More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1057 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_1597  ABC transporter related  72.04 
 
 
583 aa  875    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0839  ABC transporter-related protein  65.81 
 
 
585 aa  772    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.677417  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1502  ATPase  73.98 
 
 
587 aa  902    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1327  ATPase  73.76 
 
 
604 aa  913    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.0000000155487  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1706  ABC transporter related  72.35 
 
 
586 aa  880    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000217452  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1057  ABC transporter related  100 
 
 
583 aa  1187    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1890  ABC transporter related  71.33 
 
 
586 aa  879    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0664725  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0416  cyclic nucleotide-binding protein  45.12 
 
 
600 aa  523  1e-147  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4923  ABC transporter related  42.38 
 
 
593 aa  485  1e-136  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0406307 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1399  ABC transporter related  43 
 
 
596 aa  479  1e-134  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0150403 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2200  ABC transporter related  39.77 
 
 
592 aa  471  1.0000000000000001e-131  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.257555  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1514  ABC transporter, ATPase subunit  41.4 
 
 
591 aa  466  9.999999999999999e-131  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.143347  normal  0.756975 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6331  ABC transporter related protein  43.12 
 
 
593 aa  465  9.999999999999999e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5496  ABC transporter related  41.78 
 
 
598 aa  462  1e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.311446  hitchhiker  0.0036652 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12933  ATPase  41.12 
 
 
585 aa  457  1e-127  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.756809  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2448  ABC transporter, ATP-binding  42.1 
 
 
594 aa  452  1.0000000000000001e-126  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.946245 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1166  ABC transporter related protein  41.23 
 
 
588 aa  439  9.999999999999999e-123  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2180  ABC transporter related  39.79 
 
 
582 aa  431  1e-119  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0674  ABC transporter related  39.02 
 
 
589 aa  420  1e-116  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0505  hypothetical protein  38.92 
 
 
606 aa  421  1e-116  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0033  ABC transporter related protein  39.93 
 
 
569 aa  421  1e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3423  ABC transporter-related protein  38.76 
 
 
611 aa  414  1e-114  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000173526  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2506  ABC transporter related protein  39.73 
 
 
578 aa  415  1e-114  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.120759  normal  0.309345 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0159  ABC transporter related  39.69 
 
 
541 aa  403  1e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0032  ABC transporter related  40.11 
 
 
569 aa  395  1e-109  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1773  ABC transporter related  37.97 
 
 
581 aa  397  1e-109  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000430308  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0802  ABC transporter-like protein  39.07 
 
 
572 aa  390  1e-107  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0647  ABC transporter related  36.59 
 
 
641 aa  392  1e-107  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.356457  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3226  ABC transporter-related protein  36.41 
 
 
579 aa  387  1e-106  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0495  ABC transporter related  37.54 
 
 
603 aa  384  1e-105  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0442  ABC transporter related  35.62 
 
 
618 aa  384  1e-105  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000293437  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1525  ABC transporter related  38.38 
 
 
581 aa  380  1e-104  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.628149  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1244  ABC transporter related  35.39 
 
 
589 aa  372  1e-102  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000217275  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0093  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  37.24 
 
 
610 aa  369  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2628  ABC transporter related  37.07 
 
 
583 aa  370  1e-101  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1251  cyclic nucleotide-binding protein  36.41 
 
 
607 aa  367  1e-100  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1955  ABC transporter, transmembrane region  35.75 
 
 
607 aa  364  3e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.464432 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3812  ABC transporter related protein  35.12 
 
 
650 aa  362  1e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.882245  normal  0.204358 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2333  ABC transporter-related protein  33.45 
 
 
583 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000218217  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1527  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.62 
 
 
583 aa  355  1e-96  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000068224  normal  0.0160933 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3976  cyclic nucleotide-binding protein  34.92 
 
 
574 aa  355  1e-96  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1391  ABC transporter related  33.1 
 
 
598 aa  355  1e-96  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.310591  normal  0.711821 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2125  ABC transporter related protein  35.11 
 
 
579 aa  354  2e-96  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3787  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.45 
 
 
583 aa  355  2e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000176643  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4018  cyclic nucleotide-binding protein  34.92 
 
 
574 aa  354  2e-96  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2301  ABC transporter-like protein protein  33.33 
 
 
583 aa  351  2e-95  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3696  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.45 
 
 
583 aa  351  2e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000188932 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3467  ABC transporter ATP-binding/permease  33.45 
 
 
583 aa  351  3e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000139825  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3433  ABC transporter, ATP-binding and permease protein  33.45 
 
 
583 aa  351  3e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000702904  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3385  ABC transporter, ATP-binding and permease protein  33.45 
 
 
583 aa  350  3e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000105585  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3741  ABC transporter permease/ATP-binding protein  33.45 
 
 
583 aa  351  3e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000316784  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3715  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.62 
 
 
583 aa  348  1e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000980876  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3720  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.62 
 
 
583 aa  348  1e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1657  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  36.15 
 
 
555 aa  349  1e-94  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1938  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.62 
 
 
593 aa  347  2e-94  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0447  ABC transporter related  38.14 
 
 
604 aa  347  3e-94  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3626  ABC transporter related  37.78 
 
 
588 aa  347  4e-94  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.058238  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4932  cyclic nucleotide-binding protein  34.97 
 
 
590 aa  347  4e-94  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.074609  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1309  ATPase  33.28 
 
 
598 aa  346  6e-94  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.469057  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3366  ABC transporter related  32.76 
 
 
583 aa  345  1e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000372221  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4484  ABC transporter related  35.68 
 
 
581 aa  345  1e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1515  ABC transporter related  33.68 
 
 
577 aa  345  1e-93  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2255  ABC transporter related  35.12 
 
 
580 aa  342  8e-93  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.870645  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  36.05 
 
 
556 aa  342  9e-93  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1250  ABC transporter, ATP-binding protein  34.78 
 
 
604 aa  342  1e-92  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00143997 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1564  ABC transporter related  33.16 
 
 
577 aa  338  9.999999999999999e-92  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1468  ABC transporter related  31.5 
 
 
627 aa  338  1.9999999999999998e-91  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.308401  normal  0.364804 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0460  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.45 
 
 
581 aa  337  3.9999999999999995e-91  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2922  ABC transporter related protein  37.47 
 
 
581 aa  337  3.9999999999999995e-91  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.364865  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0568  ABC transporter related  38.85 
 
 
578 aa  337  5e-91  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0758  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein and permease  33.62 
 
 
586 aa  335  9e-91  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0751  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein and permease  33.97 
 
 
586 aa  335  9e-91  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0945  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.62 
 
 
586 aa  335  1e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.580157 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0906  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.62 
 
 
586 aa  335  1e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000129836  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1429  ABC transporter related  32.76 
 
 
581 aa  334  2e-90  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1150  ATPase  32.53 
 
 
600 aa  333  4e-90  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.144978  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0124  ABC transporter related  32.24 
 
 
573 aa  333  5e-90  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1033  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.45 
 
 
586 aa  333  5e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000502591  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2849  ABC transporter related  32.6 
 
 
595 aa  332  8e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000104844  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0685  ABC transporter-related protein  33.51 
 
 
584 aa  332  1e-89  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234722  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0809  ABC transporter ATP-binding/permease  33.45 
 
 
586 aa  332  2e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00766142  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0852  ABC transporter permease/ATP-binding protein  33.45 
 
 
586 aa  332  2e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0942  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.93 
 
 
586 aa  330  6e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.785069  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0825  ABC transporter related  35.11 
 
 
575 aa  328  1.0000000000000001e-88  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4426  ABC transporter related  34.01 
 
 
603 aa  328  2.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.368028  normal  0.0987215 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2782  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.67 
 
 
596 aa  327  3e-88  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0170515  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1777  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.63 
 
 
573 aa  327  3e-88  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00514902  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09251  multidrug ABC transporter  33.1 
 
 
583 aa  327  4.0000000000000003e-88  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.532954  normal  0.0147253 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1984  ABC transporter related  36.99 
 
 
605 aa  327  5e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0832804 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0640  ATPase  34.54 
 
 
588 aa  326  6e-88  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.25348  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0757  ABC transporter related  33.39 
 
 
586 aa  326  7e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000135449  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3781  ABC transporter related  34.96 
 
 
588 aa  326  9e-88  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000284212  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3253  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  31.31 
 
 
589 aa  325  1e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.052561  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0117  ABC transporter related  33.22 
 
 
573 aa  324  2e-87  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00018995  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2283  ABC transporter related  34.68 
 
 
589 aa  324  3e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0796  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  32.34 
 
 
588 aa  323  4e-87  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000122761  hitchhiker  1.16631e-21 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1058  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  30.97 
 
 
588 aa  323  4e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.61208  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0484  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  31.78 
 
 
590 aa  323  6e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0441  ABC transporter related protein  34.72 
 
 
650 aa  323  6e-87  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0256  multidrug ABC transporter  32.58 
 
 
583 aa  322  9.999999999999999e-87  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.607826  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>