  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3174  ABC transporter related  39.73 
 
 		 601 aa  437  1e-121  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4426  ABC transporter related  41.6 
 
 		 603 aa  435  1e-120  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.368028  normal  0.0987215 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2944  ABC transporter related  39.56 
 
 		 601 aa  436  1e-120  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.631806 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4432  ABC transporter related  39.39 
 
 		 601 aa  422  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2109  ATPase  40.75 
 
 		 591 aa  419  9.999999999999999e-116  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.265654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3017  ABC transporter, transmembrane region  39.44 
 
 		 602 aa  410  1e-113  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0138128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0828  ABC transporter related  37.97 
 
 		 596 aa  407  1.0000000000000001e-112  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.61579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12051  multidrug ABC transporter  36.28 
 
 		 590 aa  401  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1402  ATPase  40.76 
 
 		 619 aa  398  1e-109  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.387875  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12061  multidrug ABC transporter  36.11 
 
 		 590 aa  397  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0306  ABC transporter related protein  42.26 
 
 		 620 aa  394  1e-108  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.233124 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0649  ATPase  37.2 
 
 		 596 aa  392  1e-107  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.110083  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1110  ATPase  35.76 
 
 		 590 aa  390  1e-107  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.551514  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10871  multidrug ABC transporter  36.9 
 
 		 596 aa  391  1e-107  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.405422 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11901  multidrug ABC transporter  36 
 
 		 590 aa  392  1e-107  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14811  multidrug ABC transporter  37.03 
 
 		 596 aa  392  1e-107  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.25024  normal  0.341749 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1643  ATPase  42.03 
 
 		 601 aa  384  1e-105  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2187  ABC transporter related  37.39 
 
 		 595 aa  372  1e-101  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0115  ABC transporter, transmembrane region  36.01 
 
 		 625 aa  350  7e-95  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1520  hypothetical protein  33.95 
 
 		 595 aa  338  3.9999999999999995e-91  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0417  ABC transporter related  36.03 
 
 		 660 aa  335  3e-90  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2936  ABC transporter related  35.44 
 
 		 638 aa  333  8e-90  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1262  ABC transporter related  34.7 
 
 		 644 aa  323  9.999999999999999e-87  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3017  ABC transporter related protein  37 
 
 		 639 aa  314  5.999999999999999e-84  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0078  ABC transporter related  36.48 
 
 		 648 aa  313  9e-84  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.213516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0441  ABC transporter related protein  35.78 
 
 		 650 aa  313  1e-83  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1375  ABC transporter related  34.13 
 
 		 651 aa  311  4e-83  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.250681  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2242  ABC transporter related protein  35.1 
 
 		 658 aa  303  9e-81  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.406073  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4471  ABC transporter related protein  35.56 
 
 		 629 aa  296  2e-78  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0660374  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5030  ABC transporter ATP-binding/permease  32.96 
 
 		 571 aa  281  4e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0487117  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5411  ABC transporter permease/ATP-binding protein  32.96 
 
 		 571 aa  281  4e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0981  ABC transporter related  35.1 
 
 		 576 aa  281  5e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2618  ABC transporter related  31.8 
 
 		 617 aa  280  7e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000100526  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0337  ABC transporter related  31.16 
 
 		 582 aa  279  2e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4860  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  32.78 
 
 		 571 aa  278  4e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.201042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4875  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  32.78 
 
 		 571 aa  278  4e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259113  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5268  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.78 
 
 		 571 aa  278  4e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  34.24 
 
 		 556 aa  277  5e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0975  ABC transporter related  35.33 
 
 		 585 aa  276  1.0000000000000001e-72  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.685046  hitchhiker  0.000181513 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5298  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.59 
 
 		 571 aa  276  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5343  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.59 
 
 		 571 aa  276  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5285  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.59 
 
 		 571 aa  276  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0552  ABC transporter related  32.87 
 
 		 589 aa  275  3e-72  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5658  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.41 
 
 		 571 aa  275  4.0000000000000004e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4974  ABC transporter related  32.29 
 
 		 571 aa  273  8.000000000000001e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21520  ABC transporter related  36.88 
 
 		 468 aa  273  1e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4405  ABC transporter related  35.19 
 
 		 568 aa  272  2e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.292842 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2389  ABC transporter, permease protein/ATP-binding protein  33.78 
 
 		 572 aa  271  4e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000145644  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4137  ABC transporter related protein  32.78 
 
 		 718 aa  271  4e-71  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1674  ABC transporter permease/ATP-binding protein  33.78 
 
 		 572 aa  271  5e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0264422  normal  0.294375 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2487  ABC transporter related  33.78 
 
 		 572 aa  270  8e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.461616  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2350  ABC transporter related protein  34.99 
 
 		 620 aa  270  1e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  36.36 
 
 		 598 aa  268  2e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0913  ABC transporter related  33.81 
 
 		 678 aa  268  2.9999999999999995e-70  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00146704 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1896  ABC transporter related  33.86 
 
 		 572 aa  268  4e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.332587  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0672  ABC transporter related  36.23 
 
 		 777 aa  268  4e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.264122  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1201  ABC transporter related protein  32.95 
 
 		 594 aa  268  5e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1245  ABC transporter related  32.68 
 
 		 594 aa  267  5.999999999999999e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00497584  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3351  ABC transporter related  30.65 
 
 		 579 aa  266  1e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.773989  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2225  ABC transporter related  34.39 
 
 		 612 aa  266  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.164174  normal  0.618003 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2181  ABC transporter related  31.71 
 
 		 600 aa  266  2e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2189  ABC transporter related protein  33.46 
 
 		 572 aa  266  2e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.480877  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3501  ABC transporter related  33.81 
 
 		 575 aa  265  4e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2580  ABC transporter, ATP-binding protein/permease protein  31.73 
 
 		 566 aa  264  4.999999999999999e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  33.95 
 
 		 575 aa  264  6e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1306  ABC transporter related  37.02 
 
 		 582 aa  263  1e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1550  ABC transporter related  33.52 
 
 		 589 aa  262  2e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.759268  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5708  ABC transporter related  34.58 
 
 		 764 aa  262  2e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.920431  normal  0.127768 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2126  ABC transporter related protein  34.02 
 
 		 592 aa  261  3e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0739  ABC transport protein ATPase component  35.01 
 
 		 624 aa  261  3e-68  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.191693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3398  ABC transporter related  34.92 
 
 		 598 aa  262  3e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0684  ABC transporter related  34.74 
 
 		 598 aa  262  3e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000210902  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0741  ABC transporter related protein  34.83 
 
 		 650 aa  261  4e-68  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3334  ABC transporter related  33.67 
 
 		 584 aa  261  4e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3583  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1446  leukotoxin translocation ATP-binding protein LktB  34.06 
 
 		 699 aa  261  5.0000000000000005e-68  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0404979  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3262  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  34.93 
 
 		 764 aa  260  8e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1954  ABC transporter related  35.87 
 
 		 610 aa  259  1e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.111523 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0544  ABC transporter related  32 
 
 		 587 aa  259  1e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3384  ABC transporter, ATP-binding protein  31.62 
 
 		 587 aa  260  1e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.603869  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0637  ABC transporter related  35.98 
 
 		 770 aa  259  1e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.57887  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3466  ABC transporter ATP-binding/permease  31.43 
 
 		 587 aa  259  2e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.197712  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1331  ABC transporter related  33.96 
 
 		 609 aa  259  2e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.134992  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0494  ABC transporter related  34.77 
 
 		 611 aa  259  2e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3740  ABC transporter permease/ATP-binding protein  31.43 
 
 		 587 aa  259  2e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.037622  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3695  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.43 
 
 		 587 aa  259  2e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000106018 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1385  ABC transporter related  46.34 
 
 		 600 aa  259  2e-67  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0831464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2282  putative ABC transporter ATP-binding protein  30.98 
 
 		 566 aa  259  2e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3786  ABC transporter  32.08 
 
 		 587 aa  259  2e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.469191  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0418  ABC transporter related protein  34.77 
 
 		 600 aa  258  3e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0658  ABC transporter related  35.77 
 
 		 750 aa  258  3e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2429  ABC transporter related  31.07 
 
 		 619 aa  258  4e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.572705  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2998  type I secretion system ATPase  38.43 
 
 		 753 aa  258  4e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2332  ABC transporter-related protein  31.67 
 
 		 587 aa  258  5e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000229781  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3432  ABC transporter, ATP-binding protein  31.24 
 
 		 587 aa  258  5e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000147455  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4487  ABC transporter related  36.98 
 
 		 607 aa  258  5e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0324743  normal  0.0684867 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1811  ABC transporter related  32.96 
 
 		 572 aa  258  5e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00064367  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0737  ABC transporter related  34.04 
 
 		 652 aa  257  6e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>