More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0741 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0741  ABC transporter related protein  100 
 
 		 650 aa  1325    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0912  ABC transporter related  47.76 
 
 		 638 aa  516  1.0000000000000001e-145  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0165708  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0047  ABC transporter related  38.09 
 
 		 580 aa  385  1e-106  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00438981  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0475  ABC transporter related  32.79 
 
 		 584 aa  344  2.9999999999999997e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00181463  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  34.68 
 
 		 597 aa  342  1e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1250  ABC transporter, ATP-binding protein  32.82 
 
 		 604 aa  331  2e-89  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00143997 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5708  ABC transporter related  35.88 
 
 		 764 aa  328  1.0000000000000001e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.920431  normal  0.127768 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3262  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  34.62 
 
 		 764 aa  329  1.0000000000000001e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0841  ABC transporter related  34.65 
 
 		 607 aa  328  2.0000000000000001e-88  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0439  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  33.02 
 
 		 586 aa  327  3e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.214785  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0435  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  33.02 
 
 		 586 aa  327  3e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.290198  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0511  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.02 
 
 		 586 aa  327  3e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0496  ABC transporter ATP-binding/permease  33.02 
 
 		 586 aa  326  7e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.384636  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0528  ABC transporter permease/ATP-binding protein  33.02 
 
 		 586 aa  326  7e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.249641  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4793  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.02 
 
 		 586 aa  325  1e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.646278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0584  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.21 
 
 		 586 aa  325  1e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0583  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.02 
 
 		 586 aa  324  3e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2618  ABC transporter related  33.71 
 
 		 617 aa  324  3e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000100526  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3979  ABC transporter-related protein  35.81 
 
 		 773 aa  324  3e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4037  ABC transporter related protein  38.58 
 
 		 764 aa  323  4e-87  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.238544  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0532  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.82 
 
 		 586 aa  323  5e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.117534  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3967  ABC transporter related  34.2 
 
 		 768 aa  323  9.000000000000001e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4080  ABC transporter related  34.2 
 
 		 814 aa  322  9.999999999999999e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.256448  normal  0.875845 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0637  ABC transporter related  36.59 
 
 		 770 aa  322  9.999999999999999e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.57887  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0658  ABC transporter related  36.38 
 
 		 750 aa  321  3e-86  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  32.65 
 
 		 597 aa  321  3e-86  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  32.65 
 
 		 597 aa  320  3.9999999999999996e-86  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1525  ABC transporter related  32.28 
 
 		 581 aa  317  5e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.628149  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1342  ABC transporter related  34.91 
 
 		 671 aa  316  8e-85  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2584  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  32.64 
 
 		 768 aa  316  8e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2350  ABC transporter related protein  36.21 
 
 		 620 aa  315  9.999999999999999e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0672  ABC transporter related  33.79 
 
 		 777 aa  315  1.9999999999999998e-84  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.264122  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0705  ABC transporter-related protein  35.56 
 
 		 784 aa  315  1.9999999999999998e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0450  ABC transporter-related protein  32.44 
 
 		 586 aa  315  1.9999999999999998e-84  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0466  ABC transporter related  35.15 
 
 		 588 aa  313  3.9999999999999997e-84  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3781  ABC transporter related  33.46 
 
 		 588 aa  314  3.9999999999999997e-84  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000284212  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0444  ABC transporter related  32.06 
 
 		 586 aa  314  3.9999999999999997e-84  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0544  ABC transporter related  33.22 
 
 		 587 aa  313  7.999999999999999e-84  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1403  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.58 
 
 		 578 aa  312  1e-83  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1954  ABC transporter related  35.88 
 
 		 578 aa  312  1e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1920  ABC transporter related  35.88 
 
 		 578 aa  312  1e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0418  ABC transporter related protein  32.2 
 
 		 600 aa  311  2e-83  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1316  ABC transporter related  35.87 
 
 		 784 aa  311  2e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.512065  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2250  ABC transporter, transmembrane region  35.02 
 
 		 634 aa  311  2e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.993927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1007  ABC transporter related  35.64 
 
 		 784 aa  311  2.9999999999999997e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.29536 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  36.21 
 
 		 598 aa  310  5e-83  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4991  ABC transporter related  35.67 
 
 		 808 aa  310  5.9999999999999995e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2260  ABC transporter ATP-binding protein  36.29 
 
 		 571 aa  310  6.999999999999999e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4038  ABC transporter-related protein  36.23 
 
 		 726 aa  309  1.0000000000000001e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000838789 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1417  ABC transporter related  33.01 
 
 		 782 aa  308  2.0000000000000002e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.111222 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  31.23 
 
 		 575 aa  308  2.0000000000000002e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0148  ABC transporter related  35.43 
 
 		 628 aa  308  3e-82  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3872  ABC transporter related  33.14 
 
 		 585 aa  307  3e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4432  ABC transporter related  32.62 
 
 		 601 aa  306  5.0000000000000004e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3355  ABC transporter transmembrane region  36.21 
 
 		 672 aa  306  5.0000000000000004e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0018  ABC transporter related  36.04 
 
 		 581 aa  307  5.0000000000000004e-82  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2254  ABC transporter related  35.87 
 
 		 782 aa  306  7e-82  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1021  putative ABC transporter  34.87 
 
 		 778 aa  306  8.000000000000001e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.338231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1776  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.66 
 
 		 589 aa  305  1.0000000000000001e-81  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184019  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1060  ABC transporter related  35.02 
 
 		 760 aa  306  1.0000000000000001e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.120719  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4572  ABC transporter, transmembrane region  36.48 
 
 		 546 aa  305  2.0000000000000002e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1259  ATP-binding transport protein; multicopy suppressor of HtrB  32.71 
 
 		 579 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0082  ATPase  35.26 
 
 		 582 aa  305  2.0000000000000002e-81  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0133  ABC transporter, transmembrane region  35.59 
 
 		 613 aa  305  2.0000000000000002e-81  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.260657  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1777  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.68 
 
 		 573 aa  305  2.0000000000000002e-81  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00514902  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0584  ABC transporter transmembrane region  32.12 
 
 		 582 aa  303  6.000000000000001e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.321607  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5298  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.08 
 
 		 571 aa  303  6.000000000000001e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3379  ABC transporter transmembrane region  30.9 
 
 		 646 aa  303  7.000000000000001e-81  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5268  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.08 
 
 		 571 aa  303  7.000000000000001e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4860  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  33.08 
 
 		 571 aa  303  7.000000000000001e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.201042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4875  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  33.08 
 
 		 571 aa  303  7.000000000000001e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259113  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0737  ABC transporter related  35.7 
 
 		 652 aa  303  7.000000000000001e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2932  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.03 
 
 		 598 aa  303  7.000000000000001e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00230756 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2351  ABC transporter related protein  36.44 
 
 		 581 aa  303  9e-81  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.589414  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2401  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30 
 
 		 598 aa  302  1e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0684  ABC transporter related  36.24 
 
 		 598 aa  302  1e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000210902  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3941  ABC transporter, transmembrane region  33.52 
 
 		 631 aa  302  1e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4015  ABC transporter, transmembrane region  33.52 
 
 		 631 aa  302  1e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1495  ABC transporter-like protein protein  35.88 
 
 		 578 aa  302  1e-80  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.155275  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3955  ABC transporter, transmembrane region  33.52 
 
 		 631 aa  301  2e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.375009  decreased coverage  0.0046772 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11298  drug ABC transporter ATP-binding protein  35.05 
 
 		 631 aa  301  2e-80  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0115  ABC transporter, transmembrane region  33.12 
 
 		 625 aa  301  3e-80  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5343  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.89 
 
 		 571 aa  301  3e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2475  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.68 
 
 		 598 aa  301  4e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00961334  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4444  ABC transporter related  34.13 
 
 		 610 aa  300  4e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.949596  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5658  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.7 
 
 		 571 aa  300  4e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4531  ABC transporter related  34.13 
 
 		 610 aa  300  4e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.319604  normal  0.425635 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0806  ABC transporter related  32.82 
 
 		 666 aa  300  5e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2539  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.33 
 
 		 598 aa  300  7e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0506  ABC transporter, ATP-binding protein/permease  29.93 
 
 		 612 aa  299  9e-80  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.740474 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5030  ABC transporter ATP-binding/permease  32.89 
 
 		 571 aa  299  1e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0487117  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2690  multidrug resistance ABC transporter  32.27 
 
 		 615 aa  299  1e-79  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0586583  normal  0.13127 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  33.46 
 
 		 556 aa  299  1e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2717  ABC transporter related  34.12 
 
 		 608 aa  299  1e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5411  ABC transporter permease/ATP-binding protein  32.89 
 
 		 571 aa  299  1e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2109  ATPase  31.96 
 
 		 591 aa  299  1e-79  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.265654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4826  ABC transporter related  34.13 
 
 		 610 aa  299  1e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.596215 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5285  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.89 
 
 		 571 aa  298  2e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0569  ABC transporter related  30.02 
 
 		 597 aa  298  2e-79  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0838  ABC transporter related  31.56 
 
 		 640 aa  298  2e-79  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>