More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0912 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_0912  ABC transporter related  100 
 
 
638 aa  1283    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0165708  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0741  ABC transporter related protein  47.75 
 
 
650 aa  559  1e-158  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0047  ABC transporter related  40.92 
 
 
580 aa  411  1e-113  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00438981  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2717  ABC transporter related  39.45 
 
 
608 aa  358  1.9999999999999998e-97  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0544  ABC transporter related  37.48 
 
 
587 aa  353  4e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2497  ABC transporter related  37.84 
 
 
614 aa  350  4e-95  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1525  ABC transporter related  34.47 
 
 
581 aa  350  5e-95  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.628149  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  36.38 
 
 
597 aa  349  7e-95  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3626  ABC transporter related  40.63 
 
 
588 aa  349  8e-95  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.058238  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  36.14 
 
 
556 aa  348  1e-94  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  41.21 
 
 
598 aa  348  2e-94  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0418  ABC transporter related protein  37.82 
 
 
600 aa  347  3e-94  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0475  ABC transporter related  37.41 
 
 
584 aa  347  5e-94  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00181463  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2350  ABC transporter related protein  37.09 
 
 
620 aa  344  2e-93  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0648  ABC transporter related  36.19 
 
 
623 aa  345  2e-93  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.986523 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1342  ABC transporter related  34.96 
 
 
671 aa  345  2e-93  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0637  ABC transporter related  37.4 
 
 
770 aa  343  4e-93  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.57887  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4793  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.63 
 
 
586 aa  343  5.999999999999999e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.646278  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0444  ABC transporter related  37.03 
 
 
586 aa  343  8e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0658  ABC transporter related  37.4 
 
 
750 aa  343  8e-93  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2618  ABC transporter related  36.85 
 
 
617 aa  342  9e-93  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000100526  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0642  ABC transporter related  36.58 
 
 
620 aa  341  2e-92  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.014004  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  34.77 
 
 
597 aa  340  5.9999999999999996e-92  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0133  ABC transporter, transmembrane region  34.71 
 
 
613 aa  340  5.9999999999999996e-92  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.260657  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  34.77 
 
 
597 aa  340  7e-92  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0439  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  36.83 
 
 
586 aa  339  8e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.214785  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0511  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.83 
 
 
586 aa  339  8e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0583  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  37.03 
 
 
586 aa  339  9e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0532  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.44 
 
 
586 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.117534  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0496  ABC transporter ATP-binding/permease  36.83 
 
 
586 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.384636  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5708  ABC transporter related  36.4 
 
 
764 aa  338  1.9999999999999998e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.920431  normal  0.127768 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0528  ABC transporter permease/ATP-binding protein  36.83 
 
 
586 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.249641  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2109  ATPase  38.38 
 
 
591 aa  338  1.9999999999999998e-91  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.265654  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0584  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.83 
 
 
586 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1454  ABC transporter related  38.95 
 
 
641 aa  337  2.9999999999999997e-91  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1080  ABC transporter related  39.96 
 
 
601 aa  337  2.9999999999999997e-91  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00169898 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0435  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  36.63 
 
 
586 aa  337  3.9999999999999995e-91  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.290198  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2719  ABC transporter related  38.79 
 
 
606 aa  337  5.999999999999999e-91  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2505  ABC transporter related protein  36.97 
 
 
607 aa  337  5.999999999999999e-91  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.152219  normal  0.502097 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2499  ABC transporter transmembrane region  38.5 
 
 
601 aa  336  9e-91  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1942  ABC transporter, transmembrane region  37.23 
 
 
594 aa  334  3e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0082  ATPase  38.1 
 
 
582 aa  334  3e-90  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5296  ABC transporter related  39.01 
 
 
1522 aa  333  8e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0148  ABC transporter related  35.17 
 
 
628 aa  332  1e-89  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2733  ABC transporter related  36.71 
 
 
631 aa  332  1e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.021846  normal  0.190322 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1520  ABC transporter related  38.27 
 
 
597 aa  332  1e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.887648  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4991  ABC transporter related  37.6 
 
 
808 aa  332  1e-89  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3979  ABC transporter-related protein  35.39 
 
 
773 aa  331  2e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  34.15 
 
 
575 aa  332  2e-89  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2922  ABC transporter related protein  38.98 
 
 
581 aa  331  3e-89  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.364865  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1250  ABC transporter, ATP-binding protein  34.95 
 
 
604 aa  330  4e-89  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00143997 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2311  ABC transporter related  35.34 
 
 
695 aa  330  5.0000000000000004e-89  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.28541  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4038  ABC transporter-related protein  37.33 
 
 
726 aa  330  6e-89  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000838789 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2283  ABC transporter related  35.88 
 
 
589 aa  329  8e-89  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3501  ABC transporter related  37.45 
 
 
575 aa  329  1.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0948  ABC transporter related  37.22 
 
 
642 aa  328  2.0000000000000001e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.336517  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3808  ABC transporter related  37.8 
 
 
567 aa  328  2.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0584709  normal  0.445528 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19280  ABC transporter related  34.77 
 
 
609 aa  328  2.0000000000000001e-88  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0672  ABC transporter related  35.92 
 
 
777 aa  328  2.0000000000000001e-88  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.264122  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0466  ABC transporter related  36.33 
 
 
588 aa  327  4.0000000000000003e-88  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3262  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  34.4 
 
 
764 aa  327  6e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1021  putative ABC transporter  37.13 
 
 
778 aa  327  6e-88  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.338231  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1316  ABC transporter related  35.95 
 
 
784 aa  326  7e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.512065  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3081  ABC multidrug efflux transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  37.43 
 
 
567 aa  326  9e-88  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0584  ABC transporter transmembrane region  33.27 
 
 
582 aa  326  1e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.321607  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0379  ABC transporter related  37.43 
 
 
653 aa  325  1e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0841  ABC transporter related  33.33 
 
 
607 aa  325  1e-87  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4565  ABC transporter related protein  35.73 
 
 
811 aa  325  2e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4860  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  33.1 
 
 
571 aa  324  2e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.201042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4875  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  33.1 
 
 
571 aa  324  2e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259113  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6412  ABC transporter related  37.4 
 
 
649 aa  325  2e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5268  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.1 
 
 
571 aa  324  2e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0247  ABC transporter related  36.74 
 
 
586 aa  325  2e-87  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.306695  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5298  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.1 
 
 
571 aa  324  2e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0801  ABC transporter-like protein  36.04 
 
 
635 aa  324  3e-87  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.678319 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3355  ABC transporter transmembrane region  33.28 
 
 
672 aa  324  3e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1060  ABC transporter related  35.97 
 
 
760 aa  323  6e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.120719  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0806  ABC transporter related  35.06 
 
 
666 aa  323  7e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5658  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.92 
 
 
571 aa  323  7e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2049  ABC transporter related protein  36.22 
 
 
663 aa  323  9.000000000000001e-87  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.146206  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2392  ABC transporter related  38.38 
 
 
580 aa  322  9.000000000000001e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5343  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.1 
 
 
571 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2584  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  33.82 
 
 
768 aa  322  9.999999999999999e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1777  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.55 
 
 
573 aa  322  9.999999999999999e-87  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00514902  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1007  ABC transporter related  36.45 
 
 
784 aa  322  9.999999999999999e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.29536 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5285  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.92 
 
 
571 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2444  ABC transporter related  38.38 
 
 
580 aa  322  1.9999999999999998e-86  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.385044 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5994  ABC transporter related  36.61 
 
 
587 aa  322  1.9999999999999998e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1259  ATP-binding transport protein; multicopy suppressor of HtrB  35.65 
 
 
579 aa  321  3e-86  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2371  ABC transporter, ATPase subunit  34.18 
 
 
622 aa  321  3e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4974  ABC transporter related  32.38 
 
 
571 aa  321  3e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0684  ABC transporter related  35.31 
 
 
598 aa  321  3e-86  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000210902  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1429  ABC transporter related  33.77 
 
 
581 aa  320  3.9999999999999996e-86  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5030  ABC transporter ATP-binding/permease  32.92 
 
 
571 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0487117  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5411  ABC transporter permease/ATP-binding protein  32.92 
 
 
571 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0838  ABC transporter related  33.54 
 
 
640 aa  320  3.9999999999999996e-86  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8742  carbohydrate ABC transporter  34.79 
 
 
669 aa  320  3.9999999999999996e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6513  ABC transporter related protein  36.36 
 
 
613 aa  320  5e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.330093  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1455  ABC transporter related  36.16 
 
 
625 aa  319  7.999999999999999e-86  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4471  ABC transporter related protein  33.96 
 
 
629 aa  319  7.999999999999999e-86  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0660374  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>