More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_1250 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_1539  multidrug ABC transporter ATPase/permease  62.71 
 
 		 636 aa  835    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1250  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 604 aa  1254    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00143997 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1429  ABC transporter related  45.16 
 
 		 581 aa  539  9.999999999999999e-153  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3781  ABC transporter related  40.27 
 
 		 588 aa  483  1e-135  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000284212  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1525  ABC transporter related  40.97 
 
 		 581 aa  443  1e-123  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.628149  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0047  ABC transporter related  40.04 
 
 		 580 aa  413  1e-114  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00438981  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0568  ABC transporter related  38.65 
 
 		 578 aa  403  1e-111  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2283  ABC transporter related  37.2 
 
 		 589 aa  392  1e-107  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1777  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  38.24 
 
 		 573 aa  391  1e-107  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00514902  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2719  ABC transporter related  34.9 
 
 		 606 aa  362  1e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1954  ABC transporter related  34.93 
 
 		 578 aa  360  3e-98  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1920  ABC transporter related  34.93 
 
 		 578 aa  360  3e-98  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0018  ABC transporter related  36.19 
 
 		 581 aa  360  3e-98  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1514  ABC transporter, ATPase subunit  37.3 
 
 		 591 aa  359  9.999999999999999e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.143347  normal  0.756975 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2180  ABC transporter related  36.38 
 
 		 582 aa  356  5.999999999999999e-97  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2499  ABC transporter transmembrane region  34.46 
 
 		 601 aa  354  2e-96  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  36.67 
 
 		 575 aa  349  9e-95  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0159  ABC transporter related  38.13 
 
 		 541 aa  347  3e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2922  ABC transporter related protein  34.46 
 
 		 581 aa  347  4e-94  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.364865  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0674  ABC transporter related  35.16 
 
 		 589 aa  346  8.999999999999999e-94  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2717  ABC transporter related  35.16 
 
 		 608 aa  345  1e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0802  ABC transporter-like protein  40.12 
 
 		 572 aa  345  1e-93  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  33.33 
 
 		 597 aa  343  4e-93  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0033  ABC transporter related protein  36.55 
 
 		 569 aa  343  5e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1327  ATPase  34.48 
 
 		 604 aa  343  5.999999999999999e-93  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.0000000155487  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  33.67 
 
 		 598 aa  342  1e-92  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0684  ABC transporter related  34.19 
 
 		 598 aa  342  1e-92  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000210902  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2497  ABC transporter related  34.47 
 
 		 614 aa  342  1e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3423  ABC transporter-related protein  37.21 
 
 		 611 aa  341  2e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000173526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  33.45 
 
 		 597 aa  341  2.9999999999999998e-92  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  33.45 
 
 		 597 aa  341  2.9999999999999998e-92  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0532  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.42 
 
 		 586 aa  340  5e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.117534  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0544  ABC transporter related  31.75 
 
 		 587 aa  340  7e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0416  cyclic nucleotide-binding protein  38.66 
 
 		 600 aa  339  9.999999999999999e-92  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4793  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.25 
 
 		 586 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.646278  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0435  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  31.91 
 
 		 586 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.290198  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1166  ABC transporter related protein  37.6 
 
 		 588 aa  338  1.9999999999999998e-91  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0442  ABC transporter related  35.46 
 
 		 618 aa  337  2.9999999999999997e-91  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000293437  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0641  ABC transporter related  35.11 
 
 		 577 aa  337  3.9999999999999995e-91  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.061779  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0439  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  31.74 
 
 		 586 aa  336  5.999999999999999e-91  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.214785  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0511  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.74 
 
 		 586 aa  336  5.999999999999999e-91  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3626  ABC transporter related  34.07 
 
 		 588 aa  335  1e-90  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.058238  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0584  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.74 
 
 		 586 aa  335  1e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3627  ABC transporter related  34.52 
 
 		 617 aa  335  1e-90  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0583  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.57 
 
 		 586 aa  334  2e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0496  ABC transporter ATP-binding/permease  31.57 
 
 		 586 aa  334  2e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.384636  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1520  ABC transporter related  34.22 
 
 		 597 aa  335  2e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.887648  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2351  ABC transporter related protein  37.83 
 
 		 581 aa  335  2e-90  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.589414  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1502  ATPase  36.69 
 
 		 587 aa  335  2e-90  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0528  ABC transporter permease/ATP-binding protein  31.57 
 
 		 586 aa  334  2e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.249641  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0841  ABC transporter related  33.22 
 
 		 607 aa  335  2e-90  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1890  ABC transporter related  36.16 
 
 		 586 aa  335  2e-90  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0664725  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0444  ABC transporter related  31.91 
 
 		 586 aa  334  2e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1057  ABC transporter related  38.13 
 
 		 583 aa  333  4e-90  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1454  ABC transporter related  34.85 
 
 		 641 aa  333  5e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0948  ABC transporter related  36.53 
 
 		 642 aa  333  7.000000000000001e-90  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.336517  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0741  ABC transporter related protein  32.82 
 
 		 650 aa  331  2e-89  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0647  ABC transporter related  36.56 
 
 		 641 aa  331  2e-89  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.356457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1597  ABC transporter related  37.27 
 
 		 583 aa  330  6e-89  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0337  ABC transporter related  33.45 
 
 		 582 aa  330  7e-89  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1884  ABC transporter related protein  32.2 
 
 		 578 aa  328  1.0000000000000001e-88  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1399  ABC transporter related  38.22 
 
 		 596 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0150403 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0450  ABC transporter-related protein  31.74 
 
 		 586 aa  327  3e-88  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1201  ABC transporter related protein  32.03 
 
 		 594 aa  327  4.0000000000000003e-88  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0124  ABC transporter related  37.86 
 
 		 573 aa  327  4.0000000000000003e-88  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2350  ABC transporter related protein  31.89 
 
 		 620 aa  327  5e-88  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2619  ABC transporter related  34.7 
 
 		 578 aa  326  7e-88  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000800932  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3081  ABC multidrug efflux transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  34.97 
 
 		 567 aa  326  8.000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0839  ABC transporter-related protein  37.1 
 
 		 585 aa  325  1e-87  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.677417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1259  ATP-binding transport protein; multicopy suppressor of HtrB  31.89 
 
 		 579 aa  325  2e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0842  ABC transporter related  34.3 
 
 		 594 aa  325  2e-87  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3808  ABC transporter related  34.62 
 
 		 567 aa  325  2e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0584709  normal  0.445528 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1941  ABC transporter, transmembrane region  34.12 
 
 		 592 aa  324  3e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.121107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  35.55 
 
 		 556 aa  324  3e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2506  ABC transporter related protein  38.4 
 
 		 578 aa  324  3e-87  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.120759  normal  0.309345 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1403  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.88 
 
 		 578 aa  323  4e-87  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2616  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  31.62 
 
 		 577 aa  323  5e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0639798  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0466  ABC transporter related  37.82 
 
 		 588 aa  323  7e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2836  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  33.45 
 
 		 585 aa  322  8e-87  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.333651  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1706  ABC transporter related  35.89 
 
 		 586 aa  322  9.999999999999999e-87  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000217452  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0475  ABC transporter related  31.74 
 
 		 584 aa  322  9.999999999999999e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00181463  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5994  ABC transporter related  33.73 
 
 		 587 aa  322  9.999999999999999e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0032  ABC transporter related  36.66 
 
 		 569 aa  321  1.9999999999999998e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0441  ABC transporter related protein  32.61 
 
 		 650 aa  322  1.9999999999999998e-86  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1942  ABC transporter, transmembrane region  32.11 
 
 		 594 aa  320  3.9999999999999996e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1429  ABC transporter related  35.26 
 
 		 1284 aa  320  3.9999999999999996e-86  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.442581  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1060  ABC transporter related  33.56 
 
 		 760 aa  320  3.9999999999999996e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.120719  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0672  ABC transporter related  34.5 
 
 		 578 aa  319  7e-86  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0082  ATPase  33.44 
 
 		 582 aa  319  7e-86  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5708  ABC transporter related  34.9 
 
 		 764 aa  318  1e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.920431  normal  0.127768 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0117  ABC transporter related  32.35 
 
 		 573 aa  318  1e-85  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00018995  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0506  ABC transporter, ATP-binding protein/permease  34.42 
 
 		 612 aa  319  1e-85  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.740474 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1262  ABC transporter related  33.69 
 
 		 644 aa  318  3e-85  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2255  ABC transporter related  35.16 
 
 		 580 aa  317  3e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.870645  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4923  ABC transporter related  36.11 
 
 		 593 aa  318  3e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0406307 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5658  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.1 
 
 		 571 aa  317  3e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0417  ABC transporter related  33.57 
 
 		 660 aa  317  3e-85  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4875  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  33.1 
 
 		 571 aa  317  4e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259113  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5343  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.1 
 
 		 571 aa  317  4e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5268  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.1 
 
 		 571 aa  317  4e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>