More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0159 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0093  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  64.33 
 
 		 610 aa  694    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0159  ABC transporter related  100 
 
 		 541 aa  1087    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3423  ABC transporter-related protein  64.83 
 
 		 611 aa  721    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000173526  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0032  ABC transporter related  67.35 
 
 		 569 aa  719    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0033  ABC transporter related protein  67.16 
 
 		 569 aa  746    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0447  ABC transporter related  54.28 
 
 		 604 aa  540  9.999999999999999e-153  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3410  ABC transporter related  52.96 
 
 		 588 aa  509  1e-143  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2180  ABC transporter related  43.84 
 
 		 582 aa  450  1e-125  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0674  ABC transporter related  41.65 
 
 		 589 aa  430  1e-119  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1166  ABC transporter related protein  40.56 
 
 		 588 aa  419  1e-116  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1514  ABC transporter, ATPase subunit  41.23 
 
 		 591 aa  417  9.999999999999999e-116  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.143347  normal  0.756975 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1597  ABC transporter related  41.51 
 
 		 583 aa  410  1e-113  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0416  cyclic nucleotide-binding protein  42.59 
 
 		 600 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3812  ABC transporter related protein  41.9 
 
 		 650 aa  408  1.0000000000000001e-112  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.882245  normal  0.204358 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12933  ATPase  38.56 
 
 		 585 aa  397  1e-109  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.756809  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1502  ATPase  38 
 
 		 587 aa  396  1e-109  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1706  ABC transporter related  38.67 
 
 		 586 aa  397  1e-109  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000217452  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1391  ABC transporter related  40.07 
 
 		 598 aa  392  1e-108  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.310591  normal  0.711821 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1399  ABC transporter related  39.04 
 
 		 596 aa  393  1e-108  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0150403 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5496  ABC transporter related  38.89 
 
 		 598 aa  391  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.311446  hitchhiker  0.0036652 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1890  ABC transporter related  38.38 
 
 		 586 aa  391  1e-107  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0664725  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2628  ABC transporter related  40.11 
 
 		 583 aa  390  1e-107  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1066  ABC transporter related  37.41 
 
 		 571 aa  386  1e-106  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2506  ABC transporter related protein  40.26 
 
 		 578 aa  386  1e-106  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.120759  normal  0.309345 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4402  ABC transporter related  39.58 
 
 		 584 aa  386  1e-106  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.962719  normal  0.576766 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4923  ABC transporter related  38.46 
 
 		 593 aa  387  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0406307 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1057  ABC transporter related  39.96 
 
 		 583 aa  384  1e-105  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0647  ABC transporter related  39 
 
 		 641 aa  382  1e-105  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.356457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1468  ABC transporter related  38.77 
 
 		 627 aa  385  1e-105  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.308401  normal  0.364804 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2301  ABC transporter-like protein protein  39.23 
 
 		 583 aa  384  1e-105  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2200  ABC transporter related  37.07 
 
 		 592 aa  383  1e-105  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.257555  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0802  ABC transporter-like protein  40.44 
 
 		 572 aa  381  1e-104  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0495  ABC transporter related  40.34 
 
 		 603 aa  381  1e-104  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0839  ABC transporter-related protein  39.35 
 
 		 585 aa  381  1e-104  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.677417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0117  ABC transporter related  39 
 
 		 573 aa  380  1e-104  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00018995  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0124  ABC transporter related  36.67 
 
 		 573 aa  378  1e-103  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1327  ATPase  38.3 
 
 		 604 aa  377  1e-103  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.0000000155487  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1955  ABC transporter, transmembrane region  39.26 
 
 		 607 aa  374  1e-102  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.464432 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4932  cyclic nucleotide-binding protein  38.74 
 
 		 590 aa  373  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.074609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2255  ABC transporter related  43.11 
 
 		 580 aa  370  1e-101  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.870645  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1251  cyclic nucleotide-binding protein  40.27 
 
 		 607 aa  369  1e-101  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4484  ABC transporter related  39.62 
 
 		 581 aa  370  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1244  ABC transporter related  37.22 
 
 		 589 aa  372  1e-101  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000217275  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3226  ABC transporter-related protein  38.01 
 
 		 579 aa  366  1e-100  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0505  hypothetical protein  37.16 
 
 		 606 aa  367  1e-100  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1525  ABC transporter related  36.91 
 
 		 581 aa  365  1e-100  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.628149  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6331  ABC transporter related protein  38.54 
 
 		 593 aa  366  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0038  ABC-type transport system, ATPase and permease components  39.59 
 
 		 576 aa  359  8e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1527  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.86 
 
 		 583 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000068224  normal  0.0160933 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1150  ATPase  38.09 
 
 		 600 aa  357  1.9999999999999998e-97  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.144978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3787  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.04 
 
 		 583 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000176643  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09251  multidrug ABC transporter  36.43 
 
 		 583 aa  358  1.9999999999999998e-97  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.532954  normal  0.0147253 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3467  ABC transporter ATP-binding/permease  35.67 
 
 		 583 aa  357  2.9999999999999997e-97  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000139825  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3433  ABC transporter, ATP-binding and permease protein  35.67 
 
 		 583 aa  357  2.9999999999999997e-97  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000702904  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3741  ABC transporter permease/ATP-binding protein  35.67 
 
 		 583 aa  357  2.9999999999999997e-97  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000316784  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4018  cyclic nucleotide-binding protein  36.47 
 
 		 574 aa  357  3.9999999999999996e-97  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3976  cyclic nucleotide-binding protein  36.47 
 
 		 574 aa  357  3.9999999999999996e-97  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1429  ABC transporter related  37.65 
 
 		 581 aa  356  5e-97  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3696  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.49 
 
 		 583 aa  356  6.999999999999999e-97  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000188932 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3385  ABC transporter, ATP-binding and permease protein  35.75 
 
 		 583 aa  355  1e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000105585  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3715  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  37.65 
 
 		 583 aa  354  2e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000980876  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3720  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  37.45 
 
 		 583 aa  354  2e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0256  multidrug ABC transporter  36.25 
 
 		 583 aa  354  2e-96  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.607826  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1938  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  37.76 
 
 		 593 aa  353  2.9999999999999997e-96  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2333  ABC transporter-related protein  35.32 
 
 		 583 aa  353  4e-96  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000218217  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3366  ABC transporter related  34.44 
 
 		 583 aa  352  8.999999999999999e-96  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000372221  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0757  ABC transporter related  34.76 
 
 		 586 aa  351  2e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000135449  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1309  ATPase  38.3 
 
 		 598 aa  350  3e-95  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.469057  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0685  ABC transporter-related protein  35.11 
 
 		 584 aa  349  6e-95  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234722  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1107  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  37.98 
 
 		 591 aa  348  1e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.349072  hitchhiker  0.00000399844 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1250  ABC transporter, ATP-binding protein  38.13 
 
 		 604 aa  347  2e-94  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00143997 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0442  ABC transporter related  34.6 
 
 		 618 aa  346  5e-94  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000293437  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4432  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.39 
 
 		 548 aa  346  6e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000325117  normal  0.0473884 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2448  ABC transporter, ATP-binding  35.99 
 
 		 594 aa  346  7e-94  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.946245 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1515  ABC transporter related  34.76 
 
 		 577 aa  345  8.999999999999999e-94  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0942  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.05 
 
 		 586 aa  344  2e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.785069  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0945  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.05 
 
 		 586 aa  344  2e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.580157 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0906  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.05 
 
 		 586 aa  344  2e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000129836  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1564  ABC transporter related  36.29 
 
 		 577 aa  344  2.9999999999999997e-93  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0758  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein and permease  36.05 
 
 		 586 aa  343  4e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0751  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein and permease  36.25 
 
 		 586 aa  343  5e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0640  ATPase  38.2 
 
 		 588 aa  343  5e-93  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.25348  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1033  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.05 
 
 		 586 aa  343  5.999999999999999e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000502591  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2849  ABC transporter related  38.22 
 
 		 595 aa  343  5.999999999999999e-93  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000104844  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1773  ABC transporter related  36.36 
 
 		 581 aa  343  5.999999999999999e-93  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000430308  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0809  ABC transporter ATP-binding/permease  35.85 
 
 		 586 aa  341  2e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00766142  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0852  ABC transporter permease/ATP-binding protein  35.85 
 
 		 586 aa  341  2e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2283  ABC transporter related  39.31 
 
 		 589 aa  341  2e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15751  multidrug ABC transporter  36.55 
 
 		 583 aa  341  2e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00400  fused predicted multidrug transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  36.54 
 
 		 590 aa  340  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0484  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  36.54 
 
 		 590 aa  340  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00404  hypothetical protein  36.54 
 
 		 590 aa  340  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1657  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.71 
 
 		 555 aa  340  2.9999999999999998e-92  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0047  ABC transporter related  35.71 
 
 		 580 aa  340  4e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00438981  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0916  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  36.93 
 
 		 590 aa  338  9.999999999999999e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3167  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  36.35 
 
 		 590 aa  338  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.564857  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2125  ABC transporter related protein  40 
 
 		 579 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0525  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  36.35 
 
 		 590 aa  338  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0536  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  36.35 
 
 		 590 aa  338  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.772204 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10371  multidrug ABC transporter  35.33 
 
 		 581 aa  337  3.9999999999999995e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>